Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vian10g00436 ATGGAAAGACATCACCTGAATAAGAGTATTGGCTTAGAGAGGTGGTTGGGTTATTCTGGGTCACTTGTGCGAGACGATTCTCAACTCCATGATTCTGCATTTGTTGACACATCAACTTTGTCATCACCATTGAATGTCTTAGTCTCTTGTGAGGACTTGGAAGGTGTAGGATCTTTTAATACCACGTGCTTGCTAAGCTCAACTCATTATTTAAAATCTGATATTAACATTTATGGCGTTGGAAACCTGGAGCTACTTTCTGATGTGTCGCTTTTATGCCCTGTGGAAGGGTGCATGATATCAGTAAATGTGTCTGGCAACATTAAACTTGGTCAAAATGCATCCATTGTTGCTGGTTCTGTGGTTTTATCTTCAGCCAATCTGACTATGGAATGCAATTCTTATATAGAATCATCATCTTTAGGTGGGTCACCACCTTCCCAAACTAGTGGAACTCCTGTTGGCAGTGACGGAGCTGGTGGAGGGCATGGTGGGCGTGGTGCATCTTGTTTAAAAAATAATAAGACAAACTGGGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCTACATTGTCTGAACCATGGAGTTACGGGAGCAAGGGTGGTGGGAAATCTCATATAAAGCAATATGGAGGGAATGGTGGAGGACGTGTTAAGCTTCTAGTGAAGGACACTTTATATGTAAATGGATCTATTACTGCAGAAGGAGGAGATGGAGGGTCTGATGGCGGAGGTGGCTCTGGTGGAAGTATATGGGTTCATGCTGTGAAGCTGAAAGGGTATGGTACCATTAGTGCCGCAGGTGGGAGAGGATGGGGTGGAGGGGGTGGAGGAAGAATATCACTGGATTGTTACAGTATACAAGAAGATTTAAATGTTACGGTTCATGGAGGTTTGAGCATTGGCTGTCCTGGGAATTCCGGAGCAGCTGGAACATATTTCAATGCACATTTACTGAGTTTGAAAGTTAGCAATGATAATGTCACAACAGAAACTGAGACTCCTTTGCTTGACTTCTCAACCAGCCCTTTATGGTCAAATGTTTATGTGGAAAATAATGCAAAAGTTTTGGTTCCACTTGTGTGGTCCAGAGTCCAGGTCAGAGGCCAAATTAGTGTATACAGTGGAGGAAGCTTAATCTTTGGGCTGTCTGATTATCCAATTTCTGAGTTTGAGCTTGTTGCAGAAGAGCTTTTATTGAGTGATTCTATCATAAAGGTTTTTGGTGCATTTAGAGTTTCTGTTAAAATGTTACTCATGTGGAACTCCACAATGCAAATTGATGGTGGTGAGACTACAGTTGTGACTGCTTCAGTGCTTGAAGTGAGAAATCTTGCTGTTTTAAGGCAAAATTCTGTCATTAGTTCAAATACAAACTTGGCTTTATATGGTCAAGGACTACTGCAATTGACTGGTGAAGGCGATGCTATCAAAGGCGAGCGATTATCCTTGTCTCTGTTCTATAATGTAACTTTGCATATGGATGCAGCATTTCAATTGACAGTGTTGCTCTTGCAACAGGTGGGTCTAGGTTCTTTACTTCAAGCTCCTTTGGATGATGACACTAGTAGAGGCATGGTGACAAAACATCTTTGTGACGCACAAAGATGTCCAATGGATTTGATAACGCCACCTGACGATTGTCATGTCAATTATACACTCTCCTTCTCACTGCAAATTTGTCGTGTTGAGGATCTTCTTGTAAATGGCATTATGAAGGGAAGCATAATTCACATTCACAGGGCTCGAACTGTGATTGTTGATACAGATGGTATGATTACTGCATCTGAATTAGGTTGCACTGAAGGTATTGGTAAGGGAAACTTTTTGAATGGAGCTGGTGGTGGTGCTGGACATGGTGGAAAAGGAGGATCCGGATATTTCAATGGGAGAGAAAGTATTGGTGGTAATGACTATGGAAATGCTATTCTTCCATGTGAACTGGGTAGTGGAACTGAGGGCCCAAATGAGTCATATGGGCATGTTGTTGGAGGCGGGATGATTGGATCCATCCAGTGGCCACTTTTGAGACTTGACCTATATGGAACCTTGAGGGCTGATGGTGAAAGCTTTAGCAAATCAATAACAAGCAGTGATGGTTCTTTGGTGGGGGGTCTAGGCGGAGGTTCTGGTGGGACAGTCCTTCTATTCCTTCAAGAACTTAGGCTCTTGGAGAATTCATCCTTGTCTGTTGTTGGGGGCAATGGTGGACCTGTTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAGGTAGAATCCATTTCCATTGGTCAAAGATTGGTGTGGAGGAAGAATATGTTCCTGTTGCAAGTATTACTGGCACCATGAATAACAGTGGAGGTGCAGGGGACAATGATGGTCATCATGGACAAGAGGGTACTATAACTGGGAAAGCATGCCCTAAAGGTCTTTATGGAGTTTTCTGCGAGGAATGTCCTCTTGGTACCTATAAAGATGTTGATGGTTCTGAGGAAGATCTTTGCATTCCTTGTCCTCTTGATCTTCTTCCAAATCGTGCAAATTTCATTTATAAACGAGGGGGTGTTACAGAACGGTCTTGTCCATATAATTGCATATCAGACAAATATCGGATGCCAAATTGCTATACACCTCTAGAGGAGCTCATTTATACATTTGGGGGTCCCTGGCCTTTTTCAGTAATGTTATCATTCATTTTATTGCTCTTGGCTCTGCTACTAAGTACTTTGAGAATCAAGTTGATCGGTTCTGGTTCATATCATAGTTCAAGTTCAATTGAACACCGTAATCATCACCGTTTCCCATATCTTCTTTCCCTCTCCGAGGTCCGTGGAGCTAGAACTGAAGAGACTCAAAGTCATGTACACAGAGTGTACTTTATGGGTCCTAATACTTTTAGAGAACCCTGGCATCTTCCTTACTCACCTCCTCATGCTATAATTGAGATTGTGTATGAGGATGCTTTTAATAGATTTATCGATGAAATCAACTCGGTTGCTGCATATGATTGGTGGGAAGGATCAGTGCATAGTATACTTTCGGTTGTTGCATATCCCTGTGCTTGGTCTTGGAAGCATTGGAGGCGAAGAGTCAAAATCAGTCGCCTTCAGGAATATGTGAAGTCTGAATATGACCATTCCTGTCTACGGTCCTGTCGATCACGTGCTTTGTACAAAGGGATGAAGGTTGGGACAACTCCAGATTTAATGGTAGCATACATCGATTTTTTTCTTGGTGGTGATGAGAAGCGATTAGACATTGTGTCAATTATACAAAAGAGATTTCCCATGTGCATAATTTTTGGTGGGGATGGGAGCTACATGGCGCCTTATTATCTTCACAATGATACACTGTTGACAAACCTCCTTGGTCAGCATGTCCCAGCAACTGTCTGGAATCGCTTGGTAGCGGGACTGAATGCTCAGTTAAGGACGGTAAGGCATGGATCAATTCGTACTGCAATAGGTCCTGTTGTTGATTGGATAAACAGCCATGGAAACCCCCAACTTGAGTTCCATGGAGTTAAAATTGAGCTGGGATGGTTCCAAGCAACAGCTTCTGGATACTTTCAACTTGGCATTGTGGTAGCAGTTGGGGATTATTCCCTTCTGGATTTGCATCAGTCTGATACTTGGGTTGGCACTGATGAAGTAGTGAGCCTTCAAGTTGCATTGTTTCTTGATATTTCTTATTATCTCGTAGATGATGATTTGTACAGATTCAGTTTAAATCCTGTGTTTTATCAGGCTTACGTTATTTATTTATCTGTTACGTACGGCAGGAAAAATGTGCCACAAGGAAAAAAGAATCTTAAGCACCTGCAGCATAGTTGGCCATATATGAGTAATTCATTATCTCTTAAAAGGATAACCGGAGGAATTAATGGCGGCCTTATAAATGATGCTACCTTAAAATCATTGGACTTTAAAAGGGACTTTCTATTCCCACTTTCTCTCCTGTTGTGCAATACTAGACCTGTTGGTCGCCAGGACACTGTACAGTTTCTGATTACGTTGATGCTTTTAGCAGATCTTTCTGTCACTCTACTCATGTTGCTCCAGTTCTACTGGATTTCTCTTGCCGCTTTTCTTTCTGTTCTACTAATTCTTCCTCTTTCTCTACTTTCTCCGTTTCCTGCTGGTCTGAATGCATTATTCAGTAAAGAACCCAGAAGAGCTTCACTTTTTCGAGTATATGCACTGTGGAATGCTACTTCTTTATTTAATATCGGAGTTGCTTTTATTTGTTGTCTCCTTCATTATGCACTATCCCACTTTCACCACCCTGACGAAGCAAGTGCGCGTAATATTAAGAGGGAAGATGATAAATGTTGGCTGTTACCTATCATCCTTTTTCTATTCAAGTCTATACAGGCTCGATTTGTCAATTGGCACATAGCAAATCTAGAAATTGAAGATTTTTCTCTATTTTGTCCCGATCCAGATGCATTTTGGGCTCATGAATCTGGATTCTGA 