Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun9g01429 ATGGGTAGAGATCTCTGTGCAACTTCAAAACTCAGAGCCTTCACAAACTCTTTCTCCCAGATGGAGAAAGCTCTAAACGATGCCGTTTCCAAGAGCTTTGTGGGCACCTACTTCAAGTTGGAACAGAGGAAAAGTTGCTTCACAAGGGAGCTTCGTGCTGCCATCGCAACTTTTCTCACCATGGCTTACATCATTACCGTCAACGCCACCATCATCGCTGCCTCCGGCGGAACATGCTCCGTCGCCGACTGCTCCTCTCCGGCGGGCCCAGACTGCAGGGTGAAGCCCAACGTTGGTTACGAGAGGTGTCTTGCCAAGACCAAGAGTGACTTGGTTGTGGCCACTGCCGTTTCTGCTCTTGTTGGGTCTGTTGCCATGGGCCTGTTGGCTAACCTTCCTTTGGGCCTGGCTCCGGGCATGGGGCCCAATGCTTACTTCACTTTTAATTTGGTTGGGTTTCATGGAAGCGGGTCAATCTCGTATCAAACTGCATTGGCTGTGATTTTGGTTGAGGGTTGTGCTTTTCTGTTTATCTCTGCTGTTGGGTTGAGAGGGAAGCTTGCCAAGCTCATTCCTCATTCAGTGAGGCTGGGCTGCGCAGCTGGGATCGGGCTTTTCATCGCCTTTACGGGCCTGCAGTCAAGCCTCGGTGTTGGGCTTATTGGGGCCGACCCTTCCAGCCTGGTAACCATCACGGCCTGTAGGATTGTGGACCCAGAAACAGGAGCGTGCTTGGGTGGGAAACTGCAAAGCCCAAAGTTCTGGCTGGGCCTTGTGGGGTTCCTGATTACAAGCTATGGAGTGATGAAGAATATGAAGGGAAGCATGATCTATGGCATTGTTTTTGTGACTTTTGTGTCTTGGTTTAGGCACACCGAAGTTACTTATTTTCCTGACACCCCAGTTGGTGATGCAAGTTATGAGTATTTCAAGCAAGTTGTTGGTTTTCACAAGATTGAATCCACTGCTGGAATGGTGAGGTTTAGTGATTTTAACCAAAAGGAGGTTTGGGTGGCTTTGGGTACTTTGTTCTATGTTGATGTGCTTGCGATCACTGGGACTATGTACACGATGGCAGAGATTGGTGGACTTTTGGATGAAAAGGGACATTTTGAAGGTGAGTACGTGGCTTACATGGTTGATGCAGGAAGCACGATTGTGGGTTCTGCATTGGGTGTGACAAGCACAGCAACATTTGTGGAATCATCGGCTGGTTTGAGAGAAGGTGGTCGCACCGGATTAACAGCAGTTTTGGTTGGGTTGTTGTTCTTGTTGTCACTGTTTTTCACTCCTCTGTTGTCTAGTGTTCCTCCTTGGGCTATAGGACCCTCACTTGTGATGGTTGGAGTGATGATGATGAAGGTGGTGAAGGACATAGATTGGAGCAACACCAAGGATGCAGTGCCTGCTTTTGCCACAATGCTTCTAATGCCTCTCACATATTCCATAGCAAATGGGATCATTGCCGGGATTGGACTCTACATTGCTCTCAGCCTCTATGATTATGCCGCAAGTAGTGTGAATTGGTTGAGGAAGATGAGGAGAATGGTGGCCAAGGAACAAAACCAAGTTTCTGCTACTGCAGCAGTGGAAATAATATGA 1602 0.49 MGRDLCATSKLRAFTNSFSQMEKALNDAVSKSFVGTYFKLEQRKSCFTRELRAAIATFLTMAYIITVNATIIAASGGTCSVADCSSPAGPDCRVKPNVGYERCLAKTKSDLVVATAVSALVGSVAMGLLANLPLGLAPGMGPNAYFTFNLVGFHGSGSISYQTALAVILVEGCAFLFISAVGLRGKLAKLIPHSVRLGCAAGIGLFIAFTGLQSSLGVGLIGADPSSLVTITACRIVDPETGACLGGKLQSPKFWLGLVGFLITSYGVMKNMKGSMIYGIVFVTFVSWFRHTEVTYFPDTPVGDASYEYFKQVVGFHKIESTAGMVRFSDFNQKEVWVALGTLFYVDVLAITGTMYTMAEIGGLLDEKGHFEGEYVAYMVDAGSTIVGSALGVTSTATFVESSAGLREGGRTGLTAVLVGLLFLLSLFFTPLLSSVPPWAIGPSLVMVGVMMMKVVKDIDWSNTKDAVPAFATMLLMPLTYSIANGIIAGIGLYIALSLYDYAASSVNWLRKMRRMVAKEQNQVSATAAVEII 533
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun9g01429 533 PANTHER XANTHINE/URACIL PERMEASE C887.17-RELATED 21 525 IPR045018 GO:0015205
Viun9g01429 533 Pfam Permease family 108 486 IPR006043 GO:0016020|GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun9g01429 Viun-Chr9 15905901 15907850 Dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Viun9g01429 K06901 - gmx:100808299 839.721
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Viun9g01429 9 15905901 15907850 Viun9g01429 9 15905901 15907850 ECH