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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu03g00655 ATGGCgctaatcttcttcttcttcctcttcttcgcTTCTCACTTTCTCTCTTCCATCTCTGGTCAATCCAGCTCCATGGAATCGGTTCCTGATCTTCAGAACACTATGTATACGGATGTTGATGGATATCCTTGTGTGCGATTGTTGAATCTTTCTGGAACAATCGGTTGTTCAAATCCTGGGCGAGATAAGGTTGTGGCACCAATTGTAAGGTTTAaaaatgttgatgatgtttCGGAGCTATCTACTATATTGGTGTCATTGGATGAGTTTCCAACTCTCTTTACCAGATTATCAGCTGATCCAAGCTTTGCAAGAAAAGTCGGTGGTGTACTAATTGAATCAGTTACTGATTCACAGAAGAAGTTAAATGGATTTTCTCCAGATCAAAAGTTTCCGCAAGCTGAATTTGCTCCTTATCATAATATCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGGTATTATGTGGAAATCTTACAGTTTTCCTGTGTTCCTACTCACAGAAAGTGGCACAAAGACTCTTAAAGAGTTTGTATTAAAGAGCGAGGATAAAAGGAAATCATATACTTCTAATGTGGCCGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAATGAAATCTGGAACACATGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGGAACTTGCCTCCCTTTAGGTGGATACAGTGTTTGGTCGTCTCTTCCCCCAATCAACATTTCACCGTTAAATCCGCCTAAGCCCATTATATTGACAGTAGCCTCTATGgattcttcttcctttttccGGGACATAAGCGTCGGTGCAGATTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCACTACTGGCAGCAGCTGATGCACTTTCTCGTTTGGATGGCCTTCGCGACCTTAGTAAGCAGCTTGTTTTTGTAGTTTTCACTGGAGAAGCATGGGGTTATCTTGGAAGTAGGAGATTTTTGGTAGAACTTGACGAGCACTCAGATGCTGTTCATGGCCTTAATCACTCATTAATTGAAAAGGTCCTTGAAATTGGTTCTGTTGGGAAGGGTCTCAGTCAAGGTCAAGGTGCTAAAAACTTTTTTGCTCACGCTGAAGGGGATTCTTCTGCCACAGATCATATTATGGTTGCCCTGAAACATGCACAAGAGTCACTGCTATCTGAAGACATTCGGATCACATCTGCAAGTGCCTCAAATCCTGGGATACCTCCGTCATCTTTAATGACCTTTTTGAATAAGAATCCTGGGATCTCTGGTGTCGTGTTAGAAGATTTTGACTCTTCCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTCATCTTGATGATTTATCAAATGTGAACTCATCGGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTGTTGCCCGGACCCTTTACATACTTGCTAGTGAAACTAATGATGTACAAAATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTAAATGTTACACTTGTTGAAAAACTTATGGATTGCTTGTTGGACTGTGATCCCGGTCTTTCTTGTGAGTTGGTGAACAAATATATTTCGCCCGCTTCAACCTGTGCGAGCAATTATGTCGGTGTTATCTTGGATGAACCTTCATCCACACCTTATTCAGGATACATAAATGACATTCCTAGGTTCATCTGGAATTTTCTAGCCGACATAACTTCTATCCCAAAGGAGAATAATAGCTCAAGTTGTCAACAGGGTTGCAGCGGTAATGAAGTTTGCATTAAAGCAGAGACTGATGGAAAGGGAGTTTGTACTCTCTCTACAACTAGGTACGTTCCAGCATATTCGACCCGGTTAAAATTTGAATCCGGAGTATGGAGTGTTTTGCCCCCTAATTCCTCTGACAAAATGGGGGTTGTAGACCCAGTCTGGACAGAAAGTAACTGGAATACAATAGGCATCCGGGTCTACACAGTCCAGATTGCTGCATATGATCGGGTTGTTCTGTTTGGGGGAATTGCTCTTACAATCTTGGCATACCTTGCAATAGCAGTTACAAGAACTTTCGTTGCCAAAGCGACAAAGAGGGATTGA 2007 0.4036 MALIFFFFLFFASHFLSSISGQSSSMESVPDLQNTMYTDVDGYPCVRLLNLSGTIGCSNPGRDKVVAPIVRFKNVDDVSELSTILVSLDEFPTLFTRLSADPSFARKVGGVLIESVTDSQKKLNGFSPDQKFPQAEFAPYHNISYEWNPIGSGIMWKSYSFPVFLLTESGTKTLKEFVLKSEDKRKSYTSNVAEFDLVMQTMKSGTHDSESCLKEGTCLPLGGYSVWSSLPPINISPLNPPKPIILTVASMDSSSFFRDISVGADSPISGLIALLAAADALSRLDGLRDLSKQLVFVVFTGEAWGYLGSRRFLVELDEHSDAVHGLNHSLIEKVLEIGSVGKGLSQGQGAKNFFAHAEGDSSATDHIMVALKHAQESLLSEDIRITSASASNPGIPPSSLMTFLNKNPGISGVVLEDFDSSFVNKFYHSHLDDLSNVNSSAVVAAASLVARTLYILASETNDVQNSTLAAINVNVTLVEKLMDCLLDCDPGLSCELVNKYISPASTCASNYVGVILDEPSSTPYSGYINDIPRFIWNFLADITSIPKENNSSSCQQGCSGNEVCIKAETDGKGVCTLSTTRYVPAYSTRLKFESGVWSVLPPNSSDKMGVVDPVWTESNWNTIGIRVYTVQIAAYDRVVLFGGIALTILAYLAIAVTRTFVAKATKRD 668
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu03g00655 668 CDD M28_Nicastrin 40 621 - -
Tsu03g00655 668 Pfam Nicastrin 243 454 - -
Tsu03g00655 668 Gene3D Zn peptidases 213 468 - -
Tsu03g00655 668 Pfam Nicastrin small lobe 44 201 IPR041084 -
Tsu03g00655 668 PANTHER NICASTRIN 14 667 IPR008710 GO:0016021|GO:0016485
Tsu03g00655 668 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 208 455 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tsu03g00655 K06171 - gmx:100818367 1031.17