Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu07g00648 ATGAAGGATATTCTCTTGGGACAATCTAGTACTACTCCATGGTGCTTGGATATTGGCCTGGTCATAGAAGCCACCGTATTGAATAATAATATTCCCTTGCAATTGTCGAGGATATTAAAAGTGTTGGATAGATATATAGAATATGCAATGGCACATATTGGCACCTTATTCATAGTGGACAAGAAAACTGGATTGTTTAATTTGTTCATCGTACATTCTACTATGGGCAGCTTAGATTTAGAAGGAGGTGAAAAGGATTCGGTGCTGACTACTACTCAAGTGAGCATTGGTGGATTTGACACTGATGTCAAAGCTTATGATCTGGTGTCATTCTTGGAGTCAGAGATTGGATGTGTAGACAGATGTCGGCTGAAGACTTCTTGCACTCCTACAGAATCATATCCAGAATTTATTGATACCAAACACATTGAAAAAACGGATGACTATAAGAAGGTGGCGCCTCATGCCTTTGTGCATTTTACTTCGTCGGAATCTGCAACTGAGGCCATGAACGCTGCAGGTCGCTGTGACCTAATTTTGAATAATAAGGTATTAAAGGTCATCAGTGGGCCACAGAATCCAAACTTGCTGAACCAAAGGAGGCGAACTGAGCCTCCTTTTAAGATGTCGGATGTAATCGTTGAAATTGGGACTTTTGTTGGCCAAACGGATTTTACCGTTGCTTGGAGAGGACCTGCTAAAGGGGTAAACTTTCTAGTGGACCCTTTTGACAGCATGTGCAAGCTTTGTTTCAATCAGGATATTGCGTTTGATTTCAAAGGAATAGTTAAAAAAGTAGTGATAAAGTGTGATTTTAAGGTGGCATTCTTGGTTAGAGACATAAATGAGATAATAAGATATGACGATACATCTCATCTTGTTGTTTTATTACATCTAGCTTCATCACCTTTGGTGTGGTACAGAACAGCCGATGATGACATTGAAGAATCGGTCACTATTGATTTGCTGGACGACGATGATCCTTGGATCAGAACGACTGACTTTACCCCTAGTGGAGCCATTGGTCGATGCAGTTATTATAGAATTGCAATCCCACCTCGTTATGGTGCAAAATTGAATAAGGCCTTGGAATATCTGAGACGCCAAAGAGTGCAAAGGGTTCCGCTTAACCGACCACTTAGGATACTAAATGAGCCTGATTTTGGGGTGCCCATGTCAGATGCTTTCTTCTACATAGATTTTCAGAAGGACATTTCTTTTGATATAATGTTCTTGATTAATGCAATTGTACACAGAGGAATATTCAACCAGTATAGTttatcaaacaagttttttgaATTGCTGAGAAATCAACCTAAGGATGTCAATGTGGCTGCCCTGAAGCACTTATGTACTTACAAGCGCCCAGTGTTTGATGCAGCTAAGAGGCTGGAAATGGTCCAAAGATGGTTGCTCAGAAATCCAAAACTTTATGAGATCTCCAAGCAGTTCGATGATATTATGGAGGTTAGAAGACTGGTTGTTACTCCAACAAAAGCCTATTGTATAGCACCGGAAGTTGAATTGTCTAATCGGGTTCTGAGAAGGTTTAGAGAAGTTTCAGACCGATTCTTGAGAGTCACCTTTATGGATGAAGGGATGCAAACACTTAATACAAATGCTCTTAACTATTATGTTGCTCCCATTGTGAAGGAAATCACATCAAACTCCTCTCCACAGAAGACAAGAATATATAAAAGAGTGAAGACAATCCTGGAAGGTGGGTTTTACTTTTGTGGCcgaaaatattcatttttagcCTTTTCGTCCAATCAACTTAGAGATCGTTCTGCTTGGTTTTTTGCCGAAGAAAAAAACATCAGTTGTGATTATATAAGAGATTGGATGGGTAAgtttaatcagaaaaatattGCAAAGTGTGCGGCTAGGATGGGGCAATGCTTCTCATCCACATATGCATCAGTGGAAGTTCCTGCTAATGAAGTTAACTCGATGCTACCTGATGTGGAGAGGAATAATTATGTTTTCTCTGACGGTATTGGTATTATCACAACTGATCTTGCAGTTGAAGTTGCTGAAAAATTGAACTTGGACAAGGTACCCTCTGCTTACCAGATCAGGTATGCTGGTTTTAAAGGGGTTGTAGCATGTTGGCCCACAAAAGGGGATGGAATCAGACTTTCTTTGAGACCCAGCATGAACAAGTTTCAATCCAATCATACTACGTTGGAGATCTGTGCGTGGACTAGGTTTCAACCTGGTTTTCTTAACAGGCAGATTATAACTTTGCTTTCATCTTTGAAAGTGCCTGATGAAATATTCTGGGAAATGCAGGAAGGGATGATTTCAAAGTTAAATCAAATGTTTGTTGATGCAGAAGTGGCTTTTGATGTTCTTACCAAGTCTTGTGCTGAGCATGGAAATGCTGCAGCAATAATGTTAAGTTGTGGCTTCAGTCCCAAAACAGAACCTCATCTTAGAGGCATGCTAAATTCTATACGTGCTGCGCAGCTTTGGGGCCTTCGAGAAAAGTCTAGGATTTTTGTTTCATCTGGGAGATGGTTGATGGGTGTCTTAGATGAGTTGGGTGTGCTTGAACAAGGGCAATGCTTTGTGCAAGTGTCTACTCCTTCTCTTGAAAATTGTTTCTCAAAGCACGGCTCAAGATTTTCAGAGACAAAAAACTTGCATGTGGTAAAAGGTCTTGTGGCTATAGCTAAAAATCCATGTCTTCACCCTGGAGATGTGAGAATTTTGGAGGCAGTTGATGTCCCGGATTTACATCATTTATATGACTGTCTTGTTTTCCCTCAAAATGGTGAAAGACCCCATCCAAATGAAGCTTCTGGAAGTGACCTTGACGGGGATCTGTATTTTGTCACATGGGATGGAAATCTCATTCCACCTAGTAAGAAGAGCTGGCCACCTATGGATTACACTGCTCAAGAAAGCCGACTTCAAACACGGCAAGTCACTATCAGGGACATCAtagatttttttgtcaaaaacatgGTGAATGAGCATTTGGGCTCAATCTGCAATGCACATGTGGTGCATGCTGATTCCAGTGCCAAAGGTGCCTTAGATCAAAAGTGCCAATCCTTGGCTGAGTTAGCAGCTGCTGCTGTTGATTTCCCCAAGACCGGGAAGCTTGTCACAATGCCCCCTAATTTGAAGCCCAAACTGTACCCCGATTTTATGGGGAAAGAGCACCACCAGTCATACCTGTCAGAGAAAATCCTCGGTAAACTTTACCGACGGATCAAAGATGCTTACGATAAAGATATTGATGCTCCCGAATTGAACTGTGCGTCTGGTGATATATATTATGATGCAGATCTCGAGCTTCCAGGATCTGCTGAATTTATTGCTGATGCATGGGAGCAAAAGTGCTCTTATGATGGCCAGTTAACTGGATTATTGGGCCAATACAAAGTGAAAACTGAAGAAGAAGTTGTCACAGGACAAATCTGGTCCATGCCAAGGTACAACAGTAGAAAGCAAGGGGAACTGAAGGAGAGGCTAAAGCACTCATACAGTTCTCTCAAAAAAGAATTTAGGCATAGTTTTGACATACTGAATTCTGATGTTCGAGACTTAAGtgatgaagaaaaaaacttgttatatgaaaaaaaagctTCTGCCTGGTATCAGGTTACATATCATCCGAAATGGGTGAAACAGTCTGTCGATATGCAATTGAAATCTTCAGAGAACCAAGATGCTACTAGTTTGGGGAATATCTTGATGTTGAGTTTTCCCTGGATTGCTGTTGATTACCTGGCACGCATAAAGATAAGGAATCGGAAAGTTGGAAATTTTGATTCAACCAAGGAAGTTGGTTCTCTGGCGAAATATCTATCCGAAAGCCTAGTGGCATACAACTTGCAATTTACAAAGGTCAAAGCATTTGATACTGAGTTCAATGCCCATTCCTCAATAAGTATCAAGACTATCAAGAACCTGAACACCAGCAACTTTCTCGTACATTCTACTATGGGCAGCTTAGATTTAGAAGGAAGTGAAAAGGATTCTGTGCTGACTACTACTCAAGTGAGTATTGGTGGATTTGACACTGATGTCAAAGCTTATGATCTGGTGTCATTCTTGGAGTCGAAGATTGGATATGTCGACAGATGTCGGCTGAAGACTTCTTGCACTCCTCCAGAATCGTATCCAGAATTTACGATGATTGATACgaaacaaattgaaaaaacGGATGACTATCAGAAGGTGGCGCCTCATGCCTTTGTGCATTTTACTTTGTCAGAATCTGCAACTGAGGCCATCAACGCTGCAGGTCGCTGTGACCTAATTTTGAATAATAAGGTATTAAAGGTGGTCAGTGGGCCACAGAATCCAAACTTCCTGAACCAAAGGAGGCGAACCGAGGCTCCTTTTAAGATGTCCGATGTAATCGTTGAAATTGGGACTTTGGTTGGCCAAACGGATTTTACCGTTGCTTGGAGAGGACCTCCTAAAGGGTTAAACTTTCTAGTGGATCCTTTTGACAGCATGTGCAAGCTTTGCTTTAATCAGGATACTACATTTGAATTCAAAGgaataagtaaaaaagtagTGATAAAGTGTGATTTTAAGGTGGGATTCTTGGTTAGAGACATAAATGAGATAATAAGATATGATGATACATCTCATCTTGTTGTTTTATTACATCTAGCTTCATCACCTTTGGTGTGGTACAGAACTGCCGATGATGATATTGAAGAATCGGTCACTATTGATTTGTTGGACGACGATGATCCTTGGATCAGAACGACCGACTTTACCCCTAGTGGAGCCATTGGTCGATGCAGTTATTATAGAATTGCAATCCCACCTCGTTATGGTGCAAAATTGAATAAGGCTTTGGAATATCTGAGATGCCAAAGAGTGCAAAGGGTTCCACTTAACCGACCACTTAGGATATTAAATGAGCCTGATTTTGGGGTGCCCATGTCAGATGCTTTCTTCTACATAGGTTTTCAGAAGGACATTTCTTTTGATATAATGTTCTTGATTAATGCAGTTGTACACAGAGGAATATTCAATCAGTATAGTTTATCGAACAAGTTTTTTGAATTACTGGCAAATCAACCTAAGGATGTCAATGTGGCTGCCCTGAAGCACTTATGTACTTACAAGCGCCCAGTGTTTGATGCAGCTAAGAGGCTGGAAATGGTCCAAAGATGGTTGCTCAGAAATCCAAAACTTTATGAGATCTCCAAGCAGTCCGATGATATTATGGAGGTTAGAAGACTGGTTGTTACTCCAACAAAAGCCTATTGTATAGCACCAGAAGTTGAATTGTCTAATCGGGTTCTGAGAAGGTTTAGTGAAGTTTCAGACCGATTCTTGAGAGTTACCTTTATGGATGAAGGGATGCAAACACTTAACACATATGCTCTTAACTTTTATGTTGCTCCCATCGTAAAGGAAATCACATCAAACTCCTTTCCACAAAAGACAAGAATATATAAAAGAGTGAAGACAATCCTGGAAGATGGGTTTTACTTTTGTGGCcgaaaatattcatttttagcTTTTTCGTCCAATCAACTTAGAGATCGTTCTGCTTGGTTTTTTGCCGAGGAAAAGAACATCACTTGTGATGATATAAGAAATTGGATGGGTAAGTTTAATCAGAAAAATGTTGCAAAGTGTGCGGCTAGGATGGGGCAATGCTTCTCATCCACATATGCATCGGTGGAAGTTCCTTCTAATGAAGTTAACTCGATGCTACCTGACGTGGAGAGGAATAATTATGTTTTCTCTGACGGCATTGGTATTATCACTGCTGATCTTGCAGTTGAAGTTgcagaaaaattgaaattggacAAGGCACCCTCTGCTTACCAGATCAGGTATGCTGGTTTTAAAGGGGTTGTAGCCTGCTGGCCTGCTAAAGGGGATGGAATCAGACTTTCTTTGAGACCCAGCATGAACAAGTTTCAGTCCAATCATACAACCTTGGAGATCTGTGCGTGGACTAGGTTTCAACCTGGTTTTCTTAACAGGCAGATTATAACATTGCTTTCAGCTTTGGGTGTGCCTGATGAAATATTCTGGAAAATGCAGGAGGGGATGATTTCAAAGTTAAATCAAATGCTTGTTGATGCAGAAGCGGCCTTTGATGTTCTTACCAAGTCTTGTGCTGAGCATGGAAATGCTGCAGCAATAATGTTAAGTTGTGGCTTCAGTCCCAAAACAGAACCTCATCTTAGAGGCATGCTAAATTCTATACGTGCTGCACAGCTTTGGGGCCTTCGAGAAAAGTCTAGGATTTTTGTTTCACCCGGGAGATGGTTGATGGGTGTCTTAGATGAGTTGGGTGTGCTTGAACAAGGGCAATGCTTTGTGCAAGTGTCTACTCCTTCTATTGAAAATTGTTTCGCAAAGCACGGCTCAAGATTTTCAGAGACAAAAACCTTGCATGTGGTAAAAGGTCTTGTGGTTATAGCTAAAAATCCATGTCTTCACCCTGGAGATGTGAGAATTTTGGAGGCAGTTGATGTCCCGGCTTTACATCATTTATATGACTGTCTTGTTTTCCCTCAAAAGGGTGAAAGACCCCATACAAATGAAGCTTCTGGAAGTGACCTTGATGGGGATCTGTATTTTGTCACATGGGATGAAAATCTCATTCCACCTAGTAAGAGGAGCTGGCCGCCTATGGATTACACTGCTCAAGAAAGCCGGCTTCAAACACGGCAAGTCACTATCAGGGACATCATTGACTTTTTTGTAAGAAACATGGTGAACGAGCATTTGGGATCAATCTGCAATGCACATGTGGTGCATGCTGATTCCAGTGGCTATGGTGCCTTGGATGAAAATTGCCTTCACTTGGCTGAGTTAGCAGCCACTGCAGTTGATTTTCCGAAGACCGGGAAACTTGTAGCAATGCCTCCTAGTTTGAAACCCAAGCTGTATCCTGATTTTATGGGGAAAGAGCGCCACCAGTCCTATAAGTCGAAGAAAATCCTCGGTAGACTTTACCGACGGATCAAAGATGCTTACGATAAAGATATTGATGCTCCTGAATCGAACTGTACGTCTGGTGATATACATTATGATGCAGATCTCGAGGTTCCAGGATCTGCTGAATTTATTGCTGATGCATGGGAGCAAAAGTGCTCTTATGAAGGCCAGTTAACTGGATTATTAGGCCAGTATAAAGTAAAAACTGAAGAAGAAGTTGTGACCGGACAGATCTGGTCCATGCCAAGATACAACAGCCGAAAACAAGGGGAACTTAAGGAGAGGCTGAAGCACTCATACAGTTCCCTAAAAAGAGAATTTAGGCATAGTTTTGACAAACTGAATTCCGATGTTGGAGACTTGagtgatgaagaaaaaaatttgttgtaTGAACAAAAAGCATCTGCCTGGTATCAAGTGACATATCATCCTAAATGGGTGAAACAATCTCTCGATTTGCAAATGAAATCCTCAGATAATCAAGAGGCGGATAGTTTAGGGAATATCTTGATGTTGAGTTTTCCTTGGATTGCTGTTGATTATCTCGCTCGCATAAAGATAAGGAATCGGAAGGTTGGAAATTTTGATTCAACTAAGGAAGTTGGTTCTCTGGCAAAATATCTATCCGAAAGGTTATAG 