Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu8g01967 ATGTTGCCAGAGAGTCACTGGAGGGTCGCACAGGGTCATGCAGTACTTGCAAGGGATAGATGCTTTCAACATTGTAAATTCTCATCAGATGGAAAACCAATTGATGGTCCATGGTATATGCATGAACCCCTCTACCTGAGGTGGAAACAATGGGACTGTTGCACTGACTGTAGCTATTACTGTATGCTAGCTAGAGAGGAAGAAAGAACAAAACTTGGTGACAAGCCCGTCAAGTATCATGGAAAATGGCCATTCAGGCGTGTTTATGGAATTCAGGAACCTGTTGCTGTTGCTTTGTCTGCTGTCAATCTTGCCGTTCAATTTCATGGTTGGGTATCCTTTTTCATTCTTGTGTACTATAAGTTGCCTTTGAGGCCAGATAAGAAGACTTACTATGAGTACACTGGATTGTGGCATATTTATGGGATTCTATCCATGAATTCATGGTTGTGGAGTGCTGTTTTTCATAGTAGAGCCGTGGAATTAACAGAGAAGCTGGATCTTTCTTCTGCTGTGGCCTTACTTGGATTCTCTCTAATTCTAACAATACTGCGATGTTTTAACGTGAGGGATGAGGCTACACGAGTCATGATTTCTGCTCCCTTGCTTGCTTTTGTGACAACTCATATCATGTATCTGAATTTCTATGAACTTGCTTATGGTTTGAACAGGATAGTTTGCATGGGAATGGTTGTTGTCCAGCTTCTTATTTGGGCCATTTGGGCCGGCGGTTCGAACCATCCGGCACGGTGGAAGTTGTGGACAGTGGTGGTTGGAGGTGGCTTGGCTATGGTGTTGGAAACATATGACTTCCCACCTTACATGGGATATGTGGATGCTCATGCTCTATGGCATGCAACAAGCATTCCTCTCACATTTCTTTGGTGGAGTTTTGTAAGGGATGATGCTGAGTTTAGAACCTCAGCTATGCTTAAGAAGAGGTTGGATCAGATGAAGAACATGTCACATGCTGCTACCTGCATCCTTTGA 990 0.4384 MLPESHWRVAQGHAVLARDRCFQHCKFSSDGKPIDGPWYMHEPLYLRWKQWDCCTDCSYYCMLAREEERTKLGDKPVKYHGKWPFRRVYGIQEPVAVALSAVNLAVQFHGWVSFFILVYYKLPLRPDKKTYYEYTGLWHIYGILSMNSWLWSAVFHSRAVELTEKLDLSSAVALLGFSLILTILRCFNVRDEATRVMISAPLLAFVTTHIMYLNFYELAYGLNRIVCMGMVVVQLLIWAIWAGGSNHPARWKLWTVVVGGGLAMVLETYDFPPYMGYVDAHALWHATSIPLTFLWWSFVRDDAEFRTSAMLKKRLDQMKNMSHAATCIL 329
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu8g01967 329 PANTHER PER1-RELATED 18 310 IPR007217 GO:0006506
Vimu8g01967 329 Pfam Per1-like family 43 303 IPR007217 GO:0006506
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu8g01967 Vimu-Chr8 25454475 25457515 Dispersed/Transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu8g01967 K23553 - gmx:100793147 599.356
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu8g01967 8 25454475 25457515 Vimu8g01967 8 25454475 25457515 ECH