Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr5g2656 ATGAAGATGGCAAAAAACATGTGCAACAGTGAAGGAAACTTAGATGACACAGAATTCAGCAAACCTATGCCATGGATAGGAATCTACATAGCAATAGCATCACTTCTATGTCTCATTTCAATGTCTGCAGATCTCATCAAAGGTTTCAAAGCTCGCAAACTATGGTTCCCTAGTAAATATTTTTGTCTTAATGCAACTTCATTAACCATAATCGCCGTTACCGTTAAACTCTCCGTTGATCTCAACACACCTATGCCTCACCGTCATGATCAGCTAGCAAAACTTGCAAGCAGTGCTATAATCTGCACAATCATGGCTAATTCTATGCCTTCTCTTGGTGCAACACAGAATAGTGAAACCATGATGAATGTTTTGGCTATGGCTATTTTAGTGATTACAATGATTGTTAATATTTGTATTCAGTTTGTAACTGGTGTTATTTATGAGTTTTGGGTTGAACATGGTGTTATGATGTTTCTTATGATTGTTTTGTTGATGATTATGACTTCTTCTGCTTTGTGTTTACCAAAGATGAAACATTACATGGAGTTGAAGTATCAGATGAATGAAGAAGTTTTGAGAGAAATCTCAAAGCAAAAAGAACAAGAATTTAGTAATGTTACTGATAAACTAAGAGATGAATTGATGAAATTTTGGATGATGGCTCATACTAGTAGTCCTCAATTTATACTTGGAAGGTCAGTTTCATGTACTGCTTCTGGTGCTTTTTGTGTTTTGAGTACTTTGACTTTACTCGAAGCGATGCTTCGTTCTTATTTAATGCCTTGGTCGGTTAAATTTTGTACCGGTGAATGTGATTATAAGTGGTCTACAATCTTGATTCTTATAGTTCAAGTTGGTGCTGTTGGTGTTGGTACTATTGCTCCGGCTTTAAGATGGTTTTCTGCTGTTAAATATAGGTGTCCAAATGTGAGAAAAAGGAACACCAAGAGAGTTTTTCAAGTGGAAAGTTATTGGACTGATACGTTAGTGTTGGTTCGAGACAGTCCAATTAGTTTTCGGATTCGTAATCGGTGGTTTAGGAAGTTGGCTCATGATGTAAAACTGATTCTGGTGTGTTTCTGTATTAAACTACAGATTGTGATAGTTATGTTGTGTAAAGCTGCACAATATGCTTCAATTTTTCCTATGTATTGGATTTTGGGATTCTGTGAGTATTTTAGGACTTGGACCTTGAAATTCGGTTCTAGCACTTCGAGTCTAGGATCAGGCACAAAGCAGGATTTACGACGGTTTATTCTACATCTCGAAGGCGAGGAAGAGTTGGTTGAAGTGATGATGAAAGAAAATTGGGATGCAACTATTCATTGGGTTCAACAAGGTGAAAAACAGCAGCCAAAACTTGTTATGGAGTTATTGGAGAAAAAATGTTCGATGTTGCAGGGATTTAAAGGAGTTGCAGAATTTGATTGTGATCAAATTCTACCTTTGCATGGAGTTGAACCTCCTCCATATAGTTGGTCACTTCCTATTGTGACACTAGTAAGCATTATTGGTGCTTTGCCAAATATTGAGAAGTATTTGGTGAAAAATTTGATTAGTACTATAAATGAAGGGCTACCCTATGTGAAGTTCATAGAAAACAACATTGACAAAGATGGAAAATTGATTAAAGTTAGGAAAGCAGCTGAAATTGTGTGGCTTGGAGCTGATCTTTATGGAAAGTGGCTCGATGTTGATCTTTATAAACTCTCTCTTCAAAGCAAGTGTCTCAAAGAAACACTTGAGACACTAGCTGAGCTTGCAAAAACAAGGTATGAGAAATATAAAGCAAAATATAATTATGTATGTATTAAGGTAAGTCCTTCAGCATGGCCTACAAAGGTATTGGCTTCTAATGCAATGTACAGATTAACAAAAACCATTCTTCTGTTGAATCAAGATGTTGTAAGAGGCCATAATGCTAGTGAGAAGCTGTTTGAAGTTTTGATAGTGATGATTTCTGATATATTGGGTGCATGTTTAACAAACTTGCCTCATGTGATATCCACAAAGTGTTTGAGTACTAGTATTGAAGAGAGGGAGGATCGTGTTAGACAAGCGGTTTATATTCTAGGTAAAACAAAGAAGATTATAGAAATGCTTGAAAAGAGAGCTTTTCCTAGAGTTAATTTTTGCCGCGGGACTAATGTTGAAGATTGGCATTTAATGCATAAGCAGAAGAGTTTCTGTTATCCCTCTGAACTGTCTTCACAGGAGGAGAATGATGCCTACACAGATCCTGCTAAATTAAGGGATCTTTGCCTAAATATTGAATAA 2280 0.364 MKMAKNMCNSEGNLDDTEFSKPMPWIGIYIAIASLLCLISMSADLIKGFKARKLWFPSKYFCLNATSLTIIAVTVKLSVDLNTPMPHRHDQLAKLASSAIICTIMANSMPSLGATQNSETMMNVLAMAILVITMIVNICIQFVTGVIYEFWVEHGVMMFLMIVLLMIMTSSALCLPKMKHYMELKYQMNEEVLREISKQKEQEFSNVTDKLRDELMKFWMMAHTSSPQFILGRSVSCTASGAFCVLSTLTLLEAMLRSYLMPWSVKFCTGECDYKWSTILILIVQVGAVGVGTIAPALRWFSAVKYRCPNVRKRNTKRVFQVESYWTDTLVLVRDSPISFRIRNRWFRKLAHDVKLILVCFCIKLQIVIVMLCKAAQYASIFPMYWILGFCEYFRTWTLKFGSSTSSLGSGTKQDLRRFILHLEGEEELVEVMMKENWDATIHWVQQGEKQQPKLVMELLEKKCSMLQGFKGVAEFDCDQILPLHGVEPPPYSWSLPIVTLVSIIGALPNIEKYLVKNLISTINEGLPYVKFIENNIDKDGKLIKVRKAAEIVWLGADLYGKWLDVDLYKLSLQSKCLKETLETLAELAKTRYEKYKAKYNYVCIKVSPSAWPTKVLASNAMYRLTKTILLLNQDVVRGHNASEKLFEVLIVMISDILGACLTNLPHVISTKCLSTSIEEREDRVRQAVYILGKTKKIIEMLEKRAFPRVNFCRGTNVEDWHLMHKQKSFCYPSELSSQEENDAYTDPAKLRDLCLNIE* 760
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr5g2656 759 PANTHER PROTEIN, PUTATIVE-RELATED 3 730 - -
Tpr5g2656 759 Coils Coil 579 599 - -
Tpr5g2656 759 PANTHER PROTEIN, PUTATIVE-RELATED 3 730 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr5g2656 Tpr-Chr5 48721413 48725126 Tandem
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr5g2656 - - gmx:100794740 1030.78
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tpr5g2656 5 48721413 48725126 Tpr5g2656 5 48721413 48725126 ECH