Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vian2g02755 ATGCTGCGTCTGAAAGCGTTTCGGCCTACGAGCGACAAAATCGTTAAGATCCAATTGCATCCGACGCATCCATGGATGGTTACGGCCGATGATTCAGATCGAGTTTCGGTTTGGAACTGGGAGCACCGCCAGGTGGTGTATGAGTTGAAAGCTGGTGGAGTGGACGAGCGGCGTTTGGTCGGCGCCAAGTTGGAGAAGCTGGCCGAGGGAGAAATAGAGTCTAAAGGGAAGCCTACCGAAGCCATTCGGGGAGGAAGTGTTAAGCAGGTGAATTTTTATGATGATGATGTACGCTTTTGGCAACTTTGGCATAATCGTTCTGCGGCTGCTGAGGCTCCAACAGCTGTCCACACTTCAGCTTTTAGCTCTCCTGCCCCATCAACAAGAGGGAGACATTTTCTTGTCATATGTTGTTTAAACAAAGCTATATTTTTGGACTTGGTGACCATGCGTAGCCGTGATGTACCAAAGCAAGAGCTTGATAACAAGTCCCTTCTGTGCATGGAGTTCCTTTATAGAACTGGTGTTGGTGATGGTCCTCTTGTTGCTTTTGGTTCATCGGATGGTGTCATTAGAGTTCTCTCAATGATGACATGGAAGCTTGTGCGAAGGTACACTGGAGGTCATAAAGGTTCGATCTCTTGTTTGATGTCCTTCATGGCTGCTTCTGGCGAGGCTCTTCTGGTTTCGGGCGCTAGTGATGGATTGCTCATAATTTGGAGTGCTGACCACGGACAGGATTCACGTGAACTTGTACCCAAGCTGAGTTTAAAAGCACATGATGGCGGGGTTGTGGCAGTTGAGTTGTCTAGGGTAATGGGAGGTGCTCCACAGCTAATCACAATTGGTGCAGATAAGACATTAGCCATATGGGACACTGTGTCCTTTAAGGAGCTGCGACGGATAAAGCCAGTTCCCAAATTGGCTTGCCATAGTGTGGCTTCTTGGTGCCATCCTCGAGCTCCAAACCTTGATATTCTAACCTGTGTCAAGGATTCTCACATATGGGCAATTGAACATCCCACTTATTCTGCTCTCACGAGGCCATTGTGTGAATTGACCACAGTTATTCCTCCACAAGCCCTTTCTCCTAATAAGAAATTGAGGGTGTATTGTATGGTTACACATCATTTGCAGCCACATCTAGTTGCTACAGGAACCAACATTGGTGTTATTATCTGTGAGTTTGATGCTAGATCTCTTCCACCTGTTGCTCCTCTACCAACACCAGCAGACAGTAGAGAGCATTCTGCCGTATTTGTAATTGAAAGGGAATTGAAGCTATTAAATTTTCAGTTAAACAACTCTGCAAATCCATCTCTTGGAAATAACAGCTCCTTGTCAGAAACAGGAAGACCCAAGGGAGACTTTTTTGAACCATTATCTGTCAAGCAGGGGAAAAAGCACATTAGTACTCCTGTTCCACATGATTCGTACTCAGTTCTTTCTGTCAGCAGTTCAGGAAAGTATCTAGCAATTGTTTGGCCAGATATTCCTTATTTCTCTGTCTACAAGGTTAGTGATTGGTCAATTGTTGACTCTGGAAGTGCAAGGCTTCTGGCATGGGATACTTGTCGTGACAGATTTGCTATATTGGAATCAGCATTACCTCCTAGAATTCCTATAATGCCCAAGGGTAGCTCATCAAAAAGAGCCAAAGAAGCTGCTGCGGCACAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGCTGCTTCCACAGCTTCTGTTCAAGTCCGCATCTTGTTAGATGATGGTACATCAAATATACTAATGAGGTCTGTTGGCGCACGCAATGAACCAGTCATTGGTTTGCGTGGAGGAGCACTGCTTGGTGTTGCCTATCGAACATCTAGGAGAGTCAGTCCTATTGCTGCCACCGCTATTTCAACAATTCAGTCTATGCCCTTATCAGGTTATGGAAGCAGTGGTCTTTCTTCTTTTACTACTTATGATGATGGATTTTCTTCAAATAGACCTCCAACCGCAGCAGCACCTCAAAACTTCCAGCTATACAGTTGGGAGACATTCCAGCCAGTGGGGGACCTTCTTCCTCAGCCAGAATGGACTGCTTGGGACCAAACCGTTGAGTACTGTGCATTTGGATACCAGCAATACATAGTCATATCTTCTTTGCGCCCTCAATATAGATATTTGGGAGATGTTGCAATCCCATATGCTACCAGTGCTGTTTGGCACAGGAGGCAACTGTTTGTGGCTACCCCGACTACTATCGAAATCGTTTTTGTGGATGCTGGGGTTGCTCAAATTGACATTGAAACTAAGAAGATGAAAGAAGAGCAGAAAATGAAAGAAGCACAGGCAAAAGCTGTTGCAGAGCACGGAGAGTTAGCTCTAATTACTGTAGAAGGTCCTCAGTCTGCTAAGGAAGAAAGAATAGCATTGAGGCCGCCAATGTTGCAGGTGGTTCGGTTGGCTTCATTTCAGCATGCTCCTTCAGTGCCACCTTTCTTAACATTACCAAAACAATCTAGAGTGGATGGTGATGACTCTTGGTCGGCCACAGAAGAGAGAAAGACAGGTGAGGTGGCAGTTGGTGGTGGGGGTGTGGCTGTGGCAGTTACCCGTTTTCCAATGGAGCAGAAACGTCCGGTTGGGCCTCTTGTAGTTGTAGGTGTCAGGGATGGAGTTCTTTGGCTAATTGACAGTGTTATAACTGTTTACTTACAATCAGCACCAAAACCTCTGCCCCTCCATAATCGACGTGAGACCTTTGATAAAGTATGCCTATCTATCTTCCTCAAAGTAGAATGCCATGAGCAGCCAACTGATTCCAATAAAAAGGATGTTATTGATTTCTGGGTTAGCAATGATTTGAAAAGAGCTCTTCATTATAAAAAACAAGAGAAAATATCAGATAAAAAAAAAGATATGGTTGAAGGTGTTCAGGGTATTGTGAAATTTGCAAAAGAGTTCTTGGATCTTATTGATGCCGCAGATGCTACTGCACAGAGTGATATTGCACGTGAGGCTCTTAAGAGGTTAGCTGCAGCAGGTTCGGTGAAAGGTGCTTTAGAAGGTCATGAGTTGAGAGGGTTAGCATTACGTCTTGCAAATCATGGAGAGTTGACTCGTCTAAGTGGTTTGGTTAACAATTTAGTTACGCTTGGCTTGGGAAGGGAAGCAGCATTTGCTGCTGCTGTTTTGGGTGACAATGCTCTGATGGAGAAAGCATGGCAAGATACAGGAATGCTGGCAGAGGCTGTGCTTCATGCTCATGCACATGGACGGCCAACTTTGAAGAACTTAGTGCAGGCTTGGAACCAAGCATTACAGAGAGAGATTGAACCTACCCCATCTCAGAAGACAGATGCTGCAGCTGCGTTTTTAGCTTCTCTTGAGGAGCCTAAGCTCACAAGTTTGGCAGATGCTGGGAAGAAAGCACCTATTGAAATCCTGCCTCCGGGGATGATGTCTCTTAATGCTTCTATTTCCATCCAGAAAAAACCAGCTTCTTCTGCGCAGAACTCCCAACAACCCCCAGACAAGCTATTGGCACTGGAAGCACCTCCTACAACCACAGCTGCACCAGAGAGTGCTACTCAGCAGCCTGAATCCACACCAGCATCAGTTAGTGAGCCACCTCCGTCAGAGTCTACCTCAGAGTCCACGCCAGCTCATGTAGCTGCTCCACCTCAACCAGAATCAGGTGAAACGACCGTAGCTGATGGGGTTCCTACCACTGGACCAGCTAGTGACGGAGGTCCGAATGTTAATGGTGAAACTGGTCAAGCAGAAACGTCTACCGGAAATCCAGCAGTCCCAGAGGTTCTCCCACCTCCAGTAGCAGCAGAGGTTTCGGAGACTTCTACTCCAAGTATAGCTGCAGTTCCTACAACAACTACAGTTCCGGCAAATGATCCCTTTATATGA 3882 0.4619 