Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu03g02235 ATGGCGAAAGTCAGTTCCAGAGACGTTCGAGAGATTGTAGAAAATCTCTCATCGGAGAAAGTCAAACCTCGCGAAGAAGGGATCAAGTTGTTAAATAGTTGGTTAGAAGGAGAAAGATCATATAACTTCTGCAAATTTATTGGACTGAGTACGTCAAAGCTTAGGCCAGATGAAATTCCTCACTCTGAAACGTGGCCTTTTCTCGTTTCTTTGCTTATTAAAGCTTCATCATTGGAAATATCCTCAAGTAAGCGGAGAAATCCGAAAATGATATATGCAAAGACTCTTAGACTTATTGTGCAGCGAGCAGAAGATGCTAAGTATTCAGgcAAAATTCTGCCTCTGTCATCTGTGGTCAAACCACTTTTTAATCATGTTTGGGATGTCCTGAGCAATGTTCCAAGCTTTCAGTCAGAGTATGGGATTATCCTCCGGCATCTATTGGCAGTCAGGGATTACAGTTTTCAGATGAGGAAGCGCATTTATTGCAGCCTGGTGATGCTGTACATTGAGAAAGTTGAAGCAAGCTTGAATGGGAAAAACATAAGTCATTTTACTTCCAAAGAAGAGGTCTTCCGCAATATCTTAACTCTTCATTCGCTTTTGGATTATCCTCCTGGAGACTACCCTGTTAATCTACGAGAAGACATTGTTAAGGGATTTGTCAGGATCTGTTCATTCATTAGGGAAGAAGGAAAGATATCACGCAAACTTGTTGAATGTATCAATACATATTTGTTAAATGATGGTCCAAATTTGGGCTTTCAGTTGTTGGAGATTCATAATGCTATGCAGGAGTTTCTGTTTCAATGTTGGCTGACAACACATGATCGAGTGCTTAAGGATTCCCTAATTGTCTATGCAAGGACACAGTTAAGTTTAATTAGAGGTGCTGATGATAGGCAGTTATTGGTAGAACATCTTTTGGATGTGATTTATAAGGATCTTGATCAGGGTAGCGTGTCTAGTACTTCAATGCCGCGGGTTGATGGAAATATGGATGATAAACTTGGAACTTTGAGTAGCTCACAATGCGGCTTAGTGGAACTTGCAGCAGTTCTATTTTATAGGGTGTGCCTTAATACAACCAGAGCCTCATTAAGTGAAAAACGGGTTAAGAGAGAACCTGCTGCTGTGGTCTTGAGGGAGGCACTCATGAAAGGAAAATGGCTATGGAATGCTGCATTTTGTTATTTAACTCGAAACTTCCATACTCGCATTTCCAAAGATCTGTTCCTCTACTGGTTTGAAGGCATATTAATGAGCTTTGACAGAATCCTTAATTCTGCAAATGTTGATCGGGCCTACGATGGTTTGTTGTGGACTCTGCGGAGTTTGCAGGAACTTTCATCTGCTCTGTTGCTTCCAAATTCAATGATGAAGATATCGTCAATGCCACCTTCCACTTTGAATGAGTTCATCAATGGTTGGCAAGTAATATGGAGTACTATTGTGCATGGGTTGCCGATTTTCAGCAATATAGCCACTcttgtaagtttgttaataTCTATAACTCTAATGCTGTATGTTTCTATCCAGGATTTAGTAGATACATGTCTAATACCACAAGATGTGTGGGatcttcaatttttcaaaagacCAACTTCAATACCTATCTTGCATTTTTTCTCATGTTACTTTTCAAGGAAAAATTCTCATACTGATCTGCGGGATATTTTACATCTTAGAAAGAACCTTTTGAAGGCAGTTTTGAATCATCTTGATCGGAAGGGTTTTTCAAAATTGACTGAGCGGATGGGTTTGTACCTGCCGAGTGCTATGTTTGCACTTTGTGTAGGTTTTGTTACGTTCCCTGAATTCTTTAAAGAAATTGCTCTAGTTCACAGCTCTTTCGATGTCACCGAATCTCTTGATAATAGTCATAAGGTTGAAGACCCTAAACACCAATGTTTGCAACAATTTTTGGATTGCTCCGTAGAGGTTCTCACAGAAATTCACAAAGTTTCCAATGTTGAGGTTTCTGAGCTGCAAATATTTCCAGGCATACGGGTTCCCCAAGAAATAAGTGATCAACTTTTGCTTGAAATGGAGACTTCTATTCTTGAAGTGTTGGAGCAAGAGGAAAGTAATGAGACACATATACCtgatattttcttaaaatgttCTCTCTTGTCTAACCTACTATACGGTCATTTCTTCACAAGgaaaaaaaatgtttcattttgtttgaaattaagCCAATACTTGCAAGTGATGGTTGATAAGGCTGTCAGTATCATTAAAGAAGACAGTTACCACGGGGCCAGTTGCTTAAGTTATGTTCCTACATGTGAGGATACGGGTTCTCTTGCTGCTTCTGTTCGTTGTTTTCTTTCATCACCTATATCTTGTGAATTGAGGGATAAAAATAAGGACTTTGTTCCATTTCGCATGGTTATCGAATCTGTGGAGAAACTTTTGGAAGAATTTGTAAATCTATATGGTCGTTATTCTCAACATTTGGCGAGTCTTCAGTCTGACATGATCATGCAAGATACAGCTTCTACTGATAGTTTGCAAAGTTCTTGTTCATATGACATAAGTAAAAGCAGGATTGTAGATATGGAGTTGGATGTTAATGACGATTCAAGAGATGTGGATAGTttacttgtcaaaaaaattggCAGTGGCGTGTCATCTTCTGTAGAAAATTGGAAAATTGGCATGATATCacttatttccttttttttctctgCTTCACCTGATCTGACGTGGAGTAAGCTCTACAAACTAATGAAGAAAGAGTATGACCCCAAGGTGCGTGGAAAAATATTGCATCATCTCTGTGAACATCCTCATTGGTCATCTTCTACAGAATTAATACATTTGGTTAATATAATGAGCAATATCATTACAGAGCAAGTTGGACTTAAGCTTGCCTGTGGAAATGTGTTGACTTGTACCCATGCTTTACTATCTAAATTATTCTCGCTTGATTCTGTTGGTGAGGAGAAATGCGGCCCATACTTAAGTAAAGTGACAACTGAAGAGTGCTTTGAGTCACTAGGAAAATTGGTGCATAAACTTTCAAAAGTTGATCTTGATTGGTTTGGACGGGTGAAGCTTATTCATTGCATTTTTAATCTTATTTCACTCCACCCTCAATTTTGTCAGACAATCATAGACAGATTACTTTTGATGCTCAATGATATGGATTATCGGGTTCGTTTATCATTTGCAAGGGGGATTGGTGTTCTTTTCCAAACATGGGATGGCCATGAAGAGCTTTTTCAGGACTTATGTTTAAATTTTGGCGTTCCTCTGGTGGTCTATTCCAAAGGAAAAACTACCAATGCGAAGGAGGTGCTAGCTGCTGGTCCTCAGCCTCAACCTATAATGGAAACAGTTTTAATTACTCTGATGCATGTTGCATTACATAGTGAGAAGGTGGAGTTAGAGGCTGTATTTATGATATGCGTGGTTTCTGCCGTTGATCCTTGTCAAAGGTACACAATATTTCTGTGTCATTTTAAAAACCTTCGCTTTAGTGTCTTATCTTCTGTAACGTGTTTTAGGGAATTGGTCTGCGCTGTACTTGACAATCTTTCTAAGGAGCTTCAGTATATGACTAGAATGAAGTATTTGGAGGAACTTTTGGGATCACTTCTATTTTGTTGGGTAACTTGCGGTGTAAGCTTGGTTGCACTTGTTGAGACAAGGCATCTTTTTGTACCAGATGCAGAACCTGGTGATTTCCTTCAGTACTGTTGTCCATGGCTTCTTCCTGCTCTGCTTCTTCATCAAAATAGTTCTGATCTTCATTGGGTTGCCAAGGTCACTTGTCAACCTATGACAGTTCTTATAAAACACCACTTTGCTTCCACCTTTTCAATTTCTATGGCTTTGCATTGCAGTAAGAAACCAGGATCGGAGGGGGGAACTCGTGTGCTTCAGAGTTCTATTCTTGAACTTGGTCAGATTACTGAGGAAGAACGGGACGAACTCATAAAGAGACATTTGGTCTATGCCGTTCTCACTGCTTGTTATTTGATCAACCGCATGCCATCCTCAGTATTGAATAACGAGATTCCATATTCTATTTTGTTTCCTAGCAACTCTCTATATTCCGTCCCTCTTCGAGTGTTTGGTTCCACTTGTTTTGTTCATGATCTTTCTCCTGGTCGTGACAAATTGTCTGCACGAGCTTTTAAGTGTGTATTTTTGGGATATTCGAGAGTTCAAAAAGGGTATCGGTGTTATTGTCCTTCTACACATCGTTTTTATGTCTCTGCAGATGTTACTTTCTTTGAAGATGTGCCTTTCTTTGCAAGACCAGATCCAACAGATAAATGCAGTTATCTTTTCAACTTGATTGGACCATTGATCGGATGTCCTGCTTTACAAGACCAATGTTGTCGTATACTTTCCGCATTGTTGATATCTTGTAAGGAGCATTTATCAGATGATATCACTAGCATGCTTGGGGAACATCTCCAGTTTCTTGTTTCAAAGTTAGTGGCATGTTACATTCCTTCTGAAAGGAAAGAATCACGTGATAGCTTTATATCAGAATGTTTACCTCTGCTCCATACGTTTACTTTGGAGTCTGATCCATCTATGCATGATTACGTCAAAGAGTTAGAGCCATTCCCcgaattaaaaatatttgatgagaTACGGAAGTTTCATGAAGAATTAAGCCACACTTACTCTATTCGTGACCACATATTGAAGTTTGTAAAGAGGTCTTGCTACCTTCCACCACGGTTACTTTTGTCAAGTCTCCAGGCATTGCACAAGAAGTTACTGATTGAAGAAACCTTTCAAAGAAGAGGGAGAGCAGAAGGTCACTTGGAGGACAAGTATTGGCATGGTGATCATGAAATTGTGCATGCAGTTTGGACACTTGTTCACATGTGTGGGTCGGATGATGCAAGTGGTGTCAGAGAATTGGTTTCAGATTTCATTTCCAGGGTTGGTGCTGGGGACCCACACTCTGTTGTTTTCCAACTTCCAGGCAAGAGTACTCGTATCCATCTGTGCAAATCAATTGATAACTGCAGTACAGGGGAAACCAGTTACAACAAAGGCGTGTGCATATCTGACGAACTTTTAGTTGTCCTTATAAAATTACTAATGAAGTATCTGATGGATGATTCAGTGAAAGTTGTTGACACAGCATCACAAACTATTCGTGGAATTCTTTCTACTGAAAGAGGCCGAAATGCTTTACAGTCATTTGATTCTTACCAAAGGTCTCTTGTCGAGATACATTCAAAGAGCGTTAATATCGAACTTGTGGAAAGTTTCCTTTCTGATCTGGATGGGAGGTCAAAAG 5278 0.385 MAKVSSRDVREIVENLSSEKVKPREEGIKLLNSWLEGERSYNFCKFIGLSTSKLRPDEIPHSETWPFLVSLLIKASSLEISSSKRRNPKMIYAKTLRLIVQRAEDAKYSGKILPLSSVVKPLFNHVWDVLSNVPSFQSEYGIILRHLLAVRDYSFQMRKRIYCSLVMLYIEKVEASLNGKNISHFTSKEEVFRNILTLHSLLDYPPGDYPVNLREDIVKGFVRICSFIREEGKISRKLVECINTYLLNDGPNLGFQLLEIHNAMQEFLFQCWLTTHDRVLKDSLIVYARTQLSLIRGADDRQLLVEHLLDVIYKDLDQGSVSSTSMPRVDGNMDDKLGTLSSSQCGLVELAAVLFYRVCLNTTRASLSEKRVKREPAAVVLREALMKGKWLWNAAFCYLTRNFHTRISKDLFLYWFEGILMSFDRILNSANVDRAYDGLLWTLRSLQELSSALLLPNSMMKISSMPPSTLNEFINGWQVIWSTIVHGLPIFSNIATLVSLLISITLMLYVSIQDLVDTCLIPQDVWDLQFFKRPTSIPILHFFSCYFSRKNSHTDLRDILHLRKNLLKAVLNHLDRKGFSKLTERMGLYLPSAMFALCVGFVTFPEFFKEIALVHSSFDVTESLDNSHKVEDPKHQCLQQFLDCSVEVLTEIHKVSNVEVSELQIFPGIRVPQEISDQLLLEMETSILEVLEQEESNETHIPDIFLKCSLLSNLLYGHFFTRKKNVSFCLKLSQYLQVMVDKAVSIIKEDSYHGASCLSYVPTCEDTGSLAASVRCFLSSPISCELRDKNKDFVPFRMVIESVEKLLEEFVNLYGRYSQHLASLQSDMIMQDTASTDSLQSSCSYDISKSRIVDMELDVNDDSRDVDSLLVKKIGSGVSSSVENWKIGMISLISFFFSASPDLTWSKLYKLMKKEYDPKVRGKILHHLCEHPHWSSSTELIHLVNIMSNIITEQVGLKLACGNVLTCTHALLSKLFSLDSVGEEKCGPYLSKVTTEECFESLGKLVHKLSKVDLDWFGRVKLIHCIFNLISLHPQFCQTIIDRLLLMLNDMDYRVRLSFARGIGVLFQTWDGHEELFQDLCLNFGVPLVVYSKGKTTNAKEVLAAGPQPQPIMETVLITLMHVALHSEKVELEAVFMICVVSAVDPCQRYTIFLCHFKNLRFSVLSSVTCFRELVCAVLDNLSKELQYMTRMKYLEELLGSLLFCWVTCGVSLVALVETRHLFVPDAEPGDFLQYCCPWLLPALLLHQNSSDLHWVAKVTCQPMTVLIKHHFASTFSISMALHCSKKPGSEGGTRVLQSSILELGQITEEERDELIKRHLVYAVLTACYLINRMPSSVLNNEIPYSILFPSNSLYSVPLRVFGSTCFVHDLSPGRDKLSARAFKCVFLGYSRVQKGYRCYCPSTHRFYVSADVTFFEDVPFFARPDPTDKCSYLFNLIGPLIGCPALQDQCCRILSALLISCKEHLSDDITSMLGEHLQFLVSKLVACYIPSERKESRDSFISECLPLLHTFTLESDPSMHDYVKELEPFPELKIFDEIRKFHEELSHTYSIRDHILKFVKRSCYLPPRLLLSSLQALHKKLLIEETFQRRGRAEGHLEDKYWHGDHEIVHAVWTLVHMCGSDDASGVRELVSDFISRVGAGDPHSVVFQLPGKSTRIHLCKSIDNCSTGETSYNKGVCISDELLVVLIKLLMKYLMDDSVKVVDTASQTIRGILSTERGRNALQSFDSYQRSLVEIHSKSVNIELVESFLSDLDGRSK 1759
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu03g02235 1759 SUPERFAMILY ARM repeat 904 1716 IPR016024 -
Tsu03g02235 1759 PANTHER SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE ATM 25 1755 IPR038980 GO:0004674|GO:0006974
Tsu03g02235 1759 PANTHER SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE ATM 25 1755 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tsu03g02235 Tsu-Chr3 24660231 24713139 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tsu03g02235 K04728 - gmx:100788458 2426.36