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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vifa2g01517 ATGACGCTAACCTTCTTCTTTCTCTTCTTTGTCTCTCACCTTCTCTCATCCATCTCTGGACAATCCACCTCCATGGAATCGGTTCCCGATCTTCAGAACACCATGTACACGAACGTCGACGGATATCCTTGTGTGCGGTTGCTAAGTCTTTCCGGAGCCATCGGTTGTTCAAATCCTGGACGAGATAAGGTTGTTGCTCCAATTGTAAGGTTTGAAAATGTTGATGATGTGTCAGAATTGTCTTCTGTATTGGTGTCATTCGATGAGTTTCCTGCTCTCTTTACCAGGTTATCAGCTGACCCAAGCTTTGCGAGCAAAGTTGGTGGTGTACTAGTTGAACCAGTTATTGGTTCACAAAAGGAGTTAAATGGATTTTCTCCCGATAAAAAGTTTCCGCAAGCTGAGTTTGCTTCTTACCATAATATCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGATATTATGTGGAAATCCTACAACTTTCCTGTGTTTTTACTCACGGAAAGTGGCACAAAGATTCTTCAAGAGTTTGTATTAAAGAGTAAGGACAAAAAGAAAGCTTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAATGAAATCTGGAACACATGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGGAACTTGCCTCCCTTTAGGTGGATACAGTGTTTGGTCGTCGCTGCCCCCAATCAACGTTTCATCCTTAAAACCGCCTAAGCCCATTATATTGACAGTAGCCTCTATGGATTCTGCTTCCTTTTTCCGGGACAAAAGCCTTGGCGCAGATTCCCCTATTTCTGGCTTAATTGCATTACTGGCAGCAGCTGATGCACTTTCTCGTTTGGATGGTCTTGGTGGCCTTAGTAAACAGCTTGTTTTTGTAGTTTTCACTGGAGAGGCATGGGGTTATCTCGGAAGCAGAAGATTTTTAGTAGAACTTGACGAGCACTCAGATGCTGTTCATGGCCTTAATCACTCTTTAATTGAAAAGGTGTTTGAAGTTGGTTCTGTTGGAAAGGGTCTCAATAAAGGTGCTAAAAACTACTTTGCTCATGCTGAAGGGGATTCTTCTGCCACAAGTCAGATAATGGCTGCCCTGAAACATGCCCAAGAGTCGCTACTGCCTGAAGATATAAATATCGCATCTGCAAGTGTTTCAAATCCTGGGATACCTCCATCGTCTTTAATGACCTTTTTGAACAAGAACCCTGAAATCTCTGGTGTCGTATTAGAAGATTTTGACTCTTCCTTTGTCAACAAGTTTTACCGTAGTCATCTTGATGATTTATCAAATGTGAACTCATCAGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTGTTGCTCGAACCCTCTACTTACTGGCTAGTGAAACCGATGATGTACAAAATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTAAATGTCTCACTTGTTGAACATCTCATGGATTGCTTGTTGGATTGTGATCCTGGTCTTTCTTGTGAGTTGGTGGAGAAATATATTTCACCCGCTTCAACCTGCGCGAGCAATTATGTTGGTGTTATCTTAGATGAACCTTCATCCTCACCTTATCCAGGATACATTAATGATGTTCCTAGGTTCATCTGGAATTTTCTTGCCGACATAACTTCTATCCCAAAGGAGAATAATAGCTCAGACTGTCAACGGGGTTGCAGTGGTAGCAATGAAGTTTGCATTAAAGCAGAGACTGATGGAAAGGGCATATGCGCACTCTCTACAACTAGGTATGTTCCAGCATATTCGACACGATTAAAATTTGAATCTGGGGTATGGAATATTTTGCCCCCCAATGCCTCAGATAACATGGGTGTTGTAGACCCAGTCTGGACAGAAAGCAACTGGAATTCATTAGGCATTCGGGTCTACACCGTCCAAACTGCTGTCTATGATTGGGTTGTTCTGTCTGGGGCGATTGCTTTTACAATCTTGTCGTACCTTGCAATTGCAGTTACAAGAATTTTGGTTGCCAAAGCAACCAAGAGGGATTGA 2001 0.4213 MTLTFFFLFFVSHLLSSISGQSTSMESVPDLQNTMYTNVDGYPCVRLLSLSGAIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDDVSELSSVLVSFDEFPALFTRLSADPSFASKVGGVLVEPVIGSQKELNGFSPDKKFPQAEFASYHNISYEWNPIGSDIMWKSYNFPVFLLTESGTKILQEFVLKSKDKKKAYTSNVAEFDLVMQTMKSGTHDSESCLKEGTCLPLGGYSVWSSLPPINVSSLKPPKPIILTVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAADALSRLDGLGGLSKQLVFVVFTGEAWGYLGSRRFLVELDEHSDAVHGLNHSLIEKVFEVGSVGKGLNKGAKNYFAHAEGDSSATSQIMAALKHAQESLLPEDINIASASVSNPGIPPSSLMTFLNKNPEISGVVLEDFDSSFVNKFYRSHLDDLSNVNSSAVVAAASLVARTLYLLASETDDVQNSTLAAINVNVSLVEHLMDCLLDCDPGLSCELVEKYISPASTCASNYVGVILDEPSSSPYPGYINDVPRFIWNFLADITSIPKENNSSDCQRGCSGSNEVCIKAETDGKGICALSTTRYVPAYSTRLKFESGVWNILPPNASDNMGVVDPVWTESNWNSLGIRVYTVQTAVYDWVVLSGAIAFTILSYLAIAVTRILVAKATKRD 666
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vifa2g01517 666 Pfam Nicastrin small lobe 43 200 IPR041084 -
Vifa2g01517 666 FunFam Nicastrin 170 466 - -
Vifa2g01517 666 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 213 451 - -
Vifa2g01517 666 Gene3D Zn peptidases 177 470 - -
Vifa2g01517 666 PANTHER NICASTRIN 5 664 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Vifa2g01517 666 Pfam Nicastrin 242 451 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vifa2g01517 K06171 - gmx:100818367 1042.72