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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vifa1g07961 ATGGCTAGCTTCAAGACCTTCAATGTCATCACAAACTCCACCAAGGCACAAGATTCAACGTTTCTAAACCAAACACTAACAGAAAATATTGTGAGGAAAATCTTCAAGTTTATTTTCTATCTCCACTTGCTTTTAATTTCACTTTTGATCATTTCTCTCACAATCTATAACCTTATCATCTCCCCCTCTCAAAACCCTAATTTCCACCCAATGAAATGGTACCCTCCCCTCTTAACCTCAATATTATGTGCTGGAGTTTTTGGTTTCACATGGAAATGGATCACTCTCAAGAACCCTAAAATTGCCATCAAAACAATATTTTGGCTTAGCCCTATTCTTACATGTGCAATGGCCATCATGTTGGTCTACATCGAAACTACGATAAGTCTTACATTTGGTGTCATTGCTTTGATTTCTTCATTGATTCAATCTCTCTATGGTTGTTGGATCAATCATAGACTTGAATATGCCAACAAAATTTTATCAACTTCTATAGTTGATTTTCCTATCAAAACCATGAGAATAGTCTTTTCATCAACCCTAATCGAAATTTTCTATTGCTTTTTTCTCATGTTTGGAATAGGAGGATCAAGAGTAATTGAAAACAAAACAAAATTAACATCATTGTTCATTTTGTTGATTCTATTGAGCCTAGCATGGACTATGCAATTTCTCAAGAATGTGATTCAAGTAACAATTTCTAGGGTTAAGTATACGAATTTAGGTTGTGGTGAAGAAACTATGGACACAAGTGTTGCTTTTCATGACACATTGAAGTACTTAATTGGAAGTGTTACAATAGGTTCAATTTTGGTTCCATTTATCACAACCTTTAGGGGTTTTGCTAGGTCAATGAGTCTTATTGGAGGAGATAGTGATGAGTTCATGTTTTCTTTTGTTAGTTGCTATATGGGAATTGCTTCAATTCTTGTAAGGTGTGGAAATAGGTTTGGTTTTGTGCATGTTGGTATCTATAATAAAGGATTTGTGCAAAGTTCATGTGATGTATGGGACACTTTCAATAGGGTTGGATTGGTGCAACTTGTAGATTTGGATCTTACTGGATCATTTTGTTTTCTTAGTGGTGTGGTAGGGGGTGCAATAAGTAGTTTGGTGGGTGGAATTTGGAGTATTGTGGTGTATAAGAAATATGCAACTGAAGTGTCTATTTATGGATTCTTAATTGGATACTTTATGGTTAGATTGGGTTTGGCATGGGTACAAGCATGTGTTTGTGCTTACTATGTTGCTTATGCAGAGAATCCACAAAGTACTCATTTTGACTCAACTATTCCAATGCGTTTGGAACAGTTGCATAGATCTCAAGTTTAG 1332 0.3544 MASFKTFNVITNSTKAQDSTFLNQTLTENIVRKIFKFIFYLHLLLISLLIISLTIYNLIISPSQNPNFHPMKWYPPLLTSILCAGVFGFTWKWITLKNPKIAIKTIFWLSPILTCAMAIMLVYIETTISLTFGVIALISSLIQSLYGCWINHRLEYANKILSTSIVDFPIKTMRIVFSSTLIEIFYCFFLMFGIGGSRVIENKTKLTSLFILLILLSLAWTMQFLKNVIQVTISRVKYTNLGCGEETMDTSVAFHDTLKYLIGSVTIGSILVPFITTFRGFARSMSLIGGDSDEFMFSFVSCYMGIASILVRCGNRFGFVHVGIYNKGFVQSSCDVWDTFNRVGLVQLVDLDLTGSFCFLSGVVGGAISSLVGGIWSIVVYKKYATEVSIYGFLIGYFMVRLGLAWVQACVCAYYVAYAENPQSTHFDSTIPMRLEQLHRSQV 443
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vifa1g07961 443 Pfam Plasma-membrane choline transporter 135 422 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Vifa1g07961 443 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 30 437 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vifa1g07961 Vifa-Chr1 1241481547 1241483351 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vifa1g07961 - - gmx:100818674 526.554