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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr6g1280 ATGGCTTTCTCACATTCCTTTCTTTTCTCTTTGATTGTTTGTTTGGTCATTTCTAAATGTCAAGCTACTGCTAATGTTAGTATATCAAAACTAGTGATTGATGCTAGTTCTAGAAGGCCTATTCCAGACACTTTTTTTGGAGCATTTTTTGAGGAGATTAATCATGCTGGAGCTGGAGGATTATGGGCACAACTTGTGAATAACACAGGTTTCGAAGCAGGTGGTTCTAGTGTTCCTTCAAATATTTATCCATGGACAATTATTGGAGACGATTCATCCATTATTGTATCAACCGACAGTTCCTCTTGTTTTGAACGTAATAAAGTTGCTTTACGTATGGATATTCTTTGTCATAGACAATCATGTCAACCCGGTGGTGTTGGTATATCCAATCCCGGTTTTTGGGGCATGAACATTGAGCAAGGGAAGAAGTATAAAATAGTATTCTATGTTAGATCACTTGGTCCAATTGATTTACAAGTTTCATTTGTTGGGTCTAATGATACCGTCAAATTGGCTTCAACAAACATAAGGTCTTTTGGACTTAAAATTGCAAACTGGACTAGAATGGAGACAATTATTGAAGCTAATGCTACAAATCATAATTCAAATCTACAAATAACAACAAGCAATAGAGGAGTAGTATGGTTAGACCAAGTCTCAGCTATGCCTTTGGATACATATAAGGGTCATGGTTTTCGAAGTGACCTTTTTCAAATGGTGGCAGATTTGAAGCCAAAATTTTTTAGGTTCCCAGGTGGTTGTTTTGTAGAAGGAGATTATCTAAGAAATGCTTTTAGGTGGAAAGATACAATTGGAGCATATGAAGAGAGACCTGGCCACTTTAACGACATGTGGGGATATTGGACTGATGATGGATTTGGTTTTTTTGAGGGACTCCAACTATCAGAGGATCTTGGTGCATTTCCAGTTTGGGTGTTTAACAATGGTATTAGCCACCATGATCAAGTTAATACGACTACGATTTCACCATTTGTGCAAGAAGCCCTAGATGGTATTGAGTTTGCTAGAGGTTCTCCCACATCACAATGGGGTTCTCTTAGAGCTTCCATGGGACATCCTGAGCCATTTGATTTAAGATTTGTTAGTGTTGGAAATGAAGATTGTGGTAAAGATAACTATTTAGGAAATTACTTGAAGTTCTACGAAGCAATAAAACGCACTTATCCTGATATTCAAATTATTTCAAATTGTGACGGTTCCGATCAACCACTTAATCATCCAGCAGATCTCTATGAATTCCATGACATGTTTTCCAAGTACACCAAGTTCGATAACGCCCCACGATCCGGTCCAAAGGCATTTGTTAGTGAGTATGCTGTTTGGAGGGAAGATGCTGGTGCTGGAAGTCTTTTGGCTGCATTGGGCGAAGCTGCATTCCTTATGGGGCTTGAAAAAAACAGTGATATTGTCAGCATGGTCGCCTATGCACCCTTGTTTTTAAACACAAATGATAGGAAGTGGATACCAGATGCAATTGTTTTTAACTCTTATCAGAATTATGGAACTCCAAGTTATTGGCTCCAACAACTCTTTACCAACTCTAGTGGAGCAACCTTGCTTAATTCAACTCTCCAAAGTTCTTCTAGCTCAATTGTTGCATCTGCAATTGAGTATAAAGATTCTCAACATGGAAAGAATTATCTTAATGTAAAGGTAGTAAACTTTGGAAATGCTACTGAGAACTTTGAAATCTCTATAAACTGCTTAAATTCAAGTGTTCAACCGTTTGGTTCATCAATGGTGTTGCTTACATCTGCCAATGTAATGGATGAAAATTCCTTCTCAGAACCGAATAAGATTGTTCTCCAACGAACTTCACTTCAAAATGCAAGTAATGACATTAATGTTGGACTTCCTCCTTATTCAGTTACATCATTTGATCTATTGATTTAA 1917 0.3756 MAFSHSFLFSLIVCLVISKCQATANVSISKLVIDASSRRPIPDTFFGAFFEEINHAGAGGLWAQLVNNTGFEAGGSSVPSNIYPWTIIGDDSSIIVSTDSSSCFERNKVALRMDILCHRQSCQPGGVGISNPGFWGMNIEQGKKYKIVFYVRSLGPIDLQVSFVGSNDTVKLASTNIRSFGLKIANWTRMETIIEANATNHNSNLQITTSNRGVVWLDQVSAMPLDTYKGHGFRSDLFQMVADLKPKFFRFPGGCFVEGDYLRNAFRWKDTIGAYEERPGHFNDMWGYWTDDGFGFFEGLQLSEDLGAFPVWVFNNGISHHDQVNTTTISPFVQEALDGIEFARGSPTSQWGSLRASMGHPEPFDLRFVSVGNEDCGKDNYLGNYLKFYEAIKRTYPDIQIISNCDGSDQPLNHPADLYEFHDMFSKYTKFDNAPRSGPKAFVSEYAVWREDAGAGSLLAALGEAAFLMGLEKNSDIVSMVAYAPLFLNTNDRKWIPDAIVFNSYQNYGTPSYWLQQLFTNSSGATLLNSTLQSSSSSIVASAIEYKDSQHGKNYLNVKVVNFGNATENFEISINCLNSSVQPFGSSMVLLTSANVMDENSFSEPNKIVLQRTSLQNASNDINVGLPPYSVTSFDLLI* 639
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr6g1280 638 Gene3D - 62 217 - -
Tpr6g1280 638 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 203 527 IPR017853 -
Tpr6g1280 638 Gene3D Glycosidases 218 519 - -
Tpr6g1280 638 PANTHER ALPHA-L-ARABINOFURANOSIDASE-LIKE PROTEIN 2 638 - -
Tpr6g1280 638 Pfam Alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain 445 630 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Tpr6g1280 638 Gene3D - 520 636 IPR013780 -
Tpr6g1280 638 SMART alpha_l_af_c 444 630 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Tpr6g1280 638 PANTHER ALPHA-L-ARABINOFURANOSIDASE 1 2 638 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr6g1280 Tpr-Chr6 13293187 13297798 Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr6g1280 6 637 Glycoside Hydrolase AT5G26120 63.339 0.0 850
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr6g1280 K01209 - gmx:100812703 910.983