LGRPv2

Gene search

Sequence information

Select	Gene	Cds	Cds_length	GC_content	Pep	Pep_length
	Tpr4g1871	ATGTTTCCTTGGAACATTGCAAAATCCGCGGAAGCCATGTTCTCCCGCTGGGCTCTTAAGAGGGTTTGCAAATTTTTCCTTAAGAAGAAATTGGGGCAATTTATTCTCGGTGAAATTGACCTTGATCAGCTCGATGTTCAACTTTCTCAAGGAACTATTCAACTCACCGATCTTGCTCTTAATCTTGATTTCATCAACGCCAAGCTTGGTAAAACAGCATCTATAATGGTAAAAGAAGGATCAATTGGATACTTGTTGGTTAAAATGCCTTGGAGTGGCGAAGGTTGTGAGGTTGAAGTGAATGAACTCGAACTTGTAGTTTCTCCGTGCATAGATAAAAACTCGACAACTGAAGATGAAGTTGGTTGTTCCGATGTTGATAACGATACTTATGAAATCAAATATAGTTCAAACAAGACCAAGCATGAAACAGTAGATGATGCTATGAAGTCAATTTCAGTGGATGTTCATGAAGGTGTGAAAACTATTGCAAAGATGATAAAGTGGTTGCTTACAAGTTTCCATGTGAAAATAACAAACGTGATTGTCGCGTTTGATCCGTCTTTGGAAAATGAAGGAGAGGAAATAGATAGTAATCGGACTTTAGTTCTTCGGGTTTCTGAAATACAGTGTGGAACAAGTTTATCTGAAGATACTGAGTCTAATGTTGATGTCCTTGGAATAAGCCAGTTGACAAACTTTGTGAAGTTTGATGGGGCAGTACTTGAAATTCTCAAAATAGATAACGAAAATAACCAGTTACCCGTTCAAAATGTGGCAGAAGCAGGATGGGGTGATCCTATTTTGGGATCAAATAAATCCACATGTCCGGTCATGACTGGGAAGCAAGGCGGATTTGGTGGAATTGTAAAATTAAGTATTCCTTGGAAGAATGGTTCTTTGGACATTTGCAAGGTGGATGCAGATGTTTGTGTTGATCCAGTAGTGTTAAGATTTCAACCTAGCTCAATTGAATGGCTATTGAAGTCATGGGGAACTCTTAAAAATTTGAATAAGGGTGCAAAAGGTTGCAAGAATCACAACGTAAGAGGATCTTCCCATTTAAATTCTGCGTTGTTGTGTCCTTCACCAACTTCAGTTTCTATTACCAATGTCACTGGTGAAATGATAACTGGCCATGGTAGTTTGCCCGCCAATTGTTCCTCCTTGACTAAACCAGAAGATCCAGAATCCCTCACCGAAGCTTTGCTTCCTGCTGCTAATCTTATTTCAGATTGGGTGCCATTTTCTACTAATCTAAATCTTAAAGATGGTATTCAAGAACCTGATTTTGGGGCAAGTGTGGACCAGTTTTTTGAATGTTTTGATGGAATGAGGAATTCTCAATCTGCTTTAGGGAGTAGTGGAATGTGGAATTGGACTTGTTCGGTTTTCAGTGCTATTACCGCTGCATCCAGCCTTGCCTCTGGATCTTTGCATATTCCCTCCGAGCAGAGACACATGGAAACCATTCTCAGGGCTACTTTTTCTGGAGTATCTGTTGTTTTGTCCTTCTGTGATGATGAACAGAGCCATTTTTATGGGCATAAAATTGGTAACACTGTTGGATCACAGATTGATTATCTTGGTGCAGAGTGCAATGAAATTGTTGTTGCCTTGAAGGTATGTCCACAAATGACAACTTTTGATGGAACAGTGAAGTATGTAGAGGTTGCTAATTTTTCGAACATTGGGAGTGATGCCGAAAATCGAAGTGCTTTGATTGGACACCTACAGACTAAGGTCCTTGATGCTCTCCCTTTGTCTACCTCTTACAATCTATATTCAGATTCATTATTTGGGCCAGTTGCCACAGACTTTCCATTTGGAAATAAGGATTGCTTACTGAAAGTTACATTGTTTAAAACTTCTGGTGTCACCAATTGCAAATTTACGGTGCAATCAAATTCTTCAGATGGTTGTGTGACTAGGCTGACATCATTCTCGCTGAACCTGCCCCCATTTATTTTCTGGGTAATATTTTCTGTGATAAATCTGCTCACTAACCTGCTAAAGGAAATTGAAAAATCACTTGAAGTGCATAGTAAAGCAGACGAGATTTTGTCTGAAGCGTCAGATGAAAAGTGTGGATTATCTCAAAATGATGCGAAGGGAAGTTCAGAATGTTTGCATGGTGATATATCAACTTCCAGTGCAAGAGTAATACTGTGTTTCCCTTTTGAAAGGGTTGGAGATCATGCAGCTTCATTTTCATGGGAGAAGTTCATTGCTCTTGATTTTACTTCATTGTCACCTTTGAACAAGGGTTGCACCCCAGTTGGTAGCCAAACTTCAAGTGCAAGTTCAAATAAAAGATTTCCTTCTGTAGCAGCACAATCTCTTCAGTTGAATTTCTGTGATCTAGATATATACTTGATCACATCAACATGTAACGACAGTGGTAGAATAAGCTCCAATGATATGAAGAATGAGAGATTTTTTGGCAGCTGCTTTCTTTCCATTGCTCGCAGAAGGGGTTGTTTCTCTGTTTTTCGTATGGTTTGGCAGGAGGGTCAAGTGACTGGTCCTTGGATTGCTAAGAAAGCTAGATCATTTGTTAATTCAGAGCAATCAATGGGAAAAGATGATATTGCTGGAAGAGGATATGAGTATGCATCTGCATCAACGGTGAAAGATTTGGAAGATTGGAAATCTCAAACTCAACAAGAGATGATTCTAAGCTCGTCATTTCTAATGCATGTTCATCTATCTCAAGTTGTGATTAATGTGAATGATTCTCAATATAAAGGCATATACCAGCTTATTCTTCAGATGCTAAATGCAATGACATGTGGGACTACTCAGGAAGCTAAGGTGGATAAAAAATCTTCAGTTTCACAATCATCAGTATTTTTGGAATGTGATTCTGTAGAAATTCTTATTAGTATGGATACATCTGAAAGTGGCGAAAGTTCAATCAAGAGTGAGCTTCCCGGACAATGGCATCAATTCAAGCTGAAGGTACAAAGGTTTGAGTTGCTGTCTGTCACTAATACTGGTGGTGTTAAGGATGCGAGTTTCTTCCGACTAACCCATGGCGAAGGCAAGTTGTCCGGGTTCGTTACAGGGGTTCCTGATCACGAGTTTATTCTGGTTAATTGCAACAACTCCTCTGTGAAGCGAGGAAATGGGGGAGGTTCTAATGCGTTATCTTCTAGATGTGCTGGTTCTGATATCGTATTTCTATCTGACCCAGAGATTTCTCATAAAATTACATCTATTGCTGTCAGCTGCGGCACACTTATTGCTGTAGGCGGTCGTCTGGATTGGTTTGTTGTAATATCATCCTTTTTTAGTTTGCCCGCTTCTAATACTAAGGATGCAGATGATACTAGTATTTCAAAGATGGAACAAGATATCTCTTACACGACTTGTTTTGTTCTCAGCTTGATTGATATTGCTTTGAGTTATGAGCCCTATACGAAAAATCTTGTTCAGACTGAGGCCCTTAATTCCGAGTCTGGCTTTTCTTGTATCAAAGAAGAAACGGGGGAACAATGTGTTTCTTGTCTGTTGGCTGCATCCAACTTGTCTCTTTCAAGTTCATCTACTGCAGATTCAGTTGAAAGTGTTTTCCAAATTAGAGTGCAAGACCTGGGGCTTCTGCTTCATTTGATATCAAAGCATGATTCTTTTCCTGGCACTTATAGTGTAGAACATCTTCAAAAGTCGGGTTATGTTAAAGTTGCTCAGGAGGCTTTTCTGGAGGCAATTTTAAAAACCAATTGTGCTAGTGGTCTTCTTTGGGAACTAGAATTATCTAAATCTCACCTTTATGTGGAAACTTGTTATGATACAATGGCTGCGCTGATTCGTTTGGCTGCTCAACTTCAGCTATTATTTGCCCCTGATGTGGAGGAGTCCATTGTGCATTTGCAGAATAGGTGGGATAATGTTCAACAAGCACAGCAAAGCAATGAATTTAGTAATGAAATTAAGCATCTCAGATGTGACACAATGGCTTCAACTTCTGAGCAGTGCTCCCCTAAAACACATTCAAAGGATGGATCTAGTATAGCTGGCTTGATGGATGAAATATGTGAAGATGCATTTCAAGTGAATGACAATAATGCATGGCAATCATATTCTTTTGAATCAGGATTTTACATGCCACTTGAAGGAAGCTTAATTGAGGCTGGTAAGATGAATTTGGATGAGCCTGAAGTTCTCTCTCCTGAATTAATGTTGAATGAGTCAGTGCCTGTAATAGGACCAGAGGGTAGTCAAACTTCATTTCTGCATGACGGATGCTTTCCAGAGATTATAGAAAGCTATTGTTTGTCTGACTTACGCCCTCTCTCGGAGCTATCTATAGATTTACATTCTGATGAGCTTTCCAAAATAAAGCTGAGGAATGTGTCACATAGAGATATTGAAAGAGGAAGTGGTGGATGGTATAGAGGCAACTCATCAAAAGTATTAGAAAACCACATTTCAGAGGAAAATGGAAAAACTGGTCCGATGAAGGCCGCAGATCATGGCACACTTAATTCTAATGATTCCTCATCTCACAGCAAGACTTGTGGACGCTTAATTTTAAAGAAAATTGATATAAGATGGAAAATGTTTGGTGGGTCTGACTTTGTTGATTCAGATAAAAATGGACAACATTCTGGGAGGAACACATCTATTTGCTTGGAATTTGCATTGTCTGGGATGAAATTTCAGTATGATACATTTCCAGTTGGTGGACTACATGTATCAAAGATGTATTTGTCTGTTCAAGATTTTTATCTCTATGACAGAAGCCAAAATGCACCTTGGATACTGGTGCTGGGATATTATCACTCAAAGGGTCATCCGAGGGAATCTTCTTCAAAAGCATTGAAGTTGGACTTGGAGGCAGTTAGACCAGATCCTTTAACTCCCCTTGAGGAGTACAGGTTAAATGTTGCTTTTCTACCTATGCTATTACATCTACATCAGTGCCAGCTTGATTTTCTTGTTGATTTCTTTGGGAAGAAAAACTCATCAAATGACCAGTCTCCTAATTATTGTCATGATTTGGAGGGTTCAAAATCATTTCCTGAGAGGAGTGAAGATCATGCATGCCATTCAATTGCACAAGAGGCATTGCTTCCTTACTTCCAGAAGCTAGATATTCGGTCTATTATTGTTCGGGTGGATTACAGTCCTAGTCGTGTAGATCTAGCAGCATTAAGCCGTGGGAAATATGTAGAACTTGTAAATCTTATCCCTTGGAAGGGTGTTGAGCTTAACCTGAAACATGTTCATGCTTCTGGCATCTATGGTTGGGGCAGTGTTTGTGAAACAGCTTTAGGGGAGTGGTTGGAAGATATATCTCAGAATCAGATTCATAAAATACTACGGGGGCTTCCTACTGTACGATCATTAATTGCTGTTGGGACTGGTGCTGCTAAACTGATTTCATCGCCTGTAGAGAACTACAAGAAGGAGCGGAGAGTGATCAAAGGTTTGCAAAGAGGTACAATTGCATTTCTTAGAAGCATTTCTCTTGAAGCTGTTGCACTTGGAGTTCATCTAGCTGCTGGTGCCCACGACTTTCTTCTCCAAGCAGAATATAGTCTTTCAAGCGTACCTTCTTCAGTTTCTTCACCTGTAAAAGATAAATCAAACACAGGCGCTCGATCTAATCAACCTAAGGATGCCCAACAAGGAATTCAACAGGCTTGTGAGAGTCTCAGCGATGGCCTAGGAAAATCTGCTGCGGTGTTAGTTCAGAACCCCTTGAAAAAGTACCAGCGTGGCTCAGGTGCAGGACCTGCCTTGGCTGCTGCTGTTCGAGCAGTTCCTGCAGCTGCCATAGCTCCTGCTTCGGCTTGTGCAAGTGCTGTACACTATGCTCTTCTTGGATTTAGAAATAGCCTTGATCCTGAACGCAAAAAGGAGTCTATGGAGAAATATTGTCCTACACAACCCTGGGAAGAAGACTGA	5916	0.4016	MFPWNIAKSAEAMFSRWALKRVCKFFLKKKLGQFILGEIDLDQLDVQLSQGTIQLTDLALNLDFINAKLGKTASIMVKEGSIGYLLVKMPWSGEGCEVEVNELELVVSPCIDKNSTTEDEVGCSDVDNDTYEIKYSSNKTKHETVDDAMKSISVDVHEGVKTIAKMIKWLLTSFHVKITNVIVAFDPSLENEGEEIDSNRTLVLRVSEIQCGTSLSEDTESNVDVLGISQLTNFVKFDGAVLEILKIDNENNQLPVQNVAEAGWGDPILGSNKSTCPVMTGKQGGFGGIVKLSIPWKNGSLDICKVDADVCVDPVVLRFQPSSIEWLLKSWGTLKNLNKGAKGCKNHNVRGSSHLNSALLCPSPTSVSITNVTGEMITGHGSLPANCSSLTKPEDPESLTEALLPAANLISDWVPFSTNLNLKDGIQEPDFGASVDQFFECFDGMRNSQSALGSSGMWNWTCSVFSAITAASSLASGSLHIPSEQRHMETILRATFSGVSVVLSFCDDEQSHFYGHKIGNTVGSQIDYLGAECNEIVVALKVCPQMTTFDGTVKYVEVANFSNIGSDAENRSALIGHLQTKVLDALPLSTSYNLYSDSLFGPVATDFPFGNKDCLLKVTLFKTSGVTNCKFTVQSNSSDGCVTRLTSFSLNLPPFIFWVIFSVINLLTNLLKEIEKSLEVHSKADEILSEASDEKCGLSQNDAKGSSECLHGDISTSSARVILCFPFERVGDHAASFSWEKFIALDFTSLSPLNKGCTPVGSQTSSASSNKRFPSVAAQSLQLNFCDLDIYLITSTCNDSGRISSNDMKNERFFGSCFLSIARRRGCFSVFRMVWQEGQVTGPWIAKKARSFVNSEQSMGKDDIAGRGYEYASASTVKDLEDWKSQTQQEMILSSSFLMHVHLSQVVINVNDSQYKGIYQLILQMLNAMTCGTTQEAKVDKKSSVSQSSVFLECDSVEILISMDTSESGESSIKSELPGQWHQFKLKVQRFELLSVTNTGGVKDASFFRLTHGEGKLSGFVTGVPDHEFILVNCNNSSVKRGNGGGSNALSSRCAGSDIVFLSDPEISHKITSIAVSCGTLIAVGGRLDWFVVISSFFSLPASNTKDADDTSISKMEQDISYTTCFVLSLIDIALSYEPYTKNLVQTEALNSESGFSCIKEETGEQCVSCLLAASNLSLSSSSTADSVESVFQIRVQDLGLLLHLISKHDSFPGTYSVEHLQKSGYVKVAQEAFLEAILKTNCASGLLWELELSKSHLYVETCYDTMAALIRLAAQLQLLFAPDVEESIVHLQNRWDNVQQAQQSNEFSNEIKHLRCDTMASTSEQCSPKTHSKDGSSIAGLMDEICEDAFQVNDNNAWQSYSFESGFYMPLEGSLIEAGKMNLDEPEVLSPELMLNESVPVIGPEGSQTSFLHDGCFPEIIESYCLSDLRPLSELSIDLHSDELSKIKLRNVSHRDIERGSGGWYRGNSSKVLENHISEENGKTGPMKAADHGTLNSNDSSSHSKTCGRLILKKIDIRWKMFGGSDFVDSDKNGQHSGRNTSICLEFALSGMKFQYDTFPVGGLHVSKMYLSVQDFYLYDRSQNAPWILVLGYYHSKGHPRESSSKALKLDLEAVRPDPLTPLEEYRLNVAFLPMLLHLHQCQLDFLVDFFGKKNSSNDQSPNYCHDLEGSKSFPERSEDHACHSIAQEALLPYFQKLDIRSIIVRVDYSPSRVDLAALSRGKYVELVNLIPWKGVELNLKHVHASGIYGWGSVCETALGEWLEDISQNQIHKILRGLPTVRSLIAVGTGAAKLISSPVENYKKERRVIKGLQRGTIAFLRSISLEAVALGVHLAAGAHDFLLQAEYSLSSVPSSVSSPVKDKSNTGARSNQPKDAQQGIQQACESLSDGLGKSAAVLVQNPLKKYQRGSGAGPALAAAVRAVPAAAIAPASACASAVHYALLGFRNSLDPERKKESMEKYCPTQPWEED*	1972

