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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu7g02491 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4872 0.3898 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1623
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu7g02491 1623 Pfam RNA polymerase Rpb1, domain 1 229 350 IPR007080 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Vimu7g02491 1623 Gene3D RNA polymerase Rpb1, domain 3 638 784 IPR042102 -
Vimu7g02491 1623 Gene3D RNA polymerase II, clamp domain 221 335 IPR044893 -
Vimu7g02491 1623 Gene3D - 466 637 - -
Vimu7g02491 1623 CDD RNAP_IV_RPD1_N 237 1007 IPR040403 -
Vimu7g02491 1623 Gene3D - 817 960 IPR038120 -
Vimu7g02491 1623 Gene3D - 1499 1592 - -
Vimu7g02491 1623 SMART rpolaneu7 346 658 IPR006592 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Vimu7g02491 1623 Pfam RNA polymerase Rpb1, domain 2 471 628 IPR000722 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Vimu7g02491 1623 Pfam RNA polymerase Rpb1, domain 4 855 929 IPR007083 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Vimu7g02491 1623 Pfam Protein of unknown function (DUF3223) 1519 1590 - -
Vimu7g02491 1623 SUPERFAMILY beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase 224 1439 - -
Vimu7g02491 1623 PANTHER DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE 233 1437 IPR045867 GO:0003899|GO:0006351
Vimu7g02491 1623 Pfam RNA polymerase Rpb1, domain 3 635 782 IPR007066 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Vimu7g02491 1623 FunFam DNA-directed RNA polymerase subunit 638 776 - -
Vimu7g02491 1623 Gene3D RNA polymerase ii 504 556 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu7g02491 K16250 - gmx:100796185 2290
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu7g02491 7 21248564 21262719 Vimu7g02491 7 21248564 21262719 ECH