Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr3g2140 ATGGGAACCAAAATTGGAGCGAGGCCATTGCCTCGACTCCTATATGCAATAGCATTTTGCATAATTGCTATTAAGACTCTTGCTATTGCTGATGACAACCCTTACTACCATGAAGGCAAACAACCATACTACAACTATCCACAACCAACAACACCCCCATCTTACTATTACAAACCACCACCATATAATAACTATCAATCTCCACCTCCATATGCTTACAAATTCCCTCCATATAACTATCAATCTCCACCTCCATACAAATTCCCTCCATATAACTATCAATCTCCACCTCCTTATGAGTACAAATTCCCTCCATATAATTACTATAAATCTCCTCCGCCGTCACCACCACCTCCTTATGTTTACAAACCCCCACCTTATGTTTACAAACCCCCACCATATCACTACAACTCTCCACCTCCTTATGTCTATAAATCACCTCCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCCCCGCCTCCTCCACCTTATGTCTATAAATCACCTCCACCTCCTCCATATGTTTACCCGTCTCCTCCTCCACCATCACCGCCACCTCCTTATGTCTACAAATCACCTCCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCCCCACCTCCTCCACCTTATGTCTACCCGTCTCCTCCTCCACCATCACCGCCACCTCCTTATGTCTATAAATCACCTCCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCTCCTCCACCTTATGTCTACCCGTCTCCTCCTCCACCATCACCGCCACCTCCTTATGTCTACAAATCACCTCCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCCCCACCTCCTCCACCTTATGTTTATCCATCTCCTCCTCCACCATCACCACCTCCTCCATATATCTACAAGTCGCCACCTCCTCCACCATATGTCTATAACAGTCCACCACCTCCACCCTATGTGTACAACTCACCACCTCCTCCACCTTATGTCTACAAGTCGCCACCTCCACCACCATATGTCTATAAATCACCTCCTCCTCCTCCATATGTCTACAAATCACCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAATCACCACCATACGTCTACAAGCCACCAACACCTCCTCCATATGTCTACAAATCACCACCATACGTCTACAAGCCACCAACACCTCCCCCATATGTGTATGAATCACCACCATATGTCTACAAGCCACCAACACCTCCTCCATATGTCTACAAATCACCACCATACGTCTACAAGCCACCAACACCTCCCCCATATGTCTACAAATCACCACCATACGTCTACAAGCCACCAACACCTCCCCCATATGTCTACGAATCACCACCATACGTCTACAAGCCACCACCATACGTCTACAAGCCACCAACACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCCCCACCTACACCATATAATCCCTACCAATATAGCACACCTCCACCCCCTGCCTATTAA 1440 0.4674 MGTKIGARPLPRLLYAIAFCIIAIKTLAIADDNPYYHEGKQPYYNYPQPTTPPSYYYKPPPYNNYQSPPPYAYKFPPYNYQSPPPYKFPPYNYQSPPPYEYKFPPYNYYKSPPPSPPPPYVYKPPPYVYKPPPYHYNSPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYPSPPPPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYPSPPPPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYPSPPPPSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYPSPPPPSPPPPYIYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPYVYKPPTPPPYVYKSPPYVYKPPTPPPYVYESPPYVYKPPTPPPYVYKSPPYVYKPPTPPPYVYKSPPYVYKPPTPPPYVYESPPYVYKPPPYVYKPPTPPPYVYKSPPTPYNPYQYSTPPPPAY* 480
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr3g2140 479 Pfam Extensin-like region 283 326 IPR006706 GO:0005199|GO:0009664
Tpr3g2140 479 Pfam Extensin-like region 314 354 IPR006706 GO:0005199|GO:0009664
Tpr3g2140 479 PANTHER PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE 38 180 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE 405 479 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE 176 271 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE 215 354 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE 263 440 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED 38 180 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED 215 354 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED 263 440 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED 176 271 - -
Tpr3g2140 479 PANTHER EXTENSIN-LIKE PROTEIN-RELATED 405 479 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr3g2140 - - ccaj:109813380 80.4925