Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu10g00012 CAGATACAGAGAGAAAGTGATAGAAGCGAACAAAAACCCTACCCTAACCCGTATTTATGTTATTGGGTTCTTCCTCCATTGATCCGTCCGAGAAGGCAAGTCCGAGAAGGCAACTCAAAACCTGCCCTTGCGAGACCCATCCATCGAAACTCCCACACCCCTACCCCACGCCGCAACTCCACTCTTTTGAACAACACTATGGATGATCTGGATAAAGCGATTCTTATTATGTTTGATGAATCGGGAGCCCTTGACGATGATTTGAAGAAACATGCCAAACTTTACTGTAACGCTACTAAGGAGAAGCCATCAATTTGTAGACTTTGCATTGAAAAATTATGCTTTTCAAATCTTGTTCAAGTCCAGTTTTGGTGCCTACAGACCTTACATGAAGTCATTCGAACACGGTACTTGACAATGACCCTAGATGAGAGGCACATGATCAGGGGCTCCGTCTTTTCAATAGTGTGCCTCGAAGACAAGAACCTCACAAGGATTTTGGAAGGCCCTGCCTTCATAAAGAACAAGCTTGCACAGGTTTTGATAACTTTGATTTACTTCGATTACCCTTTGGTCTGGTCCTCCGTCTTTGTTGATTTTTTTCCACACTTGAGCAAAGGAAACGTGGTCATAGACATGTTCTGTCGAGTTTTGAATGCCCTGGATGATGAATTAATTAGTTTGGACTACCCTAGAACCCCTGAGGAATTGACTGTTGCGAGCCGGGTTAAAGATGCAATGAGACAGCAGTGTGTCTCTCAGATTGTCAGGGCCTGGTATGACATTGTTTCTATGTATCGGAATTCTGATCAAGAGCTATGCACTAGTGTGTTAGATTCCATGAGGAGATATATTTCTTGGATAGACATCGGGTTGATAGTTAATGATGCTTTTATCCCTTTGTTGTTTGATTTGATTTTGGTTGGTCATCTGTCTGATCAGCTTCGTGGTGCTGCAGTCAGATGCTTGTTGGCAGTTGTTTCTAAGCGAATGGATCCCCAATCCAAACTGTCGTTGTTGCAAAGCCTTCGTATTAGTCGTGTACTCAGGTTAGTGACTGAGAACGGCGATGCTGAAATGGTCTCTGATATAGCTGCATTGCTTACTGGGTATGCTGTAGAGGCCTTGGATTGCTTCAAACGCATAAATTCTGAGGATGCTAAAGGAATCTCTATGGAGCTTTTGAGTGAAGTTTTACCCTCCATTTTCTATGTAATGAAGAATTTTGAGGTAGATGCTACATTCAACATCATTCAATTTCTTTCAGGTTATGTTGCCATTTTAAAGAGTTTTACTCCTTTGCGGGAGAAACAGCTACTTCACTTGGGGCAGATATTGGAAGTTATCCTAGTGCTAATCCGTTACGACCCCGCATACCGCACTAATCTTGATGTGATGGACAAAGTTGGTAAAGAGGAGGAGGATAGGATGGTAGAGTTCAGAAAGGATTTGTTTGTTCTTCTTCGCACTGTGGGTCGTGTAGCACCTGATGTAACTCAGATGTTTATTAGAAATTCGTTGGCAAGTGCTGTTTCTAGATCTTCGAATAGCAATGTGGAGGAGGTGGAAGGTGCACTTTCTCTTTTATATGCACTTGGAGAATCCATAAGTGAGGAAGCCATGAAAACTGGGAGTGGATTGTTGAGTGAGCTTGTGATTATGCTTCTATCGACAAGGTTTCCTTGTCACTCTAATAGGCTTGTTGCCCTTGTTTACTTGGAGACAGTGACAAGATATATTAAGTTTATTCAGGATAATACTCAATATATTCCAATGGTTCTAGCTGCCTTTCTTGATGAAAGAGGCATACATCATTCAAACATCAATGTTAGTCGTAGAGCCAGTTATTTGTTTATGAGGGTTGTTAAATTGCTGAAGATGAAGTTGGTGCCTTTTATAGAGACTATTTTGCAGAGCCTGCAAGACACTGTTGCCCAATTCACTATTATGAATTATACAGCAGAAGAGCTATCAGGGTCAGAAGATGGTAGCCACATTTTTGAGGCAATTGGTTTATTGATTGGAACAGAAGATATCCAGCCTGAAAAGCAATCTGATTATCTATCTTCTTTGCTCAGTCCTCTTTGTCAGCAGGTTGAGGCATTGCTTATAAATGCCAAGTTATTGAATGCTGAGGAGGCTAATGCAAAAATTGCTGTAATCCAGCAAATTATCATGGCAATTAATTCTCTCAGTAAGGGCTTTAGCGAGCGACTTGTAACTGCTAGTCGCCCTGCAATTGGTCTCATGTTTAAGCAGACACTGGATGTACTTCTTCAAGTTCTTGTTATATTTCCAAAAGTAGAACCTCTGCGAAACAAGGTCACATCTTTTATACATCGCATGGTGGATACACTTGGAGCGTCTGTATTTCCTTACCTTCCAAAGGCATTGAAGCAGTTACTTGAAGAAATTGAACCAAAGCAAATGGTTGGTTTTCTTTTGTTACTCAATCAACTTATCTGTAAGTTCAATACTTTGGTGCGTGACATTTTGGAGGAAATATTTCCAGCTGTTGTTGAGCGGATATTCAGTGTTATTCCTAGAAATGGGTTACCTTCTCCTGGTCCTGATGCAATCACTGAGGAAGTTCGTGAATTGCAAGAACTTCAGCGAACATTGTATACTTTTCTTCATGTGATTACTACACATGACCTGTCTCCTGTATTTCTTTTCCCAAAATGTAAAGCATACCTGGATCCAGTGATGCAGTTGCTTTTGTTCTCTTCTTGTAATCATAAGGATATCCTTGTAAGAAAGGCATGTGTACAGATTTTTATTAGATTAATTAAAGATTGGTGTGCCCAGCCTTACGAAGAAAAGGTTCCTGGTTTTCGAAGTTTTGTGATTGAAGCATTTGCTATAAACTGTTGTTTGTACAGTGTGCTGGACAGATCTTTTGATTTCCATGATGCAAACACTTTTATTTTGTTTGGAGAAATCGTTCTGGCACAGAAGGTAATGTATGAAAAATTTGGGGATGATTTTCTGGTTCATTTTGTATCAAAAGGATTATCTTCTGCACATAGCCCACAAGATCTGGCAGAGCAATATCGTCAAAAGTTGCAGGGTGGAGATTTAAAGGCACTAAAATCTTTCTATCAGTCAGTAGTGGAAAACTTGAGACTGCAGCAGAATGGAAGCCTTGTATTCAGATAG 3159 0.4055 QIQRESDRSEQKPYPNPYLCYWVLPPLIRPRRQVREGNSKPALARPIHRNSHTPTPRRNSTLLNNTMDDLDKAILIMFDESGALDDDLKKHAKLYCNATKEKPSICRLCIEKLCFSNLVQVQFWCLQTLHEVIRTRYLTMTLDERHMIRGSVFSIVCLEDKNLTRILEGPAFIKNKLAQVLITLIYFDYPLVWSSVFVDFFPHLSKGNVVIDMFCRVLNALDDELISLDYPRTPEELTVASRVKDAMRQQCVSQIVRAWYDIVSMYRNSDQELCTSVLDSMRRYISWIDIGLIVNDAFIPLLFDLILVGHLSDQLRGAAVRCLLAVVSKRMDPQSKLSLLQSLRISRVLRLVTENGDAEMVSDIAALLTGYAVEALDCFKRINSEDAKGISMELLSEVLPSIFYVMKNFEVDATFNIIQFLSGYVAILKSFTPLREKQLLHLGQILEVILVLIRYDPAYRTNLDVMDKVGKEEEDRMVEFRKDLFVLLRTVGRVAPDVTQMFIRNSLASAVSRSSNSNVEEVEGALSLLYALGESISEEAMKTGSGLLSELVIMLLSTRFPCHSNRLVALVYLETVTRYIKFIQDNTQYIPMVLAAFLDERGIHHSNINVSRRASYLFMRVVKLLKMKLVPFIETILQSLQDTVAQFTIMNYTAEELSGSEDGSHIFEAIGLLIGTEDIQPEKQSDYLSSLLSPLCQQVEALLINAKLLNAEEANAKIAVIQQIIMAINSLSKGFSERLVTASRPAIGLMFKQTLDVLLQVLVIFPKVEPLRNKVTSFIHRMVDTLGASVFPYLPKALKQLLEEIEPKQMVGFLLLLNQLICKFNTLVRDILEEIFPAVVERIFSVIPRNGLPSPGPDAITEEVRELQELQRTLYTFLHVITTHDLSPVFLFPKCKAYLDPVMQLLLFSSCNHKDILVRKACVQIFIRLIKDWCAQPYEEKVPGFRSFVIEAFAINCCLYSVLDRSFDFHDANTFILFGEIVLAQKVMYEKFGDDFLVHFVSKGLSSAHSPQDLAEQYRQKLQGGDLKALKSFYQSVVENLRLQQNGSLVFR 1052
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu10g00012 1052 PANTHER EXPORTIN-T/LOS1 67 1042 IPR040017 GO:0000049|GO:0006409|GO:0031267|GO:0071528
Vimu10g00012 1052 Gene3D - 64 1023 IPR011989 -
Vimu10g00012 1052 FunFam Exportin-T 67 1023 - -
Vimu10g00012 1052 Pfam Exportin-T 388 1040 IPR045546 -
Vimu10g00012 1052 SUPERFAMILY ARM repeat 67 934 IPR016024 -
Vimu10g00012 1052 MobiDBLite consensus disorder prediction 35 62 - -
Vimu10g00012 1052 Pfam Exportin 1-like protein 170 323 IPR013598 -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu10g00012 K14288 - gmx:100800596 1781.92