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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre5g02708 ATGGGTGTGCTTAGAGTATTACGTTTGTGTATACTCTGTTGGGTTTTGTCAACACTTTGTTCTATTACCAAATGTGGCGGTTCAGATGTAACTGTGAAATTCTTGAAAGCACCTCATGCATTCTCTCACTTGAACTCATCAACATTTGCTTTTAAAGTTCTTAATTCGGGTAGTAACCGTTCTTCTTGCTCAAATTGCAGCCTCAGTTGTAAGCTTGATGATGGGATCAAATCAGTATGTACCAATGGGAGAGTTACCTACTCAAGCTTGCAGGATGGGAATCATAGTTTTGAAGTCTGCACGAATGGACATCAAGGACTTTTTGGCTGTGCTAGCTATAACTGGACTGTTGACACAATTCCACCGACAGCATATGTTACTGCCTCAACAACTTTCACAAGTTCTTTAAATGTATCAGTAAATATATCTTTCAGCGAACCTTGTATAGGTGAAGGTTTTGGATGCAAGTCTGTGAATGCATGCAATCTTCTTGTGTACGGTGCTGGCCAGGTTATACCATCTTCCTTTAAAATTCTGAAGCCAAACCTCATGTATTCTCTTCTTGTTAGTTTATCCTCTACGGTTCAATATAGCCGAGCAATCCTTGTGATGGATAAGAATTTCTGCACTGACATAGCTGGTAACAGCTTCACAAGAATGCCAAATTCAAGTGTTTATGTTCATATTGACAGAAGAAAGGTTTATGTCAACATCAGGACTCATGTACCCGAAAAACTACTTCAACTCAATGGTGAAACTAGATCAGTACAAGCAACTAATGATCATAACAAGCTGAAGGTGTATCTATACTTCTCATCTCCAATTCTAAATTCATCAAAAGAAGTTATGGATTCTCTCGATATTAGTCACGGTTCACTCGTTCCAACTAGTGCAGAAAATCTCGGAAATCGTAGATTTGGATTCATGATTGCTAATATCTCATCTACCGCTATCATCTCAGTTGACTTCGATTCGAAGTTAATGATAACCAGACAAGGGACTCGAGTTTCTCCAACTGCACCGGTTAATTTTCTCTATGATTCTAAGAGACCTATGGTGATGTTGAGTACACATAGAATGAGGACAAAAGATCACAATATCCAAATATTGATTGAATTTGTGAAACCTGTTTTTGGCTTCAATACCTCTTGCATATCAATTTCAGGAGGTTTATTAAAAAGCTTTCACAAACTAAGATGGAGCACATACATTGTTGAGCTACAAGCAGATGATGATTTAGTATTCGTCAGTATTCCAGAGAACGTAACTCATGATATTGCTGGAAACAAAAACTTAGCTTCCAATGTTCTACAAGTGAGGCACTACTCGGTACCTCTCAGTTCTTGTGTGATTTCTGCATTTACAACTGCTACTTTTGCACTGACATCAATTGCTGCGGGCCTACTTACTATCTCAACTGCGAGCCTTCAATCTGTCGATACATTCACGAGATCTTCTTCTTTCTTGATCGTTGATCCTGTTAGGAATCTTTTTAGAATTCTGTGCCATATTCAAGTATTTGCACTAGCTAGATGGTTATCAGCTAAGTTGCCAGTTGAATTTTATGAATTTTCAAGGCATTTGCAATGGACCATACCTTATTTTTCTGTGCCATGGGAATCTGGACCTATGAGTTTGTTCATGGTAGGTTCTAATCCTTTCGGAAGCTCTAGTTCCTTTACCAAAACTTCAGCAACAATCCCGAACATGTTGAATTATGGTGCTTCAGTGTATGGATCACCGCTTACTTCTTCAGAGTACCGACGATATTTTGAGAGCGAAAATATGAAACCAGAAGCTGAATATATTTTGGATTCACAACATTCCAGTGGATGGACAGATTTTTATAGAACCATGTTTTGGCTAGCTGTGATCTGTGGCGGTTTGTTGGTTCTGCATGCTTTTCTACTTATTATTCTCAAATTTAGGAAGAGAAATTCTGAAAAGCCTGGAATATATGGAGCACTTGTATTCCCAAGATTTGAAATATTCCTTTTATTTCTTGCACTGCCTGGTATTTGCAAGGCCTCTTCTGGCCTTATTAAAGGGGGAACACCTTCATCAATGGCAGTTGGAATCATACTGTTGATTTTTGTATCCATTGTGCTTCTAGCTTTGTTCATGTTTCTATCAGTTGGAATTACATTTGGAAAACTTCTTCAATACAAGGAAGTTCATCATGAAGGTGAGACGTTTCATTGGTATCAAGAGCTTATAAGAGTAACTCTTGGACCAGGTAAAAGAGGCCAATGGACATGGAAAGAAAGACCTAAATCTGTTTACCTAACTATATTTGGCCCTCTATTTGAAGATTTAAGAGGTCCTCCAAAGTACATGCTTTCACAAATATCAGGCGGAAGTCTTCCGAGTCAAAGTGACCACATTATTGCCTCAGATGATGAAAATGAAGATGCAGAAGCACCTTTCATCCAAAAGCTCTTTGGAATTCTCAGAATATACTATGTGTTTCTTGAATCCATTAGGCGTGTTTCACTCGGAATTTTAGCAGGCATTTTCATTCAGACACGATCCAGATCGTTTAAGAGTCCATTGATTATTATGCTATCTATAACCTCTTTTCAGCTATTTTTCATTGTCCTAAAGAAACCTTTTATTAAGAAAAAAGTCCAACTAGTTGAAATCATCTCACTCACATGTGAAGTTGCTTTTTTCGCTACTTGTTTCGTGCTCTTGAAGAAAGACTTTTCTGTGAGAACTGAGACAAAATTTGGGATTTTCATGCTTGTGCTATTTTTAGTAGGGTATTGTTCACAAATTACTAACGAATGGTTTGCATTATATGCACAAACAAAGCTACTAGACCCCGAGGAGAAGTCATTGTTAACAGGTTTGAAAATTGCTTCTATTGGGCTTCTTTTGTATTTCATCCCGAAAAAATGGATCAAAAACTTGGAAAAGAAGTTACCTCAAAATGGTCATGCGAACAACGAAACTCAAGACAATGGTTTGTCGGCTGAAAGAAGCATGCGCTCTGGTAGTAGAAGCTCAGGTACACCTGATATACCATGGTTGAAAAGAGTAAGGGAACTTGCAAAACGTAGCTTTAGTAAAGATAGAAGTGGAGTTCAAATTACTGATCCTTCTACTAGTAGTACTAGTAGATGGAGTGGTTTGTGGGGAAACAAGAGAAGTGGTAGTTCTTCTTCTGATTATAAGTCAAAACCAAAAGCTTTGTATGATGATATGGAAGCCATTTTTGCTTCCAAGTCATAA 3234 0.3794 MGVLRVLRLCILCWVLSTLCSITKCGGSDVTVKFLKAPHAFSHLNSSTFAFKVLNSGSNRSSCSNCSLSCKLDDGIKSVCTNGRVTYSSLQDGNHSFEVCTNGHQGLFGCASYNWTVDTIPPTAYVTASTTFTSSLNVSVNISFSEPCIGEGFGCKSVNACNLLVYGAGQVIPSSFKILKPNLMYSLLVSLSSTVQYSRAILVMDKNFCTDIAGNSFTRMPNSSVYVHIDRRKVYVNIRTHVPEKLLQLNGETRSVQATNDHNKLKVYLYFSSPILNSSKEVMDSLDISHGSLVPTSAENLGNRRFGFMIANISSTAIISVDFDSKLMITRQGTRVSPTAPVNFLYDSKRPMVMLSTHRMRTKDHNIQILIEFVKPVFGFNTSCISISGGLLKSFHKLRWSTYIVELQADDDLVFVSIPENVTHDIAGNKNLASNVLQVRHYSVPLSSCVISAFTTATFALTSIAAGLLTISTASLQSVDTFTRSSSFLIVDPVRNLFRILCHIQVFALARWLSAKLPVEFYEFSRHLQWTIPYFSVPWESGPMSLFMVGSNPFGSSSSFTKTSATIPNMLNYGASVYGSPLTSSEYRRYFESENMKPEAEYILDSQHSSGWTDFYRTMFWLAVICGGLLVLHAFLLIILKFRKRNSEKPGIYGALVFPRFEIFLLFLALPGICKASSGLIKGGTPSSMAVGIILLIFVSIVLLALFMFLSVGITFGKLLQYKEVHHEGETFHWYQELIRVTLGPGKRGQWTWKERPKSVYLTIFGPLFEDLRGPPKYMLSQISGGSLPSQSDHIIASDDENEDAEAPFIQKLFGILRIYYVFLESIRRVSLGILAGIFIQTRSRSFKSPLIIMLSITSFQLFFIVLKKPFIKKKVQLVEIISLTCEVAFFATCFVLLKKDFSVRTETKFGIFMLVLFLVGYCSQITNEWFALYAQTKLLDPEEKSLLTGLKIASIGLLLYFIPKKWIKNLEKKLPQNGHANNETQDNGLSAERSMRSGSRSSGTPDIPWLKRVRELAKRSFSKDRSGVQITDPSTSSTSRWSGLWGNKRSGSSSSDYKSKPKALYDDMEAIFASKS 1077
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre5g02708 1077 MobiDBLite consensus disorder prediction 977 1008 - -
Trre5g02708 1077 PANTHER - 4 1070 - -
Trre5g02708 1077 MobiDBLite consensus disorder prediction 1020 1061 - -
Trre5g02708 1077 MobiDBLite consensus disorder prediction 977 1005 - -
Trre5g02708 1077 MobiDBLite consensus disorder prediction 1025 1060 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre5g02708 Trre-Chr5 21480701 21486730 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre5g02708 - - gmx:100801150 1627.07
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Trre5g02708 5 21480701 21486730 Trre5g02708 5 21480701 21486730 ECH