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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
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Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian2g01785 932 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 528 818 IPR017853 -
Vian2g01785 932 SMART alpha_l_af_c 356 494 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Vian2g01785 932 SMART alpha_l_af_c 735 921 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Vian2g01785 932 Gene3D - 811 927 IPR013780 -
Vian2g01785 932 Gene3D Glycosidases 668 810 - -
Vian2g01785 932 Pfam Alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain 357 404 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Vian2g01785 932 Gene3D Glycosidases 116 413 - -
Vian2g01785 932 Gene3D Glycosidases 530 667 - -
Vian2g01785 932 PANTHER ALPHA-L-ARABINOFURANOSIDASE 1 478 541 - -
Vian2g01785 932 Pfam Alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain 736 910 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Vian2g01785 932 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 124 403 IPR017853 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vian2g01785 Vian-Chr2 36118145 36131515 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vian2g01785 542 929 Glycoside Hydrolase AT3G10740 56.459 4.61e-152 463
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian2g01785 K01209 - gmx:100780771 635.565