Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu10g01230 ATGATTCATTTCAGCCTTTTTCACTTAATTTACTGTTCCCACAATCTGCAGTCTGACCCCCAAGATATGTTACATCTGAGGAAAAGCCTTTTAAGAGCAACTCTGTGCCATCTTAATTGGAAGGGTTGTTCTATGTTAAATGAGCAGATGACTTTTCTCATTCCTAGTGCTATATATGCACTTTCTATAGGTGTTGTTCCTTTTACTCAATGCTTTAAAGAAGTTCCTTTGGCTCACAATTATTTTGATGTCACTGATGCTCAAGATGATTCTCATAAGTCTGAAGACCCTAAATACCAATGTGTTCTTGATTTTCTGGATTGCTCTGTGGAAGTTCTCGCAGAAATTGAAACGATGTCCAAAGTTGAGGCCACCCAAGTGAAAATATGTCCACATGTTCGGGTTTCACGGGAAATAAGTGATAAGCTATTGCATGAAATGGAGACCTCTATTCTTGGAGCTTTGGTGGACGAGGAGATTAACAAGAGGCATCTGCCTGATACTTTATTGATATGTTCTCTCTTGTCTAACCTACTTTATGGTTGTGTTTTCACAAGGAAAATTAATGTTTCATTTTCTTCTAAGTTAAGCCAACACTTGGAACTGATGCTTGACAATGCTGTAAGAATTATTCAAGAAGATATTGACCTCCAGGCTTTTAGTTGCTTAGGTTGTGATCCTACTTGTGATGATTTAAGTCCTCTTGTTTCTTCCGTGCATTGTTTTCTTTCATCCCCTGTATGTATCAAATTGAGGGATCAGAATTTGATGGGCTGTGCCCCATTTGGTCAGTTAATCCAATCTGTGGAGAGACTCTTGAAAGCTTTTGTTAAGCTATATGAAAGTTATTCTCAGCATCTGATAAACCTTCAGAGTGATACAATCATACAAGATATGGCTGCTACTGATAATATTCAAAGTTCTTTTCCGAGTGACAAAAGTATGAGCAGGATAATGGACATGGAATTGGATGTTAATGATGATTCTAGAGAGGTTGATGGGTTAGCTGTTGGGACAAAAGTAGGCAGCGATGTTTCATCTTCTGCAGAGAAGTGGAAAATGGGCATGATATCAGTGATTTCCAGTTTTTTTTCTGCTTCTCTTCTTACCTGGGATGTCTTCTTTAAGTTAATGGAGAAAGAAAATGATCCTAAGGTGCGTGGGAAAATATTGTATCATCTCTGTCAACATCCTCTCTGGTCTTCTTCTGGACAATTTATTGATTTGGTGAATCTAATGAATGATATAATTATTGAGCAAGTTGGATTCAAGCTTGCTTGTGATTCTGTATTGATTGCTGCTCATACTTTACTGATTAACTTATCATCCCTGGATGCTGTTGGTAAGGAAAAATGTGGCCTGTATTTAACAGAAGTGGAAACTAAACAGTGCTTTCTATCACTAGGAAATGTTGTGCATAAACTTTCCGAGGTTGATCTTGATTGGTTTGGACGGGTGAAGCTTATTGATTGCATTTGCAATCTTGTTTTGCTCGATCCTCAAATTGGCCAGACTATGATAGAACGCTTACTTCTTATGCTTAAAGATATGGACTATCGAGTTCGGTTATTCTTGGCAAGGAGGATTGGTATTCTTTTCCAGACATGGGATGGTCATGAAGAGCTCTTTCAGGACATTTGTTTGAATTTCGGTGTTCAGATGGTTGTCTACTCCAAAGGAAAAGTCATCCATGCAAAGGAGGTGCTAGGGGCTGGTCCTCAACCTCAACCTATAATGGAAACTGTTGTGATTACTCTCATGCATCTTGCTTTACACAGTGAGAAAATTGAGTTAGAGGCTGTTTTCATGATATGTGTAGTTTCGGCCATTGAACCTTCTCATAGGGAATTAGTCTACGCAGTACTCGACAATCTGTCTAGAGAGCTTCAGTATTTGACTAGAATGAAGTACTTAGAAGAGCTTTTGGGATCAATTCTCTTTTGTTGGGTAGCATGTGGTGTAAGCTTAGCTGCACTTATTGAGACAAGACAGCTTTTCTTACCTGATGTAGATCCTGGTCATTTCCTCCAATATTGCTGTCCATGGCTACTTCCCGCTCTTCTTATCAATGAAAACACTTCTGATCTCAATTGGGTTGCCAAGCTATCTGAGGAAGATCGAGACAAGCTCATAAAGAGACATTTGGTCTCTATTGTCAGCTGTATCTTATCTTTGTGCTCTTGTTCATTGAATGCCATAGTCCCATATTTTTCAAAGGATATAGTGTCCCTTGAAATTCGGACAATTGTTGATGGATTTTTGGACTTAGATGATAATCATGCAAGTGCTTCTGTTGTGGACAAGATCAACATTTTTCGCCCAGATAGGGTTTTCATGTTTTTGGTAGAAGTTCATTATAAAATTGTAGCAGCAGCTCATTACAGGCATAAGTGCCACCGATTGGGAGGAATTGAGGTGCTTGTGACTATTCTTGGTCAGAGAGCTGCTGTTTTAAGCACTTCCAATTACCTTCTCAACTTGACTGGGTCATTAATCGAATGTCGCCCTTTACAAGACCAATGTTGTCAAATACTCAATGCATTGTTGGTGCAGCTCAAAAGGAATATTTCTACAGATGTGACCAGTATGCTTGGAGAACAGCTCCAGTTTCTTGTTTCGAAGTTGGTGGCATGTTGCACTCCTTCTAAAACCCAGGAATTGTGTGATAGCTCTGCATCACAAGCTTTATCTCTGCTCCATATGTTAACCGTGGACTCTGATTCATCTATGTATGATTATGTTAAAGAATTAGAGCCATTCCCTGAACTAAAAATATTTGATGAGATAAGAAAATTCCACAAGGAATTATGCCACACTTATTCTATACGTGACCACTTAGCAAAGTTTGTGAAGAAGTCTTCCTACCTTCCACCAAGGTTGCTTTTATCAAGTCTCCAGGCATTCCACAAGAAGTTACTGAATGAAGAAACCCTTCAAAGAAGAGGGAAAGCAGCAGGCTTTTCTAGAGATGGATGTTGGCAGGGTGATGAAGAAATTGTGCATGCAGTTTGGGAACTTGTTCACATGTGTCGTTCTAATGATGCAAGTGAAGTTCGAGAATTAGTTTCAGATTTCATTTCTAGGGTTGGCACTGGAGACCCATACTCTGTTGTATTCCATCTTCATGACACGACTAGTCAATTTAGTCTTGGTAAATCTATGGATACCAGCAGTGCAATAGAAATCAGTTCTGACATGGGTGCATGCTTATCTGAAGAACATTTGGTGGTCCTTATGAAAATTCTAATGAAGGATGTTGTTGTTGTTGCCCATAACACTGTTTTTTACTCCAAAACCAAGCATATGGAAATTGTTCCTCCGCTCCAAACTCAATGTGCTGGATTTCATTTGTCCAAATCCCTCACCTTGAGTTTGAGGGGGGCTATTGATGGAATACTTTCAACTAAAAGAGGTCAACATGCTTTACAGTCATTCAATTCGTACCAGAAGTCTCTGATTGAGGTGCATTCCAAAGGTGTCAATGCTGAACTTGTGGAAAATCTCCTTTTGGACCTAGATAGGAAGTCAAAAGGTGAAGCAACGTCATTGGAGAAGTCAACTGTGTGGGTGACAGATGGTAAAACTTTTGAAATGTGGATTTGCCCATTGGTGTATTCACTTATTGCTTACTGCAGTGATGCTATACTAAGACTTTGTCAAGATATTATAATGTTTAAAGGGGAAGTTGCTGAGTTTCTTTTGCCAAGCATTTTTGTCAATATCACTGCAAGAAAGGATCTGGAGATAGATCTTCACAAATTGATCAGTTTGCAGTTGACAGAGCATGTATTTACGGAGTCAAATAAGTTGATGAAATCGATTCAAGTGGTTTTGAATAGTCTTAATGAACTTCGTATTCGTTATGTCATGGAAAGATCTTCATTTGTGCCGTCGAAGCGAGAAGTTTCTAAGAATTCAAGGCCTTCAAGTTATAGTTCTAAAACTCGGTCCACTTCTGCAAAGGCAAGAGAATCAGCAGTTATTTCAAATTCCTTGGCAAAGTCACCATCCTCATGGGAGAAAGTGTATTGGCTCTCCATTGACTATCTTCTTGTTGCCAAGTTGGCAGCTAGTTGTGGGTCATATTTTACTTCAGTTATGTATGTGGAACATTGGTGTGAAGAGCAATTTAAAACGTTAACAATTGGAGGTCCAGATTTCTCTCATAATGAAACGTTGCCAGATCATATTGAAATTCTTGTTTTGGCAGTCACTAGAATCAATGAACCAGATAGTTTATATGGAATTCTACAGTCTCACAAGTTGACTTCTCAAATAATCACATTTGAGCATGAGGGAAACTGGGGAAAGGCCCTAGAGTATTATGACTTGCAAGTGCAGTCACATACCTCAGTACAGAACGATGGCAGTTCAAGAGGTCTGGCATTGAAACAAACAGGATCAGAACATCCTTCATCCTTTGCATCCAAGACAGATGAGATGAGGCAGAGTAGACCTTACAAGGGGTTGATTAAATCCTTGCAACAGATTGCCTGTGCACACGTGCTTGAGATGTATTGCCGAGGCTTGACTTCAACCAAGGATCTGCATCATCATGATTTGGAGTTTACTGAATTGCAATATGAATCTGCCTGGCGTGCTGGGAAGTGGGATTTCTCTCTACCATATGTTGGAACTAATTTTCCTTTAACTCCAAATATCAAATGTGATCATTTCAATGGAAATTTGCACAGTTGTTTAAGGGCACTTGAGGAGGGTGATCTAACTGATTTCCAGAGAAAACTAAGAGATTCAAAGCAGGAGCTTGTCTTATCTGTTTCTCATGCAAGTGAAGAGAGCACTGAGTACATTTACTTGACTATTATCAAGCTACAGATGCTTTATCATCTTGACATGGCTTGGGATTTACGCTGGAGAAGTTGCGAAGATAATACCACAAAGCTTTTCCTGCTGAATCCAAACAATTCTTCTGAGCCTGTGATTCCTTCCATTGAGCAGTTGTCATGGCTGGATATGGAGTGGTGCTCAATTTTGCAGAGGACACAATTGCATATGAATTTGCTAGAACCATTTATAGCATTTCGACGAGTTCTACTTCAAATTTTAAGCTCTAGAGACTGTGTGCTGCAACATCTTCTGCAGTCTGCCACCACACTTCGCAAGGGATGTAGGTTCTCTCAAGCAGCTTCTGCTCTGCATGAGTTTAAACTCCTTTCTGTTGAAGCCAAAGGGCAAAGCTCATCCTTATATTGGCTTGGACGGCTTGAAGAAGCAAAGCTTTTCCGTGCTCAAGGTCAAAATTTGATTGCTATAGACATTGCAATGTATATATCACAGAATTATCGCTCTAATGAGGAGGCTTCTGATGCATTTCGTCTGGTTGGGAAGTGGCTGGCAGAAACTAGATCTAGCAACTCAAGAACAATTTTGGAGAAGTATTTGAAACCTGCAGTCTCTATTGCTGAGAATGTGAATGCTACAGCCAAGAATGCCATGAAAAGGAAATGTCAGACTCATTTTCATCTTGCACACTATGCTGATGCTCTATTTAGAAGCCATGAAGAAAGACTTAACTCGAATGAATGGCAAGCAGCAATGCGTTTAAGAAAGCATAAGACAATAGAGTTGGAAGCACTCATAAAAAGGTTAAGGAGTTCAACAAAGGGGGAGAAAATTGACTACTCAATTAAAATCCAAGAATTGCAAAAGCAAGTAGCAATGGACAAGGAAGAAGCCCAGAAATTGCTGGATGACCGGGACAATTTTCTTAGCCTAGCATTGGAGGGATACAAACAGTGTTTAGTCATTGGTGACAAGTATGATGTGAGAGTGGTTCAACCTGCTGCTTCCAAAGAACATAATTGGTGTCATCATGTTATTCCTCAACTGAGTCGAGAAAAAGGGGTGTTTCGCATTGTTTCCTTGTGGTTCAGTCTCTCCTCACAAAAAGAAGTTGTAAATAGCATGCTTAGCACAATTGATGAGGTTCAATCTTTCAAATTTATACCTTTAGTTTATCAAATTGCCTCTAGAATGGGTAACACAAAGGATGGTCATGGACATCTCAATTTCCAGTTTGCATTGGTTTCTCTTGTGAAGAAAATGGCCATTGATCATCCATATCATACGATACTTCAACTTTTGGCTCTGGCAAACGGTGACCGTATCAAGGACAAACAGCGTAGTAAAAGTTCATTCGTGGTTGATATTGACAAAAAGCTTGCAGCAGAAAATCTTCTAAATGAGTTGTCATCTTATCATGGAGCTATCATTCTACAAACGAAACAAATGGTGGAGATTTATATCAGACTTGCTGAGATGGAAACAAAGAGAGAGGATACCAATAAAAAGGTGACACTGCCTAGGGACTTGCGTAGTCTCCCGATGCTAGAACTTGTACCTGTAGTGACAGCTACAATATCAATTGATCATAGTTGTCAGTACCATGAAGGCAGTTTTCCTTACTTCAAAGGACTAGCAGATTCAGTTATGATAATGAATGGTATAAATGCTCCAAAAGTGGTTGAATGCTTTGGTTCTGATGGTTGCAAATATCGACAACTAGCAAAATCTGGAAATGATGACCTAAGACAGGATGCTGTATGA 6567 0.3945 MIHFSLFHLIYCSHNLQSDPQDMLHLRKSLLRATLCHLNWKGCSMLNEQMTFLIPSAIYALSIGVVPFTQCFKEVPLAHNYFDVTDAQDDSHKSEDPKYQCVLDFLDCSVEVLAEIETMSKVEATQVKICPHVRVSREISDKLLHEMETSILGALVDEEINKRHLPDTLLICSLLSNLLYGCVFTRKINVSFSSKLSQHLELMLDNAVRIIQEDIDLQAFSCLGCDPTCDDLSPLVSSVHCFLSSPVCIKLRDQNLMGCAPFGQLIQSVERLLKAFVKLYESYSQHLINLQSDTIIQDMAATDNIQSSFPSDKSMSRIMDMELDVNDDSREVDGLAVGTKVGSDVSSSAEKWKMGMISVISSFFSASLLTWDVFFKLMEKENDPKVRGKILYHLCQHPLWSSSGQFIDLVNLMNDIIIEQVGFKLACDSVLIAAHTLLINLSSLDAVGKEKCGLYLTEVETKQCFLSLGNVVHKLSEVDLDWFGRVKLIDCICNLVLLDPQIGQTMIERLLLMLKDMDYRVRLFLARRIGILFQTWDGHEELFQDICLNFGVQMVVYSKGKVIHAKEVLGAGPQPQPIMETVVITLMHLALHSEKIELEAVFMICVVSAIEPSHRELVYAVLDNLSRELQYLTRMKYLEELLGSILFCWVACGVSLAALIETRQLFLPDVDPGHFLQYCCPWLLPALLINENTSDLNWVAKLSEEDRDKLIKRHLVSIVSCILSLCSCSLNAIVPYFSKDIVSLEIRTIVDGFLDLDDNHASASVVDKINIFRPDRVFMFLVEVHYKIVAAAHYRHKCHRLGGIEVLVTILGQRAAVLSTSNYLLNLTGSLIECRPLQDQCCQILNALLVQLKRNISTDVTSMLGEQLQFLVSKLVACCTPSKTQELCDSSASQALSLLHMLTVDSDSSMYDYVKELEPFPELKIFDEIRKFHKELCHTYSIRDHLAKFVKKSSYLPPRLLLSSLQAFHKKLLNEETLQRRGKAAGFSRDGCWQGDEEIVHAVWELVHMCRSNDASEVRELVSDFISRVGTGDPYSVVFHLHDTTSQFSLGKSMDTSSAIEISSDMGACLSEEHLVVLMKILMKDVVVVAHNTVFYSKTKHMEIVPPLQTQCAGFHLSKSLTLSLRGAIDGILSTKRGQHALQSFNSYQKSLIEVHSKGVNAELVENLLLDLDRKSKGEATSLEKSTVWVTDGKTFEMWICPLVYSLIAYCSDAILRLCQDIIMFKGEVAEFLLPSIFVNITARKDLEIDLHKLISLQLTEHVFTESNKLMKSIQVVLNSLNELRIRYVMERSSFVPSKREVSKNSRPSSYSSKTRSTSAKARESAVISNSLAKSPSSWEKVYWLSIDYLLVAKLAASCGSYFTSVMYVEHWCEEQFKTLTIGGPDFSHNETLPDHIEILVLAVTRINEPDSLYGILQSHKLTSQIITFEHEGNWGKALEYYDLQVQSHTSVQNDGSSRGLALKQTGSEHPSSFASKTDEMRQSRPYKGLIKSLQQIACAHVLEMYCRGLTSTKDLHHHDLEFTELQYESAWRAGKWDFSLPYVGTNFPLTPNIKCDHFNGNLHSCLRALEEGDLTDFQRKLRDSKQELVLSVSHASEESTEYIYLTIIKLQMLYHLDMAWDLRWRSCEDNTTKLFLLNPNNSSEPVIPSIEQLSWLDMEWCSILQRTQLHMNLLEPFIAFRRVLLQILSSRDCVLQHLLQSATTLRKGCRFSQAASALHEFKLLSVEAKGQSSSLYWLGRLEEAKLFRAQGQNLIAIDIAMYISQNYRSNEEASDAFRLVGKWLAETRSSNSRTILEKYLKPAVSIAENVNATAKNAMKRKCQTHFHLAHYADALFRSHEERLNSNEWQAAMRLRKHKTIELEALIKRLRSSTKGEKIDYSIKIQELQKQVAMDKEEAQKLLDDRDNFLSLALEGYKQCLVIGDKYDVRVVQPAASKEHNWCHHVIPQLSREKGVFRIVSLWFSLSSQKEVVNSMLSTIDEVQSFKFIPLVYQIASRMGNTKDGHGHLNFQFALVSLVKKMAIDHPYHTILQLLALANGDRIKDKQRSKSSFVVDIDKKLAAENLLNELSSYHGAIILQTKQMVEIYIRLAEMETKREDTNKKVTLPRDLRSLPMLELVPVVTATISIDHSCQYHEGSFPYFKGLADSVMIMNGINAPKVVECFGSDGCKYRQLAKSGNDDLRQDAV 2188
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu10g01230 2188 ProSiteProfiles Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases catalytic domain profile. 2146 2188 IPR000403 -
Vimu10g01230 2188 PANTHER SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE ATM 10 704 IPR038980 GO:0004674|GO:0006974
Vimu10g01230 2188 Gene3D - 2074 2188 - -
Vimu10g01230 2188 ProSiteProfiles FAT domain profile. 1351 2040 IPR014009 -
Vimu10g01230 2188 Coils Coil 1885 1905 - -
Vimu10g01230 2188 MobiDBLite consensus disorder prediction 1453 1479 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu10g01230 K04728 - gmx:100788458 3538.04
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vimu10g01230 10 12243783 12288012 Vimu10g01230 10 12243783 12288012 ECH