Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi5g02792 ATGGAGACATATAATATTGTGATTATATTATTATTACTTCTCCCACAAGTAATCTCTCATAGTGATTCCACAACAGATAATGTGTCACAAGTCATTTCACAGCATGACCATACAACAAGAGTGGATCCTCTGGATAATTTCAAAAATTACAAAGGAGGGTTTAACATCACAAATAAGCATTATTGGAGTTCAGTTGTCTTCACAGGAATATATGGATATGCAATTGGGGTTCTCTTGCTTTTCTGTGGAGTTCTATTTGTAACAATTGATTTTTGTGGTGAAGGAATGAGGAATAGGAAAATATTTCCTAATAATTTCAAGGGTTTAGATGTTTGGACAGTTACTTTAGCTATAATGCACATGATATTGGCCATGGTTTTCAGTGGGTTAGTTATTGCATGCGGTGCGAATTTCAATTATCAAGCAAGAACTTCGGTTAATATTATAATCAAAACAACAAATGAAGCATCAGAAATCATACACAATGCAACAGAAGCATTAAAAGAGATCCATGAAGACTTGATGGAATTCAATGTTGATGTTGAAGCTTTTGAAAATCTAGGCTATACAGCTGATAAATTTAATTCTACAACTAAAAATATCATAGAGAAAGGTGTAAAAAATAAGCACATTATTAACAAGGCTTTAAAAGGAGTGTTTGTAATAACCATTGTAATCATAAGCTTATACTTGATTATGCTAATATCTTTGTCAGTTTTTGGAGTACTAAAGTTATGGAGGGCTTGTGATAATGTGCTGGTTGATGATAGTGATATGCTGGTTACTTTTTGGAGTGTATTTAGTTTTGGAAAAGTAAACAAAGTTCTTTCTAGTTTTCTAACTCTCATCATAAGTTATATCCACCATTGTGATGAACTGCTATCGGCGAAACCAATCCTCTCAGAAATTGGTGGAGGGATCTACAATCTAGTAAACGAGGTGAATTCAAACATATCAAATCTACAAGGAACATTGCTGCCAAATGTTGTTCATATATGCAGTCCTTTCACAGCACCACCTGAATATTTATACAGGCCAAATAATTGTCCACTTAATACCATTCAAATAGGAGATATCCCAAAGGTATTAAAACCTTATACATGTTTCGACGAAAAATGTGGCAATGAAGATTTCATATCTTCAAGTGAATATGAGATAGTTGAGTCATACACAAGCTCAATTCAGGATCTATTAAATGTGTATCCTTGTATGGAAGAGTTAATTGAATGTGAGTTGGTGAAAGATGCAATAGCTCAAGTTGTTTTCAAACACTGCAAGCTTTTGAAGGGATTTGCTAAGCTTGTATGGTTAGGAATGGCAATTCTTGCATTGATCATGATGTTTTTGGTTGTGCTATGGATGGCAATAAAGGCTCATCATGATGATCATAGTCATGATGTTCCATGTTCTGTAACATGA 1419 0.3383 METYNIVIILLLLLPQVISHSDSTTDNVSQVISQHDHTTRVDPLDNFKNYKGGFNITNKHYWSSVVFTGIYGYAIGVLLLFCGVLFVTIDFCGEGMRNRKIFPNNFKGLDVWTVTLAIMHMILAMVFSGLVIACGANFNYQARTSVNIIIKTTNEASEIIHNATEALKEIHEDLMEFNVDVEAFENLGYTADKFNSTTKNIIEKGVKNKHIINKALKGVFVITIVIISLYLIMLISLSVFGVLKLWRACDNVLVDDSDMLVTFWSVFSFGKVNKVLSSFLTLIISYIHHCDELLSAKPILSEIGGGIYNLVNEVNSNISNLQGTLLPNVVHICSPFTAPPEYLYRPNNCPLNTIQIGDIPKVLKPYTCFDEKCGNEDFISSSEYEIVESYTSSIQDLLNVYPCMEELIECELVKDAIAQVVFKHCKLLKGFAKLVWLGMAILALIMMFLVVLWMAIKAHHDDHSHDVPCSVT 472
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi5g02792 472 PANTHER TRANSMEMBRANE PROTEIN DDB_G0292058 22 250 IPR040283 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi5g02792 Vivi-Chr5 114565618 114567835 Dispersed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi5g02792 - - vvo:131605197 926.776