Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu04g00623 ATGGACATCCTCTTTGCTCAGATCCAAGCTGACCTCCGTTCCAATGACGCCCTCCGTCAATCAGGCGCACTCCTCCAAGCTCTCCAACAATCTGCCGCCGGTCGTGACATCGCCGTCATCGCTAAATCCGCCGTTGAAGAGATCGTAGCCGCTCCAGCTTCCGCCGTTTGCAAAAAACTCGCATTCGATCTCATCCGTTCCACTCGCTTAACTCCCGATTTATGGGACACCGTTTGTACAGGTATCCGTAACGACTTCCATTTCCCTGATCCCGATGTAACTGCCGCTGCTGTTTCAATTCTCGCTGCGATTCCTTCTTATCGTTTAGCGAAACTCATTTCCGATTGTAATAAAGAGATCTCTGATTGTTTTGATTCACCTAGTGATAATCTTAGATTCTCAATTACTGAAACCCTAGGTTGTGTACTTGCACGTGATGATCTTGTTACACTTTGtgaaaataatgttaatttgCTTGATCGTGTTTCTGCTTGGTGGGGACGGATTGGTGCTAATATGCTTGACCGATCCGATGCGGTTTCGAAAGTTGCTTTTGATTCGGTTGGAAGGCTTTTTCAAGAGTTTAGTACTAAGCGGATGAGTAAACTTGCTGGTGATAAGTTAGTTGATAGTGAGAATTCGCTTGCGATTCGTTCGAATTGGGTTTCTTCTATGGTTGATTTTGTTTGGAAGAAACGTAGGGCACTTATGGCACGTTCGTTGATTTTGCCGGTTGAGAATTTTCGAGCTACTGTGTTTCCGGTTGTTTATTCGGTTAAGGCTGTTGCCTCTGGTGGTGTTGAGGTTATTCGGAAGCTGTCGAAGTCTTCTAGTTTAGGTGGTGGTAGTGCTGAGGTTGATTCTGATGCTGAGAAATTGGTTGGTGTTTCGGATGTGGTTACACATTTGGCTCCTTTTTTGGTTTCTTCGTTGGAACCGGCGTTGATTTATGAGGTTGGCATTAATATGTTGTATTTGGCTGATGTGCCTGGAGGAAAAACAGAATGGGCATCACAATCTACTATTGCCATTCTTACATTGTGGGATAGGCAGGAGTTTGCTTCTGCTAGAGAGAGTATTGTTAGAGCTGTTGTTACCAATCTTCATCTCCTTGATCTTAACATGCAGGTTTCACTCTTCAAGAGGCTACTTTTGATGGTGAGAAACCTGAGAGCAGAATCTGATCGCATGCATGCTTTAGCTTGTATTTGTAGAACGGCTCTTTGTGTGGATCTGTTTGCTAAGGAAAGTGTCCGAAGAGGCCAGAAACCTCTTGCTGGAACTGATATTGCTTCCCTTTTTGAGGATGCCAGAGTGAATGATGATCTTAATAGCATTACAAGTAAAAGCATATTTAGGGAAGAGTTAGTTGCATCACTAGTGGAAAGTTGCTTTCAGCTGTCTCTGCCGTTGCCTGAACAGAAAAACTCTGGTATGGAGAGCAGGGTCATTGGAGCTTTAGCATATGGAACTGGTTATGGTGCATTGAACTGGACTGAACCTTCTTTAGAAGTGGTGGAAGTTTGTCGGCCTTGTGTTAAATGGGATTGTGATGGCCGCACATACGCAATTGACTGCTACTTAAAGTTGCTTGTTCGGTTATGCTGCATATATGATACTAGGGGTGGTGTAAAAAGAGTCAAAGACGGTGCTTCTCAGGACCAAATTTTGAACGAGACTAGATTGCAAAACTTGCAGCGTGAACTTGTGAGAGACTTACGTGAGGTCAATACACCAAGAATATTGGCCCGGCTTATATGGGCTATTGCAGAGCACATAGATATAGAAGGATTGGATCCACTCCTAGCAGACGACCCAGATGATCCTCTTAATGTCATTATATCAAATATTCATAAGGTTCTTTTCAATGTTGATTCAACTGCAGATACAACAAATAGAGTTCAAGATGTACAGGCAGTTCTTATATCTGCTCAAAGATTGGGATCACGCCACCCTAGAGCTGGACAGTTGCTTACTAAAGAGCTTGAAGAGTTCAGGACCAATGCTTTGGCTGATTCTGTTAGCAAGCATCAGTGCCGTTTGATATTGCAAAGAATCAAATATGCTTCAGGTCATCCTGATAGTAGGTGGGCTGGTGTTACAGCAGCCAGAGGCGATTACCCATTTAGCCACCACAAGTTAACAGTTCAGTTTTATGAAGCATCTGCTGCTCAGGATAGAAAGTTGGAAGGATTGGTTCACAAAGCTATTTTAGAGCTATGGAGGCCTGACCCCAGTGAACTAACCCTTTTGCTTACCAAAGGAGTTGATGCTACTTCACTTAAGGTTCCTCCTACTGCAAATACTTTAACTGGAAGCAGTGATCCTTGCTATGTTGAAGGTTATCATTTAGCAGATTCAAGTGATGGGAGGATAACTCTGCATTTAAAGGTCTTAAATTTAACCGAGCTTGAATTAAATCGGGTGGATGTTCGTGTTGGATTATCTGGTGCATTATATTATATGGATGGTTCTTCTCAAGCAGTGCGGCAGTTGCGAAATCTTGTTTCACAGGATCCAGTGCTGTGCAGTGTAACAGTTGGTGTTTCCCACTTTGAAAGATGTGCCCTTTGGGTTCAAGTGTTGTATTACCCATTTTATGGTAGTGGTGCTGTTGGAGACTATGAAGGTGACTATGCTGAAGAGGATCCTCAAGTCATGAGACAAAAGAGAAGCTTAAGGCCCGAATTAGGTGAACCCGTGATTTTGAGATGTCAACCTTATAAAATTCCCTTGACTGAGCTACTTTTACCACACCAAATATCACCTGTCGAATTTTTCCGACTGTGGCCCAGTTTGCCAGCCATTGTTGAATACACTGGTACATATACATATGAAGGAAGTGGCTTTCAGGCTACTGCAGCCCAGCAGTATGGTGCATCTCCTTTCTTGAGTGGACTGAAATCCCTATCTTCCAAACCGTTCCACAAAGTTTGTTCACATATTATCCGCACTGTGGCAGGGTTTCAGTTGTGTTACGCTGCTAAAACCTGGCATGGTGGCTTCTTGGGGTTGATGATTTTTGGTGCAAGTGAAGTGAGTAGAAACGTGGATTTGGGTGACGAGACAACAACCATGATGTGCAAGTTTGTGGTACGCGCATCTGATGCATCTATTACTAAGGAGATTGGATCAGATCTTCAGGGTTGGTTGGACGACCTTACTGATGGTGGGGTGGAGTATATGCCTGAAGATGAAGTGAAATTAGCTGCAGCCGAGAGGCTTCGAATATCAATGGAAAGGATAGCCTTGTTGAAGGCAGCCCAACCACGACCCAAGACTCCAAAATCCGAGTCcgaggaagatgaagaagaggaTACAGACAAAAAGGATGGGAATGAAGATGGCAAAAAGAAGGGACCTTCAACACTATCCAAATTAACTGCTGAGGAAGCTGAGCATCAAGCTCTTCAGGCAGCAGTACTACAAGAGTGGCATATGCTCTGCAAGGATAGGAGCACTGAAGTTAAATAA 3474 0.4338 MDILFAQIQADLRSNDALRQSGALLQALQQSAAGRDIAVIAKSAVEEIVAAPASAVCKKLAFDLIRSTRLTPDLWDTVCTGIRNDFHFPDPDVTAAAVSILAAIPSYRLAKLISDCNKEISDCFDSPSDNLRFSITETLGCVLARDDLVTLCENNVNLLDRVSAWWGRIGANMLDRSDAVSKVAFDSVGRLFQEFSTKRMSKLAGDKLVDSENSLAIRSNWVSSMVDFVWKKRRALMARSLILPVENFRATVFPVVYSVKAVASGGVEVIRKLSKSSSLGGGSAEVDSDAEKLVGVSDVVTHLAPFLVSSLEPALIYEVGINMLYLADVPGGKTEWASQSTIAILTLWDRQEFASARESIVRAVVTNLHLLDLNMQVSLFKRLLLMVRNLRAESDRMHALACICRTALCVDLFAKESVRRGQKPLAGTDIASLFEDARVNDDLNSITSKSIFREELVASLVESCFQLSLPLPEQKNSGMESRVIGALAYGTGYGALNWTEPSLEVVEVCRPCVKWDCDGRTYAIDCYLKLLVRLCCIYDTRGGVKRVKDGASQDQILNETRLQNLQRELVRDLREVNTPRILARLIWAIAEHIDIEGLDPLLADDPDDPLNVIISNIHKVLFNVDSTADTTNRVQDVQAVLISAQRLGSRHPRAGQLLTKELEEFRTNALADSVSKHQCRLILQRIKYASGHPDSRWAGVTAARGDYPFSHHKLTVQFYEASAAQDRKLEGLVHKAILELWRPDPSELTLLLTKGVDATSLKVPPTANTLTGSSDPCYVEGYHLADSSDGRITLHLKVLNLTELELNRVDVRVGLSGALYYMDGSSQAVRQLRNLVSQDPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGAVGDYEGDYAEEDPQVMRQKRSLRPELGEPVILRCQPYKIPLTELLLPHQISPVEFFRLWPSLPAIVEYTGTYTYEGSGFQATAAQQYGASPFLSGLKSLSSKPFHKVCSHIIRTVAGFQLCYAAKTWHGGFLGLMIFGASEVSRNVDLGDETTTMMCKFVVRASDASITKEIGSDLQGWLDDLTDGGVEYMPEDEVKLAAAERLRISMERIALLKAAQPRPKTPKSESEEDEEEDTDKKDGNEDGKKKGPSTLSKLTAEEAEHQALQAAVLQEWHMLCKDRSTEVK 1157
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu04g00623 1157 SUPERFAMILY ARM repeat 4 650 IPR016024 -
Tsu04g00623 1157 MobiDBLite consensus disorder prediction 1086 1131 - -
Tsu04g00623 1157 PANTHER TSET COMPLEX MEMBER TSTA 1 1154 IPR037501 GO:0006897
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tsu04g00623 1 838 EF-hand Containing Proteins AT3G01780 85.119 0.0 1447
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tsu04g00623 - - gmx:100781324 2066.2