Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vifa2g04287 ATGGCTCGATTTTGTTTCCGGAGCCTCCGTTTCTTTGTTGTATTCGCGGTTGGTGTTGTTGTGTTCGCGAGAGACTGTGTTTGCGATGAATCGAAGAGCGACGAGTTGGAGCGTGACTTTTCTATAACTGATTTCGATTGGAACCTTTTTCATCAGGATTACTCTCCGCCGGCTCCGCCTCCACCACCGCCTCATCCGCCATCGGTGTCGTGCGTGGACGATCTCGGCGGGGTTGGTTCTCTGGACACCACGTGCAATATTGCGAATGACGCGAATCTTACTCGCGACGTGTATGTGGCAGGGAAGGGGAATTTTAACATTCTACCCGGGGTGAGGTTTCATTGTGAGATTCCTGGGTGCATGATTACCGTTAATGTTACTGGTAATTTTAGTTTAGGTGACAACTCGTCGGTTCTCGCCGGAGCTTTTGGGTTGGGAGCAGATAATGCTGTTTTTGGGAATTTTTCGGTGGTGAACACGACAGCTATGGCGGGGCCGCCTCCACCTCAGACGAGTGGGACTCCTCATGGGGTTGCTGGGGGTGGCGGGGGCCACGGAGGGAGGGGTGCCAGTTGTTTGGTGGACACAACGAAGCTTCCGGAGGATGTTTGGGGAGGGGACGCTTATTCGTGGGCTTCCCTGCAGCAACCAGATAGTTTTGGGAGCAGTGGTGCGTCCACAAGCAAGGATAGTGACTATGGTGGGTTGGGTGGGGGGATTGTGAGCATGGTTGTTGTTAAAGTTATTGAGATGAATGCAACTCTTTTGGCTGATGGGGGTAATGGAGGGACCAAGGGTGGAGGTGGCTCCGGTGGCAGTATCTACATCAAGGGTTATAGAATGACTGGTAGTGGGATGATAAGTGCTTGTGGAGGTAATGGTTACGCAGGTGGAGGAGGTGGCAGAGTTTCAGTCGAAGTTTTCAGTAGGCATGATGAGCCCACAATTTATGTCCATGGTGGTAGTAGCTTTGCCTGTCCTGAAAATGCAGGAGCAGCCGGGACTCTTTATGATGCAGTTCCTCGAAGCCTTATAGTTGATAACTATAACATGACAACTGACACAGAGACACTTCTCTTGGATTTTCCTTATCAGCCCCTTTTGACTAATGTTTATGTCCGTAACAAGGCTAGGGCCACCGTTCCATTGCTTTGGAGTCGTGTTCAGGTGCAAGGACAGCTAAGTATATTGCAGGGTGGGGTACTGAGCTTTGGGCTGCCACACTATGCTTCTTCAGAGTTCGAGTTGTTAGCTGAAGAGCTGTTGATGAGTGATTCTGTGATGAAGGTATTTGGAGCTTTACGCATGTCTGTAAAAATGTTCTTGATGTGGAACTCAAAAATGCTCATAGAATGCGGGGAAGATATAACAGTGGCAACGTCTTTGCTTGAGGCTAGTAATTTGATTGTTCTCAGGGGGTCTTCTGTGATACATTCTAATGCTAACCTTGGAGTTCATGGGCAAGGTTTACTGAATTTATCCGGCCCAGGAGACTGGATTGAAGCACAACGTTTGGTTTTATCTCTATTTTATAGTATTCACGTTGGGCCTGGATCTGTCTTGCGTGGTCCATTGGAGAATGCAACAACTGATGATGTTACTCCAAAACTTCACTGTGACAACAAAGACTGCCCGTATGAATTACTTCACCCTCCTGAAGATTGCAATGTGAACTCATCCTTGTCTTTTACACTTCAGGTCTGCCGTGTTGAGGATGTCCTTGTTGAAGGCCTTATAAAAGGTTCTGTTGTTCATTTTCATAGGGCAAGGACAATAAGTATCGAATCTTCTGGAACAATATCTGCCTCTGGAATGGGTTGTACTGGTGGTCTGGGTCATGGAAATATTCTAAGTAATGGTATTTGCAGTGGTGGTGGGCATGGCGGTAAAGGTGGAAAAGCATGTTCCAGTGACTATTGTGTTAAGGGTGGAATCTCATATGGAACTCCAGATCTGCCCTGTGAACTTGGTAGTGGAAGTGGAAATGGAAGCTCAACTGGTACCACAGCTGGGGGTGGTATCATAGTAATTGGATCATTAGACCACCCTTTGTCAAGTTTGTCAATCAAAGGTTCTGTAAATGCCGATGGAGAGGATTTTGATCCAGCAATTAGAAGGGAAAAATTTGTTATTTTTGATAATTTTACCGGAGGCCCTGGAGGTGGATCTGGTGGCACTATTCTATTATTTCTCCATAGCCTTGCCATTGATGAATCAGCTATTCTTTCTAGCATTGGGGGATATAGTGGTATTAGTGGAGGTGGCGGTGGAGGCGGGGGAAGAATTCATTTTCATTGGTCTGACATTCCTACTGGAGATGTTTATCAGCCCATTGCAACTGTGAAAGGAAACATTCAGTCTGGGGGAGGAAAGGGTAAAGGCTTGGGTGGCTCTGGAGAAAATGGGACGATATCTGGGAAAGCTTGTCCCAAAGGACTTTACGGTACATTTTGTGAGGAATGTCCAGCAGGCACTTACAAGAATTCTACTGGATCTGATAGTTCACTTTGTCAAGTTTGTCCTGTTCACGAGCTTCCTAATCGTGCTGTTTATGTTTCAGTTCGAGGCGGCATTACTGAAGCCCCTTGCCCTTACCAATGCGTTTCAGACCGATATCACATGCCAGACTGTTATACAGCTCTTGAAGAGTTAATTTATACATTTGGTGGACCTTGGTTATTTGGTCTTTTACTTACGGGTCTCTTGGTCCTCTTAGCTTTGGTGCTTAGTGTCGCAAGAATGAAATTTGTTGGTGTTGATGAATTACCAGGCCCAGCACCCACGCAACATGGTTCTCAAATAGATCATTCCTTCCCTTTCTTGGAGTCTCTGAATGAGGTCTTGGAGACAAATAGAGTTGAGGAGTCTCAAAGTCATGTTCATAGAATGTACTTCATTGGACCTAATACTTTCAGTGAACCCTGGCATCTGCCACATACACCTTCGGAACAAATACATGATATTGTCTATGAGAGTGCATTCAATACATTTGTGGATGAGATTAATGCTATAGCTGCTTATCAATGGAGATTGAAGTTGCAACGATTGCGTGAATTTGTTCGATCAGAGTATGACCATGCTTGCCTTCGTTCTTGCCGATCACGAGCTCTCTATGAAGGGATTAAGGTAAATGCGACTTCTGACTTGATGCTTGCATATGTGGACTTCTTTCTTGGTGGGGATGAAAAGAGAACAGACCTGCCTCCTCGATTACATGAAAGGTTCCCAATAACATTGCTTTTTGGGGGTGATGGAAGTTATATGGCTCCATTTACCCTTCACAATGATAATATCCTTACTAGCCTCATGAGTCAGTCAGTTCAGCCTACAACATGGTATCGATTGGTTGCTGGGCTGAATGCACAATTACGGTTAGTGCGCCATGGACGACTAAGGGTAACATTACGACCTGTTATCAGATGGCTTGAGACTCATGCCAATCCTGCTTTGAGTGTCCATGGTGTTCGTGTTGATCTTGCATGGTTTGAGACTACCAGTGTTCGCTATGGCCACTATGGGCTTGTGGTCTATGCTCTCGAAGGAGGTTATCCGGACACTAGAGGAAGTATTGATGGAGCATTAAGAACTGAGGAAACATCGCGAGTTCCGTCTGTTAAAAAGGAACATCACTCGGGGCTTGCAAGTGGAGCTGACTTAAGTCCTGGTGGAAGAATTGAGAACAATTGTTTGAGGCGGAAGATGCAAGGAGTTTCTTTAGATGTGAACAATTTGCAGATGCTTGACGAGAAGAGGGATATCTTTTATTTTCTCTCTTTTATACTTCAGAATACAAAACCTGTTGGGCACCAGGATCTTGTTGGTTTAGTAATCTCAATGTTGCTTCTAGGAGATTTTAGTTTAGTATTACTTACCCTGCTTCAGTTGTACTCAATTTCTTTGGTGGATGTATTTCTTGTATTGTTTATATTACCTTTTGGCATTCTTCTCCCATTTCCTGTTGGAATCAATGCTCTTTTTAGTCATGGACCAAGGCGTTCTGCAGGCCTTGCACGTCTATATGCTCTGTGGAACCTTACGTCCTTTATAAATGTTGTGGTTGCATTTTTATGTGGATATATTCATTACAGCTCTCAATCCTCTTCCAGCAAAAGACAACCCAGCATTCAGCCTTGGAATATCATGGACGAAAATGAATGGTGGATTTTTCCAGCCGGACTGGTTTTGTGTAAGTTATTCCAATCTCAACTCATTAATTGGCATGTTGCCAATTTGGAAATTCAAGACCGTTCCTTGTATAGTAATGATTTTGAGCTGTTCTGGCAGTCATGA 