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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre5g00688 ATGGCGCTAATCATCTTCTTCTTCTTTGCTTCTCACCTTCTCTCTTCCATCTCTGGACAATCCAGCTCCATGGAATCGGTTCCTGATCTTCAGAACACTATGTATACGGATGTTGATGGATATCCTTGTGTTCGGTTGTTGAATCTTTCTGGAACAATCGGTTGTTCAAATCCTGGACGAGATAAGGTTGTGGCTCCAATTGTAAGGTTTGAAAATGTTGATGACGTTTCGGAGCTATCTACTATATTGGTGTCATTGGATGAGTTTCCTACTCTCTTTACCAGATTATCAGCTGATCCAAGCTTGGCAAGAAAAGTCGGTGGTGTACTAGTGGAATCAGTTACTGATTCACAAAAGAAGTTAAATGGATTTTCTCCAGATCAAAAGTTTCCGCAAGCTGAATTTGCTCCTTATCATAATATCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGGTATTATGTGGAAATCTTACAGTTTTCCTGTGTTTCTGCTCACAGAAAGTGGCACAAAGACTCTTAAAGAGTTTGTATTAAAGAGTGAGGATAAAAAGAAAGCGTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAATGAAATCTGGAACACATGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGGAACTTGCCTCCCTTTAGGTGGATACAGTGTTTGGTCGTCTCTTCCCCCAATCAACATTTCATCGTTAAAACCGCCTAAGCCCATTATATTGACAGTAGCCTCTATGGATTCTTTTTCCTTTTTCCGGGACATAAGCCTCGGTGCAGATTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTACTGGCAGCAGCTGATGCACTTTCTCGTTTGGATGGCCTTGGTGACCTTAGTAAGCAGCTTGTTTTTGTAGTATTCACTGGAGAGGCATGGGGTTATCTTGGAAGTAGGAGATTTTTGGTAGAACTTGACGAACACTCGGATGCTGTTCATGGCCTTAATCACTCATTAATTGAAAAGGTCCTTGAAATTGGTTCTGTTGGGAAGGGTCTCAGTCAAGGTCAAGGTGCTAAAAAGTTTTTTGCTCATGCTGAAGGGGATTCTTCTGCCACGGATCAGACTATGGTTGCCCTGAAACATGCACAAGAGTCACTGCTATCTGAAGACATACGAATCGCATCTGCAAGTGCCTCAAATCCTGGGATACCTCCGTCATCTTTAATGACCTTTTTGAATAAGATTCCTGGAATCTCCGGTGTCGTGTTAGAAGATTTTGACTCTTCCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTCATCTTGATGATTTATCAAATGTGGACTCATCGGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTGTTGCCCGAACCCTTTACATACTTGCTAGTGGAACTAATGATGTACAAAATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTAAATGTCACACTTGTTGAAAAACTTATGGATTGCTTGTTGGACTGTGATCCCGGTCTTTCTTGTGAGTTGGTGAAGAAATATATTTCACCCGCTTCAACCTGTGCGAGCAATTATGTCGGTGTTATCTTGGATGAACCTTCATCCACACCTTATTCAGGATACATTAATGACATTCCCAGGTTCATCTGGAATTTCCTAGCCGACATAACTTCTATCCCAAAGGAGAATAATAGCTCAAGTTGTCAACAGGGTTGCAGTAAAAATGAAGTTTGCATTAAAGCAGAGACTGATGGAAAGGGAGTTTGTACTCTCTCTACAACTAGGTACGTTCCAGCATATTCAACACGGTTAAAATTTGAATCAGGAGTATGGAGTATTTTGCCCGTTAATTCCTCTGACAAAATGGGGCTTGTAGACCCAGTCTGGACAGAAAGCAACTGGAATACAATAGGCATTCGGGTCTACACCGTCCAAATTGCTGCTTACGATCGGGTTGTTCTGGTTGGGGGAATTACTCTTACAATCTTGGCATATCTTGCAATAGCGGTTACAAGAACTTTCATTGCCAAAGCGACAAAGAGGGATTGA 2001 0.4133 MALIIFFFFASHLLSSISGQSSSMESVPDLQNTMYTDVDGYPCVRLLNLSGTIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDDVSELSTILVSLDEFPTLFTRLSADPSLARKVGGVLVESVTDSQKKLNGFSPDQKFPQAEFAPYHNISYEWNPIGSGIMWKSYSFPVFLLTESGTKTLKEFVLKSEDKKKAYTSNVAEFDLVMQTMKSGTHDSESCLKEGTCLPLGGYSVWSSLPPINISSLKPPKPIILTVASMDSFSFFRDISLGADSPISGLIALLAAADALSRLDGLGDLSKQLVFVVFTGEAWGYLGSRRFLVELDEHSDAVHGLNHSLIEKVLEIGSVGKGLSQGQGAKKFFAHAEGDSSATDQTMVALKHAQESLLSEDIRIASASASNPGIPPSSLMTFLNKIPGISGVVLEDFDSSFVNKFYHSHLDDLSNVDSSAVVAAASLVARTLYILASGTNDVQNSTLAAINVNVTLVEKLMDCLLDCDPGLSCELVKKYISPASTCASNYVGVILDEPSSTPYSGYINDIPRFIWNFLADITSIPKENNSSSCQQGCSKNEVCIKAETDGKGVCTLSTTRYVPAYSTRLKFESGVWSILPVNSSDKMGLVDPVWTESNWNTIGIRVYTVQIAAYDRVVLVGGITLTILAYLAIAVTRTFIAKATKRD 666
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre5g00688 666 Gene3D Zn peptidases 177 469 - -
Trre5g00688 666 CDD M28_Nicastrin 38 619 - -
Trre5g00688 666 Pfam Nicastrin 241 452 - -
Trre5g00688 666 PANTHER NICASTRIN 5 665 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Trre5g00688 666 FunFam Nicastrin 169 467 - -
Trre5g00688 666 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 212 453 - -
Trre5g00688 666 Pfam Nicastrin small lobe 42 199 IPR041084 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre5g00688 Trre-Chr5 4693972 4702197 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre5g00688 K06171 - gmx:100818367 1052.35