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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi3g01338 ATGTCTAAGGTTTTTGGCTTTACCGGGAGTGATGATTTTTGTACTGGGAGGTCAGTATACCTTAATCCCAAGGAAGCTGGTCTCTTCTTGTCACTTGGCTGTCAAAAATATGCTTACAAGCCTCGTCAGAAGAGATCTCGCGTCAGTGTTCCGTTTGATTTCAGTGGAGATAAGTGGTTTGAGCCGAAGCCAGATGCATCTATTGAAACATTGCCGGATGAATGCCTCTTTGAGATTCTTAGAAGGTTGCCTGCTGGCCAAGATAGGAGTTTGTGTGCTTCGGTATCCAAGCGCTGGCTTATGCATCTAAGCAATATCTGCAAGGATGAAATTTGCAAGGATCTTGGTAGCGGAAATGGCGATCAAGGATTTGGTGATGAAGGGTGTCTTTCTCGTAGATTGGAAGGGAAAAAGGCGTCAGATGTTAGACTAGCTGCTGTTGCTGTTGGCACAGCATCTCGAGGAGGATTGGGAAAGCTTTCGATCAATGGATGCAATTCAGATTCTGCGTTGACTAATGCAGGTCTCAAGGCAGTTGCTCATGGCTGCCCTTCTCTAAAGATTTTCACTCTTTGGGATGTTGATACCGTTAACGATGAAGGCTTGATTGAGATTGCTAATGGTTGTCACAAGTTAGAGAAGCTTGACCTTTGCAAGTTACAAAATATTTCTGACAAGGCTTTAATTGCCATTGCACAGAACTGCCCAAAGCTGACCGAGTTATCGATCGAGTCGTGTCCTAATATCGGTAATGAAGGTCTACCAGCTATTGGGAAGTTTTGTCCCAATCTAAGGTCTATATCAATTAAGAACTGTCCAAGAGTTGGTGATATGGGAATTGTTGGCATGGTATCTTCAGCATCCTTTGGTCTAACAAAGATGACACTTGAGTCGCTAGCTGTTTCTGATTACTCTCTAGCAGTTATTGGACAATATGGATTTGCTATTACCGATCTTACCCTAAATTCCCTCTCATATGTCACTGAGAAGGGATTCTGGGTGATGGGTAATGGCCATGCACTGCAGAAACTAACCTCACTCACAATTGGGTCGTGCTCTGGAGTAACAGATATTGGGCTTGGCGCAATCGGAAAGGGTTGTCCAAATGTGAAAAACTTTCAGCTTTATAAGTGTGCTTTTCTGTCCGACAATGGGCTGGTATCATTCTCCAAGGCTGCCCCATCAATTGTGAGCCTACATTTGGAAGAGTGCCACAGGGTTACCCAATTTGGGCTTTTCGGTCTCCTTTACAACTGTGGTTCAAAATTGAAGGCTCTTACTCTTGTGAGCTGCTATGGGATCAAAGATCTGAAACTGGAATTGACTGCAATATCTCACTGTGAATCAATTTCGTCACTATCAATCCGTAACTGCCCGGGGGTTGGTAACTCTACACTTGCCATCCTTGGAAAGCTATGTCCTCAGCTTCAGCGTCTTGAGTTGATTGCACTTGAGGGAATAACAGACACAGGGTTTCTTTATCTGCTTGAGAGGTCTAAGTCCAGTTTGGTTAATGTTAATCTAAGCCGTTGCATTAATCTGACAGATGCAGGAGTTTCGTCCATGGTCAAGTTGCACAGAAAGACTCTCAAAGTGTTAAACCTCAACGGCTGCAGAAGAGTCGGTGATTCTAGCTTGACAGAAATTGCAGGCAGCTGTCCAGCACTCACAGATCTTGATGTTTCCAGGTGCGCTATCACTGATGCAGGAATTGCTGCCCTTGCCCGTGTAGTCCTGCCCAATTTGGATGTACTTTCTTTGGCAGGCTGCCCCTTGGTTACAAACAAGAGCATGCCCGCTTTGAAAAAACTGGGCGATTCTCTCGAGGGATTAAATATAAAAAATTGCAAGGCGATCAGCAGCTGCACGGTTGACAAGCTTATTGAAAGTCTCTGGGTATGTGACATCCTCTTCTGA 1917 0.446 MSKVFGFTGSDDFCTGRSVYLNPKEAGLFLSLGCQKYAYKPRQKRSRVSVPFDFSGDKWFEPKPDASIETLPDECLFEILRRLPAGQDRSLCASVSKRWLMHLSNICKDEICKDLGSGNGDQGFGDEGCLSRRLEGKKASDVRLAAVAVGTASRGGLGKLSINGCNSDSALTNAGLKAVAHGCPSLKIFTLWDVDTVNDEGLIEIANGCHKLEKLDLCKLQNISDKALIAIAQNCPKLTELSIESCPNIGNEGLPAIGKFCPNLRSISIKNCPRVGDMGIVGMVSSASFGLTKMTLESLAVSDYSLAVIGQYGFAITDLTLNSLSYVTEKGFWVMGNGHALQKLTSLTIGSCSGVTDIGLGAIGKGCPNVKNFQLYKCAFLSDNGLVSFSKAAPSIVSLHLEECHRVTQFGLFGLLYNCGSKLKALTLVSCYGIKDLKLELTAISHCESISSLSIRNCPGVGNSTLAILGKLCPQLQRLELIALEGITDTGFLYLLERSKSSLVNVNLSRCINLTDAGVSSMVKLHRKTLKVLNLNGCRRVGDSSLTEIAGSCPALTDLDVSRCAITDAGIAALARVVLPNLDVLSLAGCPLVTNKSMPALKKLGDSLEGLNIKNCKAISSCTVDKLIESLWVCDILF 638
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi3g01338 638 SUPERFAMILY F-box domain 61 104 IPR036047 GO:0005515
Vivi3g01338 638 Gene3D - 61 113 - -
Vivi3g01338 638 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 248 438 - -
Vivi3g01338 638 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 440 637 IPR032675 -
Vivi3g01338 638 SUPERFAMILY RNI-like 157 284 - -
Vivi3g01338 638 Pfam Leucine Rich repeat 529 550 IPR001611 GO:0005515
Vivi3g01338 638 Pfam Leucine Rich repeat 234 257 IPR001611 GO:0005515
Vivi3g01338 638 Pfam Leucine Rich repeat 553 575 IPR001611 GO:0005515
Vivi3g01338 638 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 362 439 IPR032675 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 579 604 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 235 260 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 473 498 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 341 366 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 553 577 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 527 552 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 500 525 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 209 234 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 183 208 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 447 472 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 393 418 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 261 286 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 SMART LRR_CC_2 367 392 IPR006553 -
Vivi3g01338 638 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 129 247 - -
Vivi3g01338 638 SUPERFAMILY RNI-like 316 634 - -
Vivi3g01338 638 PANTHER UNCHARACTERIZED 479 621 - -
Vivi3g01338 638 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 151 353 IPR032675 -
Vivi3g01338 638 Pfam F-box domain 71 107 IPR001810 GO:0005515
Vivi3g01338 638 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 499 636 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi3g01338 Vivi-Chr3 21828917 21832494 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi3g01338 K14515 - gmx:100805418 895.96
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vivi3g01338 3 21828917 21832494 Vivi3g01338 3 21828917 21832494 ECH
Vivi4g05095 4 181970805 181974389 Vivi3g01338 3 21828917 21832494 PCT