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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre5g04962 ATGAACATTGCTGCTCTTTTAACTTCAGCAGGAATTAATATCACCGTATGTGTGATACTATTTTCACTTTATTCAATATTAAGAAAACAACCAAGCAATTTTAATGTATACTTTGGAAGAAAACTAGCTACACTATCTTCTAAAAACGTCGATCTTAGTTTGGAAAGATTTGTTCCATCTCCCACATGGGTAATGAAGGCATGGAATACAACTCAAGAAGAACTTCTTACTATTGGTGGTTTGGATGTTGTAGTTTTTAACAGGATACTTATCTTCAGCATTCGAGTATTTTCTGTTGCTGCTATCATCTGCACTATTTTAGTTCTTCCAGTGAATTACTATGGCCAAAACAGGATACATAAAGACATACCTTTAGAGTCACTAGAAGTATTTACCATTGAGAATGTCAAGGAAGGATCCAGATGGCTTTGGACTCATTGTCTAGCATTATACATCATAACTTTGACAGCTTGCGCTCTACTTTACTTTGAATATAAGAGCATTACTAATTTGCGGTTAGTACATATCACTGAATTGCCTCCAAAACCAAGTCAATTTACTATCCTTGTCCGAGGAATACCTTGGTCTGCTGAGGAATCATATTGTGAAGCTGTGAAAAAGTTTTTCACATATTACCATGCTTCAACATATTTGTCACACCAAATAGTGTATGAGTCTTGTACTGTTCAGAAGCTGAAGGATGATGCAGAATATGTATGTAAAGTGCTCGGTGATGGTTTGGAACAGTCTTGTAAGCCAAGTATGATGCAGTGTTACTTTTGTGGAGGAACCAGTAATTTTAAGATTATTGCTAATGCTAATGAAATGGATAGTATACATTCGAGAACAGGCCTCAATGACATGCATATAATTTCAAAAAAAAAGGAATGTGCAGCTGCCTTCGTGTTCTTTAAAAGTCGGTATGCTACTCTTATGGCTGCTCGAAATCTTCAAGCATCAAATCCTATGTTATGGGTGACAGATCAAGCTCCTGAACCACGTGATGTTTACTGGTCCAAACTTTGCATACCATACAAACAACTTTGGATTCGAAAGATATTTACATGGGTGGCTTCTGTCACATTTGTGCTTGTATTCCTCATCCCTGTCACATTTACACAAGGCATGACTCAACTAGACAAGCTTGAGAAAATGTTCCCTTTCTTGACAGATATAGTTAAAAAGAACTTTATGGTTCAACTGGTGACTGGATACTTGCCAAGTGTTATTTTGGTTTTATTTTTAATTTGTGTTCCACCAGTAATGATGTTACTTTCCGCAATAGAGGGTCCAATTTCCCGTAGTGGCAGGAAAAAAAGTGCATGTTGCAAAGTTTTGTATTTCACTATTTGGAATGTGTTTTTTGTCAATGTTTTTGCTGGGTCTGTTATCAGTCAACTCTCGGTGTTCACTAGTATAACAGAACTACCTGCCCAACTAGCAAAGGCTGTCCCAGTTCAGGCTACGTTCTTCACAACATATGTTTTATCATCTGGTTGGGCAACTCTGGCATGTGAGATTATACAACCGTTTCCTCTTTTTTGTAACTTGTTCCAAAGATTAGTACTCTGCTCTAGAGAAGATTCATACAATGGCTACCTAACTTTTCCGTACCATACAGAAGTTCCAAGGGTCCTTCTATTTGGATTTCTTGGGTTCACATGTTCTATTTTGGCACCCTTGATACTGCCCTTTTTATTGTTCTACTTTTTCCTTGCATACATCGTTTATCGTAATCAGATTCTCAATGTGTATATTACAAAATATGACGGTGGCGGACAGTTATGGCCTATTGCCCACAACACCATAATCTTTTCATTGCTTGTGTCACAAGTTATTGCACTTGGGGTGTTTGGACAAAAACAATCAACTGTTGCATCTGGATTTACCATTCCATTGTTGATCGGTACTGTTCTATTTAACGAATATTGTCGGCAACGATTTCTTCCAGTATTTAAGAATGATGCAACACAGGTTCTTATTGACATGGATCACAGAGATAAAAATTGTGGAAGGATGGAAGAAATTTATGATCAATTACATTCAGCTTATTGCCAATTCAAGAATAGCTCTACTCATGCTGAACGTTTCAGTTATCCAGGGGATAAAGAACGTGTTCAGAGACTTCAAATTCCAGAAGATTTAGAAACAGGCGAAAACAGCAGCCAACAAGCTATAACATGGCCCCATCGATAG 2196 0.3739 MNIAALLTSAGINITVCVILFSLYSILRKQPSNFNVYFGRKLATLSSKNVDLSLERFVPSPTWVMKAWNTTQEELLTIGGLDVVVFNRILIFSIRVFSVAAIICTILVLPVNYYGQNRIHKDIPLESLEVFTIENVKEGSRWLWTHCLALYIITLTACALLYFEYKSITNLRLVHITELPPKPSQFTILVRGIPWSAEESYCEAVKKFFTYYHASTYLSHQIVYESCTVQKLKDDAEYVCKVLGDGLEQSCKPSMMQCYFCGGTSNFKIIANANEMDSIHSRTGLNDMHIISKKKECAAAFVFFKSRYATLMAARNLQASNPMLWVTDQAPEPRDVYWSKLCIPYKQLWIRKIFTWVASVTFVLVFLIPVTFTQGMTQLDKLEKMFPFLTDIVKKNFMVQLVTGYLPSVILVLFLICVPPVMMLLSAIEGPISRSGRKKSACCKVLYFTIWNVFFVNVFAGSVISQLSVFTSITELPAQLAKAVPVQATFFTTYVLSSGWATLACEIIQPFPLFCNLFQRLVLCSREDSYNGYLTFPYHTEVPRVLLFGFLGFTCSILAPLILPFLLFYFFLAYIVYRNQILNVYITKYDGGGQLWPIAHNTIIFSLLVSQVIALGVFGQKQSTVASGFTIPLLIGTVLFNEYCRQRFLPVFKNDATQVLIDMDHRDKNCGRMEEIYDQLHSAYCQFKNSSTHAERFSYPGDKERVQRLQIPEDLETGENSSQQAITWPHR 731
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre5g04962 731 Pfam Late exocytosis, associated with Golgi transport 6 164 IPR032880 -
Trre5g04962 731 PANTHER PROBABLE MEMBRANE PROTEIN DUF221-RELATED 5 690 IPR045122 GO:0005227
Trre5g04962 731 Pfam Cytosolic domain of 10TM putative phosphate transporter 185 339 IPR027815 -
Trre5g04962 731 Pfam Calcium-dependent channel, 7TM region, putative phosphate 351 618 IPR003864 GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre5g04962 Trre-Chr5 51315219 51320399 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre5g04962 K21989 - gmx:100789875 1091.26
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Trre5g04962 5 51315219 51320399 Trre5g04962 5 51315219 51320399 ECH
Trre1g00454 1 3368322 3376443 Trre5g04962 5 51315219 51320399 PCT