Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vra9g0649 ATGGCTCCTAATCCGAGGCCCAAGTTGGTTGTTCCATTCTTCATGTTACTGTTAATGCTTCTTTCCTTTGGTTGTTCCAATGCTGAATTGGAACAGGAGCTCGGAGCTGCTCCTCATAAGAAGGTAATTGTTGGCACTGCTGGGGAGAATTCCCTCAAGTTAGAGGAAATCAATGGCAGAAAAGGTGGAGGCGGTAGTAGAGTTTCCGTTTCCACGGTTGCATTGTTCACCTTAGCAATGGCAGCTGCCACTGGTTTAGGGGCTCTGCCCTTCTTCTTTGTGGAGCTTGATCCACGATGGGCAGGGTTGTGTAATGGAATGGCAGCTGGTGTTATGTTGGCTGCAAGCTTTGATCTCATACAGGAAGGTCAATATTATGGTACTGGAAATTGGGTTGTTATTGGGATTCTAGTTGGTGGCACCTTTATTTGGTTGTGTAAGAAGTTTCTTGAGCTATATGGGGAAGTAAGCATGTTGGATATAAAGGGTGCCGATGCAACTAAAGTTGTTCTTGTAATTGGAATAATGACTCTCCACTCTTTTGGGGAAGGATCTGGAGTTGGGGTCTCCTTTGCTGGCTCAAAGGGTTTCTCTCAAGGTTTATTGGTAACTTTGGCTATTGCTGTGCATAACATTCCAGAGGGATTGGCTGTGAGCATGGTGCTGGCATCAAGGGGTGTCTCTCCACAGAAAGCTATGTTGTGGAGCGTTATTACATCTTTACCTCAGCCAATTGTAGCCGTTCCTTCATTTATTTGTGCTGATGCATTTAGTAAGTTCCTGCCATTTTGTACTGGGTTCGCTGCTGGATGCATGATCTGGATGGTTGTTGCAGAAGTGCTTCCTGATGCATTCAAGGAAGCCTCTGCTTCACAAGTTGCATCGGCTGCAACAATTTCGGTAGCATTTATGGAAGCTCTAAGCACCCTTTTTCAGAATTTCAACCGTGACAACAACTCTGAGGATGCTTCTGGCTTCTTTGTTTCATCACTTTTTGGCCTTGGCCCATTACTTGGTGGGATTATTCTGGTTGTATTTGCTCTTGCTCTTCGTCTTCGGCATACTATCCTGATGGGTATAGCATGTGGTATTGCCTTTGTTCTTGGTGCCTGGCGACCAGTGCAGCTAATTTTGTCTTCAAAATTAGGATTTGTTCCTGTTGTGTTACTCCTTGCAACGGGTGCTGCTTTAGTTCATTTTTCCAGCTCTGGTGTATTGAAGGTGGCAGCTCGCAAGAAAACCTCAGTCAATGACTTGCCTTCATTAACAGGCTTCCCTGTGAGTGTTCAAACCCTTCAATCATTTGTATCGTGTGGTGCAGTTGCTCTACATGCTTTGGCTGAAGGACTTGCGCTTGGAGTAGCTGCACCAAAAGCTTATGGATTTGGTCGTCACATGGTCGTTCCAGTCTCTCTACATGGTCTCCCCCGAGGTGCAGCTGTTGCTAGCTGCATCTATGGTGCTACTGATAGTTGGCATGGTTCTCTTGCAACAGCTGCCATAATTGGATTTATGGGTCCAATATCAGCAATTGGATCAATTCTTGCTGGGATTGACTACAGTGGCCTTGATCACATAATGGTCCTGGCTTGTGGTGGAATAATTCTAAGTTTTGGAAATGTAGTTAAGAGAGCACTTAGCTTGGACAAGAAAAAAAGCACATGTGGCCTCGTTATGGGAATTGGGTTTGCTACCTTATGCCTAACGTTCACTAAATTAGTTTGCTTGCACACACCTTACTGCAATTCTGCACCAGAGGCTGTCAGATAA 1770 0.4514 MAPNPRPKLVVPFFMLLLMLLSFGCSNAELEQELGAAPHKKVIVGTAGENSLKLEEINGRKGGGGSRVSVSTVALFTLAMAAATGLGALPFFFVELDPRWAGLCNGMAAGVMLAASFDLIQEGQYYGTGNWVVIGILVGGTFIWLCKKFLELYGEVSMLDIKGADATKVVLVIGIMTLHSFGEGSGVGVSFAGSKGFSQGLLVTLAIAVHNIPEGLAVSMVLASRGVSPQKAMLWSVITSLPQPIVAVPSFICADAFSKFLPFCTGFAAGCMIWMVVAEVLPDAFKEASASQVASAATISVAFMEALSTLFQNFNRDNNSEDASGFFVSSLFGLGPLLGGIILVVFALALRLRHTILMGIACGIAFVLGAWRPVQLILSSKLGFVPVVLLLATGAALVHFSSSGVLKVAARKKTSVNDLPSLTGFPVSVQTLQSFVSCGAVALHALAEGLALGVAAPKAYGFGRHMVVPVSLHGLPRGAAVASCIYGATDSWHGSLATAAIIGFMGPISAIGSILAGIDYSGLDHIMVLACGGIILSFGNVVKRALSLDKKKSTCGLVMGIGFATLCLTFTKLVCLHTPYCNSAPEAVR* 590
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vra9g0649 589 ProSiteProfiles Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. 1 25 - -
Vra9g0649 589 PANTHER ZINC/IRON TRANSPORTER 58 347 - -
Vra9g0649 589 PANTHER BNAA05G29570D PROTEIN 58 347 - -
Vra9g0649 589 Pfam ZIP Zinc transporter 166 289 IPR003689 GO:0016020|GO:0030001|GO:0046873|GO:0055085
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vra9g0649 Vra-Chr9 7445876 7450052 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vra9g0649 - - vra:106772981 1019.61
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vra4g0611 4 11530920 11535724 Vra9g0649 9 7445876 7450052 PCT