Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vra2g1481 ATGGCGACGGCTTCACATGCTCGAGCTGTGAAGTCTCTCAACAAGTCCTCTGGTCGAGGCCGTTTTGTCTTCAAGTCATTCTCGGAGAGAGTAAACGAGATTGATATCAATGTATATCGAAGTCTCGAGAAGGTCAAAGCCGAACCATCTGAGGGTTCTTCGTTTTTTAGAGACTGCCTTATAGAATGGAGGGAGTTGAACACTGCTGAGGATTTTATCTCATTTTATGAAGAAATCATGCCTTATACACAAACATTGCCCCTTGTGCTGTTGCATAAGGAATCTTTAATTTTAAAGCTTCTTTCTAGGTTGCACATTAAAGCAAGGCTATCTCTTGATGCAATTCTCAGTTTAATTGCTGCTTTATCCAGGGATCTCCTCGAGGAATTTGTTCCACTGTTGCCAAGAATTGTTGAATCTTTAGTATCTCTTCTTGAGAATGGTGGTGATAGGGAGCCAGATATCATTGAGCAGATATTCATGTCATGGTCTTACATCATGATGTATCTGCAAAAATATTTAGTACGGAACCCATCAGAGGTGCTCAAGGTCACGTCAAAACTAAGGTATTATCCTAACAAATATGTCCGACAGTTCATGGCAGAAGCTATGTCATTTGTTTTGAGAAATTCCCCAGACGAGCAGCTAGAAAGAGGAATCAGGAGATTGATTGACGATGCTGTGAAGAAGCCATCTCTGTGTAGAGAAGGTGTTGAGGCATTGCTCTTTAATATTATGAAAGGTTCCACATCCAGGTTCCATTCAAAAGCAGAGCGAGTGTTACAATTGTTGATCAGTGAAGCAATTTATCCTATTGGTGATAAAGCTAGCCAAGATTCAATGGCCATTGTGAAAATTGTTAAATCTGTCCTCAAGAAACTATGTGAGAAGATGGAGTCTAAGGAGCTGAATTTGGTATGGAATTGTTTATATAAGGAAACAGATGAATGTCTTAATACTGGAAATATCAGGCACTTACAATATACTTTATCAGTACTTGTCTCAGCTATAAAGGTGCAAAATGGGCAAAAAGTGTCTGATTATAAGCCTGTGTTGAAACTAGCTTTGCGGCTTGTGCAGACATTTACCAAAGCTTCTGGAGTTATTGATTCACAAGATATGGATCTAGTTGTTGATAGAATTTTGAAATTAATGTTGGCCATTCTCAAAGGACTCTGTAATTGCAATACCTCAATGATACCAGAGTGTGCCCTCCAGTGGGCTCCAATTTTTAAATCAGGAAGCTCAAGTTTGCTGTCTTTCATTAGAAAATTGCTACACGAGGATCTTTGTTTATTTCATTTCAGAAGTAATGTTATAAGTGCAATGAATGATTTGATGGAGATTTCAGAGGAAGAGGTCATACATTTGTTGCAGTCTTTCTGTGAGAAAATGCAATTAGACATACTTAACTCAGACTTAGTCAATGGAACAAGTGAAGAAGCACCGTTGGCTAGAGTTTGCAGTCGTTTGCAAAAGATAATCAGCTATTGGAAGGAAAAAATAAATGATATTGCTCGTGCTGATGTATTATGTGAAATTAATGAAGGAATGTTGGCACATTTGTGGGGAGCTGTGAGCTGCTATTCTCATATGTGTATTGTAGGTGGCAATCCTTCCTTGATGGTGGAGCTCATGGATGCTCTAGATCATCTTCTGACTGCTAAAGCTGGTTACATTGGAGATATGTCTAAAAGGGCCTTGGAAAGCATTATAGGTGCGGCATTAAGTTCTTACAACAGATTGTGCAAGCACAGTTTCTGTGGAGCTGATGAAACTGGGAAGTTTTTAAGTCTTGCAAAACGATATAAATTGTCTCCACCAGTGTTGTTGGCTGTTGCTGATTATTTGGAATTCAAGTACGGTTCTTCATTGGAAAACAATGGGTGTAGAATTTATAATCCAGAGCTCGAAGAAAAGACAGCAGATGCAGTGGCAATTTTTTCTGATAATTTGCATCACTCAGACAAGGAGATTCGCATTTCAACTCTAAAAATACTATGCCACTGTAAACCTTTAGTTTGGGAAAGTTCTTCAGTGGATGAGGCTGCTGATATGAAAAAGAAAACTGAAGTTTCTCCAACTTCCAATGCTGATTTCACAGAAAATAATGCTCTTCTGTTGCTCCTATCCCTTGAAACAACTCCTATTTCAATTTCTACAAGCAGAAGCATTCAGCTATTGATTTCCAAGATTCAGATGAAACTATCTGCTGGAAGGATTCCTAATGTTTATGTGCCTCTGGTTTTGAATGGATTGCTGGGCGTCTTGAATAATCGATTTAGCCACCTATGGAATCCTGTATTAGAATGCATTGCTGTCTTGATTAGTGTACATCATTCACATGTATGGAATAGTCTTGTGGATTATATAGAAAGGTGTCAAGCAACATTTCTTACCCCTTGTAACTTGCACGCTAGTGACAATGGTGCTTTGTTTGGTCATCCAGCTGGTCTACTTGATTGTTTCAAATTGTTTGTCTGCCATGCAACTGATAGCACACCGACTGTAACAATATTAGTGCTATTACTGCAAGCTTTGCAAAAAATTCCAGCTGTTATCGAACCTCACTCTCGGCAGTTCATTCCTTTATTTTTGAAATTTTTGGGCTACAACACTCTTGATCTTGCAAGCGTGGGATTGTTTGATTCTGTTTCTTGTGAAGGCAAAGAGTGGAAGACCGTCTTGAAAGAATGGTTAAACTTGTTGAAGCTAATGAAAAATCCTAAGTCATTTTACTGTGGCCAGTTTCTTAAGGGGGTTCTGCAGAATAGGCTTTTAGAAGAAAATGATCCTGAAATACAGATGCGAGTTTTGGATTGCTTGTTAATCTGGAAGGATGATTACATTTTACCATATATTGAGCATTTAAGAAACTTGATTAATTCCAAAAATTTAAGGGAGGAACTGACAACATGGAGTTTATCGAGAGAATCTGAATATATTGAAGAATGCCACCGAGCTTATCTTGTGCCATTAGTTATCCGTCTTTTGATGCCAAGAGTAAGAAAGTTGAAAGGACTTGCATCTCGAAAGAAAGCAAGCATTTGTCACCGGAAAGCTATTCTGAGTTTTGTAGCTGGAGTTGATGTCATTGAGTTGCCTCTTTTCTTTGCGCTACTGATAAAGCCCTTGCAAATAGTGAAGAAAACAGATGGGCCTGCTAATTTGTTTTGGACTTTACCTACAGGTTCTATTAATGAATTTCAAGATGCTGCTTTGTTGGAATATTTCACTTTCGACAATATAGCAAATCTATCCTGGAAAAAGAAATATGGTTTTTTGCATGTCATTGAAGACATTGTTGCAGTTTTTGATGAATTGCATATTAGGCCATTTCTTGATCTTCTAGTGGGCTGTGTTGTCCGGTTATTAGAGAGCTGCACTTTAAGTCTTAGTGCAAATTTGAGCAGGCTTCCTTCAGAGCAGCATAATTCTAGCCCTAAAAACTGTATTGGGGAGGACAGTTTGCCAACAGACCAAATCAAGATCAGTGGTAATTTGAATCAGCTGAAGGATATGAGATCTCTATGCCTGAGAATTATTTCTCTTGTGCTCAATAAGTACGAAGATCATGAATTTTGTCCTGATTGGTGGGATAAATTCTTTTCTGCAGTAAAACCTCTTATTGAGAAATTTAAACAGGAGACTGCTAGTAGTGAGAAACCAAGTTCACTGTTATCTTGCTTTACGGCAATGAGTGCAAACAATAAACTTGTAGCACTATTATGCTGGAAAGAAAGCCTTGTACCAGATATATTTTCCATTATCTCTGTCAATTCAGCTTCTGAAACTGTTGTATATTGTGTTTTAAAGTTTGTTGAAAACTTGTTAAACCTTGACAATCAGTTTAATGGTGAAGACAACGCTGCTCAAACAGTTTTACTTTCAAACATAGAAGTACTGGTGGACAGCATGTGCTGTTTATTTGGAAGAGATAATGCAGTCAAGAGAAAGCTGATCAAATCTCCTGGGGAGACAGTGATAAGAATTTTCAAATTTTTACCCAAGTACATCAGACATGCAGAGTTGGCAAAGCAATTCGTGGACATCTTGCTTTTGTTTATGGAAAAGAATACTCAAAATTCTGATGTCTGGGTTGAAGTTTTGCAAGTCATTCAGAATATTTTACCAACACTAGGACATGAAAGTACCACTAAAATTCTAAGGGCTGTTTCTCCATTATATATTTCGGCCGAGTTGGATATGCGATTGAGAATCTGTGATCTTCTTGATGCTCTTGTAGCTTCCAATGCATCTATACTCCCAATGGCAAAACTTCTCCGTCAGCTGAATACAACGTCTACTTTGGGTTGGCTAGATCATGATGCCATTTTGGACGCATACGGAATCATTAATATCGATTTCTTCGGAAATGTTCAAGTGGAGCAAGCATTACTTATTTTGTCACATTGTGTGCATGACATGTCATCAGAAGAAACAACTTTTATGTGTAGTGCGCATAGTTCATTGCTGTCTTTTGTTGATTTTTCTGCTCTCATCCTTCACCAAGAAGAAAACAGTGAAGAACATATGTCTGTGATGAAAAGCACTGATGATTGTTGGACAAAATCTTGCATCCAGCGTGTAGCCAAGAAATTTCTCTTGAAGCATATGGCAGATGCGATGGATGGATCACTTTCAGTTATAAAGGGATGGATAAAATTGTTACATCAAATGGTGTTGAAGCTTCCAGAAGTATCAAACCTTAAATCACTTATGGCTTTGTGCAACGAAGATGGTGAAGCAGTTTTTTTTGACAATATAAGTGACTCAGTGATACGTAAGAGAGTTAAGGCATTGTCATGGTTTCGAAATGTTGTCAGTGTGAACAAGCTTTCAGAGTTCATCACTGAAAAAGTGTTCCTGCGACTCTTCTTCAACATGTTGTTTGATGAGAAAGAAGAAAAGGCAGAACATTTGAAAAATGCATGCATAGAGACCATTGCTTCTGTAGCTGGTCAGATGGGATGGAAATCATACTATACATTATTGATCAGATGTCTTCGAGGTGCATCCAGTAGTTCAGATAAACAGAAACTCTTTATACGCCTAATTTGCTATATTTTGGATAAATTTCACTTTTATGATAAAGAACCTAAGGAACCTTTGGATGGGGTTTCTGACAAAGAGATGAGGGATACTGATGTGAACAAAGAGATACAGACATGCCTATGTAAAAATGTGCTTCCAAAGATACAAAAGTTACTGGATTCTGAATCTGAAAAGGTCAATGTAAATATCAGTCTTGCTGCACTGAAGCTTCTTAAATTACTTCCTGGAGATGTGATGGACTTGTATCTTCCAACAATTGTTCATCGAATATCAAACTTCTTGAAGAGCCATCTAGAAAGCATCCGTGATGAAGCTAGGTCTGCATTGGCCACTTGTTTGAAAGAACTTGGATTGGAATACTTGCAGTTCATTGTCAAGGTTTTGCAATCTACCTTGAAGCGAGGATATGAACTTCATGTCTTAGGATACACACTTAATTTTATTTTGTCCAAGTGTCTTTCAACTCCAGTTGTCGGAAAGATAGATTACTGTTTGGAGGATCTGCTTTCTGTGATAGAGAATGACATTCTAGGAGATGTTGCCGATCAAAAAGAGGTGGAAAAGATAGCTTCAAAAATGAAAGAAACGCGGAAGAAAAAGTCATTGGAAAGCTTGAAATTTGTGGCCCAAAATATTACATTCAAAAGCTATGCCCTGAAGCTCCTTGCACCAGTGACTTCTCATCTGCAGAAGCACATCACACCAAATGTAAAAGGAAAATTGGAAAGTATGTTACATCATATGGCTACTGGTATTGAAAGCAATCCCTCTGTAGATCAAACTGATCTATTTATCTTCATTTATGGCATTGTTGAAGATGGATTAAAAGACGAAATCAGTTGGCATGATAATAAGTTGTTGCAATTGGAAGATAAAGATAGCCATGTTAAAACAAAGAGAATTTCTAAAGGCCCCGTTGTTGCTAAGGGCTTGTTGTGTTCACACCTTATTACAGTGTTTGGTCTCAGAATATTTCATAAACGTATGAAGAGTTTGAAACAGGATGCAAAAGATGAAAATACTTTATCCTTATTAGACCCTTTTGTCAAGCTTTTATGTGATAGCTTGTCCTCAAAGTATGAAGATATCCTGTCAATTTCCCTTCTATGCCTTGCTATACTGGTAAGGTTGCCTTTACCATCCCTTCAACAACATGCTGAGAGATTAAAGGCTTCTCTGTTGGATATTGCCCAGGGTTCAGTCAGCTCTAGCAGTCCTTTAATGCAGTCATGTTTGAAATTGCAGTCTGTGCTTTTGAGGAACACTAAAATTTCTCTCACCTCAGATCAAATAAATTCATTAATTCACCTTCCTATATTTCTTGATATTGAAAAAAATCCATCATTGGATGCCCTATCACTTCTAAAGGGTATAGTCAGCCGCAAGCTGGTGGTGCCTGAAATATATGATCTTGTTACTAGGGTTGCTGAATTGATGGTGACAAGTCAAATTGAAGCAATCCGCAAAAAATGCAGTAAAATTTTCTTGCAATTTCTGCTGGATTATAGACTTTCAGAGAAACGCTTGCAACAACATTTGGATTTCCTGCTCTTAAATTTGGGTTATGAGCATTCAACTGGACGGGAATCTCTTCTTGAAATGATTCATGCTATTATTGTCAAATTTCCAAGAAGTGCTTTGGATGAACAATCTAATATATTATTTCTCCATTTGGTAGTTTGCTTAGCCAATGATAATGATAATATTGTTCGTTCTATGGCTGAAACTGCTATAAAGAAGCTTGTTAGTTCTGTCAGTCCTAATTCATTTAAATCTATTCTTGATTGTGGTCTTTCTTGGTATTTGGAAGGCAAGCAACAGCTATGCGGTGCCCAGGTTCTTGGACTGCTGATTGAAGTGAAAAAGAAAGGATTTCGTGAACATATAAATTCTATCTTGCCTGTGACTAAACACATCTTTAGGTCTGCCATAGATGCAGTTACCAACAGGAAAGAGGGCTTTTCAGATGAATCCGTCATTCCTCTTTGGAAGGAGGCTTACTATTCTCTTGTTATGTTAGAGAAGATGATCAACCAATTCGGTGATTTATGCTTTGCAGAGTATCTTGAGGATATATGGGAAGCAATATGTGAAATGCTGTTGCACCCACATTCACGGGTACGAAACATATCAGTTCGCCTCATAGCCCTCTACTTTGCGCATGTAACAGATGCTACCCGAGAAAATCATGGCACCTCCTTAAGGAGTTATTTTATTATGAGTCCAAGTAGACTATTTCTAATAGCTACTTCTCTTTGCTGCCAACTAAAAATGCCGCTCATAAATGATTCTGACAGCAGCCTGATGACCCAGATTTTTATCTTTGCTATCTGTGGTGTCCATTCTTTGATGGGGCAAAGTGCATGTATAGATCCCCCTGCTTTCTGGTCTACTCTTTCGCAACAAGAAAAGGATCAATTTCTTAAAGCATTTGACTTACTTGATTCAAGAAAAGGAAGAAGCATGTTCATGTCTTCATCTACTGCTTCTATATATGAACACAGCAATCAGCTGAATGTTGACAATGCTCATCGTGCATTAGTCTCATTATTGCTCAAGAAAATGGGGAAGATTGCCCTTCAAATGGATACTATTCAGATGGGAATAGTCTTCAACAGTTTTGGGAATATTATGGCACAGATTAGTCAGGATGACCGCCTATACTATGCACACGTGATCTTGTTACCTCTATACAAAGTTTGTGAAGGATTTGCTGGAAAAGTTGTAATTGAGAGCGACAAGAAGTTGGCGGAAGACACCTGTAGAAAACTAGAGAATATTTTGGGAACTCAGAACTTTGTGCAAGTTTACAACCATATCAGGAAGAATCTTATGTTGAAAAGAAACAAGAGGAGACAAGAAGAAAAGCAAATGGCAGTTATCAATCCGATGCGTAATGCCAAACGGAGGTTGAGAATTTCTGCTAAGAATCGTGCTAACAAAAAGAGAAAGATTATGAAATTAAAAGAAGAAACGTTCAGGGCAGGTATCAAATCGATGCGTAATCCCAAACGGAAGTTGAGAATTTCTGCTGAGAATCATGCTAACAAAAAGAGAAAGAATTTATAG 8124 0.3796 MATASHARAVKSLNKSSGRGRFVFKSFSERVNEIDINVYRSLEKVKAEPSEGSSFFRDCLIEWRELNTAEDFISFYEEIMPYTQTLPLVLLHKESLILKLLSRLHIKARLSLDAILSLIAALSRDLLEEFVPLLPRIVESLVSLLENGGDREPDIIEQIFMSWSYIMMYLQKYLVRNPSEVLKVTSKLRYYPNKYVRQFMAEAMSFVLRNSPDEQLERGIRRLIDDAVKKPSLCREGVEALLFNIMKGSTSRFHSKAERVLQLLISEAIYPIGDKASQDSMAIVKIVKSVLKKLCEKMESKELNLVWNCLYKETDECLNTGNIRHLQYTLSVLVSAIKVQNGQKVSDYKPVLKLALRLVQTFTKASGVIDSQDMDLVVDRILKLMLAILKGLCNCNTSMIPECALQWAPIFKSGSSSLLSFIRKLLHEDLCLFHFRSNVISAMNDLMEISEEEVIHLLQSFCEKMQLDILNSDLVNGTSEEAPLARVCSRLQKIISYWKEKINDIARADVLCEINEGMLAHLWGAVSCYSHMCIVGGNPSLMVELMDALDHLLTAKAGYIGDMSKRALESIIGAALSSYNRLCKHSFCGADETGKFLSLAKRYKLSPPVLLAVADYLEFKYGSSLENNGCRIYNPELEEKTADAVAIFSDNLHHSDKEIRISTLKILCHCKPLVWESSSVDEAADMKKKTEVSPTSNADFTENNALLLLLSLETTPISISTSRSIQLLISKIQMKLSAGRIPNVYVPLVLNGLLGVLNNRFSHLWNPVLECIAVLISVHHSHVWNSLVDYIERCQATFLTPCNLHASDNGALFGHPAGLLDCFKLFVCHATDSTPTVTILVLLLQALQKIPAVIEPHSRQFIPLFLKFLGYNTLDLASVGLFDSVSCEGKEWKTVLKEWLNLLKLMKNPKSFYCGQFLKGVLQNRLLEENDPEIQMRVLDCLLIWKDDYILPYIEHLRNLINSKNLREELTTWSLSRESEYIEECHRAYLVPLVIRLLMPRVRKLKGLASRKKASICHRKAILSFVAGVDVIELPLFFALLIKPLQIVKKTDGPANLFWTLPTGSINEFQDAALLEYFTFDNIANLSWKKKYGFLHVIEDIVAVFDELHIRPFLDLLVGCVVRLLESCTLSLSANLSRLPSEQHNSSPKNCIGEDSLPTDQIKISGNLNQLKDMRSLCLRIISLVLNKYEDHEFCPDWWDKFFSAVKPLIEKFKQETASSEKPSSLLSCFTAMSANNKLVALLCWKESLVPDIFSIISVNSASETVVYCVLKFVENLLNLDNQFNGEDNAAQTVLLSNIEVLVDSMCCLFGRDNAVKRKLIKSPGETVIRIFKFLPKYIRHAELAKQFVDILLLFMEKNTQNSDVWVEVLQVIQNILPTLGHESTTKILRAVSPLYISAELDMRLRICDLLDALVASNASILPMAKLLRQLNTTSTLGWLDHDAILDAYGIINIDFFGNVQVEQALLILSHCVHDMSSEETTFMCSAHSSLLSFVDFSALILHQEENSEEHMSVMKSTDDCWTKSCIQRVAKKFLLKHMADAMDGSLSVIKGWIKLLHQMVLKLPEVSNLKSLMALCNEDGEAVFFDNISDSVIRKRVKALSWFRNVVSVNKLSEFITEKVFLRLFFNMLFDEKEEKAEHLKNACIETIASVAGQMGWKSYYTLLIRCLRGASSSSDKQKLFIRLICYILDKFHFYDKEPKEPLDGVSDKEMRDTDVNKEIQTCLCKNVLPKIQKLLDSESEKVNVNISLAALKLLKLLPGDVMDLYLPTIVHRISNFLKSHLESIRDEARSALATCLKELGLEYLQFIVKVLQSTLKRGYELHVLGYTLNFILSKCLSTPVVGKIDYCLEDLLSVIENDILGDVADQKEVEKIASKMKETRKKKSLESLKFVAQNITFKSYALKLLAPVTSHLQKHITPNVKGKLESMLHHMATGIESNPSVDQTDLFIFIYGIVEDGLKDEISWHDNKLLQLEDKDSHVKTKRISKGPVVAKGLLCSHLITVFGLRIFHKRMKSLKQDAKDENTLSLLDPFVKLLCDSLSSKYEDILSISLLCLAILVRLPLPSLQQHAERLKASLLDIAQGSVSSSSPLMQSCLKLQSVLLRNTKISLTSDQINSLIHLPIFLDIEKNPSLDALSLLKGIVSRKLVVPEIYDLVTRVAELMVTSQIEAIRKKCSKIFLQFLLDYRLSEKRLQQHLDFLLLNLGYEHSTGRESLLEMIHAIIVKFPRSALDEQSNILFLHLVVCLANDNDNIVRSMAETAIKKLVSSVSPNSFKSILDCGLSWYLEGKQQLCGAQVLGLLIEVKKKGFREHINSILPVTKHIFRSAIDAVTNRKEGFSDESVIPLWKEAYYSLVMLEKMINQFGDLCFAEYLEDIWEAICEMLLHPHSRVRNISVRLIALYFAHVTDATRENHGTSLRSYFIMSPSRLFLIATSLCCQLKMPLINDSDSSLMTQIFIFAICGVHSLMGQSACIDPPAFWSTLSQQEKDQFLKAFDLLDSRKGRSMFMSSSTASIYEHSNQLNVDNAHRALVSLLLKKMGKIALQMDTIQMGIVFNSFGNIMAQISQDDRLYYAHVILLPLYKVCEGFAGKVVIESDKKLAEDTCRKLENILGTQNFVQVYNHIRKNLMLKRNKRRQEEKQMAVINPMRNAKRRLRISAKNRANKKRKIMKLKEETFRAGIKSMRNPKRKLRISAENHANKKRKNL* 2708
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vra2g1481 2707 Gene3D - 1584 1983 IPR011989 -
Vra2g1481 2707 PANTHER UNCHARACTERIZED 3 2671 - -
Vra2g1481 2707 SUPERFAMILY ARM repeat 1343 2405 IPR016024 -
Vra2g1481 2707 SUPERFAMILY ARM repeat 630 1419 IPR016024 -
Vra2g1481 2707 Pfam Down-regulated in metastasis 891 1516 IPR011430 -
Vra2g1481 2707 SUPERFAMILY ARM repeat 109 872 IPR016024 -
Vra2g1481 2707 Coils Coil 2656 2676 - -
Vra2g1481 2707 Pfam Domain of unknown function (DUF6700) 1740 1955 IPR046523 -
Vra2g1481 2707 Gene3D - 2188 2419 IPR011989 -
Vra2g1481 2707 Gene3D - 83 487 IPR011989 -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vra2g1481 K14772 - gmx:100811612 4328.86