Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu9g01255 ATGTCTTGCTGCAGTGGTAAATGTGGATGCGGAAGCAGCTGCGGTTGTGGCAGCAACTGTGGGGGTTGCAAGATGTACCCGGATTTGAGCTATGCAGAGAAATCAACCACAGAGATTCTTGTTTTGGGTGTTGCACCTGTGAAGGCCCACATCGATGGTGTTGAAATGGGTGTTGCAGCTGAGAACAGTGGTTGCAAGTGTGGATCAAACTGCACCTGTGACCCTTGCAACTGTAAGATAAGTCTATTTGTTGTACCCAATAAATCATGGTGCTATCTGCGAACATGTGCTTCTTTTGACCTTGTGTGCATAGGAACGGTTGTTCGGTTATTGAAACTTCCTTTTGTGGAGGATTACATGTTCCTTAGATGGATTGTGGGATTACTCAAGCTCGGTGAGGTAGGGTATAAGAGTGTGACTGATTCTTTCCACTATGGTATTAGGTACGATGATGCTCATAGTATTGTTTATGACTGGGATAGTCATGATGGTGGTGTATCTATAATGATGATCATGCGATGTCATCATGGTTCAAGAGTCATGGATCAGGGATTGAAGATGAAGGATCGAGAATTGAGCGCGGTAATAGAGGGACAGAGGACGGTGGCAGAGGGTTTAGGTCTTTCGCCAGTAACGGCTCTGTTTGGTGAAGAACAGAAAAAGAAAGCAGCGTCTATGCTTAAACCCTATACCCATACTTCATCTGATCGGGTTAGCGGGTCAATCCACCCTACCCGTGTAAAGAAGTTACGGATGGAGAATGAGAGAGAAACAGGGAAAACAGAGTCGAGAGGGGGGAGCTCCATAATCGACGCCAGTGATGATGACGATGACCTCGAACAAGAAGCCGGTGGGAGATGCGATGTCTCCGGCGTGAATGGCTTTGACAACGACAACTCCGACCGGCTGAGGGCGACCAGCGGCGAGACACAAGGTCTGGTGTTGGCTGTTCACGCGATGGAGAAGATGGTGTTGCATGCGCTGAGTGATTGCTGTTCACTTCGTCGCGCTGTTCTCCCCCGCCACGAGCTTCCGACCATCGATGATGTTTCGCTTGGAGCCTTTCGGGAAGAAGTAGTTCTCTTGGAAGAGCCAATTGGGGTCCTGGCAGATGTTTTGTTTCAAGTCGGAGACTCTACGCCAGGTTCGGGGACTCTACGGGGGTTCGGGGTTTGCACTGAGGAAGCATCCAACATGTGTGAGTGTGTGAGTGGGTTTGAGCCTTTGGATGGTCATGAATGGGGTTATGCTGACTACTATCAAGGTTGTCACCATGTGGACGTCGGGTGTGATGGGGATGATGGGTTTGAAGATCTTGGAGTTGTGAGGTTTGGATTTGGGATTGTGAGTCTTATTCGGGATTGGAAGGTTTTGAGTGGGGTTGTTATTGGGCCGATTGCGGTTTTGGGGGTGGTGGTGGTGACATTGTTGGTGACGGTGAAGAGGAGGGTTGAGAGGAAGAAATTGGAAAAGGATGGTTGA 1482 0.4906 MSCCSGKCGCGSSCGCGSNCGGCKMYPDLSYAEKSTTEILVLGVAPVKAHIDGVEMGVAAENSGCKCGSNCTCDPCNCKISLFVVPNKSWCYLRTCASFDLVCIGTVVRLLKLPFVEDYMFLRWIVGLLKLGEVGYKSVTDSFHYGIRYDDAHSIVYDWDSHDGGVSIMMIMRCHHGSRVMDQGLKMKDRELSAVIEGQRTVAEGLGLSPVTALFGEEQKKKAASMLKPYTHTSSDRVSGSIHPTRVKKLRMENERETGKTESRGGSSIIDASDDDDDLEQEAGGRCDVSGVNGFDNDNSDRLRATSGETQGLVLAVHAMEKMVLHALSDCCSLRRAVLPRHELPTIDDVSLGAFREEVVLLEEPIGVLADVLFQVGDSTPGSGTLRGFGVCTEEASNMCECVSGFEPLDGHEWGYADYYQGCHHVDVGCDGDDGFEDLGVVRFGFGIVSLIRDWKVLSGVVIGPIAVLGVVVVTLLVTVKRRVERKKLEKDG 493
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu9g01255 493 Pfam Metallothionein 1 78 IPR000347 GO:0046872
Vimu9g01255 493 MobiDBLite consensus disorder prediction 249 292 - -
Vimu9g01255 493 PANTHER METALLOTHIONEIN-LIKE PROTEIN 2A 1 79 IPR000347 GO:0046872
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu9g01255 Vimu-Chr9 20463851 20471716 Proximal
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu9g01255 - - cave:132162095 115.546