Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi3g01318 ATGAACCACCGCGACATGATGGCGAATGATATCAATGCCATGCTCGACAATGCACAACCGCAGTTAACCGACGATTGTTGCATTTACAAGGTCCCCTTTGATATTCGCAGACTCAATGACGACGCATACACCCCCAAAGTCATTTCCATAGGCCCTTTTCACCACCGTCACCACCAACATCCCCGCCTCCAAAACATGGAACGACACAAACTTATTTACTTCAAAGCATTTCTCCATCGTGCTGAGGCAACTATACAACCTTTGATTCACTATGTAGATTCTATCATACCTAATTTTCGTCATTGTTATTCCGAAACCTTAGACTTTACCGATCAGGAACTCGTTGAATTAATCTTAATCGATTCTGCTTTCATAATTGAACTTTTTTGTCGATCCTATAACAATGTTGCTTGGTCTCAAGTTGATGCTCTTCTCTTAAAACCTTGCATAGCTAATAATATAAGACTAGATTTGTTATTACTTGAAAATCAATTACCCTTTTTTGTTGTTGAAAAAATCTTCAATATTTCTTTTAGTGCTAAGACTAATTTCCCTTCTTTTCTTGAGCTCACTTATTATTATTTTTCTTATTACAACAAATCAAATTTGGCTTCTAATAATAATGATATTAGCATAAGGCATTTCACTGATCTAATTAGAATTTTCTACTTGCAACATCCATTTGACAAACGACCGCGTAGAATTGATGAATCGATGAATCTTCTTCATAGTGTAACTGAATTGTTAGAAGCAGGTGTTAGGTTTAAAGTGAACACAAAAAGTAATTGTTTACTTGACTTGAGGTTTTCGGGTGGAGTTCTTGAAATTCCTCAATTAAGAGTCGAGGATATGACTGAGATTTTGTTACGGAATATGGTTGCTTTGGAGCAATGTCATTACCCTTATGAATCCTACATTACCGATTACATTGGAATTTTGGATTTTCTTATTAATACCGGAAGGGATGCGGATATACTTGTTAAGAAGGGGATATTGGTTAATTGGCTTGGGGATAGTGATTCTGTGGCTAACTTGTTTAATAGTATTGGTAAAAATGTTGCACTTACTAATTCCAATTTTGATTACTATGTTCTTTGTAAGGACTTGAACGATTTTTTTAGTGATCCTTTGCATAAATTGAAGGCTACTCTCAGGCGCGACTATTGTAGCAATCCTTGGCAAACTGCTGCTACCGTTGCTGGAATTTTACTACTCATTCTCTCTTTACTTCAATCAGTTTGTTCTGTCTTGCAAGTTGTATAG 1263 0.361 MNHRDMMANDINAMLDNAQPQLTDDCCIYKVPFDIRRLNDDAYTPKVISIGPFHHRHHQHPRLQNMERHKLIYFKAFLHRAEATIQPLIHYVDSIIPNFRHCYSETLDFTDQELVELILIDSAFIIELFCRSYNNVAWSQVDALLLKPCIANNIRLDLLLLENQLPFFVVEKIFNISFSAKTNFPSFLELTYYYFSYYNKSNLASNNNDISIRHFTDLIRIFYLQHPFDKRPRRIDESMNLLHSVTELLEAGVRFKVNTKSNCLLDLRFSGGVLEIPQLRVEDMTEILLRNMVALEQCHYPYESYITDYIGILDFLINTGRDADILVKKGILVNWLGDSDSVANLFNSIGKNVALTNSNFDYYVLCKDLNDFFSDPLHKLKATLRRDYCSNPWQTAATVAGILLLILSLLQSVCSVLQVV 420
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi3g01318 420 PANTHER BNAC04G53230D PROTEIN 9 419 - -
Vivi3g01318 420 Pfam Plant protein of unknown function 28 407 IPR004158 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi3g01318 Vivi-Chr3 21592595 21593986 Tandem
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi3g01318 - - gmx:100786337 494.967
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vivi3g01318 3 21592595 21593986 Vivi3g01318 3 21592595 21593986 ECH