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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu9g01331 ATGGTGAAGATTCATGTAGGTAACAAGGAAGAAAGCCCCCAAATGGATAGCGGTGGTTATAGTGGTTCGCAGTTAGTTCATCACTTCAGAAGCGTACTTGATGCAGTCAAAACGGGTGATAGAGCGAATTACGACGATCTCGTTAGTTATTTGCACCCAAAGAGGAATCTTAGTCCTGATGAGGTTGCAATTCTTGTGACAACTTTGAAGGCACTTTCTGGAGCAGTGTCCTATATAGATTCTGATCATCACGAATCTCTTCTCTTTGCTGTTTCAAGAATGAGCCTCTGGAATAATGGAACTGAGGTTATGGATGCACTGCTGGAACTCATTACATCTTTGGCTGCTACTAATGGAAAATATATTGATTGGTGTTTGGACATGCTTGTGAAACATTTTGTGCCCCCTTTTTACATGTATGGTTCTCTGGATAACGAGAATGGAATTAACAGGAAAAATAAAGTTCTGTCTCGGGTGCATGCGGCTTTGGAAGAGATAGCTGATTTGGTGCCTCTTGCACCCTTGCGACTATGTCCAATAGTTGTCCAGAACATGCCCAGTGTCTTCAGTAATGATCGTGTGAGTTCATATGATTTTCTCCAGAGGCAACTGAGTGAATTTGTTGTGTATCACTATTATGAGATTGTCCTATATGTTGAGAATATGTTAAAGTTGGAGAGTGGTGCAATTGGAGAAACTGTCGGTTCTACAGTGCTGCCTGCTCTTGTGGATAGGTTGCTAGAGTTGGATGTGGAAATTGGATGGGATGGAATCTTGCAAGAAGATTCCAGAGGCATATTTGATATGGAGTTAGAAGATATTATTAAATTTGCAGAGGATGAGAACTCTGATAGTATGCCTCAGTCAGAGTTGTTAAATAGGAAAAATTTGCAAGGCAAGCAAGACAAAAAGGTTGTTGAAAAGTTAGATAACCTAATTGTGCTAGCTTTATTGCACCTTGAATCCTGTCAAAGCAGTGGCCGATTGGCTGAGGTGTTCGATATTCTACTTCATTCATTCCAGAAAACTGTACTGAATGCATACAAGTCAAAATTTACCCAGTTTGTGATGTTCTATGCGTGTGCACTGGACCCTGAAGGGTGTGGTGTGAAGTTTGCCATGATTCTTGCAGATATGTTTGTTTCTGATGTTAATCCACCTATAACAAGGATGAGTGCTGTTGCTTATCTTGCTAGTTATCTCTCCCGTGCAAAGTTCCTTTCGGCTGCGTTGGTCACTACCATCATACAAAGCTTGGTTGATCAGTGTTATGCTTATTGTAAGTTACGTGATTCTGGTATGAACCCACGAGCACATCAAGTTTTTTATTCTGGGTGTCAGGCTATCATGTACATTCTGTGTTTTCGCATGAGATCACTCATGGACGTTCCTAGGCTTAAATTGCAGCTACTTAATATGCCTATGGAGGCAATCTGGAAACATAAATTGTGTCCGTTGAAGGCAAAGGCTGCTAAACTTTTCATGGCATCAGAGTCATTCGTTTTCAATGACATGCTCGAGTCTGATCTTTCCAAGGCTTTTGGCGGGTTGGATAGACTTGACATGTTCTTTCCTTTTGATCCATGTTTATTGAAGAAAAGTGAAAGCTACATAAGACCACATTTTGTTCGGTGGTCAAAAGTCAGAACTACATACGATGACGATGATGATAACGTTTCCGAAGTCAGTGAGAGTGGCAGTGAAGCGACAGATGATGATTTTGTTGACACTAATACGAAAGATATGATTGATGATGATTTGATGGTGACTGTTGAAGATCTTGATTTTAACCCGGACTTGAACAAAATGTCTATCACGCCTAAAAATTCTTTGAAACATTTGCGAATGCCAGCAAGAATCAGGCCTTCCACTAGTCCAGAGTCTCTATGA 1890 0.4074 MVKIHVGNKEESPQMDSGGYSGSQLVHHFRSVLDAVKTGDRANYDDLVSYLHPKRNLSPDEVAILVTTLKALSGAVSYIDSDHHESLLFAVSRMSLWNNGTEVMDALLELITSLAATNGKYIDWCLDMLVKHFVPPFYMYGSLDNENGINRKNKVLSRVHAALEEIADLVPLAPLRLCPIVVQNMPSVFSNDRVSSYDFLQRQLSEFVVYHYYEIVLYVENMLKLESGAIGETVGSTVLPALVDRLLELDVEIGWDGILQEDSRGIFDMELEDIIKFAEDENSDSMPQSELLNRKNLQGKQDKKVVEKLDNLIVLALLHLESCQSSGRLAEVFDILLHSFQKTVLNAYKSKFTQFVMFYACALDPEGCGVKFAMILADMFVSDVNPPITRMSAVAYLASYLSRAKFLSAALVTTIIQSLVDQCYAYCKLRDSGMNPRAHQVFYSGCQAIMYILCFRMRSLMDVPRLKLQLLNMPMEAIWKHKLCPLKAKAAKLFMASESFVFNDMLESDLSKAFGGLDRLDMFFPFDPCLLKKSESYIRPHFVRWSKVRTTYDDDDDNVSEVSESGSEATDDDFVDTNTKDMIDDDLMVTVEDLDFNPDLNKMSITPKNSLKHLRMPARIRPSTSPESL 629
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu9g01331 629 Pfam RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 23 549 IPR007991 GO:0001181|GO:0006361
Vimu9g01331 629 PANTHER TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IA RRN3 9 627 IPR007991 GO:0001181|GO:0006361
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu9g01331 Vimu-Chr9 21587429 21595255 Dispersed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu9g01331 K15216 - gmx:100814416 957.207