Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre13g02728 ATGGAATTGGCAATGAAGGTAGCTGAAGCTGTTCATGTGCTTAACCACGATACCCAATCCTGCAACCGCGTCGCAGCCAATCAATGGCTTGTTCAGTTTCAACAAACTCACGCCGCTTGGGATGTCGCCACCAATATTCTCACCTCCGATCGCCGTCATCCTCTCGCTTCCAATTTCGAACTCGAGTTCTTCGCCGCTCAGATTCTCAAACGCAAGATACAAAATGAAGGTTATCAACTGCAATCAGGACCTAAGGATGCTTTGTTAAATGCTCTTCTTCTTGCCGTCAAAAGATTCAGTAGTGGTCCTCCACAGCTTTTAACACAGATCTGTCTTGCACTCTCTGCACTCATACTTCAAGTTGTTGCTCATGGAAACCCAATCGAGCAGCTTTTTTACAGTCTCCGGAATCTGCAGAGCGAAGATAATGGCAATATTGCTGTCCTGGAGATGCTCACTGTCTTGCCGGAGGAAGTTGTTGACAACCAACGTATTGATTCTAAAATTAATTCGTTAAACATAAGCCACTATACCCAAGAGCTTTTGTCTCATACACCTATGGTTCTCGAGTTCCTACTGCGGCAATCTGAAATAAATTTTGATGGTTCTGTACAACAGAATGAAAGGAACAGAAAAATTTTGCGCTGCTTATTGAGCTGGGTCAGAGCAGGTTGCTTCTCTGAGATTTCTCCAGAAACATTGGCAGCTCACCCACTTTTAAATTTTGTATTTAACTCATTGCAGGATTCTACATCATTTGATCTTGCCATTGAAGTTCTTGTTGAACTTGTGACTAAACACGAGGGAGTGCCACAAATCTTGTTATGCAGAGTACATTATCTGAAGGAAGTACTTCTTTTTCCAGCTCTTAATAGGGGAGACATGAAAGTCATTGGTGGCCTTGCATGTTTATTGTCAGAAATTGGGCAGGCTGCTCCATCTCTAATTGTAGAAGCAAGCACTGAAGCCATTGCACTGACAGATGCACTCTTGAGCTGTGTGGCATTTCCAAGTGAAGATTGGGAGATTGCAGACTCAACCCTACAGTTTTGGTCCACTCTTGCAAGCTATATACTTGGCATTGACATAGATCATGCAAAAAGAAAACACGTGGAAGCCATTTTTTCACCTGTGTTCTCAGCATTACTCGATTCACTGATATTACGCTCTCAGGTGGATGATTCTACATACAACGATGAAGGAAGAGTGATCGATTTGCCCGATGGCCTTGTACATTTCAGAATGAACCTAGTAGAACTTTTGGTGGATATATGTCACCTGTTAGGATCTACAATATTTATGCAAAAGCTTGTTATAGGTGGGTGTGCATCTCCGAATTTATCACTCCCTTGGAAAGAAATGGAAAGCAAGTTATTTGCTCTTAATGCTGCTTCCGATGTAATCATACAGGATGGCCAAAGTTTCGATTTCTCTGCAGTCATGCAGTTGGTGTCCCTGTTATCGAGTAAGCCTTCTAATGGCTTAAAGGGTTTCATTTGCATTGTATACAGATCTCTAGCAGATGCTATTGGTTCTTATTCCAAGTGGATATCTTCTTTTAAGGAAAATTTTAGACCCTTGCTATTATTCCTTGCTATTGGGATTTCTGAACCTCTTTCTTCTAATGCATGTGCGTCTTCCCTGCGTAAAGTCTGTGAAGATGCTCCTGTAGTAATTTATGAACCTTCACATTTGGAAATTTTAATGTGGATTGGAGAGGGGTTAGAGAAGTGGCATTTATCTTTGGAAGATGAGGAAGAAGTTATGCATGCAATAAGTCTCGTCCTTGGTTCTGTTCCTAATCTAGAATTGAAGAGCAACTTATTGGCTAGGTTGCTCTCGTCTAGCTATGAAGCTATTGGGAAACTTGTTGGTCCAGAGAACAGCCTTTCTCTTAAACAGAACCCTGCTTCTTATACACAAATTTTAAATGCTGCCTCTAGAGGATTACACAGAATAGGAACTGTATTCAGTCATCTTTCGATTTCTGTGGCAACTGAACCTGCTGCAGATGACTTGATACTTCTACTATTAAGGGTTTTCTGGCCCACCTTGGAGAAAATCTTTACTTCTGAGCATATGGAGAGTGGTATTTTATCAGTAGCAGCTTGCCGGGCTCTTTCCTTAGCTATTCAATCTTCAGGTCAGCATTTTGTGACCCTACTGCCCAAAGTGCTGGATTGGCTATCGACAAATTTTGTTTTGTTCCAAAGTCATGAGTGCTATATAAGAACTGCTTCCATTGTCATTGAAGAATTTGGTCACAGAGAGGAGTATGGACCTTTATTTGTTACCATGTTTGAAAGATTTACTCATTCGACTTCTGTAATGGCTCTAAATTCTTCCTACATATGTGACCAAGAACCTGACTTAGTGGAGGCCTACACCAATTTTGCATCCATATTTATTCGCTCCTGCAACAAGGATACCCTTTCAGCTTGTGGTTCTCTTCTTGAAGTTTCTATACAAAAAGCAGCTATATGCTGCACAGCCATGCACCGTGGTGCTGCTCTAGCTGCAATGTCTTATTTGTCTTGTTTCTTAGATGTGGGCCTTGTCTCTTTGTTAGAATGTATGAATTGTATTATTGAGGGGTCATTCAACGCCACAGCCATTCATGTAATATCCCACAGCGGCGAGGGACTTGTATCTAATGTGGTGTATGCCTTACTCGGTGTGTCTGCAATGTCACGGGTTCACAAGTGTGCAACAATTCTGCAACAACTGGCAGCAATTTGCACTTTATCTGAAAGAACGTCATGGAAGCCTATACTTTGTTGGCAAACTCTTAATGGATGGCTACAGTCAGCGATTCAGGCTCTTCCTGCCGAATACCTAAACCATGGAGAAGCAGAGACCCTAGTGCCCCTTTGGTCCAAGGCCCTTGCTGCTGCAGCCTCTGATTATCTTGAGAGCAAGAACTCTGATGGATTGAAGAGCGATTTTGGACATATGCAAGGGAAGGGTGGGAGAGTTTTAAAGCGCCTGGTTCGGGAGTTTGCCGATGCCCATCGAAATATTCCAAATCTGACTTGA 3036 0.4229 MELAMKVAEAVHVLNHDTQSCNRVAANQWLVQFQQTHAAWDVATNILTSDRRHPLASNFELEFFAAQILKRKIQNEGYQLQSGPKDALLNALLLAVKRFSSGPPQLLTQICLALSALILQVVAHGNPIEQLFYSLRNLQSEDNGNIAVLEMLTVLPEEVVDNQRIDSKINSLNISHYTQELLSHTPMVLEFLLRQSEINFDGSVQQNERNRKILRCLLSWVRAGCFSEISPETLAAHPLLNFVFNSLQDSTSFDLAIEVLVELVTKHEGVPQILLCRVHYLKEVLLFPALNRGDMKVIGGLACLLSEIGQAAPSLIVEASTEAIALTDALLSCVAFPSEDWEIADSTLQFWSTLASYILGIDIDHAKRKHVEAIFSPVFSALLDSLILRSQVDDSTYNDEGRVIDLPDGLVHFRMNLVELLVDICHLLGSTIFMQKLVIGGCASPNLSLPWKEMESKLFALNAASDVIIQDGQSFDFSAVMQLVSLLSSKPSNGLKGFICIVYRSLADAIGSYSKWISSFKENFRPLLLFLAIGISEPLSSNACASSLRKVCEDAPVVIYEPSHLEILMWIGEGLEKWHLSLEDEEEVMHAISLVLGSVPNLELKSNLLARLLSSSYEAIGKLVGPENSLSLKQNPASYTQILNAASRGLHRIGTVFSHLSISVATEPAADDLILLLLRVFWPTLEKIFTSEHMESGILSVAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDWLSTNFVLFQSHECYIRTASIVIEEFGHREEYGPLFVTMFERFTHSTSVMALNSSYICDQEPDLVEAYTNFASIFIRSCNKDTLSACGSLLEVSIQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVGLVSLLECMNCIIEGSFNATAIHVISHSGEGLVSNVVYALLGVSAMSRVHKCATILQQLAAICTLSERTSWKPILCWQTLNGWLQSAIQALPAEYLNHGEAETLVPLWSKALAAAASDYLESKNSDGLKSDFGHMQGKGGRVLKRLVREFADAHRNIPNLT 1011
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre13g02728 1011 Gene3D - 3 966 IPR011989 -
Trre13g02728 1011 SUPERFAMILY ARM repeat 1 816 IPR016024 -
Trre13g02728 1011 PANTHER TRANSPORTIN 3 AND IMPORTIN 13 6 1006 - -
Trre13g02728 1011 Pfam Exportin 1-like protein 103 260 IPR013598 -
Trre13g02728 1011 FunFam ARM repeat superfamily protein 2 961 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre13g02728 Trre-Chr13 26214734 26229769 Dispersed/Tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre13g02728 K15436 - gmx:100808691 1768.05