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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi5g03064 ATGGCCGATACAAGCTCCGCAGACGCCTCACTGTGGTGGGATTCATTCACTCTCCTCTTCTCCGAGCTTGAGAATTCCTCCCTCTCCTCAGATCTCCCACTAAATTTGGCCAAGAAGTTGAAGGACAATCATGCCTGGTTCTTGAATGCGCTCTCTTGCTTCAAACCGCCCAATCAGAAGTCTAAGGAAGCTTTGAATTCAAAGAAGCTGAAAATTGGATCTCATCAGCTTACTATTCAATCTCAGTTGAAAGATAAAGCTCTGCAAATTAGCTCCTGTTTGCTATTAGACGAAGTTCAATCGTACATAGTTGTTGAAAGGTTCATTGAACATAACAGTGCAGCTGCTGATTCCACGGCTCCAGAGTTTCTTCACACTATATTAATTCAATATTACAAGGAGCGGCAGTGTTTGTTGAAATGCATCAGGTGGATTCTCATGCGAGCTATATACATTGGTGCTGTGTCTGAAAACAATTTTGTGAAGGAGGAGGCAAAAGAGCTATTTCATGATGGACTGGAAAGTAAATTAGTATCTTTCTTGGAGGGTCTTTTATCCTGCAGTTACCCTGAGCAAATGGATGTTGATCTGTTTACTCTATGGGCTGAGGAGACTCTAATTGAAGACAATTTGGTTTTAGACATTCTTTTTCTAGCCTATTATGACCCATTTTGTACATGTGGTAGTGGGATATGGAAGAAGTTTGGTTCTATTTACAAGGGGATCTTAGCTGGTGAATATAACTTAGGAAAGCTGTCAATTACTTCCGAAGCACAGCAGTTATCTTATTATGTCAAAGTTCAGCTGCTGCTTATTTTAATAGAAACCCTAAACTTGGAGAATCTTCTTCAAATGGTTCATGACGAAACACCATACAGGAAAGGTGCATATACTTTCTCCTTTACTGATGTGCAAGAGATGGATACACTAGTTTCTACTTTCAGTGCTTGTGAAATGAACGAAGCTGGTCCTCTAGTTCTAGCATGGGCAGTATTTCTTTATCTACTCTCTACACTCCCGGGAAAAGATGGGAACAATGAGCTCATCGAGATTGATCACATTGGTTATGTTCGTCAAGCCTTTGAGGCTGGATCATTACACTATTGTCTTGAAATTCTTCAGTGTGACATTTTGAAGGATTATGATGGCCCGGTTTCCGGTTATCGCAGTGTTCTGAGGACATTAATATCTGCATTTATTGCATCTTATGAGATCAACCTTCAGGTACAGCCTGAGGACAGTAACTCTGCTTTGATACTGGATATTATCTGCAAGATTTATCGCGGAGAGGAATCTCTGTGTATTCAGTTTTGGGACAAGGGAAGTTTTATTGATGGTCCAATTCGGAGTCTTCTTTGCAACATAGAGAGCGAGTTCCCTTTCAGGACAGTAGAGCTTGTTAAACTCCTTTCATCCCTTTGTGAAGGAACTTGGCCTGCAGAGTGTGTGTATACCTTTCTAGATAGATCTGTTGGTATATCTTCCTTGTTCGAGATCAATAGTGATTTGCTAGCAAGTGATGACTACCATATTCTTGAGGCACAACAAGCAGTGCAGGTTCCTGGAATTGAAGGCTTGTTTGTTCCACCTGGAACTCGTGGGCGTGTCTTGAAAGTTGTAGGAGAGGAAACTTCCCTTGTACGATGGGAGTTACCCCCATCTGGAGTATATGTGTTACTCTTACACTTGGCACAAGATATGTATCTGAATAAAAAGGAGGAAGTTTTTTTCACTCTTGACCTGCTCAATAGATTGGTTTCCTTCAACACTGCTGTTTGTTTTGCAATGATGGACATTAGCAACTCCATGCAATTTCATGATATTAAACTGACAAATGAGCAAGTTGAAAAGAATGTCTGGGTGGTTGAGATGATTTGCAATTTAGTTAAAAACCTGCCTCTGGATTCCTACGGTGCTGCGCTTATGTCTATCGGTGTTAGGATTTTAGGTGTCATGTTGATTTGTTCTCCATCTAATGTTACAGCAGTTGCTCTAAATGCAAATCTATTTGATATCACTTTGCAGACTGCTGTGTTCAGTGTAAGCAGTAATGATTTGTCAAGTGGGTCATGGATGCTTTCTGGCAGACTGGCTAGAATGCTTTTAATTGACTGTGAGCAAAACAGTAATGACTACCCCTTGACAATATCAGTGCTAGACTTCACCATAGAGCTTGTAGAAACAGGAGTAGAGAATGATGTTCTCCTGGCATTGATCATTTTCTCTTTTCAGTATGTCCTGGTCAATCATGAGTACTGGAAATACAGGATAAAACATATTAGATGGAAAATAACATTGAAGGTTCTCGAGTTGATGAAAAAATGCATTATATTAATGCCGTATTGTGGAAAATTGGGTGAGATCATACACAATGTGTTGTTCTCTGATTCTTCCATCCACAACGCGCTTTTTCATATTGCTTGCACTACTGCACATGCTTTGGAGAAATTGAATGCAAGCCGTTTCTTCGATCCATTGGAAATTGAAGGGTTGCACCTTGCTATAGGTTCTGTTTTAGATATTCTTTCAGAGATGACCACCAAGCTTTCTAAGGATACATCATCCAGCATTCCTGTTTTTCTTCAGGCAGTGTTCTCATGCACAACCAAACCGGTTCCTGTTGTCACTTCTGCTATATCGTTGATTTCATACTTCCGAGACCCTGTCATCCAACTTGGTGCTGTCAAGTTTATTTCAACATTATTTGCCACAACAGACTGTGTCCAATCATTTTCATGTGAAACCACATACTTTGCTCCAGATAATCAGGAGATCATAAATTTGAGGCACTCTATGAGCTACATACTCCGGGAGAAATCAGAATCAAATGAAGATCTCTTTGTTGCAACAGTTAACCTGCTTACTTCTGCAGCAAACTACCAGCCTTCTTTTATTGTTTCCATCTTGGCTCCGGGGGAGAAGAATGAGGACCCCTCAAGTACCGATGAAGCAAAGCTACAAAGAAATGAAACTTATGCGCCTAAAGGTTCTAGTCTGATAGATGCACTTATAAACTACATTGAGCGGGCAGATGATCTGATCAAAAGTAAGCCCCGCATACTGCTTTGTGTGCTTAACTTCCTGACTGCCTTATGGCAAGGAGCCCCCCAGTATGCAAATCTCTTAGAGTCTCTAAGAAGCCACGCAAATTTCTGGAAGCACTTGGCCAATGCAATCACAAGTACTGCTAGCAGTGAAAATCCCTTATTTGAGAGTCTGAAAGGAAAAGATGCACTTAATCTGGCATACAGTTTCCGTTGTCAATCTGCCATACTGGGAATCATGGCATATGAAATATTCTTGCAGAAAAAGTTGTTGCATGCAGAGTCACTTGTGAAGAATACAGCAGAATCTAAGGACAAGGAGCAAAATGCCACAAAAACTGAAAAATCTAAAGCCACAGATTTTCATGATCTTAAGGGAGTCTGGTCTTCATGGTTCAAAGATTCTGTTTTAGAGAAACTAATAAAAACATATACTTCTTGTGCACATAATAATGATGTATATGATGGTGCAAAGGTGGCCACCAGTTTATTCTGTGTTCATGTGATGTTAAAATTAGCAGTTAACGACTCCGGAAGTTTATCCGTGTCCTTGCTTCAGAAGATTCATGGAATTGTTACGAAGCTGACAATTCATCCCGCCTTCTCTGAATTGCTATCTCAGTATTCACACCGTGGTTACAGTGAGGGGAAGGAACTAAAGAAGTTGATTTTTAATGACCTTTATTATCATTTACAAGGAGAGCTTGAAGGGAGAAAAATGGGTATCGGACCTTTCAAAGAGTTATCTCAGTATCTTGTTGAATCAAATTTTTTGGGATCCTATCAACACCAGTTCAGTGAAGATTTTTTCGCAAAGAATATTTACTTGTTTGACCTTACACAATTGCGAGCAGATTTGAACTTAGGTGCTTGGGATTGTTCTGATTGGAGAACATCTAAGGAAATTGCAGAAACCATGTTGCGTTTCCTGCAGGATGCAAACGCCGTTATGTTGCTTTCGAGTTCAAAGCTTTCTGCATTAAAAGAATTGATAGCTGTGTTGGCTGTCTATCATGATGAATCAAAAGGGAGGGCTACTACTGGAGATAGAATTCAAAATGAACTCATATTCACCTGTATGGATAACATATGCCAATCTTTCCTTGCTACCATTGAGACGTTATCACCAGTTCTGGATGCTTCTGAGGATATGCTCAATATTCTAGCTTGTCAAGTAGAATTGCTTCTCCTGTTGACTAGAACTGTTTGCAAAGACTTATCCACAGACATTTCACTACTTGTTATGAAATGCGCAAGTTCAGGTCTAAAATTGTTAAGTGAACTCAAGCTGTTACCTTCCAAAGCCAATTTGATCGTGAAATTATTACTCACATTGCTGCTTTTGGTACTTGAGTCCAACTCCCTCAATTTGAATTCTGATGCGGCAGCAGACAAAGGTTCTGGTAAGGATTTCTCAAAGGTTTCAAATGCAACCCTTGGCCTACTACCCATTCTTTGCAACTGCATTACAACTTCTGAGCATTGCATGCTCTCCCTGTCGGTCATGGACCTGATATTGGGAAGCTTCTTGATGCCGAGAACGTGGTTACCTGTCCTGCAGAATCACCTCCAAATGCAGTTTGTCATGCTAAAACTCCAAGATGAAAATTCTTCTACCATTCCGATTATACTGAAGTTCTTTTTGACCATTGCCCAGACTAGAGGAGCTGCTGAGATGCTTTATTGTTCTGGCTTCTTGTCATCATTGAGAGTGCTGTTTTCTCAGTTTGGTGAGGCTTTCTCGAGAATCGGTGGCCCGAATATGGGCGCAAGTGAAAAGTTGGAAATACCTCAAGACATTTGGGGACTCGGATTAGCTGTTGTTACTGCTATGGTTCAATCACTGGGCGACAGTTCTTCTGGCACTGCTATAGTGGAAAGCATGATGCCTTACTTTTTTTCAGAGAAAGCTCATCTTATCTTCAATTCTCTTGATGCCCCAGACTTCCCTTCCGA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1958
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi5g03064 1958 PANTHER NUCLEOPORIN NUP188 HOMOLOG 10 1956 IPR044840 GO:0017056
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi5g03064 Vivi-Chr5 119044214 119076458 Tandem
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi5g03064 K14311 - gmx:100796560 2980.66
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vivi5g03064 5 119044214 119076458 Vivi5g03064 5 119044214 119076458 ECH