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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi18g1784 ATGGACTTCTCAGAAGAATGGAAGTCGATATGGCCAATCTCTTCAGTCTTCACTCCCCCGCTCCTCATCTCCTCAAAACCCTCTCTCGGTCCTCTCTTTTTCAATCCTTCTCCCAATACCCTAACCCCCCTCTTCTCCAAACCCTCCTTTTCCTTCCCTCCTCACCTCCCTCGCTCCTCTCTCCTCCACGACCGCCTCCACCTCCTCCGCTGCCCAAATGCCGCCGTTTTGGCCCTCTTTCCCACCGGCGTCAACTCCGACCAAATTGGGTTTCTGCTATTGTCCGTAAAGGACTCCTGCTTGGATGTTAGGGCTGATCGAAACGGCGATGTTTTTGTGTCAAAGAAGCGGCTCAATCATCGGATTGTTCAGATTTTGGCCACCCCAATTGGGTATTCGTTTTCAGGTAATCCTGATTCTGTTGGGTTGGTCTTGGCTTGTACAATGTATTCTGTTCATTGGTTTAGTGTTAGAAATGATAACATCGACTCCGAGCCGGGGTTGATTTATCTGGGTGGTAAGGTGTTCAAGAGTTGTGCTGTTGTGAGCGCTTGTTGGAGTCCGCATTTATCCGAAGAGTGTTTAGTTCTGTTGGAGAGTGGTGAATTGTTCTTGTTCGATTTGGATTATTGTTGTTCAAATTCAAATTTTAAAGGAAATAGATTGAAGATCATGTGGCACAATGCAGATTGTTCAGGAGATGGTAAATGGTTGGGTTGTGAATTTAGCTGGCATCCTAGAATTTTGATTGTTGCACGATCAGATGCTGTGTTTTTAGTCGACTTGAGGTTTGATGAATGCAGCGTGAGCTGTTTAGCAAAGATTGGGATGCCAAGTGTAGGTGAATTGGTGCATAAGGAGCCGTTCATTTCATTTTCTATGGCAGGTTCTAATGGCTTTCACTTTACTGTGGCGTCTAATAGTTTGTTGTTTCTCTATGATATTCGTAATCCATTGATACCTGTGTTGCAATGGTCGCATGGTATTGACAAACCTTGTTATGTTCGTGTGTTTAAATTGTCTGAATTGAGGTCACACTCAAAGGATGACAAATATAAAGAGGCTTCAGAGTCGGCATTTTGTATTATAATGGGATCATTCTGGAAATGTGAGTGCCGAATGTTCTGCTATGGATCTTCCTTTCAAGATCCTAAAGGGTCAACTGCTTATGAAATTTCGAAACTTTGCAAATCCTATTATGCATGGGAACTCCCTTCAGAGCTTTCGTTGCTTGGTAATGAGTGTTTTTGTGGAACTTGTCTTTCAAGGAAAGAGTTTTTGAAGGGTACCCTTCCTGTGTGGGTTAATTGGCAACAAAAGAAGGACATAGTTGTGGGTTTTGGAATACTTGACAAGGATCTGTCTGCCCTATTATATGAGCCAGATAGTTTTGGTGGGTTTACATTGATTCGGTTGATGTCCTCAGGAAAGCTTGAATCACAGAGATATTATGCTTCATGGGATCTTGTAAAGAAGTCAGAAATAGCCCACAATAACTCCTTGTCTGATTTTAAAGATTATATGTACAGTATGGGTGATTTGGAATATGAATATATTAAGAAATTTAAGTATTTCAAACTTGCCTACCTATACGAATATTTTTGGAATGCTGATCTTGCTAAACTCCTCATTTGGAATATGAAGAAGCCTTGTGGGGGTCCCCTACAAGAGCCATCTTTTAATGTAGACTTTCGTGATCTTATTCTTGAAAAATTGAAGGCTTGTGGGTTCTCAAGATCATCTTCAGTTTCTGATGTTTTTAGAGATATTAGCATTCCGACAAGCATACATGAAGTTACTTGGAGGAGACTATGGTCAGGACTCCCTGTTGGTCTTTTACAGTGGGCATTTTCAAGCTACTCTGAATTCCTTGAAGTACTTGTGGACAAGAAGCAGGTATCCTTGGAATTCTTAATTGTACCAGACTCACCCCAGTTGCCTCCTTTCTTCTTAAGAAGGCCTTCATGCCGTAGCAATAAGTGGTCTCACAAAGTGCAACGTGATGATGCTCTTGTGGGTCCAGTACTTCCTCTTCCTATTTTATCTTTGCTTCGAGATATTCATGATACTGGGTGCTTTGATTTGGAAGAAGCAGATGGGTTTTCATTTCAGGAAGAAGTTTCCCTAGAATGCAATGAAGTCATGAAGGTCACTAGTGAAATGGCTGTGTCAGACTCTAGCTCTGAACTTCATGGTGACCATGCTATCTCCCTTGCTAATGACAGGGAAGAGACATGGATTGACACTCAGAATCTAAAGCCTTTCTACTTATATGATCAGCAACCATTTTCAGCTAAATGCTCTAGACTGGATCCTAGGCAGGATACCTCTGGTTATAAGGATGAGAGATTTGATACCTTGATTTTCAAAAAGCCTAAGGAACTTCTTGTTGATGGTGAGGTGGAAACAAGGGTTGGGCTAGAATTGTTTGATGACCTTTCCTCAGTAGAATTGAAGTTTGATGCTCCTGCTATGAACTTTGAAGCAAAGGAATTGCAAGCGTACAAAGCATTAAAGAGGCAGTTCTTGAAATCAAGAAGTTTTGACTTATATCAGGACTTCTTTAATCGATACAAAGTCCAAGACCAACATCCATAG 2598 0.4161 MDFSEEWKSIWPISSVFTPPLLISSKPSLGPLFFNPSPNTLTPLFSKPSFSFPPHLPRSSLLHDRLHLLRCPNAAVLALFPTGVNSDQIGFLLLSVKDSCLDVRADRNGDVFVSKKRLNHRIVQILATPIGYSFSGNPDSVGLVLACTMYSVHWFSVRNDNIDSEPGLIYLGGKVFKSCAVVSACWSPHLSEECLVLLESGELFLFDLDYCCSNSNFKGNRLKIMWHNADCSGDGKWLGCEFSWHPRILIVARSDAVFLVDLRFDECSVSCLAKIGMPSVGELVHKEPFISFSMAGSNGFHFTVASNSLLFLYDIRNPLIPVLQWSHGIDKPCYVRVFKLSELRSHSKDDKYKEASESAFCIIMGSFWKCECRMFCYGSSFQDPKGSTAYEISKLCKSYYAWELPSELSLLGNECFCGTCLSRKEFLKGTLPVWVNWQQKKDIVVGFGILDKDLSALLYEPDSFGGFTLIRLMSSGKLESQRYYASWDLVKKSEIAHNNSLSDFKDYMYSMGDLEYEYIKKFKYFKLAYLYEYFWNADLAKLLIWNMKKPCGGPLQEPSFNVDFRDLILEKLKACGFSRSSSVSDVFRDISIPTSIHEVTWRRLWSGLPVGLLQWAFSSYSEFLEVLVDKKQVSLEFLIVPDSPQLPPFFLRRPSCRSNKWSHKVQRDDALVGPVLPLPILSLLRDIHDTGCFDLEEADGFSFQEEVSLECNEVMKVTSEMAVSDSSSELHGDHAISLANDREETWIDTQNLKPFYLYDQQPFSAKCSRLDPRQDTSGYKDERFDTLIFKKPKELLVDGEVETRVGLELFDDLSSVELKFDAPAMNFEAKELQAYKALKRQFLKSRSFDLYQDFFNRYKVQDQHP* 866
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi18g1784 865 PANTHER TATA BOX-BINDING PROTEIN ASSOCIATED FACTOR RNA POLYMERASE I SUBUNIT C 1 858 IPR038801 GO:0006360
Vvi18g1784 865 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 151 322 IPR036322 GO:0005515
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi18g1784 - - vvi:104882767 1749.95