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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi19g0501 ATGGAGTCCATAGTCGCCCTCGCCTTGGAGTACACTCTCAAGTATTGGCTCAAATCCTTCTCCAGAGATCAGTTCAAGTTGCAGGGTCGTACCGTACAGCTCTCCAATTTGGATATAAATGGAGATGCTCTTCATTCGAGTCTTGGATTGCCGCCTGCTTTGAATGTCACGACAGCGAAAGTCGGGAAATTGGAGATATTGCTGCCATATGTGAGTAATGTACAAATAGAGCCGGTTGTTGTTCAAATAGATAGACTTGATTTGGTTTTGGAGGAGAATTCAGATGTGGATGCATGCAGGAGCTCAAGCAGTACTCAGTCATCCACCAGCTCAGGAAAAGGAAGTGGTTATGGATTTGCTGATAAGATTGCTGACGGGATGACTCTAGAAGTGCGCACTGTCAATCTTCTACTTGAAACTCGTGGGGGTGCTCGATGCCAAGGAGGAGCAACTTGGGCATCACCTCTGGCATCTATAACTATCCGCAACCTTTTGTTGTATACCACGAACGAAAATTGGCATGTTGTGAATCTTAAGGAAGCGAGGGACTTCTCCAATGACAAAAAGTTTATATACGTATTCAAAAAACTTGAATGGGAATTTTTGTCCATTGACCTCTTGCCTCATCCTGATATGTTCATGGATGCTAATATAGCACACCCTGAAGAGGAAGTAAATAGGAGAGATGAGGATGGTGCAAAGCGAGTGTTCTTTGGTGGAGAGCGTTTTATTGAAGGAATATCTGGAGAGGCTTATATTACAGTACAGAGGACAGAACTAAACAGTCCACTGGGGCTGGAGGTTCAACTTCATATTACAGAAGCTGTTTGTCCTGCTTTAAGTGAACCAGGATTGCGTGCTCTTCTACGCTTCTTGACTGGATTATATGTCTGTCTAAATAGAGGAGATGTAGATCCAAAAGCTCAACAGCGAACTACAGAATCAGCAGGACGTTCTCTGGTCTCTATTATTGTGGACCACATATTTCTCTGCATCAAAGATGCTGAGTTCCGGCTTGAACTTTTGATGCAGTCACTCTTCTTCTCTCGGGCCAGTGTTTCTGATGGGGAAAAGACAAAGAACCTGAACCGAGTTATGATTGGTGGACTGTTTCTAAGGGATACCTTTTCACACCCTCCATGCACCTTAGTGCAACCGTCAATGCAGGCTGTCACAAAAGATGTTCTGCATATTCCTGAATTTGGTCAGAACTTTTGTCCGGCAATATATCCTCTGGGTGAACAGCAGTGGCAGTTACATGAAGGTATTCCTCTAATATGCCTCCATTCTCTTCAGGTTAAGCCCTCCCCAGCACCACCATGTTTTGCTTCACAAACAGTGATTGATTGTCAGCCACTTATGATTCATCTTCAGGAAGAATCCTGTTTAAGGATATCTTCCTTCTTAGCTGATGGAATTGTAGTCAATCCTGGTGCTGTGTTACCAGATTTCTCCGTTGACTCCCTTGTATTCACCCTCAAAGAATTGGACATCACTATTCCTATGGACACTGGAGAATCCAATATCTCTGCTGGAGACAGTAACTCTACTCATCAGAGCTCCTTTGCTGGAGCAAGGCTCCATATTGAGAACTTGTTCTTCTCAGAATCTCCAAAACTAAAGCTCAGGCTACTGAACCTGGAGAAGGATCCTGCTTGCTTCAGTCTCTGGGCAGGTCAACCGATTGATGCCAGTCAAAAGAAATGGACCACTGGAGCTTCTCAACTTATTCTGTCTCTAGAAACATGTAGTGACTTAACTGGACTTCAAATTCCTCTTGAGCGGTCTTCAGGTTCATGGAGATGTGTTGAGCTGAAAGATGCTTGCATTGAGGTAGCTATGGCAACTGCAGATGGGAGGCCATTAATAAGTATTCCTCCTCCAGGAGGTGTTGTCAGGGTAGGTGTTGCTTTTCAACAATATTTATCCAACACTTCAGTTGAGCAATTATTTTTTGTCCTTGATCTCTATACGTACTTTGGTAGAGTCAGTGAAAAGATAGCTATTGTTGGAAAAAATAACAGACCAAAGACAAGTGAAAATGAAGCTTTGGCTGGAAGCCTGATGGAAAAAGTTCCTAGTGATACTGCAGTAAGTTTGGCAGTGAAGGACCTCCAGCTTCAGTTTCTGGAATCTTCATCCATGGATATTCATGAGATGCCTCTGGTTCAGTTTGTGGGAGACGATCTGTTCATCAAAGTCACTCATAGAACCCTTGGTGGTGCCATCGCCATTTCATCTACTTTACATTGGGGGAGTGTTGAAATTGACTGTGTAGATACCGAGGGAAACTTGTTGCATGAGAATGGTACAACTTTAACTTCTACTGAAAATGGTCTTCTGTCAGCTGGGAGTGGGTCCCCTCAACTAAGACCAGTTTTTTGGGTTCAAAACAAATGGAAGCATCGATCAAATGGTATTGCTCATGCAATTCCATTGCTAGACATAAGTGTCGTGCATGTGATTCCATATAATGCACAGGATATTGAGTGTCATAGTTTGAGTGTGGCAGCTTGTATTGCTGGTGTTCGTCTTGGTGGAGGAATGAATTATGCCGAAACCCTGCTGCATCGATTTGGAATCCTTGGGGCTGATGGTGGTCCTGGGGAGGGGCTCTCCAAAGGGTTAGAGAATTTATCAGCGGGACCATTGTCAAAACTTTTCAAGGCATCACCTCTTCTTGTGGATAATCTGGAAGAGAATGGAAGTTACAGAGATGGGAAAGACAATGGTTTCTTGAATTTGGGAAAGCCTGATGATGTGGATGTGTCTATAGAATTAAAAGATTGGTTATTTGCTCTTGAAGGTGCACAGGAGACAGCAGAAAGATGGTGGTTTTACAATGATGAAAATATTGGCAGAGAAGAGAGGTGTTGGCACACAACTTTCCAGAGTTTGCAAGTGAAAGCAAAAGGTAGTCCAAAGCGGTTGCTGAATGGAAAAGGAAAATCACAGGAAACACAGAAGTATCCTGTGGAATTGATCACTGTTGGTATTGAAGGATTGCAGATCTTGAAGCCCAACGCTGCAAAGGGCATTCTTCAAGCTGGCTTTCCTGTAGAAGGAATCAAGGAAACTGTTGAGACCTCTGGGGGAATAAATTGTGAAGTTAGCATCCTAGTCTCTGAGGACAATGCTCATGATGAAATTGGCAAATGGATGGTGGAAAACTTGAAGTTTTCTGTTAAGCAACCGATTGAGGCAATTGTGACCAAAGATGAGCTGCAATATCTTGCTTTTCTATGCAAGTCGGAAGTTGATTCAATGGGCCGAATAGCTGCTGGAATTCTACGGGTGCTCAAGTTGGAGGGATCGGTTGGCCAGGCAGCCATAGATCAACTGAGCAACCTTGGAACTGAGGGATTTGACAAGATTTTTTCCCCAGAAATTCTTAGCCCCCATAGTTATGCTAGCAATATTGGGTTCACTCCTGCGAATGGTAATGGTCAAAGCCCACATCCATCCTTGGAATCAACCGTGTTTTCACTTGAGGAGGCGGTCTTGGATTCACAGGCAAAGTGTACTGCTCTTATTGCTGAGCTACGGAGTTCAGAATCTTCCCGACACCATCTTGCCAGTGTTAAACAGCTAAGTCAGAAACTTGAAAGTATGCAGAGTTTGTTGGCAAAATTGCGGACCCAAGTTTGA 3648 0.437 MESIVALALEYTLKYWLKSFSRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHSSLGLPPALNVTTAKVGKLEILLPYVSNVQIEPVVVQIDRLDLVLEENSDVDACRSSSSTQSSTSSGKGSGYGFADKIADGMTLEVRTVNLLLETRGGARCQGGATWASPLASITIRNLLLYTTNENWHVVNLKEARDFSNDKKFIYVFKKLEWEFLSIDLLPHPDMFMDANIAHPEEEVNRRDEDGAKRVFFGGERFIEGISGEAYITVQRTELNSPLGLEVQLHITEAVCPALSEPGLRALLRFLTGLYVCLNRGDVDPKAQQRTTESAGRSLVSIIVDHIFLCIKDAEFRLELLMQSLFFSRASVSDGEKTKNLNRVMIGGLFLRDTFSHPPCTLVQPSMQAVTKDVLHIPEFGQNFCPAIYPLGEQQWQLHEGIPLICLHSLQVKPSPAPPCFASQTVIDCQPLMIHLQEESCLRISSFLADGIVVNPGAVLPDFSVDSLVFTLKELDITIPMDTGESNISAGDSNSTHQSSFAGARLHIENLFFSESPKLKLRLLNLEKDPACFSLWAGQPIDASQKKWTTGASQLILSLETCSDLTGLQIPLERSSGSWRCVELKDACIEVAMATADGRPLISIPPPGGVVRVGVAFQQYLSNTSVEQLFFVLDLYTYFGRVSEKIAIVGKNNRPKTSENEALAGSLMEKVPSDTAVSLAVKDLQLQFLESSSMDIHEMPLVQFVGDDLFIKVTHRTLGGAIAISSTLHWGSVEIDCVDTEGNLLHENGTTLTSTENGLLSAGSGSPQLRPVFWVQNKWKHRSNGIAHAIPLLDISVVHVIPYNAQDIECHSLSVAACIAGVRLGGGMNYAETLLHRFGILGADGGPGEGLSKGLENLSAGPLSKLFKASPLLVDNLEENGSYRDGKDNGFLNLGKPDDVDVSIELKDWLFALEGAQETAERWWFYNDENIGREERCWHTTFQSLQVKAKGSPKRLLNGKGKSQETQKYPVELITVGIEGLQILKPNAAKGILQAGFPVEGIKETVETSGGINCEVSILVSEDNAHDEIGKWMVENLKFSVKQPIEAIVTKDELQYLAFLCKSEVDSMGRIAAGILRVLKLEGSVGQAAIDQLSNLGTEGFDKIFSPEILSPHSYASNIGFTPANGNGQSPHPSLESTVFSLEEAVLDSQAKCTALIAELRSSESSRHHLASVKQLSQKLESMQSLLAKLRTQV* 1216
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi19g0501 1215 Coils Coil 1194 1214 - -
Vvi19g0501 1215 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 103 IPR026854 -
Vvi19g0501 1215 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1213 IPR026728 -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi19g0501 - - vvi:100241773 2385.53