Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi5g02959 ATGGATGATCCCAACAACAAAGGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTCATCTCTTCACGACTCTTCACCTTCTTCATCTTTCTTATCACAACCTTTCTTACCCAAAACCCCAATTTCAACATACCCATCATTAGAAAACCATGATTCCCAACAAGAATCTGACTCCAATCAACAGTATCTTCACATCTCATACAATCACGGTCCTCGTTCCTTCAAAGACCTTCCTTTTCTTATCCTCTTCCTCATCTTCGTTCTCTCCACTTTCGCTTTCGGAATCTTCTCAATCGTCCATAGAAACAACTTCTCAGCAATCTCTTCTTATACCTATGATTCTAACACCACCTCATGCAGTATCATCAACCCTTCCCTTTCAGTTTCAGTTTCATCAACCTCTTCCACCAGTTTTCGCTCTTCGTCTTCGCCTTTTGTGAAGGATTTAACATGGACGCTTGTTATCACTTTTGTTATAAGCCTACCCATGTGCTGGTCGCTTCTTCTTTTGCTCAAGCATTACACCAAACACCTTGTCTACGCTTCGATTCCGTTCTTTATTGTCATCCCGATTTTCCTTAATGTTTACTGGTTTGTTGCTTGCGCTATCAAAAGCTCTTGTAGTGATGCTTTTCCTCTGGTGTATAGAATTTTGGTGTTGGGTTTTGTTTTTTTGGTGATTGGTGTGATTGTGTGGATCCTTGTTGTGAATTGGCACCGTGTGGAGCTTACTGTGAGTATAATTGGGGTTGCCTCTGATGCGCTTTCTTGGAACATGGGTTTGTTTGGGGTGCTTCCTTGTTTGACAATTGGGCTTTTTGTGTATTATGTGCCTATTGTGGTGTTTTTGGTGTTTGCTAAGTATAATGGTGAGGTTGTGCCTAAGAAATTGCGTAGTGGATATGGTTGTGTTTGGAAGGAGGATTCTTGGGTGCCGGCTTATTTTGCATTGGCGATACTTACTATGTTGTGGTCAGCAGCAGCTATGCTTGAAGCTCAGGTTTATGTCATTAGTGGGACTATTGCTCGGTGGTATTTCTCCAAGGATTTGGAGGTTCCTACAAAGAGCATTAGAACTTCACTCAGAAATGCTTTTGGTCCTTCCTCTGGAACAGTATGTTTGTCGGGATTGCTTATCTTTGTTGTTCGAGTGGTGCGCTCTGTGGTTGATAATGCAAGACAAGAAGGGACTCCTGGGCTAGTGAACATTGTTTTAAGGTGCTGTGTAAATGCCTTACTGACAGCTGTCGATTTTCTCAATAAGTTTACCATCAACTTTGCTGCAATAACCGGTGAAGCTTACTGCTCATCAGCAAGGATGACATATGAACTTCTTAGACGTAACCTTCTCTCTGCTGTTTTTGTGGAGACCATATCATCCCGCCTCCTGGTTGGAATTGTTTTTGTCCTATCAGCAATATACACAATTGTGGCCTGTGTTATCTTAAAAGCTGCAACCAATCTCGAGTCTGATGCATATTTTGTGGCAGCGGCAGCATGGCTTCTACTGATAATAGTCCTGGGTTTCCTGGTGCATGTGCTCGACATTGTAATCGATACAATATATGTCTGCTACGCAATAGACAGAGACAGAGGAGAGGTTTGTAAACAAGACGTTCACGAGGTTTACGTTCACTTACCCATAAGTAGAAGTATGAGACAATCTAACATTACAAGAACTCTAGGTGTATAA 1698 0.4105 MDDPNNKGNNNNNNNNNNNNSSLHDSSPSSSFLSQPFLPKTPISTYPSLENHDSQQESDSNQQYLHISYNHGPRSFKDLPFLILFLIFVLSTFAFGIFSIVHRNNFSAISSYTYDSNTTSCSIINPSLSVSVSSTSSTSFRSSSSPFVKDLTWTLVITFVISLPMCWSLLLLLKHYTKHLVYASIPFFIVIPIFLNVYWFVACAIKSSCSDAFPLVYRILVLGFVFLVIGVIVWILVVNWHRVELTVSIIGVASDALSWNMGLFGVLPCLTIGLFVYYVPIVVFLVFAKYNGEVVPKKLRSGYGCVWKEDSWVPAYFALAILTMLWSAAAMLEAQVYVISGTIARWYFSKDLEVPTKSIRTSLRNAFGPSSGTVCLSGLLIFVVRVVRSVVDNARQEGTPGLVNIVLRCCVNALLTAVDFLNKFTINFAAITGEAYCSSARMTYELLRRNLLSAVFVETISSRLLVGIVFVLSAIYTIVACVILKAATNLESDAYFVAAAAWLLLIIVLGFLVHVLDIVIDTIYVCYAIDRDRGEVCKQDVHEVYVHLPISRSMRQSNITRTLGV 565
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi5g02959 565 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 33 - -
Vivi5g02959 565 Pfam Plasma-membrane choline transporter 225 532 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Vivi5g02959 565 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 53 531 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi5g02959 - - vvo:131602170 979.548