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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vra9g1075 ATGGTGACGGTTCATGTAAGTAACAAGGAAGAAAGCCCCCAAATGGATAACGGTGGTTATAGTGGTTCGCAGTTAGTTCATCACTTCAGAAGCGTACTTGATGCAGTCAAAACGGGTGATAGAGGGAATTACGACGAGCTTGTAAGTTATTTGTACCCGAAGAGGAATCTTAGTCCTGATGAGGTTGCAATTCTTGTGACAACTTTGAAGGCACTTTCTGGAGCAGTGTCCTATATAGATTCTGATCATCACGAATCTCTTCTCTTTGCTGTTTCAAGAATGAGCCTCTGGAATAATGGAACTGAGGTTATGGATGCACTGCTGGAACTCATTACATCTTTGGCTGCTACTAATGGAAAATATATTGATTGGTGTTTGGAGATGCTTGTGAAACATTTTGTGCCCCCTTTTTACATGCATGGTTCTCTGGATAACGAGAATGGAAATAACTGGAAAAATAAAGTTCTGTCTCGGGTGCATGCGGCTTTGGAAGAGATAGCTGATTTGGTGCCTCTTGCACCCTTGCGACTATGTCCAATAGTTGTCCAGAACATGCCCAGTGTCTTCAGTAATGATCGTGAGATTGTCCTATATGTTGAGAATATGTTAAAGTTGGAGAGTGGTGCAATTGGAGAAACTGTCGGTTCTACAGTGCTGCCTGCTCTTGTGGATAGGTTGCTAGAGTTGGATGTGGAAATTGGATGGGATGGAATCTTGCAAGAAGATACCAGAGGCATATTTGATATGGAGTTAGAAGATATTATTAAATTTGCAGAGGAGGATGAGAACTCTGATAGTATGCCTCAGTCAGAGTTGTTTAATAGGGAAAATTTGCAAGGCAAGCAAGACAAAAAGGTTGTTGAAAAATTAGATAACCTAATTGTGCTAGCTTTATTGCACCTTGAATCCTGTCAAAGCAGTGGCCGATTGGCTGAGGTATTCGATATTCTACTTCATTCATTCCAGAAAACTGTACTGAATGCATACAAGTCAAAATTTACGCAGTTTGTGATGTTCTATGCATGTGCACTGGACCCTGAAGGATGTGGTGTGAAGTTTGCCATGGTTCTTGCAGATATTTTTGTTTCTGATGTTAATCCACCTATAACTAGGATGAGTGCTGTTGCTTATCTTGCTAGTTATCTCTCTCGTGCAAAGTTCCTTTCGGCTGCGTTGGTTACTACCATCATACAAAGTTTGGTTGATCAGTGTTATGCTTATTGTAAGTTACGTGATTCTGGTATGAACCCACGAGCACATCAAGTTTTTTATTCTGGGTGTCAGGCTATCATGTACATTCTGTGTTTTCGCATGAGATCTCTCATGGACGTTCCTAGGCTTAAATTGCAGCTACTTAATATGCCTATGGAGGCAATTTGGAAACATAAATTGTGTCCCTTGAAGGTGTGTTTGCCTACTGTAGTAGTGGAATTTCTTAGACAGGCAAAGGCTGCTAAACTTTTCATGGCATCAGAGTCATTCGTTTTCAATGACATGCTCGAGTCTGATCTTTCCAAGGCTTTTGGCGGGATGGATAGACTTGACATGTTCTTTCCGTTTGATCCATGTTTATTGAAGAAAAGTGAAAGCTACATAAGACCACATTTTGTTCGGTGGTCAAAAGTCAGAACTACATACGATGACGATGATGATAACGTTTCCGAAGTCAGTGAGAGTGGCAGTGAAGCGACAGATGATGATTTTGTTGACACTAATACAAAAGATATGATCGATGATGATATGATGGTGACTGTTGAAGATCTTGATTTTAACCCGGACTTGAACAAAATGTCTATAACGCCTAAAAATTCTTTGAAACATTTGCGAATGCCAGCAAGAATCAGGCCTTCCACTAGTCCAGAGTCTCTATGA 1872 0.4065 MVTVHVSNKEESPQMDNGGYSGSQLVHHFRSVLDAVKTGDRGNYDELVSYLYPKRNLSPDEVAILVTTLKALSGAVSYIDSDHHESLLFAVSRMSLWNNGTEVMDALLELITSLAATNGKYIDWCLEMLVKHFVPPFYMHGSLDNENGNNWKNKVLSRVHAALEEIADLVPLAPLRLCPIVVQNMPSVFSNDREIVLYVENMLKLESGAIGETVGSTVLPALVDRLLELDVEIGWDGILQEDTRGIFDMELEDIIKFAEEDENSDSMPQSELFNRENLQGKQDKKVVEKLDNLIVLALLHLESCQSSGRLAEVFDILLHSFQKTVLNAYKSKFTQFVMFYACALDPEGCGVKFAMVLADIFVSDVNPPITRMSAVAYLASYLSRAKFLSAALVTTIIQSLVDQCYAYCKLRDSGMNPRAHQVFYSGCQAIMYILCFRMRSLMDVPRLKLQLLNMPMEAIWKHKLCPLKVCLPTVVVEFLRQAKAAKLFMASESFVFNDMLESDLSKAFGGMDRLDMFFPFDPCLLKKSESYIRPHFVRWSKVRTTYDDDDDNVSEVSESGSEATDDDFVDTNTKDMIDDDMMVTVEDLDFNPDLNKMSITPKNSLKHLRMPARIRPSTSPESL* 624
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vra9g1075 623 Pfam RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 23 543 IPR007991 GO:0001181|GO:0006361
Vra9g1075 623 PANTHER TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IA RRN3 20 610 IPR007991 GO:0001181|GO:0006361
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vra9g1075 K15216 - gmx:100814416 1008.05