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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vian7g00460 ATGGAGCCGGAAGTGAGCATCGAAGGATCGGCGATGATTCAGGTGGCAGTTGTTCCGCACCAGAAGTCCCCCTTCGCAGTCCAGCCCTGGGACTCCGGATCCCTCCGCTTCAAGTTTGTCCTCGGCGGCGCGCCGCCCAGTCCCTGGGAGGACTTTCAGTCGAACCGCAAAACTCTCGGCGTCGTCGGCATCGTCCACTGTCCTTCCTCCTCCGATCTCGACGCTGCCGTCGACCTTTTCACCAATGTCTGCAAGTCCTTCCCCTCTTCCCTTGTTGATCGCTGTTTCGCCTTCTGCCCTAACGATTCGCAGGTCGTGCTTCGCTTTCTTCTTGAGGAAGGAAGTAAGAAAGGGGGAAATTTGAGGTTGTTTCCTCCTGCAGATCGTCCTACATTGGAGTTCCACTTGAACACTATGATGCAAGAGATTGCTGCGTCACTGCTTATGGAGTTTGAGAAATGGGTGCTTCAGGCAGAATCTTCCGGAACCATTCTCAAGACGCCTTTAGATTCTCAAGCTAGTCTCAGCTCAGAGGAGGTGTTCATGTTTAGTTTGGTTAGGTTCATGCTCGAGTGTGTTGTTGGAATGCAGGTTATCAAGGCCAAAAAGAGAAGGCTTGGGCGTGCCCAGAAGACCATTGGTGATTACTGTTTGCTGGCAGGGTCCCCTGTCGATGCCAATGCTCATTATTCTACTGCATTGGAACTTTCCAGGTTAACTGGTGATTACTTCTGGTATGCTGGAGCATTGGAGGGTAGTGTCTGTGCCTTGCTGATTGACCGAATGGGCCAAAAAGATTCAGCACTGGAAGAAGAAGTTAGATATCGTTATAATAGTGTGATAGTGAATTACAAGAAGTCACAAGATAATGCTCAGCGAGTTTCTCCCCTAACTTTTGAACTTGAAGCTACTTTGAAATTAGCAAGGTTTCTTTGCAGGAGAGAGCTGGCCAAGGAGGTGGTGGAGTTGTTGACCACAGCTGCAGATGGTGCTAAATCTTTAATTGACGCAAGTGATAGACTCATATTGTATATTGAAATAGCTCGTCTGTATGGAAGTCTGGGATACCATAGAAAAGCTGCATTTTTCTCAAGGCAGGTTGCACAGTTATATCTGCAGCAAGAAAATAGATTGGCTGCAATTAGTGCTATGCAAGTTTTGGCAATGACCACCAAAGCTTATCATGTTCAAAGTAGATCATCAATCTCTGATCATTCTTTGCACAGTAATGGAATTGTATCAAATCATGCTGATAGTGGGAAAGCAAACCACCAATCAGCAGTCTCACTATTTGAGTCTCAATGGAGTACCCTCCAGATGGTTGTATTAAGAGAAATTCTACTTTCTGCTGTCCGTGCTGGTGATCCTCTTACTGCATGGAGTGCAGCAGCACGACTCCTTAGATCCTACTATCCTCTAATAACACCTGCTGGGCAAAATGGCCTTGCTAATGCACTTTCAAATTCAGCTGACAGGCTGCCACCAGGGACTCGTTGTGCTGATCCTGCTTTACCCTTTGTGAGGCTGCATTCCTTTCCTCTCCATCCAACACAAATAGACATAATAAAGCGCAGTTCTGCTAGAGAAGATTGGTGGGCTGGTGCTGCTCCTTCTGGACCTTTCATTTATACACCATTCAGTAAAGGAGAGTCTAATAATACCAAGAAGCATGAGCTTATTTGGATTGTTGGAGAACCTGTTGAGGTCTTGGTGGAATTAGCAAACCCATGTGGCTTTGATTTAAGGGTTGATAGCATCTATTTATCCGTGCATTCTGGGAATTTTGATGCTTTCCCCGTAAGTGTAAGCCTTCTACCAAATTCTTCAAAAGTGATCACCTTATCTGGTATTCCAACATCAGTGGGACCAGTTTCAATTCCTGGGTGCATTGTTCACTGTTTTGGTGTTATTACTGAACATCTGTTTAAAGAGGTTGATAATCTACTCCTTGGGGCCTCACAAGGGCTGGTCCTTTCTGACCCTTTTCGATGCTGTGGATCTCCAAAGTTGAAAAATGTCTCTGTTCCTAATATTTCTGTAGTACCACCACTTCCATTATTGGTATCACATGTTGTTGGAGGTGATGGAGCCATCATTTTATATGAAGGTGAAATTCGGGATGTGTGGATTCGCCTGGCTAATGCCGGTACTGTTCCAATTGAACAGGCCCATATTTCATTGTCCGGGAAAAATCAAGATTCTGTAATTTCATATTCTTCTGAAACATTGAAATCTTGCCTCCCTCTGAGACCTGGAGCAGAAGTTACATTCCCTGTGACCTTGAGAGCCTGGCAGGTTGGCTTGGTGGATGCAGATGCTGGTGCAGGGAAGACTGTCTCAGGGAACAATATGAGGCATTCCAAAGATGGAAGCAGCCCATCGCTGTTGATCCACTATGCCGGTCCGATGCAAACCTCTGAAGAAACTCCAACAAATGGATCTACTCTGCCCCCTGGCAGAAGGCTTGTTGTTCCTCTGCAGATTTGTGTTTTGCAGGGCTTGTCCTTTGTGAAGGCTCAGCTTCTTTCAATGGAGTTTCCTGCTCATGTTGGTGAAAGTCTTCCGAAGTTGGATGATGTAAATAATAAGTCTATTGATGAACATGTTAACTCAGAGACAAAAATGGACAGATTGGTGAAAATAGATCCTTTCAGAGGAAGTTGGGGGCTTCGATTCCTTGAACTTGAGTTATCTAATCCGACTGATGTTGTGTTTGAAATCAATGTCTCTGTCAAACTGGAGAACTCAAGCAGTGAGAACAACCATTTTTCTGATCAGGGTGCAACTGAATATGTCTATCCTAAAACAAGAATTGATAGAGATTGCTCCGCGAGGGTTCTAGTGCCTCTTGAGCATTTTAAATTACCTGTTCTTGACGATTCCTTTTTTATGAAGGATACCCAGTTAGATGGGAATGGAGGAAGAAATGCATCCTTCTCAGAGAAGAACACCAAAGCTGAACTAAATGCTTGCATCAAGAACCTTATATCTAGGATTAAGGTTCGATGGCAATCAGGACGGAATAGCTCTGGGGAGTTAAATATTAAAGAAGCTATCCAGGCTGCTCTCCAAACATCAGTCATGGATATTTTACTTCCAGATCCATTGACGTTTGGCTTCAGGCTTGTTAGAGATGGTTCTGAATCAACAACAGCTGATCCGGATAAAGAATCTGCATCTGCTGCTTCCAAAGGTTCCGTGATTGCACATGAAATGACCGCAATGGAAGTTCTGGTTCGTAATAATACTAAAGATATGCTCAAAATGAGTCTTAATATTACATGCAGAGATGTAGCCGGGGAAAATTGTGTAGATGGTACCAAAGCGACTGTTCTATGGACGGGTGTTCTGAGTGACATTGCTATGGAAATTCCCCCACTTCAACAAATTAGACACTCGTTCTGCCTTCATTTTCTTGTCCCTGGAGAGTATACACTACTTGCTGCAGCAGTGATTGATGATGCAAATGACATTCTTCGTGCTCGTGCGAAGACAACCTCGGCTTCTGAGCCAATTTTCTGTCGTGGACCACCCTATCACGTTCGTGTCCTTGGAACTGCATGA 3564 0.4481 MEPEVSIEGSAMIQVAVVPHQKSPFAVQPWDSGSLRFKFVLGGAPPSPWEDFQSNRKTLGVVGIVHCPSSSDLDAAVDLFTNVCKSFPSSLVDRCFAFCPNDSQVVLRFLLEEGSKKGGNLRLFPPADRPTLEFHLNTMMQEIAASLLMEFEKWVLQAESSGTILKTPLDSQASLSSEEVFMFSLVRFMLECVVGMQVIKAKKRRLGRAQKTIGDYCLLAGSPVDANAHYSTALELSRLTGDYFWYAGALEGSVCALLIDRMGQKDSALEEEVRYRYNSVIVNYKKSQDNAQRVSPLTFELEATLKLARFLCRRELAKEVVELLTTAADGAKSLIDASDRLILYIEIARLYGSLGYHRKAAFFSRQVAQLYLQQENRLAAISAMQVLAMTTKAYHVQSRSSISDHSLHSNGIVSNHADSGKANHQSAVSLFESQWSTLQMVVLREILLSAVRAGDPLTAWSAAARLLRSYYPLITPAGQNGLANALSNSADRLPPGTRCADPALPFVRLHSFPLHPTQIDIIKRSSAREDWWAGAAPSGPFIYTPFSKGESNNTKKHELIWIVGEPVEVLVELANPCGFDLRVDSIYLSVHSGNFDAFPVSVSLLPNSSKVITLSGIPTSVGPVSIPGCIVHCFGVITEHLFKEVDNLLLGASQGLVLSDPFRCCGSPKLKNVSVPNISVVPPLPLLVSHVVGGDGAIILYEGEIRDVWIRLANAGTVPIEQAHISLSGKNQDSVISYSSETLKSCLPLRPGAEVTFPVTLRAWQVGLVDADAGAGKTVSGNNMRHSKDGSSPSLLIHYAGPMQTSEETPTNGSTLPPGRRLVVPLQICVLQGLSFVKAQLLSMEFPAHVGESLPKLDDVNNKSIDEHVNSETKMDRLVKIDPFRGSWGLRFLELELSNPTDVVFEINVSVKLENSSSENNHFSDQGATEYVYPKTRIDRDCSARVLVPLEHFKLPVLDDSFFMKDTQLDGNGGRNASFSEKNTKAELNACIKNLISRIKVRWQSGRNSSGELNIKEAIQAALQTSVMDILLPDPLTFGFRLVRDGSESTTADPDKESASAASKGSVIAHEMTAMEVLVRNNTKDMLKMSLNITCRDVAGENCVDGTKATVLWTGVLSDIAMEIPPLQQIRHSFCLHFLVPGEYTLLAAAVIDDANDILRARAKTTSASEPIFCRGPPYHVRVLGTA 1187
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian7g00460 1187 PANTHER TRAFFICKING PROTEIN PARTICLE COMPLEX SUBUNIT 9 19 1181 IPR013935 -
Vian7g00460 1187 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 318 733 IPR013935 -
Vian7g00460 1187 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 21 266 IPR013935 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vian7g00460 Vian-Chr7 11716955 11725566 Dispersed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian7g00460 K20306 - gmx:100784850 2117.43