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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre9g02025 ATGTCGTCGGCACCGGAAGGAAAACGATTAGAAGAAGAATTATCCTATCCAATTCTACTAGCAGAACGAATTCGCTCAGCAATAGACGAAACCGACTCGTTCAAACTCGAATGTTCCGAAGTCTGGAAACAAGTCGACCGTCTCCTTCAAATGCTCCGAACAGTTGTCCGATTCGCCGCCACATCTCCTCTCTACGAACGTCCCGTCCGACGTGTAACCGCCGAAACAGCAAAAAATCTCGAACGCGCTTTAACCTTAGTTCGTAAATGTAAACGCCGTAGCATCCTCCACCGTGTTGTTACCATCGTCAGCGCCACCGATTTTCGGAAAGTTTTGAGTTATCTTGATGCATCGGTTGGAGATATGAAGTGGTTGTTAAGTATCATTGATGGTGAAAGTGGAAGTGGAATCAATTTAGCACTTCCTCCAATTGCGAGTAATGATCCAATTCTTTCATGGGTTTGGTCTTTTATTGGTTCAATTCAAATGGGTCAATTGAATGATAAAATTGAAGGTACAAATGAACTTGCTTCATTAGCACAAGATAATGATAGGAATAAAAAGATTATTGTTGAAGAAGGTGGTGTTCCACCACTTTTGAAGCTTCTTAAAGAAGCTACTTCTCCAACTGCTCAAATTGCTGCTGCTACTTGTTTATGTTATTTGGCTAATGATTTGGAGAGAGTTAGGGTTATTGTGAATGAAGTTGGTGTACCTGCTGTTGTTCAGGTTCTTGCTGATTCGCCCATTAGGGTTCAAACATTAGCGGCTAATTTAGTTGCTAGGATGGCTAGACATGATCCTGTTGCTCAAGAGGATTTCGCCAGGGAGAATGCCATTAGACCGCTTGTTACGCTTTTGTCGTTTGATACTTTTATGGATGAGCAGTTGGGTAATGGTCAGTTGAGTAATGGTAGGCAGAGTATTCATTCTATTTTTCAGATTAATAAGGAGTTAGGGAAGAAGTCGACCGATAGGTCTAGTACTGGTGGTAGTAGTCGACAGTTTGCGAATTCGTATTCTAATTCGTATTATTTTACGGAAGGAAGTAGTCGTGGAGGGAATTATAGGAAGGAGAGGGAGAATGAGGATCCTGCTGTGAAGCTTCAGCTTAAAGTTAGCTGTGCTGAGGCGTTGTGGATGCTTGCAGCGGGGAGTGTGTCGAATAGTAGGAAGATAACTGAGACTAAGGGAATGCTTTGTTTGGCTAAGATTATTGAGAAGGAACAGGGTGAGTTGCAGCAGAATTGTTTGATGACTATAATGGAGATAACAGCTGCGGCTGAATCCAATGCTGATCTTCGACGTGCTGCGTTTAAGACTAATTCCCCTCCTGCTAAAGCTGTTGTTGAACAGCTTTTGAGGATAATTAAGGAGGTCAATAGCCCGCCGATGCAGATTCCGGCAATAAAGTCTATTGGTTCGTTGGCTAGGACGTTTCCTGCTAGAGAGACTCGAGTAATTGAACCTCTAGTAGCACAGCTGAGTAATCGAGACATAGATGTAGCAGATGAAGCAGCCGTTGCTCTTACCAAGTTTGCTTCTCCAGATAATTTCCTATATGTCGAGCATTCTAAGAAAATAATTGAATTCGATGCAGTTCCGGCAGTGATGAAACTGCTGAGGAGTAACGAAGTTAACCACATGCATCATGCGCTAACTCTCCTTTGCTACCTTGCACTACATGCTGGCAGCAGCGAGTCCTTGGAACAAGCACGGGTATTGTTGGTTCTAGAGGGTGCGGATAGAGCAACTCTTCCTCAGCATATAAGAGATTTGGTGTCAAAGGCAATTGTCCACCTCAACTTGTATCATGCAGGAAGGAATTCTCAACCATTGTCATATATTCCTTGA 1854 0.431 MSSAPEGKRLEEELSYPILLAERIRSAIDETDSFKLECSEVWKQVDRLLQMLRTVVRFAATSPLYERPVRRVTAETAKNLERALTLVRKCKRRSILHRVVTIVSATDFRKVLSYLDASVGDMKWLLSIIDGESGSGINLALPPIASNDPILSWVWSFIGSIQMGQLNDKIEGTNELASLAQDNDRNKKIIVEEGGVPPLLKLLKEATSPTAQIAAATCLCYLANDLERVRVIVNEVGVPAVVQVLADSPIRVQTLAANLVARMARHDPVAQEDFARENAIRPLVTLLSFDTFMDEQLGNGQLSNGRQSIHSIFQINKELGKKSTDRSSTGGSSRQFANSYSNSYYFTEGSSRGGNYRKERENEDPAVKLQLKVSCAEALWMLAAGSVSNSRKITETKGMLCLAKIIEKEQGELQQNCLMTIMEITAAAESNADLRRAAFKTNSPPAKAVVEQLLRIIKEVNSPPMQIPAIKSIGSLARTFPARETRVIEPLVAQLSNRDIDVADEAAVALTKFASPDNFLYVEHSKKIIEFDAVPAVMKLLRSNEVNHMHHALTLLCYLALHAGSSESLEQARVLLVLEGADRATLPQHIRDLVSKAIVHLNLYHAGRNSQPLSYIP 617
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre9g02025 617 ProSiteProfiles Armadillo/plakoglobin ARM repeat profile. 194 237 IPR000225 GO:0005515
Trre9g02025 617 SMART arm_5 475 515 IPR000225 GO:0005515
Trre9g02025 617 SMART arm_5 521 561 IPR000225 GO:0005515
Trre9g02025 617 SMART arm_5 225 265 IPR000225 GO:0005515
Trre9g02025 617 SMART arm_5 182 224 IPR000225 GO:0005515
Trre9g02025 617 PANTHER ARMADILLO REPEAT ONLY 4 10 605 - -
Trre9g02025 617 Gene3D - 12 128 IPR036537 GO:0007166
Trre9g02025 617 Gene3D - 440 584 IPR011989 -
Trre9g02025 617 Gene3D - 361 439 IPR011989 -
Trre9g02025 617 SUPERFAMILY ARM repeat 167 573 IPR016024 -
Trre9g02025 617 Gene3D - 164 323 IPR011989 -
Trre9g02025 617 Pfam Armadillo/beta-catenin-like repeat 183 223 IPR000225 GO:0005515
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre9g02025 Trre-Chr9 20380279 20382132 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre9g02025 - - gmx:100779659 935.25
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Trre9g02025 9 20380279 20382132 Trre9g02025 9 20380279 20382132 ECH