4290 0.4497 MARFCFRSLRFFVVFAVGVVVFARDCVCDESKSDELERDFSITDFDWNLFHQDYSPPAPPPPPPHPPSVSCVDDLGGVGSLDTTCNIANDANLTRDVYVAGKGNFNILPGVRFHCEIPGCMITVNVTGNFSLGDNSSVLAGAFGLGADNAVFGNFSVVNTTAMAGPPPPQTSGTPHGVAGGGGGHGGRGASCLVDTTKLPEDVWGGDAYSWASLQQPDSFGSSGASTSKDSDYGGLGGGIVSMVVVKVIEMNATLLADGGNGGTKGGGGSGGSIYIKGYRMTGSGMISACGGNGYAGGGGGRVSVEVFSRHDEPTIYVHGGSSFACPENAGAAGTLYDAVPRSLIVDNYNMTTDTETLLLDFPYQPLLTNVYVRNKARATVPLLWSRVQVQGQLSILQGGVLSFGLPHYASSEFELLAEELLMSDSVMKVFGALRMSVKMFLMWNSKMLIECGEDITVATSLLEASNLIVLRGSSVIHSNANLGVHGQGLLNLSGPGDWIEAQRLVLSLFYSIHVGPGSVLRGPLENATTDDVTPKLHCDNKDCPYELLHPPEDCNVNSSLSFTLQVCRVEDVLVEGLIKGSVVHFHRARTISIESSGTISASGMGCTGGLGHGNILSNGICSGGGHGGKGGKACSSDYCVKGGISYGTPDLPCELGSGSGNGSSTGTTAGGGIIVIGSLDHPLSSLSIKGSVNADGEDFDPAIRREKFVIFDNFTGGPGGGSGGTILLFLHSLAIDESAILSSIGGYSGISGGGGGGGGRIHFHWSDIPTGDVYQPIATVKGNIQSGGGKGKGLGGSGENGTISGKACPKGLYGTFCEECPAGTYKNSTGSDSSLCQVCPVHELPNRAVYVSVRGGITEAPCPYQCVSDRYHMPDCYTALEELIYTFGGPWLFGLLLTGLLVLLALVLSVARMKFVGVDELPGPAPTQHGSQIDHSFPFLESLNEVLETNRVEESQSHVHRMYFIGPNTFSEPWHLPHTPSEQIHDIVYESAFNTFVDEINAIAAYQWRLKLQRLREFVRSEYDHACLRSCRSRALYEGIKVNATSDLMLAYVDFFLGGDEKRTDLPPRLHERFPITLLFGGDGSYMAPFTLHNDNILTSLMSQSVQPTTWYRLVAGLNAQLRLVRHGRLRVTLRPVIRWLETHANPALSVHGVRVDLAWFETTSVRYGHYGLVVYALEGGYPDTRGSIDGALRTEETSRVPSVKKEHHSGLASGADLSPGGRIENNCLRRKMQGVSLDVNNLQMLDEKRDIFYFLSFILQNTKPVGHQDLVGLVISMLLLGDFSLVLLTLLQLYSISLVDVFLVLFILPFGILLPFPVGINALFSHGPRRSAGLARLYALWNLTSFINVVVAFLCGYIHYSSQSSSSKRQPSIQPWNIMDENEWWIFPAGLVLCKLFQSQLINWHVANLEIQDRSLYSNDFELFWQS 1429
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vifa2g04287 1429 SMART GCC2_GCC3_2 815 867 - -
Vifa2g04287 1429 MobiDBLite consensus disorder prediction 164 185 - -
Vifa2g04287 1429 PANTHER EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 1010 1429 - -
Vifa2g04287 1429 MobiDBLite consensus disorder prediction 1196 1215 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vifa2g04287 Vifa-Chr2 1259662285 1259676156 Dispersed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vifa2g04287 - - tpra:123893655 2402.48
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vifa2g04287 2 1259662285 1259676156 Vifa2g04287 2 1259662285 1259676156 ECH