Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun5g03739 ATGGAACCTAACCCACAACCCTCAGCAAATGGTCCTCCGCCAAAACCCTGGGAACAAGCAGGTTCCTCGTCTGGCCCAGCGCCTTTTAAACCCCCGTCAGCTGGCAATACGAGTGATGTAGTTGAGGCTTCAGGAACTGCGAAACCTGGGGAAATTGTTTCTGCTTCTGATAGGACTGCAGCTGTTAACAGGAATTCTCTTGGGAGGCCCGTGCCCACAAGGCCGTGGGAGCAGAATTATGGAAATAGCACATATGGAGGATATGGTTCTACAATGAATTATAATTCTGGATATGGAACTGGGATGTATGGATCCTCTTATGGTGGACTAGGAGGAGGAATGTATGGATCTTCTTATGGTGGGGGACTTTATGGTGGTAACAGTATGTACAGGGGAGGATATGGTGGTGGCATGTATGGGTCGTCCGGGATGTATGGAGGGGGAATGTATAACAGTGGCTTTGGAGGTCCAATGGGTGGTTATGGCATGGGTGGTGGACCTTATGGAGATCAAGATCCCAACAATCCATTTGGTGGCCCTCCATCCCCACCTGGATTTTGGATTTCTGTCCTACGTGTGATGCAAGGTGTGGTTAATTTTTTTGGTCGAATATCAATACTCATAGACCAGAACACACAGGCTTTCCATCTGTTCATGACTGCACTTCTCCAGCTGTTTGATCGCTCCGGTTTATTGTATGGAGAGCTAGCTAGATTTGTGTTGCGCTTGCTTGGAATTAGAAGTAAGTCCAAGAAGGTTCACCCACCAGGTCCAAATGGACAGCGGCTGCCTGGACCATACAATTCTTCTGGAGATGTAAATTACATTGAGGCACCAAAGGCTGCTCCAAGTGGTGGTTCATGGGACAATGTTTGGGGAAATGACTCCCCTCAATGA 897 0.4816 MEPNPQPSANGPPPKPWEQAGSSSGPAPFKPPSAGNTSDVVEASGTAKPGEIVSASDRTAAVNRNSLGRPVPTRPWEQNYGNSTYGGYGSTMNYNSGYGTGMYGSSYGGLGGGMYGSSYGGGLYGGNSMYRGGYGGGMYGSSGMYGGGMYNSGFGGPMGGYGMGGGPYGDQDPNNPFGGPPSPPGFWISVLRVMQGVVNFFGRISILIDQNTQAFHLFMTALLQLFDRSGLLYGELARFVLRLLGIRSKSKKVHPPGPNGQRLPGPYNSSGDVNYIEAPKAAPSGGSWDNVWGNDSPQ 298
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun5g03739 298 PANTHER PEROXISOMAL MEMBRANE PROTEIN PEX13 12 296 IPR035463 GO:0005777|GO:0016020|GO:0016560
Viun5g03739 298 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 55 - -
Viun5g03739 298 MobiDBLite consensus disorder prediction 251 298 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun5g03739 Viun-Chr5 46253992 46257321 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Viun5g03739 K13344 - pvy:116117162 327.02
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Viun5g03739 5 46253992 46257321 Viun11g02327 11 37493272 37496331 PCT