4434 0.4197 MERHHLNKSIGLERWLGYSGSLVRDDSQLHDSAFVDTSTLSSPLNVLVSCEDLEGVGSFNTTCLLSSTHYLKSDINIYGVGNLELLSDVSLLCPVEGCMISVNVSGNIKLGQNASIVAGSVVLSSANLTMECNSYIESSSLGGSPPSQTSGTPVGSDGAGGGHGGRGASCLKNNKTNWGGDVYAWSTLSEPWSYGSKGGGKSHIKQYGGNGGGRVKLLVKDTLYVNGSITAEGGDGGSDGGGGSGGSIWVHAVKLKGYGTISAAGGRGWGGGGGGRISLDCYSIQEDLNVTVHGGLSIGCPGNSGAAGTYFNAHLLSLKVSNDNVTTETETPLLDFSTSPLWSNVYVENNAKVLVPLVWSRVQVRGQISVYSGGSLIFGLSDYPISEFELVAEELLLSDSIIKVFGAFRVSVKMLLMWNSTMQIDGGETTVVTASVLEVRNLAVLRQNSVISSNTNLALYGQGLLQLTGEGDAIKGERLSLSLFYNVTLHMDAAFQLTVLLLQQVGLGSLLQAPLDDDTSRGMVTKHLCDAQRCPMDLITPPDDCHVNYTLSFSLQICRVEDLLVNGIMKGSIIHIHRARTVIVDTDGMITASELGCTEGIGKGNFLNGAGGGAGHGGKGGSGYFNGRESIGGNDYGNAILPCELGSGTEGPNESYGHVVGGGMIGSIQWPLLRLDLYGTLRADGESFSKSITSSDGSLVGGLGGGSGGTVLLFLQELRLLENSSLSVVGGNGGPVGGGGGGGGRIHFHWSKIGVEEEYVPVASITGTMNNSGGAGDNDGHHGQEGTITGKACPKGLYGVFCEECPLGTYKDVDGSEEDLCIPCPLDLLPNRANFIYKRGGVTERSCPYNCISDKYRMPNCYTPLEELIYTFGGPWPFSVMLSFILLLLALLLSTLRIKLIGSGSYHSSSSIEHRNHHRFPYLLSLSEVRGARTEETQSHVHRVYFMGPNTFREPWHLPYSPPHAIIEIVYEDAFNRFIDEINSVAAYDWWEGSVHSILSVVAYPCAWSWKHWRRRVKISRLQEYVKSEYDHSCLRSCRSRALYKGMKVGTTPDLMVAYIDFFLGGDEKRLDIVSIIQKRFPMCIIFGGDGSYMAPYYLHNDTLLTNLLGQHVPATVWNRLVAGLNAQLRTVRHGSIRTAIGPVVDWINSHGNPQLEFHGVKIELGWFQATASGYFQLGIVVAVGDYSLLDLHQSDTWVGTDEVVSLQVALFLDISYYLVDDDLYRFSLNPVFYQAYVIYLSVTYGRKNVPQGKKNLKHLQHSWPYMSNSLSLKRITGGINGGLINDATLKSLDFKRDFLFPLSLLLCNTRPVGRQDTVQFLITLMLLADLSVTLLMLLQFYWISLAAFLSVLLILPLSLLSPFPAGLNALFSKEPRRASLFRVYALWNATSLFNIGVAFICCLLHYALSHFHHPDEASARNIKREDDKCWLLPIILFLFKSIQARFVNWHIANLEIEDFSLFCPDPDAFWAHESGF 1477
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian10g00436 1477 PANTHER EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 35 1472 - -
Vian10g00436 1477 SMART GCC2_GCC3_2 799 847 - -
Vian10g00436 1477 MobiDBLite consensus disorder prediction 139 166 - -
Vian10g00436 1477 MobiDBLite consensus disorder prediction 139 155 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vian10g00436 Vian-Chr10 3995753 4018530 Transposed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian10g00436 - - gmx:100784489 2489.92
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vian10g00436 10 3995753 4018530 Vian10g00436 10 3995753 4018530 ECH