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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi1g1437 ATGCAGGATGTTTTCCCTGTGATTCCTGGAGATACAGATTATAGAATATTTGCTGAAGATTATGGTGACATTCCTGGGCTAGATATTATCTTTCTTCTTGGTGGTTATTTTTATCATACCTCCTATGATACAATGGAGAGACTATTACCTGGAAGCATTCAAGCGCGTGGAGAAAATTTGTTAAGCATAACAAGGGCCTTTGCTAATTCCTCTAAGTTATTGAATGCTCATGAACGAGAATCTCTTAAAGTTGCTGCCAATGAACCCAAGGATGAGCGAGCTGTTTTCTTTGATTATTTATCATGGTTCATGATATTCTACTCAAGAAGGGCAGCTGTGGTGCTTCATACTATTCCAATTGCTATCTTCCTTCTTATGCCATTTCTTCTGTTTGTATTGAATATCGGAAAACGTACTTGGTTTTCAACATTCTATGACTTTTTTAAAGGATTACTGCTCCATACTATTGGAGTTGTGCTGGCAGTTGTCGTTCCAATTGTCTTTGCTATCCTGAGATTGTTGTTTTCTAATCATGCAATGAGCTGGTTTGCTCGCCCTTACCTTGCTTTCATGATGTTTATTCCCTGCTCACTTGTTGGTGTTTTGATTCCAAGAGTTGTTTGGAGAAGTGTTCCCCTCACACATGGTGTTTCACGTCTTCAAGCATCAAAGGAGGGACTATCTGATGATCCAAGGTTCTGGGGGGTGTTTGGGTTTTATGCTCTGTTGACCTTGGCCTATCTTGTAGCTGGATTGAGTGGAGGTTTCTTGACTTTTTCTCTGTCAGTTTCTATGCTTGCTGCATGGATCTCATTTCACTTTGCAGTCAAGCTTTTTGATTGTCAATCACTTAGATCAGCAATGTGCTACGTGTTACCTCTAATACCCTGCATCACGTACTCTGTCTACTTTGGTGGGTTTCTTGCCCAATTCTTGATTGAGAAGATGGGTATGATGGGTTCTATCCCACCCCCCTATGGATATTTCATTCCGGATATTATAGTGGCAGCAGTAATAGGATTAGTAACCAGTTGGTGTGTGGGCCCGCTAATACCTATTTGTGGTCACTGGCTTGCCAGATCATCCATCTTGAAATTCTTGTTGCAGCTTAGTGTGCTTGCCTTGGCTCTGTCATCGCAGTTCTTTCCTTATAGCATTGCTGCTCCTAAGAGGGTTGTTTTTCAGCATACATTCCTAACTGCAGATGCAAGTCGGGTAGTAGGCTCCAGTTATGATTTTTCTGTGGTTGATTCCAATTCTTTGCCTTTTCTTTTTGAACATGCCCCCGAAGTGGCAAAGGAACTAAACATGGGTTCAGAGTTGTCATTTAAAGCCACTAAGGACTCTCCTCGACAGACTTGGATGGTGCTCTTTCCAGTATCTTTCTTATTTTCAGGAAGCTTGAAGTTCCCTGCAAGAAGTGATGATATGTTGAAACACTACAGCTCTTTTCCCCATTTGTCTGCTTATAAGCCACATACGCTTTATGATGGGGGATCTCGTAGGGTTCATTTAGAATTTTACTTAGGTTCTTTAGAGGAGGTTTGGGTTTCAGTCCTTAACATTACTGGTCCTTTATCCAGTTGGTCATTTGCAGATAATGTACTTCCTGCTCCTGAATCACGTGGTGGTGGTCCACTTTCATACATTTGTAGACTCAGTGGAGCTAGCCATGAGAATTGGACCTTCTGGTTGGAGGCTAGCAGTTCTGAAGAGATAAGGGTGGAAGTTGCTGTATTAGATCAATATATGGTGGATGCAGCAAAGAAGTTAAAGGGCCTTTTTCCGAGCTGGGTGGATGTTACTGCTTATTCAAGCTTTTTGTCTAGTTATGTCTTCTAA 1842 0.4153 MQDVFPVIPGDTDYRIFAEDYGDIPGLDIIFLLGGYFYHTSYDTMERLLPGSIQARGENLLSITRAFANSSKLLNAHERESLKVAANEPKDERAVFFDYLSWFMIFYSRRAAVVLHTIPIAIFLLMPFLLFVLNIGKRTWFSTFYDFFKGLLLHTIGVVLAVVVPIVFAILRLLFSNHAMSWFARPYLAFMMFIPCSLVGVLIPRVVWRSVPLTHGVSRLQASKEGLSDDPRFWGVFGFYALLTLAYLVAGLSGGFLTFSLSVSMLAAWISFHFAVKLFDCQSLRSAMCYVLPLIPCITYSVYFGGFLAQFLIEKMGMMGSIPPPYGYFIPDIIVAAVIGLVTSWCVGPLIPICGHWLARSSILKFLLQLSVLALALSSQFFPYSIAAPKRVVFQHTFLTADASRVVGSSYDFSVVDSNSLPFLFEHAPEVAKELNMGSELSFKATKDSPRQTWMVLFPVSFLFSGSLKFPARSDDMLKHYSSFPHLSAYKPHTLYDGGSRRVHLEFYLGSLEEVWVSVLNITGPLSSWSFADNVLPAPESRGGGPLSYICRLSGASHENWTFWLEASSSEEIRVEVAVLDQYMVDAAKKLKGLFPSWVDVTAYSSFLSSYVF* 614
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi1g1437 613 Pfam Peptidase family M28 8 62 IPR007484 -
Vvi1g1437 613 Gene3D Zn peptidases 2 86 - -
Vvi1g1437 613 PANTHER METALLOPEPTIDASE M28 FAMILY MEMBER 2 490 IPR045175 GO:0006508|GO:0008235
Vvi1g1437 613 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 3 70 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vvi1g1437 Vvi-Chr1 20714886 20726477 Dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi1g1437 - - vvi:100267769 1214.91