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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi5g01562 ATGGGCAGCTATCACGATGCTAATTATTATCCAGGTTCATGGTGCTGTCGGCTAATTTTTTTTGTCATCTGGCTTCCTACTTTCTTAAATGTGACAGCACAAGAATCACATGCCGACCATAGGCGAACCACTTCACTAGTTGAGTTAGCTAAGGAACCCACTTCTGGAGATTCTGGGCTCTTTGAACCCATAGAAATATCACCTTCCGTTATACCTAAAGTTCCATTTCCCACCGAGTCTGTCCCACCAATGTATCCTATTCCTTATGTGCCAACCAGATATGAACCAGTTTTAACCGGTAAGTGCCCTGTAAACTTTTCACGACCTGAAATTGCAAATATCCTCGATAAAGCAGCATATGATTGCTTTCAGCCTTTGGCAGCCCTTGTAGGGAATGTTGTGTGTTGTCCACAGTTTAGTAGCTTAATCCACATCTTCCAGGGTTTCTTTGGCATGAAATCCGATAATCTGGTTTTGTCAAATACAGTGGCTGATCATTGCTTCTCTGATATTGTTAGTATTCTAGCTAGCAGAGGGGCAAATAGTTCATTACCCACACTTTGTTCTATTAAATCATCTAATCTTACAGGCGGGTCATGCCCTGTGAAGGATGATTCTACTTTTGAAAAAACAGTAAACACAAGTAAATTAGTTGAGGCCTGCAGAACTGTTGATCCGCTTAAAGAGTGTTGCAGACCTGTTTGTCGGCCTGCAATTATGGAGGCAGCACTTCAGATTTCTGGCCGACAAATGATGATAAATAGTGACAATATGGCTGGGGAAATGAATCACACTGATTATCTAAATGATTGTAAAGGTGTTGTTTATTCTTATCTTTCCAAACAATTATCATCGGAGGCCGCAAATAAAGCATTCCGGATATTATCTGCCTGCAAAGTCAACAAAGTTTGTCCTTTGACTTTTAAGGAGCCTTCAGATGTAATTGCTGTATGTAAGAATGTAGCTGCTCCTAGTCCTACCTGCTGCAGTTCGTTAAATACATATATTGCAGAGACACAACAAAAAATATTAATTACCAATAAACAAGCTATAATATGTGCAACACAATTTGGATCTATGTTACGTGGAGGTGGGGTGATGACAAATGTTTATGAGCTTTGTGATGTCGATTTGAAAGATTTCAGCATACAAGCAGCGTTTGGACTACAAGATGGAGGATGTCTACTTCGAAGCTTACCGGGAGATGTAATATTTGACAATTCATCTGGCGTTAGCTTTACATGTGATTTAAGTGACAATATTGCTGCACCCTGGCCCTCGTCATCTTCATTTACATCTCTATCATTCTGTGCACCTGAGATGTCATTACCAGCATTACCAATTTCACAGTCATTTAAAAACATTGGTTGTAATTCTGCTGGACTGGATTTCCTTCATATTATATTTTCATTTTTTGTCAGTACAGTTGTACTGAGATTTTAG 1443 0.395 MGSYHDANYYPGSWCCRLIFFVIWLPTFLNVTAQESHADHRRTTSLVELAKEPTSGDSGLFEPIEISPSVIPKVPFPTESVPPMYPIPYVPTRYEPVLTGKCPVNFSRPEIANILDKAAYDCFQPLAALVGNVVCCPQFSSLIHIFQGFFGMKSDNLVLSNTVADHCFSDIVSILASRGANSSLPTLCSIKSSNLTGGSCPVKDDSTFEKTVNTSKLVEACRTVDPLKECCRPVCRPAIMEAALQISGRQMMINSDNMAGEMNHTDYLNDCKGVVYSYLSKQLSSEAANKAFRILSACKVNKVCPLTFKEPSDVIAVCKNVAAPSPTCCSSLNTYIAETQQKILITNKQAIICATQFGSMLRGGGVMTNVYELCDVDLKDFSIQAAFGLQDGGCLLRSLPGDVIFDNSSGVSFTCDLSDNIAAPWPSSSSFTSLSFCAPEMSLPALPISQSFKNIGCNSAGLDFLHIIFSFFVSTVVLRF 480
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi5g01562 480 PANTHER GPI-ANCHORED PROTEIN 11 468 IPR040336 -
Vivi5g01562 480 Pfam SPARK 99 254 IPR043891 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi5g01562 Vivi-Chr5 49243371 49247017 Tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi5g01562 - - vvo:131601642 957.592