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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi4g00532 ATGGCTAGCTTCAAGAACTTGAATGTCATCACAAACTCCACCAAGGCACAAGATTCAACCTTTCTAAACCAAACACTAAGAGGAAATATTGTGAGGAAAATCTTCAAGATTATTTTCTATCTCCACTTGCTTCTAATTTCACTTTTGATAATTTCCCTCACAATCTATAACCTTACTATCTCCACCTCTCAAAACCCTAATTTCCACCCAATGAAATGGTACCCTCCACTCTTAACCTCAACATTATGTGCTGGAGTTTTTAGTTTCACATGGCAATGGATCACTCTCAAGAACCCTGAAAATGCCATCAAAACAACATTTTGGCTTAGCCCTATTCTTACATGTGCAATGGCCATCATGTTGGTCTACATCGAAACTCCGACAAGCCTAACTTTTGGTGTCATTGCTTTGATTTCTTCATTGATTCAATCTCTTTATGGTTGTTGGATCAATCATAGACTTGAATATGCCAACAAAATTTTATCAACTTCAATAGTTGATTTTCCTATCAAAACCATGAGAATAGCCTTTTCATCGACCCTAATCGGAATTTTCTATTGTTTTTTTCTCATGTTTGGAATGGGAGGGTCAAGAGCAATTGAAAACAAAACAAAATCAACATCATTATTCATTTTGTTGATTCTATTAAGCCTAGTATGGACTATGCAATTTCTCAAGAATGTGATTCAAGTAACAATTTCTAGGGTTAAGTATATGAACTTAGGTTGTGGTGAAGAAATCATGGACACAAGTGTTGCATTTCATGACACATTGAACTACTTAATTGGAAGTGTTACAATAGGTTCAATTTTGGTTCCATTTATCTCAACCTTTAGGGGTTTTGCTAGGTCAATGAGTCTCATTGGAGGAGATAGTGATGAGTTCATGTTTTCTTTTAATAGTTGCTATATGGGAATTGCAACAATTCTTGTAAGGTGTGGAAATAGGTTTGGTTTTGTGCATGTTGGTGTTTATAATAAAGGGTTTGTGCAAAGTTCTTGCGATGTATGGGACATTTTCAATAGGGTTGGATTGGTGCAACTTGTGGATTTGGATCTTACTGGATCATTTTGTTTTCTTAGTGGTGTGGCAGGGGGTGCAATTAGTAGTTTGGTGGGTGGTATTTGGAGTATTGTGGTGTATAAGAAATATGCAACTGAAGTGTCTATTTATGGATTCTTAATTGGATACTTTATGGTTAGATTGGGTTTGGCATGGATACAAGCATGTGTTAGTGCTTACTATGTTGCTTATGCAGAGAATCCACAAAGTACTCATTTTGACTCAACTATTCCAATGCGTTCGGAACAGTTGTATAGATCTCAAGTTTAA 1332 0.3604 MASFKNLNVITNSTKAQDSTFLNQTLRGNIVRKIFKIIFYLHLLLISLLIISLTIYNLTISTSQNPNFHPMKWYPPLLTSTLCAGVFSFTWQWITLKNPENAIKTTFWLSPILTCAMAIMLVYIETPTSLTFGVIALISSLIQSLYGCWINHRLEYANKILSTSIVDFPIKTMRIAFSSTLIGIFYCFFLMFGMGGSRAIENKTKSTSLFILLILLSLVWTMQFLKNVIQVTISRVKYMNLGCGEEIMDTSVAFHDTLNYLIGSVTIGSILVPFISTFRGFARSMSLIGGDSDEFMFSFNSCYMGIATILVRCGNRFGFVHVGVYNKGFVQSSCDVWDIFNRVGLVQLVDLDLTGSFCFLSGVAGGAISSLVGGIWSIVVYKKYATEVSIYGFLIGYFMVRLGLAWIQACVSAYYVAYAENPQSTHFDSTIPMRSEQLYRSQV 443
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi4g00532 443 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 34 431 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Vivi4g00532 443 Pfam Plasma-membrane choline transporter 136 422 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi4g00532 Vivi-Chr4 11932979 11935038 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi4g00532 - - gmx:100818674 526.939