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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre1g00909 ATGGGGAGGAATAGATTTGATGCGTTTGTCTCCGTTTTCGTTACGGTGCACCCGCACGAATCCTCTGCTCTTCTTCATTCATTCTTCTGCTTCTTCTTCATTTTGAGTGCGTATTTTGTAGTTTTACCTTTGCGTGATGAAGGTGCAATTTCATTGGGACTATCAAATCTACCTGGTCTATTTATAGGTTCATTGTTGCTCACCGTCGTTGCTGCACCGTTTTCATCACTCGTCTTCTCTCTCCCTAATCTCTCTAAAAACAAGGCTTTGGTTTTCATACACAGGTTCTTCAGTGCATCACTCATAGTGTTCTTTATTTTATGGCACTACTCATCAGCTGGATCTTCGTCATCCAATTTGATCGGCTCCACAGCTTTGACCTCGAAAGAAGGGAAGCTTAGTGATCAAGGTAGTCTTGCGTCGTCATCTGGCTGGGATAACCATGGATGGTTTTATATCTCTGTCCGTATAGGATTGTTTCTTTGGGTTGCTTTGCTTAATCTAATTACAATTTCTTCAACTTGGGCAAGGGTAATTGACGTAATGGACAATGAGTCAGGTTCAAGATTATTTGGGTTTATTGGTGCTGGTGCCACCCTTGGACAACTTTGTGGATCACTGTTTGCCACAGGAATGGCTTTTGTCGGTCCATTCTTACTTCTGTTTGCTGCTTTGTTAATGGAACTTGCGGCTCAGACATCAAGAGGGATAAATTGTGATACATCTCATGTTGAAGAAGAATTGTCTCCCATTAGAGAATCTGATTCCAACATCAAGAATGTGGCTGGTGAGATTGAGAGGACTGAACCCACTCTAATAGGTTCCCCAAAGTCATCCACTTCTTTAGTGAAGCATAAAGTTTGGCCCATACTGGAAGGACTCTGGCTTATATTATCATCAACTTACCTGTTGCATATATCATTGTTCATCTGGCTGAGCGCAGTTGTCTCTTCATTCTTCTATTTCCAGAAGATGAGTGTTATTTCCAGCACAGTTACTAGCTCTATTGGTAGGAGAAAACTGTTTGCCGAGATAAATAGCTTTATTGCTGTTTTTATTCTTATTGGACAACTATCCTTAACGGGGCGCATTCTTACTGTTGCTGGGGTGACTACAGCTATATGCTCATCTCCTTTCATTGGCTTCTTAAATTTAGCCGCTCTAGCTGTTTGGCCAGATTGGATGGTGGTGGCTATTTGTGAGACACTGAGAAAGGTTGTTACATATGTCGTTACAAGGCCTGGAAGAGAGCTTTTATTTGTTGTTGTTTCAGAGGATGAAAAGTATAAAGCTAAAATATGCATAGATGTGCTGGTTCAAAGACTTGGAGATGCTGCAGCAGCTGGAATGTATAAAATGCTTTTTGGTACCCAAAATGGAAGTCCATCAACTGCTGCCCTTTACGGCCTTCCGGTTTGTTTGTTGTGGATAGTTACAGCATTCTTTTTGGGTCGTAGGCAAGAGCAACTTTCAAAAGAAAATTTGAGATTAAGTGTACATTGA 1503 0.4132 MGRNRFDAFVSVFVTVHPHESSALLHSFFCFFFILSAYFVVLPLRDEGAISLGLSNLPGLFIGSLLLTVVAAPFSSLVFSLPNLSKNKALVFIHRFFSASLIVFFILWHYSSAGSSSSNLIGSTALTSKEGKLSDQGSLASSSGWDNHGWFYISVRIGLFLWVALLNLITISSTWARVIDVMDNESGSRLFGFIGAGATLGQLCGSLFATGMAFVGPFLLLFAALLMELAAQTSRGINCDTSHVEEELSPIRESDSNIKNVAGEIERTEPTLIGSPKSSTSLVKHKVWPILEGLWLILSSTYLLHISLFIWLSAVVSSFFYFQKMSVISSTVTSSIGRRKLFAEINSFIAVFILIGQLSLTGRILTVAGVTTAICSSPFIGFLNLAALAVWPDWMVVAICETLRKVVTYVVTRPGRELLFVVVSEDEKYKAKICIDVLVQRLGDAAAAGMYKMLFGTQNGSPSTAALYGLPVCLLWIVTAFFLGRRQEQLSKENLRLSVH 500
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre1g00909 500 Pfam TLC ATP/ADP transporter 387 484 IPR004667 GO:0005471|GO:0006862|GO:0016020
Trre1g00909 500 PANTHER ADP,ATP CARRIER PROTEIN 2 491 - -
Trre1g00909 500 SUPERFAMILY MFS general substrate transporter 23 494 IPR036259 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre1g00909 Trre-Chr1 6904874 6911689 Tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre1g00909 K03301 - gmx:100802404 789.645