Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi2g0677 ATGCATCCCATGTTAATTTATGGGTGCCTTTGCCAGTCCATTCTGTTGGGATCTCTTTTTGTGTCTGTGCTTGCTCTCACTTCAGTGCAGTCTAGAGGTAGAAGCTCTGTGTCCGGAAACTGGTTACATGGTTACTTGGGATCTGGTTCCGAAATCCATAACTCTATTTATATTAAAAGATCAACTGATTTATCCACATCAAATGATTCATTATCTTGTGAGGACCTGGAAGGTGTTGGATCATTCAACACGACCTGTTTTCTGAATTCAAATTTGTATTTGAATTCTGATCTTTATATATATGGTACGGGAAACCTAGAGATACTCCCTCATGTTTCCATTACATGTCCTGCTGAGGGCTGTTCAATAAGTTTCAATGTATCTGGCAATATAAAAATCGGCAAATATGCTGCCATTATTGCTGGGTCAGTAGTTTTTTCTGCAGCTAATCTGACTATGGAACAATATTCTTCTGTAAATACATCATCTTTGGGTGGACCACCGCCTCCTCAGACTAGTGGTACTCCAGTTGGCTATGATGGAGCTGGTGGAGGGCATGGTGGCCGAGGTGCTTCCTGCTTGAAAAGTAATCGGACAAAATTCTGGGGTGGTGATGTTTATGCCTGGTCTACTTTGTCTGAGCCATGGAGTTATGGGAGTAAGGGTGGTGGCAACTCTGCTGAGAATCGGTTTGGGGGGGATGGTGGAGGGCGTGTCATGCTTAAGGTGAGGGACATACTATATCTAAATGGATCTGTAACTGCAGAAGGAGGGAATGGAGGACCCGGAAGGGGAGGAGGATCTGGTGGAAGTATCATGGTACATGCTCTAAAGCTGAAGGGATATGGCACTATAAGTGCAGCAGGTGGTAGTGGATGGGGTGGAGGTGGAGGTGGAAGAATATCACTGGATTGTTATAGCATACAAGAAGATGTCAAAATCACTGTGCATGGTGGTTTGAGTATTGGATGTCCTGGTAATGCTGGAGCAGCAGGTACATACTTCGATGCAACTCTACTGAGTTTAAGAGTTGGCAATGACAATATCACAACAGAAACTGAAACTCCTTTGCTGGATTTTCCTACCACCCCACTATGGTCAAATGTTTTTGTGGAGAACAATGCAAAAGTTTTGGTTCCTTTACTATGGACCCGAGTTCAGGTGAGAGGTCAAATTAAACTACTCTGTGGGGGCAGCATCATCTTTGGACTGTCAGAGTATCCAATCTCAGAATTTGAGCTTGTTGCAGAAGAACTTTTGATGAGTGATTCTGTCATTAAGGTTTTTGGTGCATTTAGAGTGGCTGTGAAGATGTTACTCATGTGGAACTCTAAAATCAAAATTGATGGTGGTGGAAATACTGTTGTTACCACTTCTGTCCTTGAAGTTAGGAATCTTATTGTTCTAACGGAAAATTCTGTAATTAGTTCAAATACGAACTTGGCTGTATATGGTCAGGGACTTCTGAAGTTGACTGGTCATGGTGATGCAATCAAAGCTCAGCGACTTTCCTTGTCACTGTTTTATAATATAACTGTTGGGCCTGGTTCCTTACTTCAGGCTCCATTGGATGATGATACAAGCATGGTAACAAAATCCCGTTGTGAGAGTCAGACATGCCCAATGGATTTGATTACCCCACCAGATGATTGCCATGTTAATAATACACTATCCTTTTCACTTCAAATTTGTCGTGTTGAGGACCTTCTTGTTAATGGCCTCATCGAGGGAAGCATCATTCACATCCACAGGGCAAGAACTATCATCATTGATACTGATGGCATGATTTCTGCATCAGAATTAGGTTGCAGAACAGGCATCGGTAAGGGTAACTATTCAAATGGAGCTGGTGGTGGTGCTGGCCATGGCGGAAGAGGCGGCTCAGGACTTTTTCATGGGAGGGTGAGTGAAGGTGGTGACAAATATGGTAGTGCTGAGCTTCCCTGTGAATTGGGAAGTGGAACTGAGGGTCCCAACGAATCTTATGGACATGTGGCTGGAGGGGGAATGATAGTGATGGGATCCATTCAGTGGCCTCTTCTAACGCTTGATATTTATGGAGCTTTGAGAACCAATGGTCAAAGCTATGTTGGGGCAACAAGAAACATTAATGGGACTTTGATTGGTGGACTTGGTGGTGGTTCTGGTGGGACAATTCTCCTTTTCCTTCAAACACTTGTGCTGGCAGAAAACTCATCTTTATCTGCTGTTGGAGGCAATGGTGGTCTTTTTGGTGGTGGAGGGGGTGGGGGTGGAAGAGTTCATTTTCACTGGTCTAAGATAGATGTGGGTGATGAATATGTTCCAGTTGCAATGATAAGTGGTGCCATTGATAGTAGTGGAGGTGCTGGAAACAATGGTGGTTTTCATGGAGAAGAGGGCACAGTTACAGGAAAGAAATGCCCTAAGGGCCTTTATGGTACATTCTGCAATGAATGCCCTGTTGGCACTTACAAAGATGTTGATGGCTCTGATGTACATCTTTGCGCTCCTTGCTCTCTTGACCTTCTTCCCAACCGGGCAGATTTTATATATGTGCGAGGAGGAGTTACTCAGCAATCCTGTCCCTATAAATGTATATCTGACAAGTATAGAATGCCAAATTGCTATACACCTCTTGAGGAGCTGATGTATACATTTGGAGGGCCTTGGCCTTTCTCGCTTTTGTTGTCGTGCATTTTGGTTCTTCTAGCTATATTATTAAGTACCTTGAGAATCAAATTGGTGGGATCAGGTTGTTCTTATCATAGTACAAATTCAATTGAAACACAAAGTCATAACCATTTTCCATACCTTCTTTCGTTGTCAGAGGTGCGGGGGACCAGAGCTGAAGAAACTCAGAGCCATGTTTACAGGATGTACTTTATGGGTCCCAATACTTTCAGAGAACCCTGGCATCTTCCTTACTCTCCTCCCAATGCAATCATAGAGATTGTGTATGAAGATGCTTTTAACAGATTCATTGATGAGATTAATTCAGTTGCTGCATATGATTGGTGGGAAGGGTCAGTACACAGCATACTTTCAGTGCTTGCATATCCTTGTGCATGGTCATGGAAACAGTGGCGTAGGAGGAATAAGATTCATCGCCTTCAGGAATTTGTCAAATCTGAATATGATCATTCATGTCTCCGCTCATGTAGGTCAAGGGCTCTATACAAAGGCATGAAGGTTGGAGCAACACCTGATTTGATGGTTGCATATATTGATTTCTTCCTTGGTGGTGATGAAAAGCGCATAGACATAGTGTCTATTATACAGAAGAGATTCCCCATGTGCATCATTTTCGGTGGTGATGGAAGCTATATGTCCCCTTATAATCTTTACAGTGACACATTATTGACAAATCTTCTTGGCCAGCATGTCCCTGCTACTGTCTGGAATCGTTTGGTGGCTGGTTTGAATGCTCAATTAAGGACAGTGAGACATGGATCCATCCGTTCTGCATTAATTCCTATTATTCGTTGGATCAGTAGTCATGGAAACCCCCAACTTGAGTTCCATGGGGTTAAAATTGAGCTTGGATGGTTCCAGGCCACTGCTTCTGGTTATTATCAACTGGGTATTTTGGTAGTTGTTGGCGATTACTCGCTCCATAACATGAATCAGTCTGATCTATTGGACAGAAGTAGTGATGAATGTCCAAGAAAAGATACAGCAGTTGCAAGAAAAAGCCTTAAACAGCTGCAGAAGAGTCAGCCACATACAAGTCATGCATTATCTCGAAAAAGGATTACTGGTGGAATCAATGGAGGTCTAATAAATGATGCTACTTTGAAATCTTTGGATTTTAGAAGGGACTTTCTCTTTCCATTTTCTCTCTTATTGCACAATACAGGACCTGTTGGACGTCAGGAGTCCCTGCAGCTGCTGATATCTATAGTTCTTCTGGCAGATCTTTCAGTCACCCTCCTTACATTGCTCCAGTTCTATTGGATTTCTCTTGGGGCTTTTCTTGCTGTCTTGCTTATTCTTCCTCTATCCTTGCTCTCTCCCTTCCCTGCAGGCTTGAATGCCTTATTCAGTCAAGGACCTAGAAGATCTTCGCTAGCTCGCATATATGCATTGTGGAATGCTACATCTTTATCAAACATTGCTGTGGCTTTCATCTGCGGCATTTGTCACTATGGACTTTCCTTTTTTCAACCATCTGAAAAAGCAAATACATGGCATTCAAGGAGGGAAGACGATAAATGGTGGCTTTTGTCAACCATCCTTCTGCTCTTCAAGTCAATACAAGCTCGTTTTGTTGATTGGCACATAGCAAATCTAGAAATCCAAGATTTTTCTTTGTTCAGTCCTGATCCAGACACTTTCTGGGCCCATGAGTCTAGTTTATGA 