Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu02g02725 atGACCGATTTGGAAGCAAATTCAAAGATGAACAATCGTAAACGAAAGCCGAAAACCCACCACCAACCACAAAAATCTTCTAAATTGCATCGTTCCGAGCCTGCTCAGAAGCCTCAGGACCCCTGGAGCAATCTTCAATTGATATTGTGCATCCAAGACAAACACCTTGATCTTCACAGTAAGGTCagtcaagcattcaattttgtGCGTTCGAGAGTGGATGGTGGTGCTGATATTGATCAGCATTGTGAAACCGTAAAACTACCAAGACTACTTGGTTATCTTAATGATTGGATCCTGACAGTGCTGTTTCCTCCAAATGGGAAGGAAAACTGGGGGGTTGGGAAAACGCCACAGCTTGATGGAATTGAGGCATATATGGATCTTAGTTGTTGGGAGATTTACAGATTCTGCTTGCAGGAGTCTTTGAAGCTCAGTGTCTCTTTGAATATGTCACGGAATCTTCTACAGACTCTCCAATTTATTGTCAGAAATACTATGTTGCTGCTAGAGAACTTCTCTACCAGTTCAGGAGAACATTTTAAATCTGGTGAAAAGTTGAAACTTTATGATACTGCTCTTGATTGTGTTTCGTTGGTGTTCTCATCCCATGGTGGGTTGTCAAACGAAAATTTGGACTTATGGGTTGAAACAACAGGGGCATTGCTTGAGCTTGTCATAAAAGTGTATGGCAAGAACCTTGATGGAAGCTGTGTGGGTGCTTGTGTATTTCGCTTTTTGTGGTTAGTGCTTCAGCCCTTCTCAAATTTTTTGAGGGTCCATCCAGCTAGGAAAGGATTTCAAAATTTTGTGGATAAACTTCTTGAGCCATTGTTGCATTTGTCGGGTGAGTTGCATCTTCGGGCTAATGGGAGTGATCCCATTTGGACAGGGAGATTGGTGAAGGTGGTGGAAGAAGTTCTTTCTCATGGACTTTTTCATCCAGTTCATATTGATGAATTTTTAAGCTTACATGGTTCAGAAAAGTATGTCGCTTCATGTGATGATAAACCAAAAGATTCAAATGCAGCTATTAAGAGTTATCATAGACATTTGTTTGATGTGCTGAACAAAATTATTTCCAGAAAGAATGCTATAGCAATGGGTAGCCTAGGTTTGATATTTCGCTTGTATGCTGATTCCGCAAGAAAGTTCAAGGGAACTTCAATTTTGTATGAAGGGAGCAATACAATGGAGAAAATGAATGACTTAAGGCAACCTGTACCAGGAGAAACTTGTAGCTCTAATAATATTTCTGTCGATActcaaaaatcactttttaatttCTTGGTACTGATTATGGAGCCACTTTTGCTCGAGGTTAATGCCTATCTCCATGCTAACCTAGATGCCAAGCTCATTTTTTCTGATCTTTGTGGTATACTAAAGTCTATTTGTAATTTGCTTGCTAGTTTTATGCAAGAGAAAGTATATGTGAAAACTGAGGACACATCTGGAGGAGCTTGTCTTAATTTCTTGAagaaaatattcaatacattgataGCTAGTTCCACTAGTATACTCTGTTTGGCCAACTATGGTACAACCAACATGGCAGGGATGGAAACATTTAGTTTAGCAGCTAATGACATGTTAGTTGCAATGGGTTATCTTTTGGAAATTGAATATGAGGTTATTGGAGAAGATTTGGTGAATTTATGGCTTATTCTGTTATCATACTCTGCTGTCAATTGCAATATGACAAATGCTTTTGATCGATGCTCATTATCTTCCACTATTCCTGCCTTGGGTTGCCAAATAGTTAATCTCTACAGTCAACTTCGACAGGTACAAATTGCCATTTTAGCATTGTGCAAAGCGCTAAGGCGTCTGACTTGTGATGGTAATGCTGAAGAAAGTTCTTCTAAGTTATTGACATTTCTGTCTAATGACGTTTATTCCGAATCAGTTGAAAGTCTTTTATCTTCACATAAGTTCAACCACACCATTTTTAAAGCCATGGAGTCTATTCCAGAAGGGCAAGTGAGTGGGTTTATTAGACAGATAACAGATGATATATCTGTAACTCTTGGGTGGATGAAAAGTTGCTCTCCATTGGTTGGTGGAAACAAATTGCGACTGATTAATCTGCAGGCAGAGCTTTTGGGTAGAGGGCTCTCTAGATTGTATTCTTTAGTGCTTGATTCAGCCACTATAACTGAAGGCAATAGCAATCTTGTTGGAGTTGCTGTTAAAGAACTTATGTCATTATTGCGTCCCTACCTGATCATTCTAGTTGTACAACAACCAGATGCTATTTGCAAGTTTTTTTCATCTATAATAGGAGAAAATGTTGATTGTGCTGTTGGAAAGGGAAagtttttgaagaaatttggtAGGTCCAGTCAATGGGTCTTTGTGTTCTTTTTGCAGTTGTTTGTGTCCAGCCGAAGCTTACTTAGGCAAGCAATCAGCCTTATGCCTCCtagtttatcaaaaaaaatgtCTGCCGAGATGGGGGATGACTCAGCATATTCTGCCTTTGAGTTGATGGAGAGGGCTGATGAGACTGATATTGGTTTCTTCTCGTGGATTGCCCAACCTTCTGATTCCCTCCTTGACATTATGAAATTAATATGCAACTTCTATTTAAAGCATGGCTTCAATGATTCTTCTcctttgatttatatatttcagtCTATGGCTCTTCAGAGGCTTGTTGACTTGAATAAGCACGTTATATTGTTGAAGTATTTGCAAAAGAAACATTGTAGACCACGGATCGAGGCCCTGAAGAAAGAGGCTTCTGAACTTACTGCTTTTATTATGGAAAACTTATCATGTGTGTATCAATCTCCAATGTTTCTTTCTGATGATGTAAAATGTGAAGATTCAGTTTCTTTGGCTCCTCAAATCAACATATGGAATCAAGGAATTTATGTTGCTAACAAAAAATCATTGCCAATTGCCATTTGGTCAAATCTCTGCAAAAATGTTGATATTTGGGGAAACCATTGTTCCAAGAAGCAGTTGAAAATATTCTTCTTACATTTACTTCGTACTTCTCTTCATTGTGTATCTAGCAGTTTTCAAGAGCTAGACATGCAAGATGAGTATAAGCTACTCAAGAGAGTCACTTTGGCACATATATCATCAGGCCTTCTAAGTGATTCAATTTTGTACGAACAAAAGTTTGCCCACAGGAAGCTAGCCACTATCTTTTGCAGAGCTTTAGAGAAATCTGCATTACCATTGTTTGGTAATGTTGCATGTACTGCTGTCAAGCTTCAGTCAGAACCTAACTGGATTGATTTTTTAAGTGCCCTTGACAACTTGGCACTTGTCGACAATAAAGAGGATCCCATTGGTTGTTCTGCAGTTAAAAAACTTAATGCAGATGTCAGCAGCAGTGAAAGTGCCTCGCCTCTTACCATCAAGAGTTTCACAGATTGCCATCATTTGCTTAAGCTCTTATCTTTGATGTCAGATGTAAATGCAAGATCATTTTCACTTATTATATCTTGTATTTTCAACCTTGAAAGGCTTCTTGTAAATGCATTGGTATATTATAAGAGTACAATGTACGGGGactattattgtgagtttttgAGGTTATTTGTCTCTTGCCGGAAGGCCTTAAGGTATATATTAATAGGATTCTGCGAGAAGACAGGCACTATCCAATCCTTACCAAAATCGGTTATTTCTGAAAGTTCATCTTCTGTTTTGTGGCTGTCAAAATCATTATCTTTGATTGCTGGAATTCAAGAGGTATTCTCAGCAGAAAATATTCTAGTTAGATCACTGATGTTTTCTTTAATGGATCACACGTCATATGCCTTGTTGGGCATTGGAAAACATCAAACTATCCATGTTTTTTCTTTAGATAAGGAAGCTGAGATGCCTTGTGAAGAGATCTCTGATCACAAAATTAGCCATGCAGAGAATCATTTGCTTTCATCTTCTCAGTATTTAGGTTCTTCCAAGCTTGAGGCATTGAAGTGTTTAACCTTTATGGCTGAGAATTTGAAAGAGCAGCTGCAAAACTTGTGTGTTTCTCAAAAGGGTATCCCCTGTCATGTCAATGTGGGACATGGTCTTACTTATGAAAACATTAATAGATTGTCTTCTGCAGTTTCGTGCTTTAATGGAGTTTTGTGTGGCCTAACATCTGCCCTGGGCCAAACAGATGCTAAAGATGGCAGTCATAAAGAAAAAGTGCTGATGTGGAAACATGAACTTGGCTCTGTGTGGAGttgtatattttcttttgtgcAAGTTGTTGATTTTGTCATAAACAAATTGCTCAGTGAGAATAACCAACTCTCCGAAATTTTACATGATTCCCAGAATGTTGATTTTGCTAATTGTTCTACTTCATCAGCAATTGGTAATGTCTCCAAAAGTTGCAGTGATGTCGATAGAATGTCAAATCCAGAAAATGTAAACTTTGTTGCTAGTGTTTTGGCTAGGGATGATTCCCCTGAGCCACTGGGTTTGAATAAACCTTTGTTACAAAGCTTGGTAAAAGGTGATCATCCTGAAGTAGCTTTTTTAGTAAGACAACTGTTAATAGCTTCGTCGTCTCTTTTGAGGCTAAATTTGCAGATGGATGATGTTTCGCCATTGCCTTGTTTTGTGCCTGCTTTTATTGAAATCTCACAAGTCTTGCTATTAGAATTTACAGAGATGGTTGGGGTCCCACAACCATCTGCTTTTCTTTTGTTAGATGGTGCTCTCAGCTATCTGAGAGAATTGgcaatttattttcctttcacAGATCCTACCTCATCGAGTAAAGTTTATACAAAATTAGTACTGATTCACATGAGGGCAATAGGCAAGTCCATATTGTTGCAAGGGAAAAGGGCAACACTTACCTTACACGAAAGACAGTCAAGTACAAAGACACTACATAAAGGATCATTTAAAGCTTGCTCTTCTAATGAAATGTTCGACATTTGCTTGGATGAATTGAAAACTAGGCTGCGGGTGTCGTTCAAAGCATATATAGAGAGGCAATCAGAGTTGCATCTTTTGTCTACTATACAGGCAGTTGAGAGAGCTCTAGTTGGAGTACAAGAAGGATGTACTATAATCTATGACATAAAAACAAGTAAAGAGGGAGGTGAAATTTCGACACTTGTGGCAGCCGGCATTGATTGCTTGGACATGATTATCGAATTTGTTTCAGGTCAGAAAAGCTTGAAGCTGATCAAAAGATACTGTCAGAGTTTAGTATATTCTAGTTTCAGCATTATTGTGCATTTACAGAGCCCACACATATTTTATGTTAGCTTAAGATGTAGAACAGTTGCCGGTGTTCCTGATCCTGGGTCAGCCATTCTCATGTGTGTTGAAGTCCTAGCTACAATCTCAAGGAAACATACTCTATTTTCAATGGATGTCTGGCATGTGGGTCATATGTTACATATCCCTGCAGCActctttcaaaattttgatCAGCATAGAATTTCTAAAGCTTCTTGTCCGTCAGAGTCATTTATGGGCTCAGAAGAGCAAAATTCTCATCCAGCAGAGGGAGTGAATTTCTGTCACGTAGACCACCAGTTCACGATCAACCTATTTGTTGCATGTTGTCAACTGTTGTGTACCATTATAAGGCATCGTCCAAGCGAGTGCAAGCGGTGCGTTGCCCATCTTGAAGCTTCTGTTACTGTTCTTCTTAATTGCTTGCAGACAGTTTTAGAGAACAAATCAATTGTGAATGAAGGTCACTTTTCTTGGGAAGTAGAAGAAGGAGTGAAATGTGCTTGTTTTCTTCGAAGAATTTATGAAGAGATAAAACAGCAAAAAGATATCTTTGGTCGCCAATGTTGTCTGTTTTTATCCAACTATATATCGATTTATTCAGGATATGGTCCCAAAAGAAGTGGCATTAGAAGAGAAATAGATGAAGCTTTACGACCGGGTGTCTATGCTTTGATAGATGCTTGCTCAGTTGATGATCTTCAATATCTTCATACTGTTTTTGGAGAGGGACCTTGCAGGAATACCTTGACAACTCTTCAACACGATTACaaactcaattttaaatatgaagGAAAAGTGTGA 6015 0.3754 MTDLEANSKMNNRKRKPKTHHQPQKSSKLHRSEPAQKPQDPWSNLQLILCIQDKHLDLHSKVSQAFNFVRSRVDGGADIDQHCETVKLPRLLGYLNDWILTVLFPPNGKENWGVGKTPQLDGIEAYMDLSCWEIYRFCLQESLKLSVSLNMSRNLLQTLQFIVRNTMLLLENFSTSSGEHFKSGEKLKLYDTALDCVSLVFSSHGGLSNENLDLWVETTGALLELVIKVYGKNLDGSCVGACVFRFLWLVLQPFSNFLRVHPARKGFQNFVDKLLEPLLHLSGELHLRANGSDPIWTGRLVKVVEEVLSHGLFHPVHIDEFLSLHGSEKYVASCDDKPKDSNAAIKSYHRHLFDVLNKIISRKNAIAMGSLGLIFRLYADSARKFKGTSILYEGSNTMEKMNDLRQPVPGETCSSNNISVDTQKSLFNFLVLIMEPLLLEVNAYLHANLDAKLIFSDLCGILKSICNLLASFMQEKVYVKTEDTSGGACLNFLKKIFNTLIASSTSILCLANYGTTNMAGMETFSLAANDMLVAMGYLLEIEYEVIGEDLVNLWLILLSYSAVNCNMTNAFDRCSLSSTIPALGCQIVNLYSQLRQVQIAILALCKALRRLTCDGNAEESSSKLLTFLSNDVYSESVESLLSSHKFNHTIFKAMESIPEGQVSGFIRQITDDISVTLGWMKSCSPLVGGNKLRLINLQAELLGRGLSRLYSLVLDSATITEGNSNLVGVAVKELMSLLRPYLIILVVQQPDAICKFFSSIIGENVDCAVGKGKFLKKFGRSSQWVFVFFLQLFVSSRSLLRQAISLMPPSLSKKMSAEMGDDSAYSAFELMERADETDIGFFSWIAQPSDSLLDIMKLICNFYLKHGFNDSSPLIYIFQSMALQRLVDLNKHVILLKYLQKKHCRPRIEALKKEASELTAFIMENLSCVYQSPMFLSDDVKCEDSVSLAPQINIWNQGIYVANKKSLPIAIWSNLCKNVDIWGNHCSKKQLKIFFLHLLRTSLHCVSSSFQELDMQDEYKLLKRVTLAHISSGLLSDSILYEQKFAHRKLATIFCRALEKSALPLFGNVACTAVKLQSEPNWIDFLSALDNLALVDNKEDPIGCSAVKKLNADVSSSESASPLTIKSFTDCHHLLKLLSLMSDVNARSFSLIISCIFNLERLLVNALVYYKSTMYGDYYCEFLRLFVSCRKALRYILIGFCEKTGTIQSLPKSVISESSSSVLWLSKSLSLIAGIQEVFSAENILVRSLMFSLMDHTSYALLGIGKHQTIHVFSLDKEAEMPCEEISDHKISHAENHLLSSSQYLGSSKLEALKCLTFMAENLKEQLQNLCVSQKGIPCHVNVGHGLTYENINRLSSAVSCFNGVLCGLTSALGQTDAKDGSHKEKVLMWKHELGSVWSCIFSFVQVVDFVINKLLSENNQLSEILHDSQNVDFANCSTSSAIGNVSKSCSDVDRMSNPENVNFVASVLARDDSPEPLGLNKPLLQSLVKGDHPEVAFLVRQLLIASSSLLRLNLQMDDVSPLPCFVPAFIEISQVLLLEFTEMVGVPQPSAFLLLDGALSYLRELAIYFPFTDPTSSSKVYTKLVLIHMRAIGKSILLQGKRATLTLHERQSSTKTLHKGSFKACSSNEMFDICLDELKTRLRVSFKAYIERQSELHLLSTIQAVERALVGVQEGCTIIYDIKTSKEGGEISTLVAAGIDCLDMIIEFVSGQKSLKLIKRYCQSLVYSSFSIIVHLQSPHIFYVSLRCRTVAGVPDPGSAILMCVEVLATISRKHTLFSMDVWHVGHMLHIPAALFQNFDQHRISKASCPSESFMGSEEQNSHPAEGVNFCHVDHQFTINLFVACCQLLCTIIRHRPSECKRCVAHLEASVTVLLNCLQTVLENKSIVNEGHFSWEVEEGVKCACFLRRIYEEIKQQKDIFGRQCCLFLSNYISIYSGYGPKRSGIRREIDEALRPGVYALIDACSVDDLQYLHTVFGEGPCRNTLTTLQHDYKLNFKYEGKV 2004
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu02g02725 2004 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 40 - -
Tsu02g02725 2004 Pfam Urb2/Npa2 family 1764 2003 IPR018849 -
Tsu02g02725 2004 PANTHER UNHEALTHY RIBOSOME BIOGENESIS PROTEIN 2 HOMOLOG 33 2004 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tsu02g02725 - - lja:Lj3g3v3541690.1 2794.22
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tsu02g02725 02 28902411 28913734 Tsu02g02725 02 28902411 28913734 ECH