Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre15g02055 ATGCATAAGCAACTTAATTACACCCTCTTTATCCTCTTCTCTATACTCAATGTTGGTTTGGCAATAAATCATGAGAAAAGCCAAAACCCATTCACTCCAAAGGCTTTTGTAATTCGTTATTGGGACAGAGTCATCAAAAACAACTTACCAAAGCCATCTTTTATTCTCTCCAAGGCCTCGCCGCTAAGCGCGGCCGACGCAGCCGCTTTCGCGAAACACGCGGCTGACAACACACTCTCCGAAAAGCTGCCGGAATTCTGCTCCGCCGCACACCTCTTCTGCTTTCCCGACCTCGCGAAACAACACCTTTTCGATCCCCTGCATTTCGCTGTATACAGCGTCGACCAGAATTTCACTGCCTACAGCTTCAACGAAAATTTCACCACCTATGGAACGCATAAATCCGACGGAATCGATACATTCAAGAATTACTCTATCGGTTTAAACACAGTTCAGCACAACGAATTCAAATCATACAGCAAAAGTTCCGCCGATCACAACGACAGTTTCACTACCTACCTCGTCGACAACAACGCGTCGGAAGAAGACTTCAACAATTATGGAACAACCGCCGCCGGTGGATCAGGCGAATTCAAAATCTACGCTCAAGACAGTAACGTCCCTAACATGAAATTCACCACCTACACCGCCGGTACTACCGGAAGAGAACAAGAATTCACAAGCTACAGCAACGCCGCAAACGCCGGTAATCAGAGTTTCATGAATTATGGCAAAAACTCTCTTCATGCCGTTAACGGTTTTACGGAGTATGGAACACACGCTAACGTCTTCAAAACCGATTTCTCCACTTATTCAGAAAAAGGCACAAGCGCTAAAGATACTTTCACAAACTATGGTAACCACTTGAATGATCCTGATACGAATTTTAAGAATTACGGTAAAGGAAGTACCGATGCGGCGGAGAAATTTACGAATTACAGAGACGTTGCTAGTGGTGGTGATGATTCGTTCATTTCGTACGGTGAAAGTTCGCGACTTGGTGTCCATGTTGATTTTGAAAATTACGGTCGTAAACCCCTTTTTCCAAAATTAGGATCCGAAACTTTCAAAGGCTATGCTAAAGGTGCAGATTTAAATCACAAGGTTAGTTTCAAAGGTTATGATGCTGTTAATAACACTTTCAAGGATTATGATAAAAAAGGTATTTCATTTGCAAAGTATGCTAATGCTTCTTCAAGTTCAACTAGTTCTGTTAGTGAAAGTGGTAGTTTGGTAAAAGCATCGGTTCAACCAGGTAAATTTTTCCGAGAAAGGATGTTGAAGGAAGGGACGGTTATGCCTATGCCGGATATAAGGGATAAATTGCCGCCGACGTCGTTTTTGCCTCGTTCTATTTTGACTAAATTGCCCTTTGCGTCTTCTAAGTTAAATGAGATGAAACAAGTTTTTAAGGTGTCTGAGAATTCCTCAATGAATAAGATTATGGTTGATGCGTTGAGTGAGTGTGAGAGGGCGCCGAGTATGGGCGAGACCAAGCGTTGTGTGGGTTCCCTTGAGGATATGATTGATTTTGCATCTTCTGTATTGGGTCACAGTGTTACAGTTCGGTCTACTGAGAATGTAAATGGATCGAGTAAGAATGTTATGGTGGGTAAGGTTAAGGGGATAAATGGTGGAAAAGTTACTCAATCTGTATCGTGTCACCAAAGTTTGTTTCCTTATTTGTTGTACTATTGTCACTCAGTTCCAAAAGTTCGAGTCTACGAAGCAGATCTTTTGGATACAATTTCCAAGGCTAAGATTAATCATGGCATTGCCATCTGTCACTTGGATACAACTGCTTGGAGTCCTACTCATGGTGCATTTGTGGCTCTTGGATCTGGTCCAGGACATATTGAAGTTTGTCACTGGATCTTTGAAAATGATATGACATGGACTACTGCTGATTGA 1911 0.4239 MHKQLNYTLFILFSILNVGLAINHEKSQNPFTPKAFVIRYWDRVIKNNLPKPSFILSKASPLSAADAAAFAKHAADNTLSEKLPEFCSAAHLFCFPDLAKQHLFDPLHFAVYSVDQNFTAYSFNENFTTYGTHKSDGIDTFKNYSIGLNTVQHNEFKSYSKSSADHNDSFTTYLVDNNASEEDFNNYGTTAAGGSGEFKIYAQDSNVPNMKFTTYTAGTTGREQEFTSYSNAANAGNQSFMNYGKNSLHAVNGFTEYGTHANVFKTDFSTYSEKGTSAKDTFTNYGNHLNDPDTNFKNYGKGSTDAAEKFTNYRDVASGGDDSFISYGESSRLGVHVDFENYGRKPLFPKLGSETFKGYAKGADLNHKVSFKGYDAVNNTFKDYDKKGISFAKYANASSSSTSSVSESGSLVKASVQPGKFFRERMLKEGTVMPMPDIRDKLPPTSFLPRSILTKLPFASSKLNEMKQVFKVSENSSMNKIMVDALSECERAPSMGETKRCVGSLEDMIDFASSVLGHSVTVRSTENVNGSSKNVMVGKVKGINGGKVTQSVSCHQSLFPYLLYYCHSVPKVRVYEADLLDTISKAKINHGIAICHLDTTAWSPTHGAFVALGSGPGHIEVCHWIFENDMTWTTAD 636
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre15g02055 636 Pfam BURP domain 421 633 IPR004873 -
Trre15g02055 636 PANTHER POLYGALACTURONASE 1 BETA-LIKE PROTEIN 2 15 636 - -
Trre15g02055 636 SMART BURP_2 419 635 IPR004873 -
Trre15g02055 636 ProSiteProfiles BURP domain profile. 421 635 IPR004873 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre15g02055 Trre-Chr15 16682217 16684375 Proximal
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre15g02055 - - var:108321369 768.459
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Trre15g02055 15 16682217 16684375 Trre15g02055 15 16682217 16684375 ECH