4341 0.4287 MHPMLIYGCLCQSILLGSLFVSVLALTSVQSRGRSSVSGNWLHGYLGSGSEIHNSIYIKRSTDLSTSNDSLSCEDLEGVGSFNTTCFLNSNLYLNSDLYIYGTGNLEILPHVSITCPAEGCSISFNVSGNIKIGKYAAIIAGSVVFSAANLTMEQYSSVNTSSLGGPPPPQTSGTPVGYDGAGGGHGGRGASCLKSNRTKFWGGDVYAWSTLSEPWSYGSKGGGNSAENRFGGDGGGRVMLKVRDILYLNGSVTAEGGNGGPGRGGGSGGSIMVHALKLKGYGTISAAGGSGWGGGGGGRISLDCYSIQEDVKITVHGGLSIGCPGNAGAAGTYFDATLLSLRVGNDNITTETETPLLDFPTTPLWSNVFVENNAKVLVPLLWTRVQVRGQIKLLCGGSIIFGLSEYPISEFELVAEELLMSDSVIKVFGAFRVAVKMLLMWNSKIKIDGGGNTVVTTSVLEVRNLIVLTENSVISSNTNLAVYGQGLLKLTGHGDAIKAQRLSLSLFYNITVGPGSLLQAPLDDDTSMVTKSRCESQTCPMDLITPPDDCHVNNTLSFSLQICRVEDLLVNGLIEGSIIHIHRARTIIIDTDGMISASELGCRTGIGKGNYSNGAGGGAGHGGRGGSGLFHGRVSEGGDKYGSAELPCELGSGTEGPNESYGHVAGGGMIVMGSIQWPLLTLDIYGALRTNGQSYVGATRNINGTLIGGLGGGSGGTILLFLQTLVLAENSSLSAVGGNGGLFGGGGGGGGRVHFHWSKIDVGDEYVPVAMISGAIDSSGGAGNNGGFHGEEGTVTGKKCPKGLYGTFCNECPVGTYKDVDGSDVHLCAPCSLDLLPNRADFIYVRGGVTQQSCPYKCISDKYRMPNCYTPLEELMYTFGGPWPFSLLLSCILVLLAILLSTLRIKLVGSGCSYHSTNSIETQSHNHFPYLLSLSEVRGTRAEETQSHVYRMYFMGPNTFREPWHLPYSPPNAIIEIVYEDAFNRFIDEINSVAAYDWWEGSVHSILSVLAYPCAWSWKQWRRRNKIHRLQEFVKSEYDHSCLRSCRSRALYKGMKVGATPDLMVAYIDFFLGGDEKRIDIVSIIQKRFPMCIIFGGDGSYMSPYNLYSDTLLTNLLGQHVPATVWNRLVAGLNAQLRTVRHGSIRSALIPIIRWISSHGNPQLEFHGVKIELGWFQATASGYYQLGILVVVGDYSLHNMNQSDLLDRSSDECPRKDTAVARKSLKQLQKSQPHTSHALSRKRITGGINGGLINDATLKSLDFRRDFLFPFSLLLHNTGPVGRQESLQLLISIVLLADLSVTLLTLLQFYWISLGAFLAVLLILPLSLLSPFPAGLNALFSQGPRRSSLARIYALWNATSLSNIAVAFICGICHYGLSFFQPSEKANTWHSRREDDKWWLLSTILLLFKSIQARFVDWHIANLEIQDFSLFSPDPDTFWAHESSL* 1447
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi2g0677 1446 PANTHER EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 53 1441 - -
Vvi2g0677 1446 SMART GCC2_GCC3_2 807 855 - -
Vvi2g0677 1446 MobiDBLite consensus disorder prediction 159 181 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vvi2g0677 Vvi-Chr2 6220277 6270195 Dispersed/Transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi2g0677 - - vvi:100254039 2658.63