7578 0.4023 MKDILLGQSSTTPWCLDIGLVIEATVLNNNIPLQLSRILKVLDRYIEYAMAHIGTLFIVDKKTGLFNLFIVHSTMGSLDLEGGEKDSVLTTTQVSIGGFDTDVKAYDLVSFLESEIGCVDRCRLKTSCTPTESYPEFIDTKHIEKTDDYKKVAPHAFVHFTSSESATEAMNAAGRCDLILNNKVLKVISGPQNPNLLNQRRRTEPPFKMSDVIVEIGTFVGQTDFTVAWRGPAKGVNFLVDPFDSMCKLCFNQDIAFDFKGIVKKVVIKCDFKVAFLVRDINEIIRYDDTSHLVVLLHLASSPLVWYRTADDDIEESVTIDLLDDDDPWIRTTDFTPSGAIGRCSYYRIAIPPRYGAKLNKALEYLRRQRVQRVPLNRPLRILNEPDFGVPMSDAFFYIDFQKDISFDIMFLINAIVHRGIFNQYSLSNKFFELLRNQPKDVNVAALKHLCTYKRPVFDAAKRLEMVQRWLLRNPKLYEISKQFDDIMEVRRLVVTPTKAYCIAPEVELSNRVLRRFREVSDRFLRVTFMDEGMQTLNTNALNYYVAPIVKEITSNSSPQKTRIYKRVKTILEGGFYFCGRKYSFLAFSSNQLRDRSAWFFAEEKNISCDYIRDWMGKFNQKNIAKCAARMGQCFSSTYASVEVPANEVNSMLPDVERNNYVFSDGIGIITTDLAVEVAEKLNLDKVPSAYQIRYAGFKGVVACWPTKGDGIRLSLRPSMNKFQSNHTTLEICAWTRFQPGFLNRQIITLLSSLKVPDEIFWEMQEGMISKLNQMFVDAEVAFDVLTKSCAEHGNAAAIMLSCGFSPKTEPHLRGMLNSIRAAQLWGLREKSRIFVSSGRWLMGVLDELGVLEQGQCFVQVSTPSLENCFSKHGSRFSETKNLHVVKGLVAIAKNPCLHPGDVRILEAVDVPDLHHLYDCLVFPQNGERPHPNEASGSDLDGDLYFVTWDGNLIPPSKKSWPPMDYTAQESRLQTRQVTIRDIIDFFVKNMVNEHLGSICNAHVVHADSSAKGALDQKCQSLAELAAAAVDFPKTGKLVTMPPNLKPKLYPDFMGKEHHQSYLSEKILGKLYRRIKDAYDKDIDAPELNCASGDIYYDADLELPGSAEFIADAWEQKCSYDGQLTGLLGQYKVKTEEEVVTGQIWSMPRYNSRKQGELKERLKHSYSSLKKEFRHSFDILNSDVRDLSDEEKNLLYEKKASAWYQVTYHPKWVKQSVDMQLKSSENQDATSLGNILMLSFPWIAVDYLARIKIRNRKVGNFDSTKEVGSLAKYLSESLVAYNLQFTKVKAFDTEFNAHSSISIKTIKNLNTSNFLVHSTMGSLDLEGSEKDSVLTTTQVSIGGFDTDVKAYDLVSFLESKIGYVDRCRLKTSCTPPESYPEFTMIDTKQIEKTDDYQKVAPHAFVHFTLSESATEAINAAGRCDLILNNKVLKVVSGPQNPNFLNQRRRTEAPFKMSDVIVEIGTLVGQTDFTVAWRGPPKGLNFLVDPFDSMCKLCFNQDTTFEFKGISKKVVIKCDFKVGFLVRDINEIIRYDDTSHLVVLLHLASSPLVWYRTADDDIEESVTIDLLDDDDPWIRTTDFTPSGAIGRCSYYRIAIPPRYGAKLNKALEYLRCQRVQRVPLNRPLRILNEPDFGVPMSDAFFYIGFQKDISFDIMFLINAVVHRGIFNQYSLSNKFFELLANQPKDVNVAALKHLCTYKRPVFDAAKRLEMVQRWLLRNPKLYEISKQSDDIMEVRRLVVTPTKAYCIAPEVELSNRVLRRFSEVSDRFLRVTFMDEGMQTLNTYALNFYVAPIVKEITSNSFPQKTRIYKRVKTILEDGFYFCGRKYSFLAFSSNQLRDRSAWFFAEEKNITCDDIRNWMGKFNQKNVAKCAARMGQCFSSTYASVEVPSNEVNSMLPDVERNNYVFSDGIGIITADLAVEVAEKLKLDKAPSAYQIRYAGFKGVVACWPAKGDGIRLSLRPSMNKFQSNHTTLEICAWTRFQPGFLNRQIITLLSALGVPDEIFWKMQEGMISKLNQMLVDAEAAFDVLTKSCAEHGNAAAIMLSCGFSPKTEPHLRGMLNSIRAAQLWGLREKSRIFVSPGRWLMGVLDELGVLEQGQCFVQVSTPSIENCFAKHGSRFSETKTLHVVKGLVVIAKNPCLHPGDVRILEAVDVPALHHLYDCLVFPQKGERPHTNEASGSDLDGDLYFVTWDENLIPPSKRSWPPMDYTAQESRLQTRQVTIRDIIDFFVRNMVNEHLGSICNAHVVHADSSGYGALDENCLHLAELAATAVDFPKTGKLVAMPPSLKPKLYPDFMGKERHQSYKSKKILGRLYRRIKDAYDKDIDAPESNCTSGDIHYDADLEVPGSAEFIADAWEQKCSYEGQLTGLLGQYKVKTEEEVVTGQIWSMPRYNSRKQGELKERLKHSYSSLKREFRHSFDKLNSDVGDLSDEEKNLLYEQKASAWYQVTYHPKWVKQSLDLQMKSSDNQEADSLGNILMLSFPWIAVDYLARIKIRNRKVGNFDSTKEVGSLAKYLSERL 2525
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu07g00648 2525 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 6 1334 2524 - -
Tsu07g00648 2525 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 6 89 1276 - -
Tsu07g00648 2525 Pfam RNA dependent RNA polymerase 495 1075 IPR007855 GO:0003968
Tsu07g00648 2525 Pfam RNA dependent RNA polymerase 1742 2322 IPR007855 GO:0003968
Tsu07g00648 2525 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 89 1276 IPR007855 GO:0003968
Tsu07g00648 2525 PANTHER RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 1334 2524 IPR007855 GO:0003968
Tsu07g00648 2525 CDD RRM_SF 94 187 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tsu07g00648 Tsu-Chr7 5111886 5124113 Dispersed/Transposed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tsu07g00648 K11699 - gmx:100795178 2032.68
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tsu07g00648 07 5111886 5124113 Tsu07g00648 07 5111886 5124113 ECH