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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi6g03496 ATGGCGACTCTATCGAGTTGCACTTTATTGCATCTAAACTCTGAGTTCCGCTTCAACCCGGTTCGCCGCTCCTTCAGGACCACAATTCAGTGCCACCGTCTCAATTCACATGTATCCAAATGGGGGAAGTTGAAGCACGTTGATTTCGATAGGTTTAGGTGTTTTTCGATTGATAATAAAGACGGTGTTGATGGTGAAGGGGAAAGTGGGAAGAATAATGATTCTAAATCCAATGTAACCACCGCGGCGCCTGAGGAAGATAGAGGATTCAGTTCTGATAAACCAACGACTCCCTCTACTTCTCAAAGGTCATCTCTGTCCTCACTTGGATCTGCATACAACAATTTTCAACTTGATTCATTCAAACTCATGGAACTCCTTGGACCTGAGAAGGTTGATCCTGCTGATGTAAAGCTAATCAAGGATAAGCTTTTTGGTTATTCAACCTTTTGGGTGACCAAAGAGGAGCCTTTTGGGGAATTGGGAGAAGGCGTTCTTTTCATAGGAAATTTAAGGGGAAAGAGAGAGGATGTTTATTCCATACTCCAAAATCGGCTAGTTGAGGCCACTGGTGATAAGTACAACCTTTTTATGGTGGAGGAACCTGGTTCAGACAGTCCTGATCCACGAGGTGGGCCACGTGTTAGCTTTGGTTTGCTACGCAAGGAGGTTTCTGAGCCCGAGGCAACAACACTTTGGCAATACGTCATTGCATCTTTGTTGTTTTTTCTCACCATTGGTACCTCAGTGGAGCTAGGAATTGCATCTCAGATCAACAGACTTCCCCCGGAACTTGTGAAATTCTTGACAGATCCTAACTATACGCAAGCCCCGGATATGGAGCTGCTATATCCATTTGTTGACTCAGCGTTACCTCTAGCATATGGTGTCTTGGGGGTTCTTTTGTTTCATGAGGTTGGACACTTTTTAGCTGCATTTCCCAAACAAGTAAAATTAAGCATTCCTTTCTTCATTCCCCACATCACACTTGGCAGCTTTGGTGCTATTACTCAGTTTAAATCCATCCTTCCGGATAGAAGTACGCAAGTAGACATATCACTTGCGGGTCCCTTTGCTGGTACTGTGCTATCATTTTCAATGTTTGCCGTTGGTCTTCTTCTTTCATCAAATCCAGATGCAGCTGGAGATTTGGTGCAAGTTCCTAGCACGTTGTTTCAAGGTTCCTTGCTTCTTGGTTTAATCAGTAGAGCGAGTCTTGGTTATGCGGCAATTCATGCTGCAACAGTTCCAATTCATCCTCTTGTGATTGCAGGATGGTGTGGTTTAACCATCCAAGCTTTTAACATGCTTCCAGTGGGGTGCCTTGATGGTGGCAGGTCTGTGCAGGGTGCTTTTGGAAAAGGTGCACTAACGGTCTTTGGTTTGACCACTTATTCACTGCTAGGGTTGGGAGTGCTTGGTGGACCTCTTTCACTTGCTTGGGGATGTTTTATTATATTTGCGCAGAGGTCACCGGAGAAACCATGCTTAAACGATGTGACAGAAGTTGGAACATGGAGACAAACATTTGTGGGGGTTGCTATTTTTCTTGCTGTCTTAACTCTTCTGCCTGTTTGGGATGAGCTTGCAGATGAACTTGGCATAGGTCTTGTAACCACACTTTAG 1626 0.4459 MATLSSCTLLHLNSEFRFNPVRRSFRTTIQCHRLNSHVSKWGKLKHVDFDRFRCFSIDNKDGVDGEGESGKNNDSKSNVTTAAPEEDRGFSSDKPTTPSTSQRSSLSSLGSAYNNFQLDSFKLMELLGPEKVDPADVKLIKDKLFGYSTFWVTKEEPFGELGEGVLFIGNLRGKREDVYSILQNRLVEATGDKYNLFMVEEPGSDSPDPRGGPRVSFGLLRKEVSEPEATTLWQYVIASLLFFLTIGTSVELGIASQINRLPPELVKFLTDPNYTQAPDMELLYPFVDSALPLAYGVLGVLLFHEVGHFLAAFPKQVKLSIPFFIPHITLGSFGAITQFKSILPDRSTQVDISLAGPFAGTVLSFSMFAVGLLLSSNPDAAGDLVQVPSTLFQGSLLLGLISRASLGYAAIHAATVPIHPLVIAGWCGLTIQAFNMLPVGCLDGGRSVQGAFGKGALTVFGLTTYSLLGLGVLGGPLSLAWGCFIIFAQRSPEKPCLNDVTEVGTWRQTFVGVAIFLAVLTLLPVWDELADELGIGLVTTL 541
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi6g03496 541 CDD S2P-M50_like_2 240 466 - -
Vivi6g03496 541 PANTHER ZINC METALLOPROTEASE EGY1 53 535 IPR044838 -
Vivi6g03496 541 MobiDBLite consensus disorder prediction 93 107 - -
Vivi6g03496 541 MobiDBLite consensus disorder prediction 63 107 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi6g03496 K25380 - gmx:100808073 836.639
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vivi6g03496 6 127637835 127642819 Vivi6g03496 6 127637835 127642819 ECH