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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi3g04580 ATGCAAACCACATTCACCAACTTCATCACTCTCTTCTTCTTCTTCATATCACATTTCATCATGGGAAGAGGAAAACCATGCAGTGTATTTTCTCAAATGGAAAAAACCATAAACGACACCGTTTTAAACAGTTTCATAGGAAAATACTTCAAGTTAAACCAAAGAAAAACATGTTTCACCAAAGAACTCCGAGCCGCAACCGCCACTTTCCTCACCATGGCTTACATCATAACCGTCAACGCCACCATCCTAACCGCTTCCGGCGGAACATGCTCCGTCGCCGACTGTTCTCCTCCGGCCACACCAGATTGCACGTTAAAGCCAAACGCCGGCTACGAAACTTGTCTCGCGAAAACTAAAAACGACCTGGTGGTTGCAACTGCCGTATCCGCCATGGTTTCTTCTCTCGCTATGGGCTTATTAGCGAACCTTCCTTTGGGCCTTGCTCCGGGTATGGGGCCTAATGCTTATTTGGCTTTTAACCTTGTTGGTTATCATGGAAGCGGTTCGATTGATTATCGAACCGCGATTACGGTTGTTTTTGTGGAAGGTTGTGCTTTTCTGTTTGTTTCTGTTTTTGGTTTAAGAGGGAAGCTTGCTAAGCTTATACCTCAGTCTGTTAGGCTTGCTTGTGCTGCTGGGATTGGGCTTTTTATTGCTTTTGTGGGCTTACAAAGTAACCAAGGTGTTGGGCTTATTGGGCCTGATGCGTCGAATTTGGTTACTATTACTGCTTGTAAGAATGTTGACCTTGAAACTGGGGCTTGCTTGGGTGGGAAGTTACAAAGTCCTAAGTTCTGGCTTGGGGTTTTAGGGTTTCTTATTACAAGCTATGGTTTGATGAAGAATGTTAAGGGGAGTATGATTTATGGGATTGTTTTTGTGACTTTTGTGTCATGGTTTAGACATACTGAGGTCACTTATTTTCCTGATACATTGGTTGGTGATGGGAATTTTGATTATTTTAAGAAAATTGTTGATTTTCATACGATTGAATCAACTGCATGGGTTTTTAAGTTTAGTGATTTTAATAGAAGGGAGGTATGGGAGGCTTTGGCTACTTTGTTTTATGTTGATGTGATTGCGATGACGGGGATAATGTATACTATGGCTGAGATTGGAGAGTTCGTGGATGAGAAAGGGAATTTCGAAGGTGAATATATGGCTTATATTGTTGATGCGGCCGGTACTATTGCTGGGTCGGCTTTAGGTGTTACAACGACTGCGACATTTGTTGAATCGTCGGCTGGGATGAGGGAAGGTGGTAGGACGGGGCTAACTGCTGTGTTTATAGGGCTGTTTTTCTTTTTGTCGTTGTTTTTTACTCCTCTTTTGACGAGTGTTCCTCCGTGGGCTATAGGTCCATCGTTGGTGATGGTTGGGGTGACGATGATGAAAGTTGTGAAGGATATTGATTGGAGTAATGTGAAGGAAGCGGTTCCGGCTTTTGCTATAATGATTTTAATGCCTCTGACTTATTCCATAGCAAATGGGATTGTTGCTGGTATTGGTCTTTATGTTGCTCTCAGTCTTTTTGACTATGCTGCAAGCATCATAAGTTGGTTGGGGAAAATGAGAAAAATGGTGATCAAAGAGCATAACCAAGTGTCTGCCACTGCCACAAGTGTTGACCCAGTAGTGGAAAATGTTTGA 1653 0.4283 MQTTFTNFITLFFFFISHFIMGRGKPCSVFSQMEKTINDTVLNSFIGKYFKLNQRKTCFTKELRAATATFLTMAYIITVNATILTASGGTCSVADCSPPATPDCTLKPNAGYETCLAKTKNDLVVATAVSAMVSSLAMGLLANLPLGLAPGMGPNAYLAFNLVGYHGSGSIDYRTAITVVFVEGCAFLFVSVFGLRGKLAKLIPQSVRLACAAGIGLFIAFVGLQSNQGVGLIGPDASNLVTITACKNVDLETGACLGGKLQSPKFWLGVLGFLITSYGLMKNVKGSMIYGIVFVTFVSWFRHTEVTYFPDTLVGDGNFDYFKKIVDFHTIESTAWVFKFSDFNRREVWEALATLFYVDVIAMTGIMYTMAEIGEFVDEKGNFEGEYMAYIVDAAGTIAGSALGVTTTATFVESSAGMREGGRTGLTAVFIGLFFFLSLFFTPLLTSVPPWAIGPSLVMVGVTMMKVVKDIDWSNVKEAVPAFAIMILMPLTYSIANGIVAGIGLYVALSLFDYAASIISWLGKMRKMVIKEHNQVSATATSVDPVVENV 550
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi3g04580 550 PANTHER XANTHINE/URACIL PERMEASE C887.17-RELATED 32 538 IPR045018 GO:0015205
Vivi3g04580 550 Pfam Permease family 120 498 IPR006043 GO:0016020|GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi3g04580 Vivi-Chr3 82992000 82993891 Dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi3g04580 K06901 - gmx:100808299 772.696
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vivi3g04580 3 82992000 82993891 Vivi3g04580 3 82992000 82993891 ECH