Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu07g02944 ATGGTTCTCGAGTTCCTGCTGCGGCAATCTGAAATGAATTTTGATGGTTCTGTACAACAGAATGAAAGGAACAGAAAAATTTTACGCTGCTTATTGAGCTGGGTCAGAGCGGGTTGCTTCTCTGAGATTTCTCCCGAAACATTGGCAGCTCACCCACTtctaaattttgtatttaactCATTGCAGGATTCTACATCATTTGATCTTGCCATTGAAGTTCTTGTTGAGCTTGTGACTAAACACGAGGGAGTGCCACAAATTTTGTTATGCAGAGTACATTATCTGAAGGAAGTACTTCTTTTTCCAGCTCTTAATAGGGGAGACATGAAAGTAATTGGTGGCCTTGCATGTCTGTTGTCAGAAATTGGGCAGGCTGCTCCATCTCTAATTGTAGAAGCAAGCGCCGAAGCCATTGCACTGACAGATGCACTCTTGAGCTGTGTGGCCTTTCCAAGTGAAGATTGGGAGATTGCAGACTCAACCCTACAGTTTTGGTCCACTCTTGCAAGCTATATACTTGGCATTGATGTAGATCGTGCAAAAAGAAAACACGTGGAAGCCATTTTTTCACCTGTGTTCTCAGCATTACTCGATTCACTGATATTACGCTCCCAGGTAGATGATTCTACATACAACGATGAAGGTAGAGTGATTGATTTGCCCGATGGCCTTGTACATTTCAGAATGAACCTAGTAGAACTTTTGGTGGATATATGTCACCTGTTAGGATCTACAATATTTATGCAAAAGCTCTTTATAGGTGGGTGTGCATCTCCGAATCTATCACTCCCTTGGAAAGAAATGGAAAGCAAGTTATTTGCTCTTAATGCTGCTTCCGATGTAATCATACAGGATGGCCAAAGTTTCGATTTCTCTGCAGTCATGCAGTTGGTGTCCATGTTATCGAGTAAGCCTTCTGATGGCTTAAAGGGTTTCATTTGCATTGTATACAGATCTCTAGCAGATGCTATTGGTTCTTATTCCAAGTGGATATCTGCTTTTAAGGAAAATTTTAGACCCTTGCTATTATTCCTCGCTATCGGGATTTCTGAACCTCTTTCTTCTAATGCATGTGCGTCTGCCCTGCGTAAAGTCTGTGAAGATGCTCCTGTAGTAATATATGAACCTTCACATTTGGAAATTTTAATGTGGATTGGAGAGGGGTTAGAGAAGTGGCATTTATCTTTGGAAGATGAGGAAGAAGTTATGCATGCAATAAGTCTCGTCCTTGGTTCTGTTCCTAATCTAGAATTGAAGAGCAACTTATTGGCTAGGTTGCTCTCGTCTAGCTACGAAGCTATTGGGAAACTTGTTGATCCAGAGAACAGCCTTTCTCTTAAACAGAACCCTGCTTCTTATACACAAATTTTGAATGCTGCCTCTAGAGGACTGCACAGAATAGGAACTGTGTTCAGTCATCTTTCGATATCTGTGGCAACTGAACCTGCTGCAGATGATTTGATACTTCTACTGCTAAGGGTTTTCTGGCCCACCTTGGAGAAAATATTTACCTCTGAGCATATGGAGAGTGGTATTTTATCAGTAGCAGCTTGCCGGGCTCTTTCCTTAGCTATTCAATCTTCAGGTCAGCATTTTGTGACCCTACTGCCCAAAGTGCTGGATTGGCTATcgacaaattttgttttgttccaaAGTCACGAGTGCTATATAAGAACTGCTTCCATTGTCATTGAAGAATTTGGTCACCGAGAGGAGTATGGACCTTTATTTGTTACCATGTTTGAAAGATTTACTCATTCGACTTCTGTAATGGCTCTAAACTCTTCCTACATATGTGACCAAGAACCTGACTTAGTGGAGGCCTACACCAATTTTGCATCCATATTCATTCGCTCCTGTAACaagGATGCCCTTTCAGCTTGTGGTTCTCTTCTTGAAGTTTCTATACAAAAAGCAGCTATATGCTGCACAGCCATGCACCGTGGTGCTGCTCTAGCTGCAATGTCTTATTTGTCTTGTTTCTTAGATGTGGGCCTTGTCTCTTTGTTAGAATGTATGAATTGTATTATTGAGGGGTCATTCAACGCCACAGCCATTCATGTCATATCCCACAGCGGTGAGGGACTTGTATCTAATGTGGTGTATGCCTTACTCGGTGTGTCTGCAATGTCACGGGTTCACAAGTGTGCAACAATTCTGCAACAACTGGCAGCAATTTGCACTTTATCTGAAAGAACATCATGGAAGACTATACTTTCTTGGCAAACTCTTAATGGATGGCTACAGTCAGCGGTTCAAGCTCTTCCTGCCGAATACTTAAACCATGGAGAAGCGGAGACCTTAGTGCCCCTTTGGTCCAAGGCCCTTGCTGCTGCAGCCTCTGATTATCTTGAGAGCAAGAACTCTGATGGATTGAAGAGCGATTTTGGACATATGCAAGGGAAGGGTGGGAGAGTTTTAAAGCGTCTGGTTCGGGAATTTGCCGATGCACACCGAAATATTCCAAATCTGACTTGA 2478 0.4193 MVLEFLLRQSEMNFDGSVQQNERNRKILRCLLSWVRAGCFSEISPETLAAHPLLNFVFNSLQDSTSFDLAIEVLVELVTKHEGVPQILLCRVHYLKEVLLFPALNRGDMKVIGGLACLLSEIGQAAPSLIVEASAEAIALTDALLSCVAFPSEDWEIADSTLQFWSTLASYILGIDVDRAKRKHVEAIFSPVFSALLDSLILRSQVDDSTYNDEGRVIDLPDGLVHFRMNLVELLVDICHLLGSTIFMQKLFIGGCASPNLSLPWKEMESKLFALNAASDVIIQDGQSFDFSAVMQLVSMLSSKPSDGLKGFICIVYRSLADAIGSYSKWISAFKENFRPLLLFLAIGISEPLSSNACASALRKVCEDAPVVIYEPSHLEILMWIGEGLEKWHLSLEDEEEVMHAISLVLGSVPNLELKSNLLARLLSSSYEAIGKLVDPENSLSLKQNPASYTQILNAASRGLHRIGTVFSHLSISVATEPAADDLILLLLRVFWPTLEKIFTSEHMESGILSVAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDWLSTNFVLFQSHECYIRTASIVIEEFGHREEYGPLFVTMFERFTHSTSVMALNSSYICDQEPDLVEAYTNFASIFIRSCNKDALSACGSLLEVSIQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVGLVSLLECMNCIIEGSFNATAIHVISHSGEGLVSNVVYALLGVSAMSRVHKCATILQQLAAICTLSERTSWKTILSWQTLNGWLQSAVQALPAEYLNHGEAETLVPLWSKALAAAASDYLESKNSDGLKSDFGHMQGKGGRVLKRLVREFADAHRNIPNLT 825
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu07g02944 825 Gene3D - 1 780 IPR011989 -
Tsu07g02944 825 PANTHER TRANSPORTIN 3 AND IMPORTIN 13 1 824 - -
Tsu07g02944 825 SUPERFAMILY ARM repeat 22 631 IPR016024 -
Tsu07g02944 825 PANTHER ARM REPEAT SUPERFAMILY PROTEIN 1 824 - -
Tsu07g02944 825 Pfam Exportin 1-like protein 2 74 IPR013598 -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tsu07g02944 K15436 - gmx:100780430 1451.8