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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu10g03340 ATGGGTGCAGAGTCACAAATTCCACGAAGCTTAATCCACAGAATCTACGCTCCCTTGGCTAACGAATTTCATTTTGCACCACCAGTCTCTTCATCCAGAACAAATGAACTCGAACTTGTTCGAGGTGTTCTACGAATGCTGCAAGGGTTTTCTGGTCCCCTGTTCTCTTGGGATAAAAGTGCAAACAGTTTCCGTGCAAAGAGCGGTGTTTACGTTAGCCATCTCTCACAGAAAAGTCTCCACTCTCTTCTCAACCAGTTTATCCACGCCGCTACGTGTCTCCAATCCGTGGCGATTACACTCGATAAAATTGAATTTGCAGTGCCGAAGTCTCCCCCTACTTTGAACGCGTTCGCGTCCTCTGCTTCAGCGTGCCTTCAGCGGTTACGGAATCTTGCCTTGAAGGAGGAAACGTCCTCGAGCAATGCAGATGGAATAACCACTCCAACCTTGTTAGGATTGACCAATTCCTTATCGAGTCTTTGCTCAGGGGCTGAATTTCTATTTCAGGTAGTGCATGAGGCCATTCCTGCTGTATACTTTGAGTTTGGTGTGTCTTTACCAGCAGCAGAACTCACTGTTCACGTGCTTGACTATCTTCATAAGAAGCTTGATGAAATGTGTCTGGTACAAGGTGGTGAGGAGGAAGCTAATCAGATGATGCTTTATATGTATGTTGGAAGCTTGTTGCCGTATATTGAGGGTCTTGATTCCTGGCTTTTTGAAGGGATTCTTGATGATCCTTTTGGTGAGATGTTCTTTTTCACTAATAAAGAAGTCTCGGTTGATGAGGCCGAGTTCTGGGAGAAGAGTTATTTATTAAGAATACTACAGGATAGCAAGTTAAGTTCAGAATTCTCTTCCACAAATTATGGCAATGATTCAACCACAGCATCAGATTACAAGGAAATGGACAGGAGGGATTCCGTCTCTTTGTCTGGTACAATTAAAGGAAAAGAGCCAAGCATTAGAGACCGTCCAGCTTGTCCCTTTTTTATTAACGACTTAGCCAAATCAATAATTTCTGCTGGAAAATCTTTGCAGCTTATGCGCTATGTACCTAATTCCTCAGTGAATTGTACCAAAGAAAGTAATTATGAGGTTGGAAGTGCCAAATGTTTAAATTATGGTTTATATCCTACTCAGAGAATGGCTGGGCTAACCTTGCCGGAAATTTTTTCTGTATCACTAGTTGGACTTCTTGGTCATGGTGACCATGTCTGTAAGTACTTTTGGCAAGAGAACTGGTACGATATTGTAACTGTTTCTTCGCATGCATCTTATGTAAATGAGGAAAAAATAGACAACGACAATAATGAAAAATTAATTGCTCCACCTTATTCAGAGAAGACTTGGTATAAGTTCTTGATTGATACATTATTTCAGAAAAGATCAGCTGACTTAAAGCTAAAATATGAACACATAAATAATGACACATTAGAGCTGAGAGGGGCTAAAGTTATTGAAGATGAAGTGCTACTCTTGGGGTCATACATGGAAAATCCAGTTATAACAGTATGTCGAGAAAATCTTGGAAAGAATGGGAACGCCTTGAAAGCATTGAATTTATCTCGAAAATTCAGCTTGCCTTCATTAAATGATGAGAGTTTAAGAAGAGCTATATTTGGTGCAGAAAGTACTGGATTTTCGGATAGTGAAGGAACAAACTATACTTTTGGCTTTCACTTTGGTGAATCCGAATACCTTCATTCACAGGATGACAGAAAGCTGTTAGAAATGTTATTTCCTTTTCCCACTATTTTACCTCCATTTCAGGATGAGGTTCCTGTGTCAGAGCTCTTACCTTTCCAGAGAAACAGCAGTCTTATTTCTAGAGTTCTTCGATGGATGCAAAATGACCTAAGAACTACTCCACTTCCTCTTGTTATCATGCAGTACTGTCTAACCGTCTACATTCAGAAACAGGTGGATTATATTGGAGTGAATATGCTGTTAAAGTTAATGAATGAATGGAGATTGATGGATGAGCTCGCAGTGTTGAGAGCTATATATTTGTTAGGTTCAGGTGATTTGCTGCAACACTTTCTGACCGTAATTTTCAATAAGTTAGACAAGGGCGAAGCATGGGATGATGATTTTGAATTAAACACAATATTGCAGGAATCAATCAGAAATTCTTCTGATTGTATGCTATTAAGTGCTCCAGATTCATTGGTAGTGACGATAACCAAAAATAGTGTTGACAATGATGAGCAAGCTAGTACAGGTGGTGCTCCTTTGAGTGCTCCTCGTCAAAGTCATGTCAATAGCTTTGGAATTAATGGCCTTGATATGCTCAAATTCACGTATAAGGTCCCTTGGCCTCTTGAACTCATTGCAAATACAGAGGCAATTAAGAAGTACAACCAGGTAATGCGGTTCTTGTTAAAGGTCAAGCGTGCAAAATTCGTATTAGATAAAGTGCGGAGATGGATGTGGAAGGGTAGGGGATCTGCTACAAACTACAGAAAGCATCATTGGTTAGTGGAGCAGAAACTCCTTCATTTTGTGGATGCTTTTCACCAATATGTGATGGATCGGGTATATCACAGTGCATGGCGTGAACTATGTGAGGGTATGGGTGCAGCAAAATCTCTGGATGAAGTTATTGAAGTCCATGAGACTTACATGTTATCAATTCAACGGCAATGCTTTGTGGTTCCTGATAAGCTGGGGGCTCTTATTGCTAGCCGCATCAACAGCATCCTTGGCCTAGCTTTAGACTTTTATAACATACAGCAGACATTAAGTGGTGGTGGAGCTGCTTCTGCCATCAAAGCAAGGTGTGAGATGGAAGTGGACCGAATAGAGAAACAGTTTGATGATTGCATTGCTTTCTTACTTCGGGTATTCTTCTAA 2859 0.4064 MGAESQIPRSLIHRIYAPLANEFHFAPPVSSSRTNELELVRGVLRMLQGFSGPLFSWDKSANSFRAKSGVYVSHLSQKSLHSLLNQFIHAATCLQSVAITLDKIEFAVPKSPPTLNAFASSASACLQRLRNLALKEETSSSNADGITTPTLLGLTNSLSSLCSGAEFLFQVVHEAIPAVYFEFGVSLPAAELTVHVLDYLHKKLDEMCLVQGGEEEANQMMLYMYVGSLLPYIEGLDSWLFEGILDDPFGEMFFFTNKEVSVDEAEFWEKSYLLRILQDSKLSSEFSSTNYGNDSTTASDYKEMDRRDSVSLSGTIKGKEPSIRDRPACPFFINDLAKSIISAGKSLQLMRYVPNSSVNCTKESNYEVGSAKCLNYGLYPTQRMAGLTLPEIFSVSLVGLLGHGDHVCKYFWQENWYDIVTVSSHASYVNEEKIDNDNNEKLIAPPYSEKTWYKFLIDTLFQKRSADLKLKYEHINNDTLELRGAKVIEDEVLLLGSYMENPVITVCRENLGKNGNALKALNLSRKFSLPSLNDESLRRAIFGAESTGFSDSEGTNYTFGFHFGESEYLHSQDDRKLLEMLFPFPTILPPFQDEVPVSELLPFQRNSSLISRVLRWMQNDLRTTPLPLVIMQYCLTVYIQKQVDYIGVNMLLKLMNEWRLMDELAVLRAIYLLGSGDLLQHFLTVIFNKLDKGEAWDDDFELNTILQESIRNSSDCMLLSAPDSLVVTITKNSVDNDEQASTGGAPLSAPRQSHVNSFGINGLDMLKFTYKVPWPLELIANTEAIKKYNQVMRFLLKVKRAKFVLDKVRRWMWKGRGSATNYRKHHWLVEQKLLHFVDAFHQYVMDRVYHSAWRELCEGMGAAKSLDEVIEVHETYMLSIQRQCFVVPDKLGALIASRINSILGLALDFYNIQQTLSGGGAASAIKARCEMEVDRIEKQFDDCIAFLLRVFF 952
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu10g03340 952 Pfam Gamma tubulin complex component C-terminal 660 950 IPR040457 GO:0043015
Vimu10g03340 952 Gene3D - 660 951 IPR042241 -
Vimu10g03340 952 PANTHER GAMMA TUBULIN COMPLEX PROTEIN 31 948 IPR007259 GO:0000226|GO:0000922|GO:0005815|GO:0007020|GO:0043015
Vimu10g03340 952 Pfam Gamma tubulin complex component N-terminal 40 364 IPR041470 -
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vimu10g03340 2 707 Glycosyltransferase AT1G20570 49.096 0.0 587
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu10g03340 K16572 - gmx:100782299 1679.46
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu10g03340 10 43515707 43524491 Vimu10g03340 10 43515707 43524491 ECH