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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
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Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian2g00592 808 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 12 806 IPR021910 GO:0016020
Vian2g00592 808 MobiDBLite consensus disorder prediction 792 808 - -
Vian2g00592 808 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 562 767 IPR021910 GO:0016020
Vian2g00592 808 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 541 552 IPR000742 -
Vian2g00592 808 Gene3D - 390 556 - -
Vian2g00592 808 MobiDBLite consensus disorder prediction 788 808 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vian2g00592 Vian-Chr2 7237847 7245282 Dispersed/Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian2g00592 - - gmx:100778959 1513.43
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vian2g00592 2 7237847 7245282 Vian2g00592 2 7237847 7245282 ECH
Vian2g00592 2 7237847 7245282 Vian9g00649 9 7998591 8004244 PCT