Annotation information

Select	Seq ID	Length	Analysis	Description	Start	End	IPR	GO
	Tpr4g1871	1971	Pfam	Autophagy-related protein C terminal domain	1870	1962	IPR015412	-
	Tpr4g1871	1971	Pfam	N-terminal region of Chorein or VPS13	19	119	IPR026854	-
	Tpr4g1871	1971	Pfam	Autophagy-related protein 2 CAD motif	1215	1284	IPR026885	-
	Tpr4g1871	1971	PANTHER	AUTOPHAGY-RELATED 2, ISOFORM A	13	1962	IPR026849	GO:0006914
	Tpr4g1871	1971	MobiDBLite	consensus disorder prediction	1857	1884	-	-
	Tpr4g1871	1971	PANTHER	AUTOPHAGY-RELATED 2, ISOFORM A	13	1962	IPR026886	GO:0006914\|GO:0030242

Pathway information

Select	Query	KO	Definition	Second KO	KEGG Genes ID	GHOSTX Score
	Tpr4g1871	K17906		-	gmx:100805552	2957.55

Event-related genes

Select	Gene_1	Chr_1	Start_1	End_1	Gene_2	Chr_2	Start_2	End_2	Event_name
	Tpr4g1871	4	19582560	19598349	Tpr4g1871	4	19582560	19598349	ECH