MLRLKAFRPTSDKIVKIQLHPTHPWMVTADDSDRVSVWNWEHRQVVYELKAGGVDERRLVGAKLEKLAEGEIESKGKPTEAIRGGSVKQVNFYDDDVRFWQLWHNRSAAAEAPTAVHTSAFSSPAPSTRGRHFLVICCLNKAIFLDLVTMRSRDVPKQELDNKSLLCMEFLYRTGVGDGPLVAFGSSDGVIRVLSMMTWKLVRRYTGGHKGSISCLMSFMAASGEALLVSGASDGLLIIWSADHGQDSRELVPKLSLKAHDGGVVAVELSRVMGGAPQLITIGADKTLAIWDTVSFKELRRIKPVPKLACHSVASWCHPRAPNLDILTCVKDSHIWAIEHPTYSALTRPLCELTTVIPPQALSPNKKLRVYCMVTHHLQPHLVATGTNIGVIICEFDARSLPPVAPLPTPADSREHSAVFVIERELKLLNFQLNNSANPSLGNNSSLSETGRPKGDFFEPLSVKQGKKHISTPVPHDSYSVLSVSSSGKYLAIVWPDIPYFSVYKVSDWSIVDSGSARLLAWDTCRDRFAILESALPPRIPIMPKGSSSKRAKEAAAAQAAAAAAAAASTASVQVRILLDDGTSNILMRSVGARNEPVIGLRGGALLGVAYRTSRRVSPIAATAISTIQSMPLSGYGSSGLSSFTTYDDGFSSNRPPTAAAPQNFQLYSWETFQPVGDLLPQPEWTAWDQTVEYCAFGYQQYIVISSLRPQYRYLGDVAIPYATSAVWHRRQLFVATPTTIEIVFVDAGVAQIDIETKKMKEEQKMKEAQAKAVAEHGELALITVEGPQSAKEERIALRPPMLQVVRLASFQHAPSVPPFLTLPKQSRVDGDDSWSATEERKTGEVAVGGGGVAVAVTRFPMEQKRPVGPLVVVGVRDGVLWLIDSVITVYLQSAPKPLPLHNRRETFDKVCLSIFLKVECHEQPTDSNKKDVIDFWVSNDLKRALHYKKQEKISDKKKDMVEGVQGIVKFAKEFLDLIDAADATAQSDIAREALKRLAAAGSVKGALEGHELRGLALRLANHGELTRLSGLVNNLVTLGLGREAAFAAAVLGDNALMEKAWQDTGMLAEAVLHAHAHGRPTLKNLVQAWNQALQREIEPTPSQKTDAAAAFLASLEEPKLTSLADAGKKAPIEILPPGMMSLNASISIQKKPASSAQNSQQPPDKLLALEAPPTTTAAPESATQQPESTPASVSEPPPSESTSESTPAHVAAPPQPESGETTVADGVPTTGPASDGGPNVNGETGQAETSTGNPAVPEVLPPPVAAEVSETSTPSIAAVPTTTTVPANDPFI 1293
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian2g02755 1293 MobiDBLite consensus disorder prediction 1174 1293 - -
Vian2g02755 1293 PANTHER TSET COMPLEX MEMBER TSTF 928 1207 - -
Vian2g02755 1293 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 7 316 IPR036322 GO:0005515
Vian2g02755 1293 Gene3D - 3 348 IPR015943 GO:0005515
Vian2g02755 1293 SMART WD40_4 250 292 IPR001680 GO:0005515
Vian2g02755 1293 SMART WD40_4 1 39 IPR001680 GO:0005515
Vian2g02755 1293 SMART WD40_4 198 241 IPR001680 GO:0005515
Vian2g02755 1293 MobiDBLite consensus disorder prediction 1269 1293 - -
Vian2g02755 1293 Gene3D - 939 1111 - -
Vian2g02755 1293 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 257 301 IPR001680 GO:0005515
Vian2g02755 1293 MobiDBLite consensus disorder prediction 1177 1210 - -
Vian2g02755 1293 MobiDBLite consensus disorder prediction 1223 1254 - -
Vian2g02755 1293 Coils Coil 752 772 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian2g02755 - - gmx:100786844 2081.6